logo

Genes within 1Mb (chr6:133435884:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 6.84e-01 0.0369 0.0906 0.248 B L1
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 7.95e-02 0.0631 0.0358 0.248 B L1
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0485 0.0678 0.248 B L1
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 6.47e-01 0.0188 0.041 0.248 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0115 0.0633 0.248 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 5.95e-01 0.046 0.0863 0.248 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 6.60e-01 0.0292 0.0662 0.248 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 9.85e-02 0.114 0.0685 0.248 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 7.75e-01 0.017 0.0597 0.248 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0119 0.0406 0.248 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0212 0.0545 0.248 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 1.04e-01 0.133 0.0816 0.248 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 6.40e-01 0.0308 0.0657 0.248 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0148 0.0686 0.248 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0987 0.0798 0.248 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 7.92e-01 -0.00722 0.0274 0.248 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0286 0.0422 0.248 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 3.72e-01 0.0739 0.0826 0.248 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 7.53e-01 0.0316 0.1 0.25 DC L1
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 9.59e-01 0.00322 0.0624 0.25 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 701119 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0874 0.0772 0.25 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 721829 sc-eQTL 4.33e-01 0.0656 0.0834 0.25 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 5.76e-01 -0.05 0.0893 0.25 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0665 0.0499 0.25 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 2.99e-01 0.0604 0.058 0.25 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0745 0.0792 0.25 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 332756 sc-eQTL 2.45e-01 0.0838 0.072 0.25 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -860417 sc-eQTL 4.35e-01 0.0704 0.0899 0.25 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 8.19e-01 0.016 0.0701 0.248 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 7.56e-01 0.0146 0.0469 0.248 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 701119 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0654 0.0803 0.248 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 721829 sc-eQTL 7.65e-02 0.153 0.0859 0.248 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0607 0.061 0.248 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0492 0.0365 0.248 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 3.10e-01 0.0525 0.0516 0.248 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0731 0.0723 0.248 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -860417 sc-eQTL 4.83e-01 0.0499 0.0711 0.248 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 7.37e-01 0.0258 0.0768 0.247 NK L1
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 7.53e-01 0.0223 0.071 0.247 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 2.82e-01 -0.095 0.0881 0.247 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0333 0.0365 0.247 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0121 0.0676 0.247 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0978 0.0898 0.248 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 1.32e-01 0.107 0.0705 0.248 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0394 0.0857 0.248 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0188 0.034 0.248 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 5.66e-01 0.036 0.0625 0.248 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 7.21e-01 0.0333 0.093 0.248 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0402 0.106 0.237 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0421 0.0904 0.237 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 1.65e-01 0.134 0.0957 0.237 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 9.72e-01 0.00181 0.0516 0.237 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 1.63e-01 0.128 0.0914 0.237 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0737 0.0901 0.237 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 1.96e-01 0.129 0.0992 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 4.89e-02 0.112 0.0567 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0629 0.086 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00222 0.0528 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 9.53e-01 0.00538 0.0912 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 3.43e-01 0.0902 0.0948 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 2.29e-01 -0.115 0.0949 0.248 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 1.47e-02 0.167 0.0679 0.248 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 1.62e-01 0.126 0.0897 0.248 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 8.66e-01 -0.00734 0.0434 0.248 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 5.80e-02 0.151 0.079 0.248 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 3.18e-01 0.0905 0.0904 0.248 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 8.01e-01 0.0228 0.0904 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 1.87e-01 0.0572 0.0433 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 2.62e-02 -0.187 0.0834 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 3.03e-01 0.0496 0.0479 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 6.50e-01 0.0341 0.0752 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0745 0.0926 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0254 0.0962 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 3.33e-01 0.0495 0.051 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 4.83e-01 0.0658 0.0937 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 2.78e-01 0.0539 0.0495 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 9.82e-01 0.00198 0.0878 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 8.72e-01 0.0153 0.0948 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 3.46e-02 0.203 0.0956 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 4.07e-01 0.0797 0.0958 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 9.77e-01 0.00284 0.0968 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00266 0.0447 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 6.19e-01 0.0386 0.0775 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 1.43e-01 0.132 0.0897 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0997 0.0758 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 6.93e-02 0.135 0.0741 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 4.19e-01 0.0559 0.069 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00546 0.0449 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 8.62e-01 0.00953 0.0549 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 1.06e-01 0.139 0.0858 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 7.09e-01 0.0305 0.0816 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 7.58e-01 0.0253 0.0821 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 5.03e-02 -0.158 0.0803 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0487 0.0418 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 6.80e-01 0.0243 0.0587 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 2.68e-01 0.108 0.0969 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 5.75e-01 0.053 0.0945 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 8.12e-01 0.0226 0.0947 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 2.68e-01 0.101 0.0906 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0333 0.0372 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 9.45e-01 0.00443 0.0641 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 9.54e-02 0.154 0.092 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 4.15e-01 0.0695 0.0852 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0101 0.0797 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0528 0.0905 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 1.00e+00 -2.14e-05 0.0485 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 8.60e-02 0.14 0.0813 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0617 0.0938 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 6.92e-01 0.0357 0.0901 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 5.07e-01 0.0638 0.096 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 1.29e-01 -0.126 0.0824 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0207 0.0474 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0576 0.0594 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 2.73e-01 0.104 0.0949 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0966 0.0993 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 1.73e-01 0.125 0.0917 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 4.19e-01 -0.074 0.0913 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0433 0.0445 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 9.05e-02 0.125 0.0733 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0168 0.0977 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 8.05e-01 -0.023 0.0929 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 2.41e-01 -0.119 0.101 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 2.21e-01 0.123 0.1 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 5.96e-02 0.102 0.0538 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 7.62e-01 -0.027 0.0889 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 5.42e-02 0.197 0.102 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0193 0.0952 0.247 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 4.88e-01 0.0627 0.0903 0.247 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 9.14e-01 0.00997 0.092 0.247 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 2.58e-02 -0.1 0.0447 0.247 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 2.80e-01 0.0687 0.0635 0.247 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 9.78e-01 0.00266 0.0949 0.247 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00153 0.105 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0357 0.0972 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00961 0.0987 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0264 0.055 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 4.92e-01 0.0565 0.0821 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 9.49e-01 0.00532 0.0824 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 9.88e-01 0.00117 0.0755 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 7.76e-02 -0.166 0.0937 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0284 0.0374 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 5.68e-01 0.0474 0.0829 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 4.85e-01 0.0726 0.104 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 9.12e-01 0.0105 0.0947 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0401 0.0958 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0215 0.0446 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 7.36e-01 0.0298 0.0882 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 8.75e-01 0.0135 0.0855 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 1.26e-01 0.127 0.0824 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0155 0.0931 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00517 0.0505 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0791 0.0839 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 2.15e-01 0.143 0.115 0.244 PB L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0824 0.0822 0.244 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0944 0.1 0.244 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 1.08e-01 -0.0918 0.0566 0.244 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 3.71e-01 0.0828 0.0922 0.244 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 6.89e-01 0.0431 0.107 0.244 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0516 0.098 0.248 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 9.86e-02 0.144 0.087 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0681 0.0938 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 8.04e-01 0.00884 0.0355 0.248 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 4.71e-01 0.0514 0.0712 0.248 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 6.30e-01 0.0444 0.0919 0.248 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0058 0.0972 0.248 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 1.16e-01 0.144 0.0911 0.248 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 6.21e-01 0.0381 0.077 0.248 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 3.70e-01 0.0306 0.034 0.248 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 8.97e-01 0.00932 0.0718 0.248 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 9.12e-01 0.0107 0.0963 0.248 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 8.45e-01 0.02 0.102 0.249 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 7.22e-01 0.0286 0.0801 0.249 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 701119 sc-eQTL 6.97e-01 -0.031 0.0796 0.249 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 721829 sc-eQTL 5.44e-01 0.0569 0.0935 0.249 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0707 0.091 0.249 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0591 0.0448 0.249 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 5.31e-02 0.146 0.0751 0.249 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 3.33e-01 0.0863 0.0889 0.249 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 332756 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0536 0.0712 0.249 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -860417 sc-eQTL 4.15e-02 0.178 0.0867 0.249 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 7.13e-01 0.0295 0.0799 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 9.77e-01 0.00172 0.0606 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 701119 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00962 0.0857 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 721829 sc-eQTL 5.46e-02 0.166 0.0857 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0732 0.0689 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0391 0.0383 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 3.73e-01 0.051 0.0571 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0157 0.074 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -860417 sc-eQTL 4.50e-01 0.0582 0.077 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0487 0.0906 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 8.16e-02 0.114 0.065 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 701119 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0943 0.0815 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 721829 sc-eQTL 1.96e-01 0.115 0.0884 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 4.40e-01 -0.045 0.0581 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0291 0.0418 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 9.53e-02 0.0797 0.0476 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 6.05e-02 -0.145 0.0769 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -860417 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00108 0.0758 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0683 0.122 0.258 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 1.75e-01 0.143 0.105 0.258 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 2.79e-01 -0.126 0.116 0.258 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 8.18e-01 0.0102 0.0444 0.258 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 4.66e-02 0.166 0.0826 0.258 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 9.45e-01 0.008 0.115 0.258 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 4.51e-01 0.0694 0.092 0.249 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0288 0.0879 0.249 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 701119 sc-eQTL 7.12e-02 -0.16 0.0881 0.249 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 721829 sc-eQTL 1.64e-01 0.122 0.0874 0.249 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0178 0.0892 0.249 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 1.67e-01 -0.0536 0.0387 0.249 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 6.51e-01 0.0295 0.0652 0.249 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 5.67e-01 0.0542 0.0945 0.249 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -860417 sc-eQTL 8.78e-01 0.0139 0.0904 0.249 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 8.11e-01 0.0233 0.0973 0.247 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0176 0.0658 0.247 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 701119 sc-eQTL 6.25e-01 0.0454 0.0928 0.247 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 721829 sc-eQTL 5.91e-01 0.0496 0.0921 0.247 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 9.00e-01 0.0111 0.0886 0.247 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0241 0.0444 0.247 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 1.10e-02 0.159 0.0618 0.247 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00787 0.0785 0.247 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -860417 sc-eQTL 2.68e-02 0.183 0.082 0.247 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0919 0.112 0.257 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0519 0.0747 0.257 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 701119 sc-eQTL 8.04e-02 -0.131 0.0746 0.257 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 721829 sc-eQTL 5.53e-01 0.0455 0.0766 0.257 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0657 0.0911 0.257 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0294 0.0628 0.257 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 3.99e-01 0.0539 0.0637 0.257 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 8.04e-03 -0.244 0.0909 0.257 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 332756 sc-eQTL 3.16e-01 0.0892 0.0887 0.257 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -860417 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0194 0.0789 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 4.23e-01 0.0776 0.0966 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 2.00e-02 0.123 0.0526 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 1.88e-01 0.111 0.0839 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 9.69e-01 0.00188 0.048 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 4.84e-01 0.0525 0.0749 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 2.25e-01 0.107 0.0878 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 8.77e-01 0.0141 0.0906 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 1.11e-01 0.0648 0.0406 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 1.77e-01 -0.107 0.0789 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 2.11e-01 0.06 0.0478 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 8.76e-01 0.0116 0.0742 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0479 0.0904 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0209 0.0725 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 4.64e-01 0.037 0.0504 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 701119 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0589 0.0821 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 721829 sc-eQTL 3.14e-02 0.184 0.0848 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0497 0.0566 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0442 0.0388 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 3.75e-01 0.047 0.0529 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0665 0.069 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -860417 sc-eQTL 7.98e-01 0.0186 0.0725 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 6.02e-01 0.0491 0.0941 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0419 0.0621 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 701119 sc-eQTL 2.44e-01 -0.107 0.0911 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 721829 sc-eQTL 2.93e-01 0.0952 0.0903 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 7.62e-01 0.0259 0.0854 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0216 0.0362 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 8.75e-02 0.0935 0.0545 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00647 0.088 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -860417 sc-eQTL 2.09e-01 0.0998 0.0792 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -516286 sc-eQTL 7.10e-01 0.0283 0.0759 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 922686 sc-eQTL 7.27e-01 0.0249 0.0713 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 672425 sc-eQTL 2.02e-01 -0.115 0.0899 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 621315 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0333 0.0368 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -882228 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00302 0.0761 0.248 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 922686 eQTL 0.000144 0.0704 0.0184 0.0 0.0 0.236
ENSG00000112299 VNN1 721829 pQTL 0.000687 0.137 0.0403 0.0 0.0 0.25
ENSG00000146409 SLC18B1 622545 eQTL 0.0298 0.0566 0.026 0.0 0.0 0.236

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina