logo

Genes within 1Mb (chr6:133441859:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0417 0.0955 0.271 B L1
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 9.03e-01 0.00466 0.0381 0.271 B L1
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 4.74e-01 0.0512 0.0715 0.271 B L1
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 7.06e-02 0.078 0.0429 0.271 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0908 0.0664 0.271 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 2.30e-01 0.109 0.0907 0.271 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 2.25e-01 0.0879 0.0722 0.271 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 4.18e-01 -0.061 0.0752 0.271 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0354 0.0652 0.271 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 1.87e-01 0.0586 0.0442 0.271 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 1.95e-02 -0.139 0.0589 0.271 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 8.06e-01 0.022 0.0898 0.271 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 9.51e-01 0.00437 0.0708 0.271 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 3.10e-02 0.159 0.0731 0.271 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 3.72e-01 0.077 0.0861 0.271 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 1.74e-02 0.0697 0.0291 0.271 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 7.78e-02 -0.0799 0.0451 0.271 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 1.42e-01 0.131 0.0887 0.271 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00828 0.107 0.264 DC L1
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0148 0.0663 0.264 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 707094 sc-eQTL 3.07e-01 0.084 0.082 0.264 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 727804 sc-eQTL 4.86e-01 0.0618 0.0886 0.264 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 6.31e-01 0.0456 0.0949 0.264 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 2.15e-01 0.0659 0.053 0.264 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0657 0.0616 0.264 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 1.67e-01 -0.116 0.0838 0.264 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 338731 sc-eQTL 7.08e-01 0.0287 0.0766 0.264 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -854442 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0113 0.0955 0.264 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 9.43e-01 0.00543 0.0765 0.271 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 4.75e-01 0.0366 0.0511 0.271 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 707094 sc-eQTL 5.04e-02 0.171 0.087 0.271 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 727804 sc-eQTL 7.13e-02 -0.17 0.0937 0.271 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 3.24e-01 0.0658 0.0665 0.271 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 9.74e-01 0.0013 0.04 0.271 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 1.34e-01 -0.0844 0.0561 0.271 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 5.64e-01 0.0457 0.079 0.271 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -854442 sc-eQTL 1.41e-01 -0.114 0.0773 0.271 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0247 0.0837 0.273 NK L1
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 4.23e-02 0.157 0.0766 0.273 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 9.21e-01 0.00958 0.0963 0.273 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 3.83e-01 0.0348 0.0398 0.273 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0567 0.0736 0.273 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 6.79e-01 0.0396 0.0956 0.271 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 8.36e-01 0.0156 0.0752 0.271 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0573 0.0909 0.271 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00334 0.0361 0.271 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 1.34e-01 -0.0994 0.066 0.271 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 5.77e-01 0.0551 0.0987 0.271 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 6.12e-02 0.203 0.108 0.27 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 2.55e-01 0.106 0.0927 0.27 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 5.76e-01 0.0554 0.099 0.27 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 5.48e-01 0.0319 0.053 0.27 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 7.87e-02 -0.166 0.0938 0.27 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 1.97e-01 0.12 0.0925 0.27 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 2.08e-01 -0.133 0.106 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 4.63e-01 0.0447 0.0609 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 1.38e-01 0.136 0.0913 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 1.63e-01 0.0783 0.0559 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 1.12e-02 -0.245 0.0957 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0133 0.101 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0513 0.103 0.272 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 9.71e-01 0.00269 0.0747 0.272 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0652 0.0977 0.272 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 1.02e-02 0.12 0.0464 0.272 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0783 0.0862 0.272 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 1.77e-01 -0.132 0.0979 0.272 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 3.64e-01 0.0857 0.0943 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0167 0.0454 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 4.09e-01 0.0728 0.0881 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 6.02e-01 0.0262 0.0502 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0645 0.0785 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 2.87e-01 0.103 0.0967 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 9.87e-01 -0.0017 0.101 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 4.35e-01 0.042 0.0538 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 5.50e-01 0.0592 0.0988 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 4.30e-01 0.0413 0.0523 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 9.04e-02 -0.156 0.0918 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 6.48e-02 0.184 0.099 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 2.53e-01 -0.116 0.101 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0678 0.1 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 7.33e-01 0.0346 0.101 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 5.19e-01 0.0303 0.0468 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 1.13e-01 -0.129 0.0807 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00274 0.0945 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 1.43e-01 0.12 0.082 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 1.53e-01 -0.116 0.0804 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0911 0.0746 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 4.55e-01 0.0363 0.0485 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 5.97e-03 -0.162 0.0584 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 5.67e-01 0.0535 0.0934 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 7.26e-02 0.162 0.0895 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 5.61e-01 0.0529 0.0908 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 3.27e-01 0.0877 0.0893 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 4.00e-02 0.095 0.046 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0672 0.0648 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 9.62e-01 0.00516 0.108 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 1.86e-01 0.135 0.102 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 6.42e-01 0.0478 0.103 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 6.73e-01 0.0417 0.0985 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 7.93e-01 0.0106 0.0404 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 9.29e-02 -0.116 0.069 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 9.52e-01 0.00611 0.1 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 1.23e-01 0.138 0.0891 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 2.90e-02 0.182 0.0829 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 3.49e-01 0.0892 0.095 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 7.40e-01 0.0169 0.0509 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 4.34e-03 -0.243 0.0844 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 5.99e-01 0.0519 0.0987 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0712 0.0941 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 8.01e-02 0.175 0.0997 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 8.50e-01 0.0165 0.0867 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 8.66e-02 0.0848 0.0493 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 1.76e-02 -0.147 0.0615 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 6.54e-02 0.183 0.0988 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0639 0.107 0.275 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000663 0.0995 0.275 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 4.62e-01 0.0727 0.0986 0.275 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 4.33e-01 0.0378 0.0481 0.275 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 4.00e-03 -0.227 0.078 0.275 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 8.61e-01 0.0184 0.105 0.275 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 8.06e-02 -0.173 0.0984 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 2.87e-01 -0.115 0.108 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 2.55e-01 -0.123 0.107 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0292 0.0579 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0676 0.0947 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00594 0.109 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0619 0.101 0.273 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 4.21e-01 0.0776 0.0962 0.273 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 6.60e-01 0.0431 0.0979 0.273 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 7.08e-01 0.0181 0.0482 0.273 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0524 0.0677 0.273 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 9.90e-01 0.00128 0.101 0.273 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 2.77e-01 0.117 0.107 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 6.22e-01 -0.049 0.0994 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0978 0.101 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 4.88e-01 0.039 0.0562 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 7.54e-01 0.0264 0.0841 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000356 0.09 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 6.05e-02 0.154 0.0817 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 4.83e-01 0.0723 0.103 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 3.15e-01 0.0411 0.0408 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 5.64e-02 -0.172 0.0898 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 8.86e-01 0.016 0.111 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 3.71e-01 0.0905 0.101 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0225 0.102 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 3.14e-01 0.048 0.0475 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 4.74e-01 0.0674 0.094 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 4.86e-01 -0.064 0.0919 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 8.65e-01 0.0152 0.0891 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0451 0.1 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 6.18e-01 0.0271 0.0543 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0891 0.0902 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0745 0.119 0.274 PB L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 9.20e-01 0.00857 0.085 0.274 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 1.51e-01 0.149 0.103 0.274 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 8.16e-01 0.0138 0.0589 0.274 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 1.77e-01 -0.128 0.0945 0.274 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 7.51e-01 0.0351 0.11 0.274 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 5.85e-01 0.0547 0.0999 0.27 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0836 0.089 0.27 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0112 0.0957 0.27 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0447 0.0361 0.27 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 4.09e-01 -0.06 0.0725 0.27 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 6.58e-01 0.0415 0.0937 0.27 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0628 0.107 0.271 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 8.97e-02 -0.171 0.1 0.271 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 3.73e-01 0.0756 0.0846 0.271 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0167 0.0375 0.271 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0367 0.079 0.271 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0183 0.106 0.271 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0138 0.108 0.256 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0141 0.0845 0.256 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 707094 sc-eQTL 4.10e-01 0.0691 0.0838 0.256 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 727804 sc-eQTL 4.23e-01 0.0791 0.0986 0.256 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0452 0.0961 0.256 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 1.45e-01 0.0691 0.0472 0.256 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 2.92e-02 -0.174 0.079 0.256 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 2.76e-01 -0.102 0.0937 0.256 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 338731 sc-eQTL 1.49e-01 0.108 0.0748 0.256 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -854442 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0898 0.0923 0.256 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 6.30e-01 -0.042 0.0869 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 2.86e-01 0.0703 0.0658 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 707094 sc-eQTL 1.83e-01 0.124 0.0929 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 727804 sc-eQTL 1.36e-01 -0.14 0.0936 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 2.84e-01 0.0807 0.075 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 7.45e-01 0.0136 0.0418 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 2.10e-01 -0.078 0.0621 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 9.76e-01 0.00246 0.0806 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -854442 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0716 0.0838 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 3.53e-01 0.0909 0.0977 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0407 0.0706 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 707094 sc-eQTL 2.08e-02 0.203 0.0872 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 727804 sc-eQTL 7.13e-02 -0.172 0.0951 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 3.68e-01 0.0566 0.0627 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 8.75e-01 0.00713 0.0452 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 9.04e-02 -0.0874 0.0514 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 8.89e-02 0.142 0.0831 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -854442 sc-eQTL 1.03e-01 -0.133 0.0813 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 7.19e-01 0.0476 0.132 0.255 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 7.83e-01 0.0315 0.114 0.255 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0978 0.126 0.255 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 7.57e-01 0.0149 0.048 0.255 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 5.19e-03 -0.25 0.0881 0.255 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 8.98e-01 0.0159 0.124 0.255 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 8.78e-01 0.0154 0.1 0.267 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0195 0.0957 0.267 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 707094 sc-eQTL 7.15e-02 0.174 0.0959 0.267 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 727804 sc-eQTL 8.78e-02 -0.163 0.0949 0.267 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0754 0.097 0.267 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 8.71e-01 -0.00689 0.0423 0.267 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0319 0.0709 0.267 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 2.07e-02 -0.237 0.102 0.267 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -854442 sc-eQTL 2.13e-01 -0.122 0.098 0.267 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00948 0.105 0.269 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 5.32e-01 0.0442 0.0707 0.269 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 707094 sc-eQTL 8.18e-01 0.0231 0.0998 0.269 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 727804 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0897 0.0989 0.269 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0687 0.0952 0.269 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 9.96e-01 0.000224 0.0478 0.269 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0916 0.0673 0.269 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 9.07e-01 0.00984 0.0844 0.269 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -854442 sc-eQTL 3.77e-01 -0.079 0.0891 0.269 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 6.82e-01 0.0485 0.118 0.249 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 1.20e-01 0.122 0.0781 0.249 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 707094 sc-eQTL 4.18e-01 0.0641 0.079 0.249 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 727804 sc-eQTL 4.51e-01 0.0608 0.0805 0.249 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 2.55e-03 0.286 0.0932 0.249 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 6.72e-01 0.0281 0.0661 0.249 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0244 0.0671 0.249 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0398 0.0978 0.249 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 338731 sc-eQTL 7.41e-01 0.031 0.0936 0.249 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -854442 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0122 0.083 0.249 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 2.36e-01 -0.122 0.102 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 4.80e-01 0.0399 0.0564 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 8.26e-01 0.0196 0.0894 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 1.47e-01 0.0737 0.0507 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 1.71e-02 -0.189 0.0785 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0441 0.0934 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 8.88e-01 0.0133 0.0948 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 8.41e-01 -0.00857 0.0427 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 3.79e-01 0.073 0.0828 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 4.54e-01 0.0375 0.0501 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 1.55e-01 -0.11 0.0773 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 1.31e-01 0.143 0.0941 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 9.75e-01 0.00252 0.079 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 4.67e-01 0.04 0.0549 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 707094 sc-eQTL 6.65e-02 0.164 0.0888 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 727804 sc-eQTL 5.98e-02 -0.175 0.0926 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 3.97e-01 0.0523 0.0616 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 8.16e-01 0.00985 0.0423 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 1.18e-01 -0.0899 0.0573 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 4.40e-01 0.0581 0.0752 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -854442 sc-eQTL 2.65e-01 -0.088 0.0788 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 5.43e-01 0.0623 0.102 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 4.82e-01 0.0476 0.0675 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 707094 sc-eQTL 9.12e-02 0.168 0.0987 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 727804 sc-eQTL 3.51e-01 -0.092 0.0983 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0751 0.0927 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 7.65e-01 0.0118 0.0394 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0632 0.0595 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 628520 sc-eQTL 1.24e-01 -0.147 0.0951 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -854442 sc-eQTL 2.78e-02 -0.189 0.0855 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -510311 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0408 0.0832 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 928661 sc-eQTL 3.09e-02 0.168 0.0773 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 678400 sc-eQTL 6.50e-01 0.0449 0.0989 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 627290 sc-eQTL 3.37e-01 0.0388 0.0403 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -876253 sc-eQTL 1.08e-01 -0.134 0.0829 0.274 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 727804 pQTL 0.00197 -0.124 0.0399 0.0 0.0 0.234

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina