logo

Genes within 1Mb (chr6:133452931:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 5.24e-01 0.0578 0.0907 0.244 B L1
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 1.36e-01 0.0538 0.036 0.244 B L1
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0557 0.0678 0.244 B L1
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 5.07e-01 0.0272 0.041 0.244 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 9.85e-01 0.00119 0.0634 0.244 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 5.00e-01 0.0584 0.0864 0.244 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 6.18e-01 0.0332 0.0664 0.244 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 6.16e-02 0.129 0.0685 0.244 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 6.49e-01 0.0272 0.0598 0.244 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 8.09e-01 -0.00984 0.0407 0.244 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0114 0.0547 0.244 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 1.18e-01 0.128 0.0818 0.244 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 4.12e-01 0.0542 0.066 0.244 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00656 0.069 0.244 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0854 0.0804 0.244 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0119 0.0275 0.244 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 5.25e-01 -0.027 0.0424 0.244 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 5.46e-01 0.0503 0.0832 0.244 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 8.01e-01 0.0254 0.101 0.248 DC L1
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 8.72e-01 0.0101 0.0625 0.248 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 718166 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0956 0.0772 0.248 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 738876 sc-eQTL 5.27e-01 0.053 0.0835 0.248 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 6.47e-01 -0.041 0.0894 0.248 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0657 0.0499 0.248 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 2.65e-01 0.0649 0.058 0.248 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0672 0.0792 0.248 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 349803 sc-eQTL 2.59e-01 0.0815 0.072 0.248 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -843370 sc-eQTL 4.15e-01 0.0734 0.0899 0.248 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 7.97e-01 0.0182 0.0705 0.244 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 8.96e-01 0.0062 0.0472 0.244 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 718166 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0612 0.0809 0.244 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 738876 sc-eQTL 9.82e-02 0.144 0.0866 0.244 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0604 0.0614 0.244 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0477 0.0367 0.244 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 3.33e-01 0.0504 0.0519 0.244 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0659 0.0728 0.244 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -843370 sc-eQTL 5.06e-01 0.0477 0.0716 0.244 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 7.21e-01 0.0276 0.0769 0.242 NK L1
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 6.65e-01 0.0308 0.0711 0.242 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 2.12e-01 -0.111 0.0882 0.242 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 3.26e-01 -0.036 0.0366 0.242 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0207 0.0678 0.242 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 2.35e-01 -0.107 0.0897 0.244 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 1.32e-01 0.107 0.0705 0.244 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0485 0.0856 0.244 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0266 0.0339 0.244 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 5.20e-01 0.0402 0.0625 0.244 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 7.71e-01 0.0271 0.093 0.244 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0366 0.106 0.235 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0572 0.0903 0.235 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 2.15e-01 0.119 0.0958 0.235 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 9.98e-01 0.000124 0.0516 0.235 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 1.40e-01 0.135 0.0914 0.235 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0658 0.0902 0.235 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 1.48e-01 0.144 0.0991 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 7.92e-02 0.1 0.0568 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0747 0.086 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 8.11e-01 0.0126 0.0528 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 8.73e-01 0.0146 0.0912 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 3.66e-01 0.0859 0.0949 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 2.93e-01 -0.1 0.095 0.244 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 2.06e-02 0.159 0.0681 0.244 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 1.12e-01 0.143 0.0896 0.244 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000342 0.0435 0.244 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 4.23e-02 0.161 0.0789 0.244 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 3.64e-01 0.0824 0.0905 0.244 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 7.15e-01 0.0332 0.0907 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 2.65e-01 0.0485 0.0435 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 3.51e-02 -0.178 0.0838 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 1.94e-01 0.0625 0.048 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 5.44e-01 0.0458 0.0754 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0617 0.0929 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0172 0.0966 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 5.49e-01 0.0308 0.0513 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 5.81e-01 0.052 0.0941 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 1.97e-01 0.0643 0.0497 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 9.15e-01 0.00947 0.0881 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 6.05e-01 0.0492 0.0951 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 4.10e-02 0.197 0.0956 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 4.78e-01 0.068 0.0958 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 8.73e-01 0.0155 0.0968 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00406 0.0447 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 7.00e-01 0.0299 0.0775 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 1.97e-01 0.116 0.0898 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0902 0.076 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 3.85e-02 0.154 0.0741 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 3.21e-01 0.0687 0.0691 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 9.63e-01 0.00211 0.045 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 6.88e-01 0.0221 0.055 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 1.05e-01 0.14 0.086 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 7.87e-01 0.0222 0.0819 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 6.54e-01 0.037 0.0824 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 4.01e-02 -0.166 0.0805 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0484 0.042 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 6.30e-01 0.0285 0.0589 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 3.43e-01 0.0926 0.0974 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 6.41e-01 0.0441 0.0946 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 8.63e-01 0.0164 0.0948 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 2.05e-01 0.115 0.0906 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0274 0.0373 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 9.41e-01 0.00479 0.0641 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 1.12e-01 0.147 0.0922 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 4.59e-01 0.0632 0.0852 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0167 0.0797 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0687 0.0904 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0109 0.0485 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 8.50e-02 0.141 0.0813 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0567 0.0939 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 5.05e-01 0.0604 0.0905 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 4.15e-01 0.0787 0.0964 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0963 0.083 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0238 0.0477 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0499 0.0598 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 3.07e-01 0.0978 0.0955 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0948 0.0994 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 1.81e-01 0.123 0.0918 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0671 0.0914 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0455 0.0445 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 9.16e-02 0.124 0.0733 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0296 0.0977 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00565 0.093 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 2.83e-01 -0.109 0.101 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 2.54e-01 0.115 0.101 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 6.92e-02 0.0984 0.0539 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0191 0.089 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 6.99e-02 0.186 0.102 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0608 0.0952 0.242 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 5.61e-01 0.0526 0.0904 0.242 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 9.91e-01 0.00101 0.0921 0.242 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 2.50e-02 -0.101 0.0447 0.242 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 5.05e-01 0.0425 0.0637 0.242 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 9.76e-01 0.00288 0.0949 0.242 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0154 0.105 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0391 0.0976 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 9.71e-01 0.00364 0.0991 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0393 0.0552 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 7.11e-01 0.0307 0.0825 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00792 0.0826 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 9.08e-01 0.00871 0.0756 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 6.33e-02 -0.175 0.0938 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0292 0.0375 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 5.79e-01 0.0461 0.0831 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 4.09e-01 0.0861 0.104 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 7.44e-01 0.031 0.0947 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0575 0.0958 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0238 0.0446 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00352 0.0883 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 8.36e-01 0.0178 0.0857 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 1.06e-01 0.134 0.0825 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0244 0.0933 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 8.90e-01 -0.00702 0.0506 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0772 0.0841 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 2.35e-01 0.137 0.115 0.241 PB L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0773 0.0822 0.241 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 3.00e-01 -0.104 0.1 0.241 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 8.74e-02 -0.0974 0.0565 0.241 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 2.83e-01 0.0991 0.092 0.241 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 6.78e-01 0.0446 0.107 0.241 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0498 0.0982 0.243 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 9.16e-02 0.148 0.0871 0.243 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0659 0.094 0.243 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 9.26e-01 0.00329 0.0356 0.243 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 4.64e-01 0.0523 0.0713 0.243 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 6.44e-01 0.0426 0.0921 0.243 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00945 0.0973 0.244 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 1.24e-01 0.141 0.0912 0.244 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 6.91e-01 0.0307 0.0772 0.244 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 3.94e-01 0.0291 0.0341 0.244 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00908 0.0719 0.244 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 8.99e-01 0.0122 0.0964 0.244 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 8.45e-01 0.02 0.102 0.249 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 7.22e-01 0.0286 0.0801 0.249 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 718166 sc-eQTL 6.97e-01 -0.031 0.0796 0.249 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 738876 sc-eQTL 5.44e-01 0.0569 0.0935 0.249 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0707 0.091 0.249 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0591 0.0448 0.249 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 5.31e-02 0.146 0.0751 0.249 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 3.33e-01 0.0863 0.0889 0.249 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 349803 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0536 0.0712 0.249 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -843370 sc-eQTL 4.15e-02 0.178 0.0867 0.249 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 7.08e-01 0.0302 0.0803 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0012 0.061 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 718166 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0108 0.0862 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 738876 sc-eQTL 6.17e-02 0.162 0.0862 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0796 0.0693 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0405 0.0385 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 3.53e-01 0.0535 0.0575 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00725 0.0745 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -843370 sc-eQTL 3.59e-01 0.0711 0.0774 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0359 0.0908 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 1.02e-01 0.107 0.0652 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 718166 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0995 0.0816 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 738876 sc-eQTL 1.84e-01 0.118 0.0886 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0469 0.0582 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0313 0.0419 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 1.12e-01 0.0762 0.0477 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 5.72e-02 -0.147 0.077 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -843370 sc-eQTL 9.69e-01 -0.003 0.076 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0484 0.122 0.252 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 2.06e-01 0.133 0.105 0.252 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 2.10e-01 -0.146 0.116 0.252 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 8.90e-01 0.00615 0.0443 0.252 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 5.02e-02 0.163 0.0825 0.252 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 9.32e-01 0.00979 0.115 0.252 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 3.44e-01 0.0874 0.0922 0.247 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0301 0.0883 0.247 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 718166 sc-eQTL 8.80e-02 -0.152 0.0885 0.247 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 738876 sc-eQTL 1.38e-01 0.131 0.0876 0.247 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00916 0.0895 0.247 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0542 0.0388 0.247 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 6.23e-01 0.0322 0.0654 0.247 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 5.30e-01 0.0596 0.0948 0.247 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -843370 sc-eQTL 9.18e-01 0.0094 0.0907 0.247 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 8.07e-01 0.0239 0.0977 0.242 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0156 0.066 0.242 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 718166 sc-eQTL 5.05e-01 0.0622 0.0931 0.242 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 738876 sc-eQTL 5.07e-01 0.0614 0.0924 0.242 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 6.80e-01 0.0367 0.0889 0.242 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0303 0.0446 0.242 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 2.82e-02 0.138 0.0624 0.242 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00589 0.0788 0.242 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -843370 sc-eQTL 4.80e-02 0.164 0.0825 0.242 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0919 0.112 0.257 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0519 0.0747 0.257 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 718166 sc-eQTL 8.04e-02 -0.131 0.0746 0.257 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 738876 sc-eQTL 5.53e-01 0.0455 0.0766 0.257 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0657 0.0911 0.257 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0294 0.0628 0.257 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 3.99e-01 0.0539 0.0637 0.257 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 8.04e-03 -0.244 0.0909 0.257 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 349803 sc-eQTL 3.16e-01 0.0892 0.0887 0.257 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -843370 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0194 0.0789 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 3.03e-01 0.0997 0.0966 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 3.60e-02 0.111 0.0527 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 2.37e-01 0.0997 0.084 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 7.43e-01 0.0158 0.048 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 3.84e-01 0.0654 0.075 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 2.38e-01 0.104 0.0879 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 7.76e-01 0.0259 0.0908 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 1.70e-01 0.0561 0.0408 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 1.78e-01 -0.107 0.0791 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 1.23e-01 0.074 0.0478 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 7.68e-01 0.022 0.0744 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0261 0.0907 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0153 0.073 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 5.64e-01 0.0294 0.0508 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 718166 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0636 0.0827 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 738876 sc-eQTL 4.59e-02 0.172 0.0855 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0577 0.0569 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0443 0.039 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 3.30e-01 0.052 0.0532 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0691 0.0695 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -843370 sc-eQTL 6.34e-01 0.0348 0.073 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 5.86e-01 0.0516 0.0946 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0521 0.0623 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 718166 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0838 0.0917 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 738876 sc-eQTL 2.30e-01 0.109 0.0907 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 5.27e-01 0.0543 0.0858 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0268 0.0364 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 1.18e-01 0.0861 0.0548 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 sc-eQTL 9.99e-01 0.000162 0.0884 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -843370 sc-eQTL 3.04e-01 0.0822 0.0798 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -499239 sc-eQTL 7.07e-01 0.0286 0.0761 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 939733 sc-eQTL 6.42e-01 0.0333 0.0714 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 689472 sc-eQTL 1.46e-01 -0.131 0.09 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 638362 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0355 0.0368 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -865181 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00555 0.0763 0.244 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 939733 eQTL 0.00017 0.0696 0.0184 0.0 0.0 0.236
ENSG00000112299 VNN1 738876 pQTL 0.000756 0.135 0.0401 0.0 0.0 0.251
ENSG00000146409 SLC18B1 639592 eQTL 0.0191 0.061 0.026 0.0 0.0 0.236

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina