Genes within 1Mb (chr6:133440916:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 8.85e-01 0.0219 0.151 0.079 B L1
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 1.00e+00 -6.77e-06 0.0601 0.079 B L1
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 7.65e-01 0.0338 0.113 0.079 B L1
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 7.29e-02 -0.122 0.0678 0.079 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0726 0.105 0.079 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 6.56e-01 0.064 0.144 0.079 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 8.74e-03 -0.285 0.108 0.079 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 1.22e-01 -0.176 0.113 0.079 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 3.24e-01 0.0974 0.0985 0.079 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0105 0.0671 0.079 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0519 0.0901 0.079 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0607 0.136 0.079 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 1.13e-01 -0.173 0.108 0.079 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 4.72e-02 -0.225 0.113 0.079 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 1.57e-01 0.188 0.132 0.079 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0381 0.0453 0.079 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 4.03e-01 0.0585 0.0698 0.079 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 5.15e-01 0.0894 0.137 0.079 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 6.83e-01 0.0675 0.165 0.083 DC L1
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0682 0.102 0.083 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 706151 sc-eQTL 4.34e-02 0.256 0.126 0.083 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 726861 sc-eQTL 5.04e-01 0.0918 0.137 0.083 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 9.01e-01 0.0182 0.147 0.083 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 8.86e-01 0.0118 0.0823 0.083 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 3.94e-02 -0.196 0.0945 0.083 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0907 0.13 0.083 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 337788 sc-eQTL 6.60e-01 0.0522 0.119 0.083 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -855385 sc-eQTL 7.34e-01 0.0503 0.148 0.083 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 7.50e-01 -0.037 0.116 0.079 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 3.78e-01 0.0683 0.0773 0.079 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 706151 sc-eQTL 1.86e-02 -0.311 0.131 0.079 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 726861 sc-eQTL 9.25e-01 0.0134 0.143 0.079 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 1.00e-01 0.166 0.1 0.079 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 6.43e-01 0.0281 0.0605 0.079 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0683 0.0853 0.079 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 9.31e-01 0.0103 0.12 0.079 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -855385 sc-eQTL 2.12e-01 -0.147 0.117 0.079 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 5.94e-01 0.0681 0.128 0.079 NK L1
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 9.74e-01 0.00385 0.118 0.079 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 9.99e-01 0.000122 0.147 0.079 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0634 0.0607 0.079 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 3.16e-01 -0.113 0.112 0.079 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 9.26e-01 0.0141 0.151 0.079 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0662 0.119 0.079 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 2.56e-02 0.319 0.142 0.079 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0293 0.0569 0.079 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 5.93e-01 -0.056 0.105 0.079 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 2.26e-01 -0.189 0.155 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 9.92e-02 0.299 0.18 0.082 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0485 0.155 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 4.27e-01 0.131 0.165 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 8.99e-01 0.0113 0.0887 0.082 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 9.99e-01 0.000149 0.158 0.082 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 3.49e-01 0.145 0.155 0.082 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 9.95e-01 0.000982 0.166 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0396 0.0954 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 6.91e-01 0.0572 0.144 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 1.14e-01 -0.139 0.0875 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0132 0.152 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0342 0.158 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 1.81e-01 0.218 0.162 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 2.89e-01 -0.125 0.117 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 2.08e-01 -0.194 0.153 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 3.59e-01 -0.068 0.074 0.08 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 9.90e-02 -0.224 0.135 0.08 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 8.88e-01 0.0219 0.155 0.08 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0906 0.151 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 7.68e-01 0.0215 0.0726 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 4.47e-01 0.107 0.141 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 6.42e-02 -0.148 0.0796 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 2.65e-01 -0.14 0.125 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 6.37e-03 0.419 0.152 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 5.25e-01 0.102 0.161 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 1.34e-01 0.128 0.085 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 3.54e-01 -0.146 0.157 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 1.73e-01 -0.113 0.0827 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 1.27e-01 0.224 0.146 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 1.05e-01 -0.257 0.158 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 6.42e-01 0.0752 0.161 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 1.38e-01 -0.238 0.159 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 3.32e-01 0.157 0.161 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 6.88e-01 0.03 0.0747 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 9.81e-01 0.00313 0.129 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 9.43e-01 0.0107 0.151 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 2.12e-01 -0.157 0.125 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 4.06e-02 -0.252 0.122 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0155 0.114 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0217 0.0741 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00468 0.0907 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 1.29e-01 -0.216 0.142 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 2.61e-02 -0.302 0.135 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 8.21e-01 0.0311 0.137 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 5.27e-04 0.463 0.132 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0155 0.0702 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 1.87e-02 -0.23 0.097 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 2.42e-02 0.365 0.161 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 4.51e-01 0.118 0.156 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 6.32e-01 0.0749 0.156 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 1.43e-01 -0.219 0.149 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 5.43e-01 0.0374 0.0615 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 1.67e-01 -0.146 0.105 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0195 0.153 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 4.29e-01 -0.11 0.139 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 3.59e-02 -0.273 0.129 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 3.97e-01 0.126 0.148 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0105 0.0793 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 1.80e-01 -0.179 0.133 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 3.48e-01 0.144 0.153 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0678 0.147 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0738 0.156 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 7.17e-01 0.049 0.135 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 4.18e-01 0.0627 0.0772 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 7.66e-01 0.0289 0.097 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 3.30e-01 -0.151 0.155 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0284 0.179 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 5.42e-01 -0.101 0.166 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 4.24e-01 0.132 0.164 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 1.68e-01 -0.111 0.0799 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 9.69e-01 0.00514 0.133 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00433 0.176 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 5.31e-01 0.0949 0.151 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 8.20e-01 0.0376 0.165 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 1.23e-01 0.253 0.163 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0219 0.0884 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 7.66e-01 0.0432 0.145 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 6.72e-01 0.0707 0.167 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 2.48e-01 -0.185 0.16 0.078 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 9.04e-02 -0.257 0.151 0.078 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 4.39e-01 0.12 0.155 0.078 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0126 0.0762 0.078 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000394 0.107 0.078 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 2.09e-01 -0.201 0.159 0.078 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 3.52e-01 -0.152 0.163 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0129 0.152 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0854 0.154 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 5.82e-01 0.0474 0.0858 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 2.29e-01 -0.154 0.128 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 3.49e-01 0.128 0.136 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 6.71e-01 -0.053 0.125 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0081 0.156 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0645 0.0617 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 4.21e-01 -0.11 0.137 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 2.42e-01 -0.198 0.169 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 6.13e-01 0.0782 0.154 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 2.59e-01 0.176 0.156 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 4.34e-01 -0.057 0.0726 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 4.29e-02 0.29 0.142 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0132 0.142 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 9.31e-01 0.0119 0.138 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0682 0.155 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0227 0.084 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 7.92e-01 0.037 0.14 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 5.13e-02 -0.385 0.196 0.078 PB L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0388 0.142 0.078 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 4.65e-01 0.127 0.173 0.078 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 5.25e-01 0.0626 0.0982 0.078 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 1.35e-01 -0.237 0.157 0.078 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 3.92e-01 -0.158 0.184 0.078 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 5.05e-01 0.104 0.156 0.08 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 8.42e-01 0.0279 0.139 0.08 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 2.81e-01 0.161 0.149 0.08 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0613 0.0564 0.08 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0353 0.113 0.08 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0483 0.146 0.08 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0966 0.16 0.079 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 3.82e-01 -0.132 0.151 0.079 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 6.42e-01 0.0591 0.127 0.079 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00226 0.0562 0.079 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 9.07e-01 0.0138 0.118 0.079 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0232 0.159 0.079 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 9.03e-01 0.0207 0.169 0.078 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 9.34e-01 0.011 0.133 0.078 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 706151 sc-eQTL 8.55e-01 0.024 0.132 0.078 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 726861 sc-eQTL 8.54e-01 0.0286 0.155 0.078 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 1.78e-01 0.203 0.15 0.078 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 2.06e-01 0.0941 0.0741 0.078 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 1.22e-01 -0.194 0.125 0.078 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0475 0.147 0.078 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 337788 sc-eQTL 4.75e-01 0.0843 0.118 0.078 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -855385 sc-eQTL 3.01e-01 -0.15 0.145 0.078 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0167 0.131 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 5.98e-01 0.0524 0.0993 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 706151 sc-eQTL 3.68e-02 -0.292 0.139 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 726861 sc-eQTL 2.93e-01 -0.149 0.141 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 3.46e-02 0.238 0.112 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 9.52e-01 0.00383 0.0629 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 2.60e-01 -0.106 0.0935 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0903 0.121 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -855385 sc-eQTL 1.60e-01 -0.177 0.126 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0512 0.149 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 4.95e-01 0.0737 0.108 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 706151 sc-eQTL 2.67e-02 -0.297 0.133 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 726861 sc-eQTL 3.94e-01 0.125 0.146 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 7.06e-01 0.0362 0.0958 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 7.00e-01 0.0266 0.069 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0234 0.0789 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 1.24e-01 0.196 0.127 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -855385 sc-eQTL 3.19e-01 -0.124 0.125 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 7.40e-02 0.384 0.213 0.067 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 9.14e-03 0.478 0.181 0.067 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 9.66e-01 0.00866 0.205 0.067 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0491 0.078 0.067 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 1.36e-01 0.219 0.146 0.067 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 1.51e-01 0.289 0.2 0.067 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 4.40e-01 -0.118 0.152 0.082 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 7.42e-01 -0.048 0.146 0.082 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 706151 sc-eQTL 2.58e-01 -0.166 0.147 0.082 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 726861 sc-eQTL 3.61e-01 0.133 0.145 0.082 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 3.85e-01 0.129 0.148 0.082 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 7.54e-01 0.0202 0.0643 0.082 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 1.97e-01 -0.139 0.108 0.082 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 2.59e-01 0.177 0.156 0.082 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -855385 sc-eQTL 9.45e-01 0.0104 0.15 0.082 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 8.36e-01 -0.033 0.16 0.081 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 3.41e-01 -0.103 0.108 0.081 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 706151 sc-eQTL 3.00e-01 -0.158 0.152 0.081 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 726861 sc-eQTL 5.74e-01 0.0852 0.151 0.081 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 3.58e-01 0.134 0.145 0.081 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 9.30e-01 0.00647 0.073 0.081 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 4.19e-01 0.0834 0.103 0.081 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 3.08e-01 -0.132 0.129 0.081 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -855385 sc-eQTL 9.18e-01 0.014 0.136 0.081 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0619 0.189 0.071 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 8.87e-01 0.018 0.126 0.071 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 706151 sc-eQTL 9.50e-02 0.211 0.126 0.071 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 726861 sc-eQTL 2.55e-01 0.147 0.128 0.071 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0798 0.153 0.071 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 6.28e-01 0.0513 0.106 0.071 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0233 0.107 0.071 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 7.01e-01 0.0602 0.157 0.071 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 337788 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0465 0.15 0.071 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -855385 sc-eQTL 1.32e-01 0.2 0.132 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 3.11e-01 0.162 0.16 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0743 0.0882 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0728 0.14 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0623 0.0795 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 9.95e-01 0.000798 0.124 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 3.29e-01 0.142 0.146 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0169 0.149 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 5.80e-01 0.0371 0.0669 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 7.15e-01 0.0475 0.13 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 3.79e-02 -0.163 0.0779 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0466 0.122 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 2.41e-01 0.174 0.148 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0161 0.12 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 2.79e-01 0.0902 0.083 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 706151 sc-eQTL 2.29e-02 -0.307 0.134 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 726861 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0158 0.142 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 9.24e-02 0.157 0.093 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 8.09e-01 0.0155 0.0642 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0777 0.0873 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 9.69e-01 0.00445 0.114 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -855385 sc-eQTL 1.27e-01 -0.183 0.119 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 4.63e-01 -0.115 0.156 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 1.69e-01 -0.142 0.103 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 706151 sc-eQTL 2.01e-01 -0.194 0.151 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 726861 sc-eQTL 7.82e-01 0.0418 0.15 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 2.67e-01 0.157 0.141 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 8.18e-01 0.0139 0.0602 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0397 0.0911 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 627577 sc-eQTL 9.25e-01 0.0138 0.146 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -855385 sc-eQTL 8.80e-01 -0.02 0.132 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -511254 sc-eQTL 5.37e-01 0.0781 0.126 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 927718 sc-eQTL 8.38e-01 0.0243 0.119 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 677457 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000504 0.15 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 626347 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0587 0.0611 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -877196 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0776 0.126 0.078 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118515 \N -877196 2.74e-07 1.3e-07 4.91e-08 1.81e-07 9.87e-08 9.9e-08 1.61e-07 5.48e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.52e-07 1.01e-07 1.52e-07 7.13e-08 6.18e-08 7.49e-08 4.17e-08 1.33e-07 5.97e-08 4.21e-08 1.21e-07 1.24e-07 1.44e-07 2.93e-08 1.55e-07 1.25e-07 1.07e-07 9.92e-08 1.16e-07 1.03e-07 1.02e-07 3.08e-08 3.89e-08 8e-08 5.99e-08 3.2e-08 5.31e-08 9.23e-08 6.37e-08 4.47e-08 4.92e-08 1.33e-07 5.27e-08 1.13e-08 4.25e-08 1.87e-08 1.21e-07 1.88e-09 5.02e-08