logo

Genes within 1Mb (chr6:133441284:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 8.61e-01 -0.027 0.154 0.079 B L1
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 6.38e-01 0.0289 0.0613 0.079 B L1
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 2.81e-01 0.124 0.115 0.079 B L1
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0501 0.0696 0.079 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0239 0.107 0.079 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 5.97e-02 -0.275 0.145 0.079 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 3.67e-01 -0.104 0.115 0.079 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 7.08e-01 -0.045 0.12 0.079 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 9.49e-01 0.0066 0.104 0.079 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 8.20e-02 -0.122 0.07 0.079 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 1.83e-01 0.126 0.0944 0.079 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 1.25e-01 -0.219 0.142 0.079 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 7.75e-01 0.033 0.115 0.079 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0545 0.12 0.079 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 2.53e-01 -0.161 0.14 0.079 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0229 0.0481 0.079 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 5.36e-01 0.0459 0.074 0.079 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 5.02e-02 -0.284 0.144 0.079 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 4.16e-01 -0.139 0.17 0.083 DC L1
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 9.51e-01 0.00648 0.106 0.083 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 706519 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0995 0.131 0.083 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 727229 sc-eQTL 4.40e-01 -0.11 0.142 0.083 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0443 0.152 0.083 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0228 0.0851 0.083 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 8.42e-01 0.0197 0.0988 0.083 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 1.56e-01 0.191 0.134 0.083 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 338156 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00406 0.123 0.083 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -855017 sc-eQTL 3.73e-01 -0.136 0.153 0.083 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 8.54e-01 0.0229 0.124 0.079 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0382 0.0831 0.079 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 706519 sc-eQTL 4.19e-01 0.115 0.142 0.079 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 727229 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0689 0.153 0.079 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0499 0.108 0.079 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0306 0.0649 0.079 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0622 0.0916 0.079 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 8.41e-02 0.221 0.128 0.079 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -855017 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0822 0.126 0.079 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00356 0.131 0.079 NK L1
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 1.38e-01 -0.18 0.121 0.079 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 3.62e-01 0.138 0.151 0.079 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0294 0.0625 0.079 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00533 0.116 0.079 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 7.62e-01 0.049 0.161 0.079 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 3.73e-01 -0.113 0.127 0.079 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0951 0.153 0.079 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0722 0.0607 0.079 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0661 0.112 0.079 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0668 0.167 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 3.97e-02 -0.367 0.177 0.087 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0395 0.154 0.087 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 6.52e-02 -0.3 0.162 0.087 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 3.25e-01 0.0862 0.0873 0.087 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 2.19e-01 -0.192 0.155 0.087 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 4.47e-01 0.117 0.153 0.087 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 8.96e-01 0.0232 0.177 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 9.45e-01 0.00698 0.102 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 1.11e-01 0.244 0.152 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0359 0.0939 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 9.26e-01 0.0151 0.162 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0815 0.169 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 1.29e-01 0.262 0.172 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 6.07e-01 0.0645 0.125 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 2.87e-01 0.174 0.163 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0942 0.0786 0.08 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 9.00e-02 -0.245 0.144 0.08 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0948 0.164 0.08 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 2.92e-01 -0.163 0.154 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 6.70e-01 0.0318 0.0744 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0856 0.144 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0679 0.0822 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 4.05e-01 0.107 0.129 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 3.65e-01 -0.144 0.159 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 9.61e-01 0.00819 0.166 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 2.44e-01 -0.103 0.0878 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 1.94e-01 0.21 0.161 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 7.98e-01 0.022 0.0856 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 6.09e-01 0.0775 0.151 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 3.98e-02 -0.335 0.162 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 3.44e-02 -0.367 0.172 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 4.26e-01 0.138 0.173 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 3.55e-01 0.162 0.174 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0326 0.0807 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 3.74e-01 0.124 0.14 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00337 0.163 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0504 0.133 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 2.38e-01 -0.154 0.13 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 6.81e-01 0.0497 0.121 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 1.97e-01 -0.101 0.078 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 6.89e-01 0.0384 0.0959 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 9.00e-02 -0.255 0.15 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0742 0.142 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0167 0.143 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0712 0.141 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 1.26e-01 -0.111 0.0725 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 4.63e-01 0.075 0.102 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 2.60e-01 -0.19 0.168 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 5.26e-02 -0.332 0.17 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0705 0.172 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 8.93e-02 -0.28 0.164 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0684 0.0676 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 9.22e-01 0.0113 0.116 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 4.28e-01 -0.133 0.168 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0184 0.144 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 4.77e-01 0.0957 0.134 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0406 0.153 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0405 0.0818 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 7.87e-02 0.242 0.137 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 2.71e-01 -0.175 0.158 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 3.47e-01 -0.144 0.153 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 3.42e-01 -0.155 0.163 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 4.10e-01 -0.116 0.141 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 4.85e-02 -0.159 0.0801 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 2.15e-01 0.126 0.101 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 1.13e-01 -0.257 0.161 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 7.74e-01 0.0532 0.185 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 6.17e-02 -0.319 0.17 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 5.36e-01 -0.105 0.17 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0288 0.0828 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 3.15e-01 -0.138 0.137 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 4.52e-01 0.137 0.181 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 8.70e-02 0.27 0.157 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 8.44e-01 0.0341 0.173 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0163 0.172 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 1.49e-02 -0.223 0.0909 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 1.92e-01 0.197 0.151 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 9.89e-02 -0.287 0.173 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0664 0.167 0.078 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 2.63e-01 -0.178 0.158 0.078 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 3.51e-01 0.151 0.161 0.078 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00985 0.0795 0.078 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 2.80e-01 -0.121 0.112 0.078 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 3.82e-01 0.146 0.166 0.078 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 9.86e-01 0.00296 0.172 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 6.63e-01 0.0698 0.16 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0379 0.162 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0772 0.0903 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0605 0.135 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0151 0.141 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 3.82e-01 -0.113 0.129 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 6.38e-01 0.0764 0.162 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0447 0.0642 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 2.81e-01 0.153 0.142 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 1.43e-01 -0.255 0.173 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 1.13e-01 -0.251 0.158 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 4.70e-01 0.116 0.16 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0601 0.0747 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 5.08e-03 -0.411 0.145 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 5.45e-01 0.0878 0.145 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 1.46e-01 -0.204 0.14 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 2.24e-01 0.192 0.157 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 5.13e-01 -0.056 0.0855 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 9.28e-01 0.0129 0.142 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000399 0.199 0.085 PB L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 5.06e-01 0.0946 0.142 0.085 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 6.44e-01 0.0803 0.173 0.085 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 6.67e-01 0.0424 0.0984 0.085 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0623 0.159 0.085 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 9.80e-01 0.00473 0.185 0.085 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 4.94e-01 -0.113 0.165 0.078 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00611 0.147 0.078 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 9.98e-01 0.000432 0.158 0.078 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0247 0.0597 0.078 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 4.37e-01 0.0931 0.12 0.078 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00864 0.155 0.078 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 1.15e-01 0.261 0.165 0.079 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0174 0.156 0.079 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 9.77e-01 0.00381 0.132 0.079 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0841 0.0579 0.079 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 5.73e-02 0.232 0.122 0.079 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 4.02e-02 -0.336 0.163 0.079 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 1.63e-01 -0.247 0.176 0.085 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0145 0.139 0.085 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 706519 sc-eQTL 5.25e-01 0.0877 0.138 0.085 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 727229 sc-eQTL 2.01e-01 -0.207 0.162 0.085 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 1.95e-01 0.205 0.157 0.085 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0529 0.0779 0.085 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0957 0.131 0.085 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 7.40e-01 0.0514 0.155 0.085 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 338156 sc-eQTL 7.98e-01 0.0317 0.124 0.085 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -855017 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0244 0.152 0.085 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 3.17e-01 0.138 0.138 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0259 0.105 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 706519 sc-eQTL 6.48e-01 0.0677 0.148 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 727229 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0586 0.15 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 6.48e-01 0.0547 0.12 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0673 0.0663 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0222 0.099 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 4.92e-02 0.251 0.127 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -855017 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0601 0.133 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 9.23e-02 -0.266 0.157 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0281 0.114 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 706519 sc-eQTL 1.97e-01 0.184 0.142 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 727229 sc-eQTL 5.42e-01 0.0945 0.155 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00938 0.101 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0716 0.0729 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 1.57e-01 -0.118 0.0832 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 6.87e-01 0.0546 0.135 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -855017 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0495 0.132 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 5.47e-01 -0.132 0.218 0.079 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 2.57e-01 -0.213 0.187 0.079 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 9.71e-01 0.00753 0.208 0.079 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0929 0.0788 0.079 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0228 0.149 0.079 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 2.47e-01 -0.237 0.204 0.079 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 8.59e-01 0.0283 0.159 0.078 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 2.70e-01 0.168 0.152 0.078 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 706519 sc-eQTL 1.91e-01 0.201 0.153 0.078 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 727229 sc-eQTL 3.20e-01 0.151 0.152 0.078 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 6.72e-01 0.0654 0.154 0.078 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0566 0.0671 0.078 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 3.90e-01 -0.097 0.113 0.078 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 1.80e-01 -0.219 0.163 0.078 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -855017 sc-eQTL 7.75e-01 0.0447 0.156 0.078 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 5.29e-01 -0.106 0.167 0.077 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 2.11e-01 -0.141 0.113 0.077 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 706519 sc-eQTL 5.63e-01 0.0925 0.16 0.077 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 727229 sc-eQTL 2.90e-01 -0.168 0.158 0.077 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 3.65e-01 -0.138 0.152 0.077 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 4.50e-01 0.0577 0.0763 0.077 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 3.05e-02 -0.233 0.107 0.077 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 1.19e-01 0.21 0.134 0.077 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -855017 sc-eQTL 1.92e-01 -0.186 0.142 0.077 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 9.16e-01 0.0206 0.195 0.09 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 5.58e-01 0.0761 0.13 0.09 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 706519 sc-eQTL 3.43e-01 -0.124 0.13 0.09 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 727229 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0424 0.133 0.09 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 9.70e-02 -0.262 0.157 0.09 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 1.06e-01 -0.176 0.108 0.09 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 9.31e-01 0.00966 0.111 0.09 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0162 0.161 0.09 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 338156 sc-eQTL 8.03e-01 0.0387 0.154 0.09 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -855017 sc-eQTL 8.08e-01 0.0333 0.137 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 4.60e-01 0.121 0.164 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 2.55e-01 0.103 0.0901 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 3.63e-01 0.13 0.143 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 1.54e-01 -0.116 0.0811 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 2.64e-01 -0.142 0.127 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 4.76e-01 -0.107 0.149 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 2.45e-01 -0.179 0.154 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0306 0.0694 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 6.06e-01 0.0697 0.135 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 5.90e-01 -0.044 0.0815 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 7.31e-01 0.0435 0.126 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 3.73e-02 -0.319 0.152 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0128 0.127 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0407 0.0881 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 706519 sc-eQTL 6.06e-01 0.0742 0.144 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 727229 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0365 0.15 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0205 0.099 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0746 0.0677 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0468 0.0925 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 6.60e-02 0.222 0.12 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -855017 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0807 0.127 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000446 0.163 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 9.80e-01 0.00274 0.108 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 706519 sc-eQTL 1.51e-01 0.227 0.158 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 727229 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0663 0.157 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0751 0.148 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 9.19e-01 0.00643 0.0628 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 1.34e-01 -0.142 0.0945 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0661 0.152 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -855017 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0193 0.138 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -510886 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0312 0.13 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 928086 sc-eQTL 1.34e-01 -0.182 0.121 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 677825 sc-eQTL 2.03e-01 0.196 0.154 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 626715 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0272 0.0629 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -876828 sc-eQTL 6.92e-01 0.0516 0.13 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 928086 pQTL 0.028 -0.0789 0.0359 0.0 0.0 0.108
ENSG00000079950 STX7 928086 eQTL 0.0461 -0.0495 0.0248 0.0 0.0 0.11
ENSG00000112299 VNN1 727229 pQTL 0.000655 0.189 0.0553 0.0 0.0 0.108
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 eQTL 0.00022 -0.128 0.0346 0.0 0.0 0.11

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 SLC18B1 627945 2.69e-07 1.19e-07 3.72e-08 1.82e-07 9.02e-08 9.65e-08 1.44e-07 5.35e-08 1.44e-07 4.4e-08 1.62e-07 8.03e-08 1.71e-07 6.38e-08 6.17e-08 7.17e-08 4.63e-08 1.14e-07 5.19e-08 4.03e-08 1.04e-07 1.23e-07 1.32e-07 4.82e-08 1.37e-07 1.14e-07 1.11e-07 8.7e-08 1.03e-07 1.12e-07 9.64e-08 3.71e-08 2.74e-08 8.49e-08 8.74e-08 4.02e-08 4.79e-08 9.56e-08 6.78e-08 3.77e-08 4.19e-08 1.5e-07 4.04e-08 1.43e-08 9.21e-08 1.99e-08 1.26e-07 4.26e-09 4.77e-08