logo

Genes within 1Mb (chr6:133453360:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 3.35e-02 -0.227 0.106 0.226 B L1
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0557 0.0424 0.226 B L1
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 9.73e-01 0.0027 0.0801 0.226 B L1
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0188 0.0484 0.226 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 2.64e-02 0.165 0.0738 0.226 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 2.93e-01 -0.107 0.102 0.226 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 8.13e-01 0.0187 0.0792 0.226 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0437 0.0823 0.226 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0554 0.0712 0.226 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 4.14e-01 0.0396 0.0484 0.226 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 4.23e-02 0.132 0.0645 0.226 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 3.17e-02 -0.21 0.097 0.226 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0833 0.0793 0.226 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0275 0.0829 0.226 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0874 0.0967 0.226 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00397 0.0331 0.226 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 4.00e-01 0.043 0.0509 0.226 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 1.50e-01 -0.144 0.0996 0.226 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0638 0.12 0.218 DC L1
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0336 0.0746 0.218 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 718595 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0519 0.0924 0.218 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 739305 sc-eQTL 9.30e-02 -0.167 0.0991 0.218 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 2.17e-01 -0.132 0.106 0.218 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 7.46e-01 0.0194 0.0599 0.218 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 9.42e-01 0.00507 0.0695 0.218 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 2.01e-01 0.121 0.0944 0.218 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 350232 sc-eQTL 2.06e-01 -0.109 0.0859 0.218 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -842941 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00824 0.108 0.218 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00684 0.0834 0.226 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0628 0.0556 0.226 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 718595 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00606 0.0957 0.226 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 739305 sc-eQTL 8.16e-01 -0.024 0.103 0.226 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 5.77e-02 -0.138 0.0721 0.226 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 5.21e-01 0.028 0.0435 0.226 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 5.87e-01 0.0335 0.0615 0.226 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0988 0.0859 0.226 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -842941 sc-eQTL 6.07e-01 0.0436 0.0846 0.226 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0335 0.0906 0.225 NK L1
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 1.75e-01 -0.114 0.0834 0.225 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 9.95e-01 0.000698 0.104 0.225 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 8.83e-01 0.00636 0.0432 0.225 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 1.25e-01 0.122 0.0794 0.225 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 5.81e-01 0.0581 0.105 0.226 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 1.49e-01 -0.119 0.0824 0.226 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 1.99e-01 -0.129 0.0998 0.226 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 1.55e-01 0.0564 0.0395 0.226 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 3.19e-01 0.0729 0.0729 0.226 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 1.60e-01 -0.153 0.108 0.226 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 5.44e-01 -0.073 0.12 0.235 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0477 0.103 0.235 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0607 0.11 0.235 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0619 0.0586 0.235 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 2.52e-01 0.12 0.104 0.235 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0821 0.103 0.235 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0561 0.118 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 7.81e-03 -0.179 0.0667 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0328 0.102 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 8.43e-01 0.0124 0.0626 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 1.17e-01 0.169 0.108 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0711 0.113 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 4.50e-01 -0.085 0.112 0.224 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0857 0.0812 0.224 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 2.63e-01 -0.119 0.106 0.224 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0475 0.0512 0.224 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 8.59e-01 0.0167 0.0941 0.224 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0355 0.107 0.224 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 1.29e-01 -0.161 0.105 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0192 0.051 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 1.30e-01 0.15 0.0985 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 8.21e-01 0.0128 0.0564 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 3.08e-01 0.0898 0.088 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 1.49e-01 -0.157 0.108 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 3.95e-02 -0.233 0.113 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0723 0.0602 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 3.64e-01 -0.101 0.111 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0452 0.0586 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 2.97e-01 0.108 0.103 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 2.67e-01 -0.124 0.112 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0198 0.112 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0263 0.111 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 1.23e-01 -0.172 0.111 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 8.67e-01 0.00866 0.0517 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0182 0.0897 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0562 0.104 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00654 0.0903 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 5.94e-01 0.0472 0.0884 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0304 0.082 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 2.39e-01 0.0626 0.053 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 5.02e-02 0.127 0.0645 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 1.92e-01 -0.133 0.102 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 7.70e-01 0.0285 0.0973 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0958 0.0978 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0364 0.0966 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 5.56e-01 0.0295 0.05 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 2.30e-01 0.0841 0.0698 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 4.43e-03 -0.327 0.114 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0255 0.113 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0318 0.113 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 6.95e-01 0.0427 0.109 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 3.70e-01 0.0399 0.0445 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 1.42e-01 0.112 0.0762 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 7.90e-02 -0.194 0.11 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 1.92e-01 -0.13 0.0993 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 9.75e-01 0.0029 0.0932 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 2.40e-01 -0.124 0.106 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 8.08e-01 0.0138 0.0567 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 4.64e-01 0.0701 0.0956 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 3.23e-01 -0.109 0.11 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00753 0.105 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 2.46e-01 -0.13 0.112 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 5.54e-01 0.0573 0.0968 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 7.76e-01 0.0158 0.0555 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 1.81e-02 0.164 0.0687 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 2.95e-01 -0.117 0.111 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 9.25e-01 0.0114 0.121 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 6.92e-01 0.0444 0.112 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0371 0.111 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 5.97e-02 0.102 0.0537 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 1.92e-01 0.117 0.0894 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 1.87e-01 -0.157 0.118 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0339 0.105 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 7.52e-02 0.204 0.114 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0819 0.114 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0381 0.0615 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0991 0.101 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00221 0.116 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 9.02e-02 0.189 0.111 0.227 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0178 0.106 0.227 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 2.71e-02 -0.237 0.107 0.227 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 1.21e-01 0.0822 0.0527 0.227 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 6.16e-01 0.0375 0.0746 0.227 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 1.07e-01 -0.179 0.11 0.227 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 9.73e-01 0.00405 0.12 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0131 0.111 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 2.86e-01 0.12 0.112 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 7.36e-02 -0.112 0.0623 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 3.50e-01 0.0877 0.0937 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 7.02e-01 0.0376 0.0982 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0569 0.0898 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 4.33e-01 0.0882 0.112 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 9.62e-01 0.00213 0.0446 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 8.47e-01 0.0191 0.0988 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 4.67e-01 0.0885 0.121 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 3.54e-01 -0.103 0.11 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0423 0.112 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00412 0.0522 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 1.33e-01 -0.155 0.103 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00846 0.102 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 2.97e-01 -0.103 0.0982 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0454 0.111 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0474 0.06 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 8.45e-02 0.172 0.0993 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 4.39e-01 0.105 0.136 0.23 PB L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 7.36e-01 0.0328 0.0969 0.23 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 1.11e-01 -0.188 0.117 0.23 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 4.64e-01 0.0493 0.0671 0.23 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 1.49e-01 0.156 0.108 0.23 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0292 0.126 0.23 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 6.27e-01 0.0555 0.114 0.228 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 2.77e-01 -0.111 0.102 0.228 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0159 0.109 0.228 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 3.39e-01 0.0395 0.0412 0.228 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 6.66e-01 0.0357 0.0828 0.228 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0182 0.107 0.228 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0607 0.115 0.226 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00642 0.109 0.226 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 2.30e-01 -0.11 0.0913 0.226 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 9.68e-01 0.00164 0.0405 0.226 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 8.48e-01 0.0164 0.0854 0.226 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 5.60e-01 0.0668 0.114 0.226 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 7.08e-01 -0.045 0.12 0.227 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0296 0.0944 0.227 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 718595 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0501 0.0937 0.227 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 739305 sc-eQTL 2.61e-01 -0.124 0.11 0.227 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 6.18e-02 -0.2 0.106 0.227 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0244 0.053 0.227 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 8.27e-01 0.0195 0.0893 0.227 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0306 0.105 0.227 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 350232 sc-eQTL 1.63e-01 -0.117 0.0835 0.227 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -842941 sc-eQTL 7.83e-01 0.0285 0.103 0.227 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0815 0.0946 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 1.36e-01 -0.107 0.0715 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 718595 sc-eQTL 8.28e-01 0.0221 0.102 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 739305 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0215 0.102 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 5.03e-02 -0.16 0.0812 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 6.91e-01 0.0181 0.0455 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 8.15e-01 0.0159 0.0679 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0761 0.0876 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -842941 sc-eQTL 5.87e-01 0.0497 0.0914 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 4.21e-01 0.0867 0.108 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 4.26e-01 -0.062 0.0777 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 718595 sc-eQTL 2.42e-01 -0.114 0.0969 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 739305 sc-eQTL 2.43e-01 -0.123 0.105 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 1.30e-01 -0.105 0.0687 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 5.70e-01 0.0283 0.0497 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 3.17e-01 0.057 0.0568 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 1.73e-01 -0.125 0.0917 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -842941 sc-eQTL 7.53e-01 0.0284 0.0901 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 5.47e-01 -0.085 0.141 0.239 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 6.11e-02 -0.226 0.12 0.239 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 2.62e-01 0.15 0.134 0.239 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 5.47e-01 0.0308 0.0511 0.239 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 5.48e-01 0.0581 0.0964 0.239 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0951 0.132 0.239 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0934 0.11 0.224 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0564 0.105 0.224 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 718595 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0951 0.106 0.224 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 739305 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0902 0.105 0.224 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 4.77e-01 -0.076 0.107 0.224 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 6.37e-01 0.022 0.0465 0.224 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 5.78e-01 0.0435 0.0781 0.224 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 7.51e-01 0.0359 0.113 0.224 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -842941 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0223 0.108 0.224 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 6.98e-01 0.0451 0.116 0.229 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 4.71e-01 0.0566 0.0785 0.229 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 718595 sc-eQTL 1.14e-01 -0.175 0.11 0.229 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 739305 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00301 0.11 0.229 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 4.09e-02 -0.216 0.105 0.229 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 7.27e-01 0.0186 0.0531 0.229 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0455 0.075 0.229 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 6.93e-01 -0.037 0.0937 0.229 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -842941 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0597 0.099 0.229 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 6.91e-01 0.0523 0.131 0.229 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 2.51e-02 -0.195 0.086 0.229 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 718595 sc-eQTL 9.74e-01 -0.0029 0.088 0.229 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 739305 sc-eQTL 2.68e-02 -0.197 0.0882 0.229 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0786 0.106 0.229 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00782 0.0734 0.229 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0255 0.0746 0.229 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 3.12e-02 0.233 0.107 0.229 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 350232 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0316 0.104 0.229 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -842941 sc-eQTL 8.71e-01 -0.015 0.0923 0.229 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 2.39e-01 -0.133 0.113 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 2.78e-02 -0.136 0.0616 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 2.32e-01 -0.118 0.0982 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0161 0.0561 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 1.71e-01 0.12 0.0874 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 2.82e-01 -0.111 0.103 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 2.45e-02 -0.24 0.106 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0295 0.0483 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 8.59e-01 0.0167 0.0938 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0164 0.0568 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 1.05e-01 0.142 0.0873 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 2.56e-01 -0.122 0.107 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 6.36e-01 0.041 0.0866 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 1.06e-01 -0.0973 0.0599 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 718595 sc-eQTL 9.70e-01 0.00373 0.0982 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 739305 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0388 0.102 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 1.18e-01 -0.106 0.0673 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 5.62e-01 0.0269 0.0464 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 6.44e-01 0.0292 0.0632 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0993 0.0823 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -842941 sc-eQTL 6.63e-01 0.0377 0.0866 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0746 0.113 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 4.46e-01 0.0567 0.0742 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 718595 sc-eQTL 5.53e-02 -0.209 0.108 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 739305 sc-eQTL 2.62e-01 -0.121 0.108 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 3.59e-02 -0.213 0.101 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 4.71e-01 0.0313 0.0433 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 9.77e-01 0.00192 0.0656 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 sc-eQTL 5.85e-01 0.0575 0.105 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -842941 sc-eQTL 9.42e-01 0.00698 0.0951 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -498810 sc-eQTL 7.19e-01 0.0326 0.0906 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 940162 sc-eQTL 1.10e-01 -0.136 0.0846 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 689901 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0219 0.108 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 638791 sc-eQTL 8.14e-01 0.0103 0.044 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -864752 sc-eQTL 2.46e-01 0.105 0.0906 0.226 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 739305 pQTL 0.0167 -0.0993 0.0414 0.0 0.0 0.217
ENSG00000146409 SLC18B1 640021 eQTL 0.0245 -0.0593 0.0263 0.0 0.0 0.219

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina