logo

Genes within 1Mb (chr6:133442161:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 8.85e-01 0.0219 0.151 0.079 B L1
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 1.00e+00 -6.77e-06 0.0601 0.079 B L1
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 7.65e-01 0.0338 0.113 0.079 B L1
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 7.29e-02 -0.122 0.0678 0.079 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0726 0.105 0.079 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 6.56e-01 0.064 0.144 0.079 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 8.74e-03 -0.285 0.108 0.079 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 1.22e-01 -0.176 0.113 0.079 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 3.24e-01 0.0974 0.0985 0.079 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0105 0.0671 0.079 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0519 0.0901 0.079 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0607 0.136 0.079 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 1.13e-01 -0.173 0.108 0.079 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 4.72e-02 -0.225 0.113 0.079 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 1.57e-01 0.188 0.132 0.079 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0381 0.0453 0.079 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 4.03e-01 0.0585 0.0698 0.079 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 5.15e-01 0.0894 0.137 0.079 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 6.83e-01 0.0675 0.165 0.083 DC L1
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0682 0.102 0.083 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 707396 sc-eQTL 4.34e-02 0.256 0.126 0.083 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 728106 sc-eQTL 5.04e-01 0.0918 0.137 0.083 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 9.01e-01 0.0182 0.147 0.083 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 8.86e-01 0.0118 0.0823 0.083 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 3.94e-02 -0.196 0.0945 0.083 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0907 0.13 0.083 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 339033 sc-eQTL 6.60e-01 0.0522 0.119 0.083 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -854140 sc-eQTL 7.34e-01 0.0503 0.148 0.083 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 7.50e-01 -0.037 0.116 0.079 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 3.78e-01 0.0683 0.0773 0.079 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 707396 sc-eQTL 1.86e-02 -0.311 0.131 0.079 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 728106 sc-eQTL 9.25e-01 0.0134 0.143 0.079 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 1.00e-01 0.166 0.1 0.079 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 6.43e-01 0.0281 0.0605 0.079 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0683 0.0853 0.079 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 9.31e-01 0.0103 0.12 0.079 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -854140 sc-eQTL 2.12e-01 -0.147 0.117 0.079 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 5.94e-01 0.0681 0.128 0.079 NK L1
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 9.74e-01 0.00385 0.118 0.079 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 9.99e-01 0.000122 0.147 0.079 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0634 0.0607 0.079 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 3.16e-01 -0.113 0.112 0.079 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 9.26e-01 0.0141 0.151 0.079 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0662 0.119 0.079 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 2.56e-02 0.319 0.142 0.079 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0293 0.0569 0.079 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 5.93e-01 -0.056 0.105 0.079 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 2.26e-01 -0.189 0.155 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 9.92e-02 0.299 0.18 0.082 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0485 0.155 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 4.27e-01 0.131 0.165 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 8.99e-01 0.0113 0.0887 0.082 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 9.99e-01 0.000149 0.158 0.082 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 3.49e-01 0.145 0.155 0.082 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 9.95e-01 0.000982 0.166 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0396 0.0954 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 6.91e-01 0.0572 0.144 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 1.14e-01 -0.139 0.0875 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0132 0.152 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0342 0.158 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 1.81e-01 0.218 0.162 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 2.89e-01 -0.125 0.117 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 2.08e-01 -0.194 0.153 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 3.59e-01 -0.068 0.074 0.08 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 9.90e-02 -0.224 0.135 0.08 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 8.88e-01 0.0219 0.155 0.08 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0906 0.151 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 7.68e-01 0.0215 0.0726 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 4.47e-01 0.107 0.141 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 6.42e-02 -0.148 0.0796 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 2.65e-01 -0.14 0.125 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 6.37e-03 0.419 0.152 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 5.25e-01 0.102 0.161 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 1.34e-01 0.128 0.085 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 3.54e-01 -0.146 0.157 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 1.73e-01 -0.113 0.0827 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 1.27e-01 0.224 0.146 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 1.05e-01 -0.257 0.158 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 6.42e-01 0.0752 0.161 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 1.38e-01 -0.238 0.159 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 3.32e-01 0.157 0.161 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 6.88e-01 0.03 0.0747 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 9.81e-01 0.00313 0.129 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 9.43e-01 0.0107 0.151 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 2.12e-01 -0.157 0.125 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 4.06e-02 -0.252 0.122 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0155 0.114 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0217 0.0741 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00468 0.0907 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 1.29e-01 -0.216 0.142 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 2.61e-02 -0.302 0.135 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 8.21e-01 0.0311 0.137 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 5.27e-04 0.463 0.132 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0155 0.0702 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 1.87e-02 -0.23 0.097 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 2.42e-02 0.365 0.161 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 4.51e-01 0.118 0.156 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 6.32e-01 0.0749 0.156 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 1.43e-01 -0.219 0.149 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 5.43e-01 0.0374 0.0615 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 1.67e-01 -0.146 0.105 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0195 0.153 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 4.29e-01 -0.11 0.139 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 3.59e-02 -0.273 0.129 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 3.97e-01 0.126 0.148 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0105 0.0793 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 1.80e-01 -0.179 0.133 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 3.48e-01 0.144 0.153 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0678 0.147 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0738 0.156 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 7.17e-01 0.049 0.135 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 4.18e-01 0.0627 0.0772 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 7.66e-01 0.0289 0.097 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 3.30e-01 -0.151 0.155 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0284 0.179 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 5.42e-01 -0.101 0.166 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 4.24e-01 0.132 0.164 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 1.68e-01 -0.111 0.0799 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 9.69e-01 0.00514 0.133 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00433 0.176 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 5.31e-01 0.0949 0.151 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 8.20e-01 0.0376 0.165 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 1.23e-01 0.253 0.163 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0219 0.0884 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 7.66e-01 0.0432 0.145 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 6.72e-01 0.0707 0.167 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 2.48e-01 -0.185 0.16 0.078 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 9.04e-02 -0.257 0.151 0.078 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 4.39e-01 0.12 0.155 0.078 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0126 0.0762 0.078 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000394 0.107 0.078 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 2.09e-01 -0.201 0.159 0.078 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 3.52e-01 -0.152 0.163 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0129 0.152 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0854 0.154 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 5.82e-01 0.0474 0.0858 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 2.29e-01 -0.154 0.128 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 3.49e-01 0.128 0.136 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 6.71e-01 -0.053 0.125 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0081 0.156 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0645 0.0617 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 4.21e-01 -0.11 0.137 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 2.42e-01 -0.198 0.169 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 6.13e-01 0.0782 0.154 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 2.59e-01 0.176 0.156 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 4.34e-01 -0.057 0.0726 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 4.29e-02 0.29 0.142 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0132 0.142 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 9.31e-01 0.0119 0.138 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0682 0.155 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0227 0.084 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 7.92e-01 0.037 0.14 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 5.13e-02 -0.385 0.196 0.078 PB L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0388 0.142 0.078 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 4.65e-01 0.127 0.173 0.078 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 5.25e-01 0.0626 0.0982 0.078 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 1.35e-01 -0.237 0.157 0.078 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 3.92e-01 -0.158 0.184 0.078 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 5.05e-01 0.104 0.156 0.08 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 8.42e-01 0.0279 0.139 0.08 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 2.81e-01 0.161 0.149 0.08 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0613 0.0564 0.08 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0353 0.113 0.08 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0483 0.146 0.08 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0966 0.16 0.079 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 3.82e-01 -0.132 0.151 0.079 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 6.42e-01 0.0591 0.127 0.079 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00226 0.0562 0.079 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 9.07e-01 0.0138 0.118 0.079 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0232 0.159 0.079 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 9.03e-01 0.0207 0.169 0.078 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 9.34e-01 0.011 0.133 0.078 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 707396 sc-eQTL 8.55e-01 0.024 0.132 0.078 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 728106 sc-eQTL 8.54e-01 0.0286 0.155 0.078 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 1.78e-01 0.203 0.15 0.078 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 2.06e-01 0.0941 0.0741 0.078 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 1.22e-01 -0.194 0.125 0.078 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0475 0.147 0.078 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 339033 sc-eQTL 4.75e-01 0.0843 0.118 0.078 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -854140 sc-eQTL 3.01e-01 -0.15 0.145 0.078 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0167 0.131 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 5.98e-01 0.0524 0.0993 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 707396 sc-eQTL 3.68e-02 -0.292 0.139 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 728106 sc-eQTL 2.93e-01 -0.149 0.141 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 3.46e-02 0.238 0.112 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 9.52e-01 0.00383 0.0629 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 2.60e-01 -0.106 0.0935 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0903 0.121 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -854140 sc-eQTL 1.60e-01 -0.177 0.126 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0512 0.149 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 4.95e-01 0.0737 0.108 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 707396 sc-eQTL 2.67e-02 -0.297 0.133 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 728106 sc-eQTL 3.94e-01 0.125 0.146 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 7.06e-01 0.0362 0.0958 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 7.00e-01 0.0266 0.069 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0234 0.0789 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 1.24e-01 0.196 0.127 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -854140 sc-eQTL 3.19e-01 -0.124 0.125 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 7.40e-02 0.384 0.213 0.067 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 9.14e-03 0.478 0.181 0.067 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 9.66e-01 0.00866 0.205 0.067 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0491 0.078 0.067 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 1.36e-01 0.219 0.146 0.067 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 1.51e-01 0.289 0.2 0.067 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 4.40e-01 -0.118 0.152 0.082 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 7.42e-01 -0.048 0.146 0.082 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 707396 sc-eQTL 2.58e-01 -0.166 0.147 0.082 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 728106 sc-eQTL 3.61e-01 0.133 0.145 0.082 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 3.85e-01 0.129 0.148 0.082 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 7.54e-01 0.0202 0.0643 0.082 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 1.97e-01 -0.139 0.108 0.082 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 2.59e-01 0.177 0.156 0.082 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -854140 sc-eQTL 9.45e-01 0.0104 0.15 0.082 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 8.36e-01 -0.033 0.16 0.081 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 3.41e-01 -0.103 0.108 0.081 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 707396 sc-eQTL 3.00e-01 -0.158 0.152 0.081 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 728106 sc-eQTL 5.74e-01 0.0852 0.151 0.081 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 3.58e-01 0.134 0.145 0.081 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 9.30e-01 0.00647 0.073 0.081 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 4.19e-01 0.0834 0.103 0.081 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 3.08e-01 -0.132 0.129 0.081 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -854140 sc-eQTL 9.18e-01 0.014 0.136 0.081 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0619 0.189 0.071 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 8.87e-01 0.018 0.126 0.071 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 707396 sc-eQTL 9.50e-02 0.211 0.126 0.071 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 728106 sc-eQTL 2.55e-01 0.147 0.128 0.071 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0798 0.153 0.071 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 6.28e-01 0.0513 0.106 0.071 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0233 0.107 0.071 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 7.01e-01 0.0602 0.157 0.071 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 339033 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0465 0.15 0.071 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -854140 sc-eQTL 1.32e-01 0.2 0.132 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 3.11e-01 0.162 0.16 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0743 0.0882 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0728 0.14 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0623 0.0795 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 9.95e-01 0.000798 0.124 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 3.29e-01 0.142 0.146 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0169 0.149 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 5.80e-01 0.0371 0.0669 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 7.15e-01 0.0475 0.13 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 3.79e-02 -0.163 0.0779 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0466 0.122 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 2.41e-01 0.174 0.148 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0161 0.12 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 2.79e-01 0.0902 0.083 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 707396 sc-eQTL 2.29e-02 -0.307 0.134 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 728106 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0158 0.142 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 9.24e-02 0.157 0.093 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 8.09e-01 0.0155 0.0642 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0777 0.0873 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 9.69e-01 0.00445 0.114 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -854140 sc-eQTL 1.27e-01 -0.183 0.119 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 4.63e-01 -0.115 0.156 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 1.69e-01 -0.142 0.103 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 707396 sc-eQTL 2.01e-01 -0.194 0.151 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 728106 sc-eQTL 7.82e-01 0.0418 0.15 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 2.67e-01 0.157 0.141 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 8.18e-01 0.0139 0.0602 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0397 0.0911 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 628822 sc-eQTL 9.25e-01 0.0138 0.146 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -854140 sc-eQTL 8.80e-01 -0.02 0.132 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -510009 sc-eQTL 5.37e-01 0.0781 0.126 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 928963 sc-eQTL 8.38e-01 0.0243 0.119 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 678702 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000504 0.15 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 627592 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0587 0.0611 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -875951 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0776 0.126 0.078 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118515 \N -875951 2.76e-07 1.42e-07 6.42e-08 2.09e-07 1.03e-07 8.45e-08 1.67e-07 5.43e-08 1.5e-07 6.4e-08 1.67e-07 1.05e-07 1.71e-07 7.64e-08 5.82e-08 7.97e-08 4.45e-08 1.56e-07 7.09e-08 5.07e-08 1.22e-07 1.26e-07 1.5e-07 2.83e-08 1.65e-07 1.23e-07 1.17e-07 1.06e-07 1.24e-07 1.03e-07 1.08e-07 3.84e-08 3.13e-08 8.89e-08 4.92e-08 2.74e-08 3.91e-08 8.2e-08 6.3e-08 5.13e-08 5.44e-08 1.46e-07 3.99e-08 1.76e-08 3.4e-08 1.65e-08 8.74e-08 2.05e-09 4.83e-08