logo

Genes within 1Mb (chr6:133443713:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 4.30e-01 0.0717 0.0906 0.246 B L1
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 1.24e-01 0.0555 0.0359 0.246 B L1
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0717 0.0678 0.246 B L1
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 5.05e-01 0.0274 0.041 0.246 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00368 0.0634 0.246 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 5.49e-01 0.0518 0.0864 0.246 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 6.53e-01 0.0299 0.0664 0.246 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 9.09e-02 0.117 0.0687 0.246 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 6.74e-01 0.0252 0.0598 0.246 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 8.62e-01 -0.00707 0.0407 0.246 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00719 0.0547 0.246 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 1.26e-01 0.126 0.0819 0.246 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 4.52e-01 0.0499 0.0661 0.246 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00347 0.0691 0.246 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0865 0.0805 0.246 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0116 0.0276 0.246 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 5.89e-01 -0.023 0.0425 0.246 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 4.62e-01 0.0614 0.0833 0.246 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 7.37e-01 0.0338 0.1 0.25 DC L1
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 8.36e-01 0.0129 0.0624 0.25 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 708948 sc-eQTL 1.82e-01 -0.103 0.077 0.25 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 729658 sc-eQTL 4.31e-01 0.0658 0.0834 0.25 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0283 0.0893 0.25 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0651 0.0499 0.25 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 2.84e-01 0.0622 0.0579 0.25 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 4.57e-01 -0.059 0.0791 0.25 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 340585 sc-eQTL 3.07e-01 0.0737 0.0719 0.25 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -852588 sc-eQTL 5.27e-01 0.057 0.0898 0.25 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 6.84e-01 0.0287 0.0704 0.246 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 9.88e-01 -0.000697 0.0471 0.246 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 708948 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0438 0.0808 0.246 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 729658 sc-eQTL 8.46e-02 0.15 0.0864 0.246 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0546 0.0613 0.246 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0421 0.0367 0.246 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 3.37e-01 0.0499 0.0519 0.246 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0589 0.0727 0.246 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -852588 sc-eQTL 4.84e-01 0.0501 0.0715 0.246 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 7.29e-01 0.0268 0.077 0.245 NK L1
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 6.95e-01 0.028 0.0712 0.245 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 1.86e-01 -0.117 0.0883 0.245 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0342 0.0366 0.245 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0173 0.0678 0.245 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 2.39e-01 -0.106 0.0897 0.246 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 1.27e-01 0.108 0.0705 0.246 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0407 0.0856 0.246 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0195 0.0339 0.246 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 5.57e-01 0.0367 0.0625 0.246 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 9.14e-01 0.0101 0.093 0.246 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0563 0.105 0.237 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0574 0.0902 0.237 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 2.10e-01 0.12 0.0957 0.237 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00232 0.0515 0.237 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 1.07e-01 0.148 0.0912 0.237 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0703 0.09 0.237 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 1.22e-01 0.154 0.099 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 7.36e-02 0.102 0.0567 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0782 0.0859 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 8.45e-01 0.0103 0.0527 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 8.99e-01 0.0116 0.0912 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 4.50e-01 0.0719 0.0949 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0845 0.095 0.246 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 1.15e-02 0.173 0.0679 0.246 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 1.29e-01 0.136 0.0896 0.246 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 9.65e-01 0.00189 0.0434 0.246 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 2.45e-02 0.178 0.0787 0.246 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 2.72e-01 0.0995 0.0903 0.246 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 6.31e-01 0.0437 0.0907 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 2.70e-01 0.0481 0.0435 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 2.31e-02 -0.192 0.0837 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 2.01e-01 0.0616 0.048 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 6.70e-01 0.0322 0.0754 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0653 0.093 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0012 0.0966 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 4.96e-01 0.035 0.0513 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 6.57e-01 0.0419 0.0942 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 2.01e-01 0.0637 0.0497 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000388 0.0881 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 6.08e-01 0.0488 0.0951 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 4.28e-02 0.195 0.0956 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 4.51e-01 0.0723 0.0958 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 9.88e-01 0.00151 0.0968 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 9.95e-01 0.000255 0.0447 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 7.60e-01 0.0237 0.0775 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 2.15e-01 0.112 0.0898 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0976 0.0761 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 5.89e-02 0.141 0.0743 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 3.53e-01 0.0644 0.0693 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 9.91e-01 0.000491 0.045 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 5.74e-01 0.031 0.0551 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 1.20e-01 0.135 0.0862 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 7.63e-01 0.0248 0.082 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 6.97e-01 0.0322 0.0826 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 4.09e-02 -0.166 0.0806 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0446 0.0421 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 6.22e-01 0.0292 0.059 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 3.41e-01 0.0931 0.0976 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 6.14e-01 0.0479 0.0946 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 9.17e-01 0.00993 0.0948 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 2.17e-01 0.112 0.0906 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0259 0.0373 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 9.10e-01 0.00726 0.0641 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 1.19e-01 0.144 0.0922 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 4.35e-01 0.0667 0.0852 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00607 0.0798 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0668 0.0906 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 8.90e-01 -0.00673 0.0485 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 8.57e-02 0.14 0.0814 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0532 0.094 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 6.24e-01 0.0444 0.0906 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 4.80e-01 0.0683 0.0964 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 2.06e-01 -0.105 0.083 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0256 0.0477 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0413 0.0598 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 2.26e-01 0.116 0.0954 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0896 0.0993 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 1.74e-01 0.125 0.0917 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0623 0.0913 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0482 0.0444 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 6.05e-02 0.138 0.0731 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0119 0.0977 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0124 0.0931 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 2.27e-01 -0.123 0.101 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 3.17e-01 0.101 0.101 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 4.84e-02 0.107 0.0538 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00271 0.0891 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 7.64e-02 0.182 0.102 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0586 0.0953 0.245 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 5.39e-01 0.0557 0.0905 0.245 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 9.08e-01 0.0107 0.0921 0.245 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 4.02e-02 -0.0926 0.0449 0.245 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 5.68e-01 0.0364 0.0637 0.245 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00902 0.095 0.245 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00945 0.105 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0512 0.0975 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00619 0.0991 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0293 0.0552 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 6.50e-01 0.0375 0.0825 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00835 0.0827 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 8.99e-01 0.00962 0.0757 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 7.37e-02 -0.169 0.0939 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0254 0.0375 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 5.35e-01 0.0517 0.0831 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 3.94e-01 0.0889 0.104 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 7.74e-01 0.0273 0.0948 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0735 0.0958 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0227 0.0447 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00611 0.0884 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 9.12e-01 0.00946 0.0857 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 1.19e-01 0.129 0.0825 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0363 0.0933 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00269 0.0506 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 3.25e-01 -0.083 0.0841 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 2.35e-01 0.137 0.115 0.241 PB L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0773 0.0822 0.241 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 3.00e-01 -0.104 0.1 0.241 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 8.74e-02 -0.0974 0.0565 0.241 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 2.83e-01 0.0991 0.092 0.241 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 6.78e-01 0.0446 0.107 0.241 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0526 0.098 0.246 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 9.08e-02 0.148 0.087 0.246 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0581 0.0939 0.246 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 8.94e-01 0.00472 0.0355 0.246 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 5.68e-01 0.0407 0.0712 0.246 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 6.74e-01 0.0387 0.0919 0.246 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00936 0.0972 0.246 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 1.70e-01 0.126 0.0913 0.246 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 6.07e-01 0.0397 0.0771 0.246 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 3.06e-01 0.0349 0.034 0.246 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00431 0.0719 0.246 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 9.82e-01 0.00223 0.0964 0.246 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 7.41e-01 0.0338 0.102 0.251 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 7.33e-01 0.0273 0.0801 0.251 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 708948 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0383 0.0795 0.251 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 729658 sc-eQTL 4.49e-01 0.0708 0.0934 0.251 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0624 0.091 0.251 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0555 0.0448 0.251 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 5.24e-02 0.146 0.075 0.251 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 3.55e-01 0.0824 0.0889 0.251 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 340585 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0573 0.0711 0.251 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -852588 sc-eQTL 5.78e-02 0.166 0.0868 0.251 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 6.60e-01 0.0354 0.0803 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0102 0.0609 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 708948 sc-eQTL 9.43e-01 0.00618 0.0861 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 729658 sc-eQTL 7.49e-02 0.154 0.0862 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0809 0.0692 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0333 0.0385 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 3.71e-01 0.0515 0.0574 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 9.72e-01 0.0026 0.0744 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -852588 sc-eQTL 3.41e-01 0.0737 0.0773 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0113 0.0907 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 1.30e-01 0.099 0.0651 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 708948 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0864 0.0816 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 729658 sc-eQTL 1.53e-01 0.127 0.0884 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0296 0.0581 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0281 0.0418 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 1.29e-01 0.0725 0.0477 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 7.10e-02 -0.14 0.0769 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -852588 sc-eQTL 9.65e-01 -0.0033 0.0758 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0532 0.122 0.255 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 2.19e-01 0.129 0.104 0.255 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 1.98e-01 -0.149 0.115 0.255 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 9.83e-01 0.00093 0.0442 0.255 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 7.02e-02 0.15 0.0824 0.255 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00563 0.114 0.255 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 3.63e-01 0.084 0.092 0.249 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0317 0.088 0.249 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 708948 sc-eQTL 1.44e-01 -0.13 0.0884 0.249 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 729658 sc-eQTL 1.52e-01 0.126 0.0875 0.249 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0186 0.0893 0.249 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0512 0.0387 0.249 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 6.48e-01 0.0298 0.0653 0.249 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 6.53e-01 0.0426 0.0946 0.249 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -852588 sc-eQTL 8.68e-01 0.0151 0.0905 0.249 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 8.96e-01 0.0127 0.0976 0.244 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0184 0.066 0.244 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 708948 sc-eQTL 4.70e-01 0.0674 0.093 0.244 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 729658 sc-eQTL 4.40e-01 0.0714 0.0923 0.244 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 6.79e-01 0.0368 0.0889 0.244 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0255 0.0446 0.244 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 2.63e-02 0.139 0.0623 0.244 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 9.89e-01 0.00104 0.0788 0.244 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -852588 sc-eQTL 4.69e-02 0.165 0.0824 0.244 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0892 0.112 0.26 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0512 0.0747 0.26 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 708948 sc-eQTL 7.00e-02 -0.136 0.0745 0.26 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 729658 sc-eQTL 4.44e-01 0.0587 0.0765 0.26 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0557 0.0911 0.26 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0325 0.0628 0.26 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 3.70e-01 0.0572 0.0637 0.26 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 1.04e-02 -0.236 0.091 0.26 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 340585 sc-eQTL 3.76e-01 0.0789 0.0888 0.26 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -852588 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0307 0.0789 0.26 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 2.69e-01 0.107 0.0965 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 2.81e-02 0.117 0.0527 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 2.69e-01 0.0932 0.084 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 7.62e-01 0.0145 0.048 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 3.39e-01 0.0717 0.0749 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 2.58e-01 0.0996 0.0879 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 6.58e-01 0.0403 0.0909 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 1.62e-01 0.0572 0.0408 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 1.28e-01 -0.121 0.0791 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 1.22e-01 0.0742 0.0479 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 9.20e-01 0.00751 0.0745 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0295 0.0908 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 9.83e-01 0.00152 0.073 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 6.88e-01 0.0204 0.0507 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 708948 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0453 0.0827 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 729658 sc-eQTL 4.50e-02 0.172 0.0854 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0509 0.0569 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0388 0.039 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 3.56e-01 0.0492 0.0532 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0593 0.0695 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -852588 sc-eQTL 6.10e-01 0.0373 0.0729 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 6.48e-01 0.0432 0.0945 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0552 0.0622 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 708948 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0721 0.0916 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 729658 sc-eQTL 1.87e-01 0.12 0.0905 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 5.19e-01 0.0553 0.0856 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 5.10e-01 -0.024 0.0363 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 1.08e-01 0.0883 0.0547 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00363 0.0883 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -852588 sc-eQTL 2.92e-01 0.0841 0.0796 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -508457 sc-eQTL 7.14e-01 0.0279 0.0761 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 930515 sc-eQTL 6.65e-01 0.031 0.0715 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 680254 sc-eQTL 1.34e-01 -0.135 0.09 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 629144 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0337 0.0369 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -874399 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00503 0.0763 0.246 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 930515 eQTL 0.000139 0.0705 0.0184 0.0 0.0 0.236
ENSG00000112299 VNN1 729658 pQTL 0.000655 0.138 0.0403 0.0 0.0 0.25
ENSG00000146409 SLC18B1 630374 eQTL 0.0202 0.0605 0.026 0.0 0.0 0.236

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina