logo

Genes within 1Mb (chr6:133434069:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 9.00e-01 -0.012 0.0952 0.267 B L1
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00429 0.0379 0.267 B L1
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 7.26e-01 0.025 0.0713 0.267 B L1
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 5.82e-02 0.0814 0.0427 0.267 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0688 0.0663 0.267 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 2.69e-01 0.1 0.0904 0.267 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 3.18e-01 0.0716 0.0716 0.267 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 4.54e-01 -0.056 0.0745 0.267 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0266 0.0646 0.267 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 2.00e-01 0.0563 0.0438 0.267 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 5.01e-02 -0.115 0.0585 0.267 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00383 0.0889 0.267 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 8.32e-01 0.0149 0.0701 0.267 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 2.52e-02 0.163 0.0723 0.267 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 3.08e-01 0.0872 0.0852 0.267 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 3.81e-02 0.0603 0.0289 0.267 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 1.22e-01 -0.0694 0.0447 0.267 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 2.39e-01 0.104 0.088 0.267 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0175 0.106 0.261 DC L1
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 9.19e-01 0.00666 0.0657 0.261 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 699304 sc-eQTL 4.11e-01 0.067 0.0813 0.261 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 720014 sc-eQTL 4.66e-01 0.0641 0.0878 0.261 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 4.42e-01 0.0724 0.0939 0.261 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 2.37e-01 0.0624 0.0526 0.261 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 4.14e-01 -0.05 0.0611 0.261 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 1.82e-01 -0.111 0.0831 0.261 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 330941 sc-eQTL 8.76e-01 0.0119 0.076 0.261 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -862232 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0278 0.0947 0.261 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 8.84e-01 0.011 0.0753 0.267 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 5.31e-01 0.0316 0.0504 0.267 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 699304 sc-eQTL 2.00e-02 0.2 0.0854 0.267 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 720014 sc-eQTL 6.85e-02 -0.169 0.0924 0.267 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 4.51e-01 0.0496 0.0656 0.267 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 8.55e-01 0.00723 0.0394 0.267 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0749 0.0554 0.267 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 4.79e-01 0.0551 0.0778 0.267 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -862232 sc-eQTL 1.52e-01 -0.11 0.0762 0.267 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0181 0.083 0.268 NK L1
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 2.78e-02 0.168 0.0759 0.268 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00463 0.0955 0.268 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 4.35e-01 0.0309 0.0395 0.268 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0636 0.073 0.268 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 7.87e-01 0.0259 0.0957 0.267 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 7.64e-01 0.0226 0.0753 0.267 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0605 0.091 0.267 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00469 0.0361 0.267 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 1.42e-01 -0.0973 0.0661 0.267 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 7.66e-01 0.0294 0.0988 0.267 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 1.09e-01 0.173 0.107 0.268 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 3.09e-01 0.0941 0.0923 0.268 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 6.98e-01 0.0383 0.0985 0.268 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 6.36e-01 0.025 0.0528 0.268 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 1.49e-01 -0.136 0.0936 0.268 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 2.41e-01 0.108 0.0921 0.268 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0791 0.106 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 5.27e-01 0.0384 0.0606 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 2.15e-01 0.113 0.0911 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 1.01e-01 0.0915 0.0556 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 2.11e-02 -0.222 0.0956 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0535 0.101 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0137 0.102 0.267 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 7.64e-01 0.0223 0.0741 0.267 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0568 0.0969 0.267 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 8.39e-03 0.122 0.0459 0.267 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0439 0.0856 0.267 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 2.68e-01 -0.108 0.0972 0.267 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 3.34e-01 0.091 0.094 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 5.66e-01 -0.026 0.0452 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 4.29e-01 0.0695 0.0878 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 4.86e-01 0.0349 0.05 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0451 0.0782 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 2.82e-01 0.104 0.0963 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 7.94e-01 0.0264 0.101 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 6.28e-01 0.026 0.0536 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 7.62e-01 0.0299 0.0985 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 3.54e-01 0.0483 0.0521 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 1.42e-01 -0.135 0.0917 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 3.51e-02 0.209 0.0985 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 2.28e-01 -0.122 0.101 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0784 0.1 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 7.96e-01 0.0262 0.101 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 5.33e-01 0.0292 0.0467 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 8.14e-02 -0.141 0.0804 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0351 0.0942 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 2.11e-01 0.102 0.0816 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 1.61e-01 -0.112 0.0799 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0832 0.0741 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 4.67e-01 0.0351 0.0482 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 2.33e-02 -0.133 0.0584 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 7.62e-01 0.0281 0.0928 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 9.00e-02 0.151 0.0886 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 4.48e-01 0.0683 0.0897 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 4.13e-01 0.0726 0.0884 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 3.78e-02 0.095 0.0455 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0516 0.0642 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0194 0.106 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 1.94e-01 0.132 0.102 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 7.26e-01 0.0358 0.102 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 5.53e-01 0.0582 0.0978 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 7.22e-01 0.0143 0.0401 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 1.14e-01 -0.109 0.0686 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 8.96e-01 -0.013 0.0998 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 1.61e-01 0.125 0.0888 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 3.62e-02 0.174 0.0825 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 4.60e-01 0.07 0.0946 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 7.78e-01 0.0143 0.0507 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 4.52e-03 -0.241 0.084 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 5.27e-01 0.0622 0.0982 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0725 0.0937 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 7.96e-02 0.175 0.0992 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 7.47e-01 0.0278 0.0862 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 1.06e-01 0.0797 0.0491 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 3.12e-02 -0.133 0.0613 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 7.74e-02 0.175 0.0983 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0528 0.107 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 9.02e-01 0.0122 0.0991 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 3.44e-01 0.093 0.0981 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 4.60e-01 0.0354 0.0479 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 9.43e-03 -0.205 0.078 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 7.91e-01 0.0278 0.105 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 7.50e-02 -0.175 0.0976 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 2.59e-01 -0.121 0.107 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 1.78e-01 -0.144 0.106 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 7.29e-01 -0.02 0.0574 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0398 0.0941 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0448 0.109 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0923 0.102 0.268 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 4.63e-01 0.0711 0.0966 0.268 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 7.50e-01 0.0314 0.0984 0.268 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 5.25e-01 0.0308 0.0483 0.268 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 1.67e-01 -0.0941 0.0678 0.268 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0158 0.101 0.268 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 3.10e-01 0.109 0.107 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 5.20e-01 -0.064 0.0992 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0956 0.101 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 5.87e-01 0.0305 0.0561 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 8.30e-01 -0.018 0.084 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00953 0.0894 0.269 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 3.60e-02 0.171 0.081 0.269 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 4.37e-01 0.0796 0.102 0.269 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 2.71e-01 0.0447 0.0405 0.269 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 7.03e-02 -0.162 0.0893 0.269 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 7.08e-01 0.0413 0.11 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 2.49e-01 0.116 0.1 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0838 0.102 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 4.12e-01 0.0389 0.0473 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 7.17e-01 0.034 0.0936 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0577 0.0914 0.269 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 8.09e-01 0.0215 0.0886 0.269 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0544 0.0995 0.269 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 6.15e-01 0.0272 0.054 0.269 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 2.63e-01 -0.101 0.0897 0.269 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 4.02e-01 -0.101 0.121 0.267 PB L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 7.44e-01 0.0282 0.0862 0.267 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 2.06e-01 0.133 0.105 0.267 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 8.30e-01 0.0129 0.0598 0.267 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 2.56e-01 -0.11 0.096 0.267 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 7.88e-01 0.0301 0.112 0.267 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 6.49e-01 0.0455 0.0998 0.265 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0765 0.089 0.265 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00058 0.0956 0.265 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 1.80e-01 -0.0485 0.036 0.265 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0632 0.0724 0.265 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 7.18e-01 0.0339 0.0936 0.265 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0905 0.106 0.267 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 5.99e-02 -0.188 0.0992 0.267 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 3.59e-01 0.0772 0.084 0.267 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0182 0.0372 0.267 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0461 0.0784 0.267 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0366 0.105 0.267 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0116 0.107 0.256 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00334 0.0843 0.256 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 699304 sc-eQTL 4.58e-01 0.0622 0.0836 0.256 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 720014 sc-eQTL 3.25e-01 0.0969 0.0982 0.256 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 7.87e-01 -0.026 0.0959 0.256 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 1.27e-01 0.0721 0.047 0.256 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 4.03e-02 -0.163 0.0789 0.256 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 2.18e-01 -0.115 0.0934 0.256 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 330941 sc-eQTL 1.65e-01 0.104 0.0746 0.256 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -862232 sc-eQTL 2.27e-01 -0.111 0.0919 0.256 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 6.84e-01 -0.035 0.0859 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 2.82e-01 0.0702 0.065 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 699304 sc-eQTL 1.05e-01 0.149 0.0916 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 720014 sc-eQTL 1.12e-01 -0.147 0.0924 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 5.10e-01 0.049 0.0743 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 6.17e-01 0.0206 0.0413 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0645 0.0614 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 7.94e-01 0.0209 0.0796 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -862232 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0544 0.0828 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 2.14e-01 0.12 0.0964 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0461 0.0698 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 699304 sc-eQTL 1.51e-02 0.211 0.0861 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 720014 sc-eQTL 1.14e-01 -0.149 0.0942 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 3.00e-01 0.0644 0.0619 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 8.52e-01 0.00835 0.0447 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 8.69e-02 -0.0873 0.0508 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 9.79e-02 0.137 0.0822 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -862232 sc-eQTL 1.05e-01 -0.131 0.0804 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 6.31e-01 0.0629 0.131 0.252 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 8.84e-01 0.0164 0.112 0.252 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 3.22e-01 -0.123 0.124 0.252 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 9.34e-01 0.00392 0.0473 0.252 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 3.27e-03 -0.259 0.0866 0.252 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000108 0.122 0.252 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 7.22e-01 0.0353 0.0991 0.264 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00984 0.0947 0.264 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 699304 sc-eQTL 2.58e-02 0.212 0.0944 0.264 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 720014 sc-eQTL 1.04e-01 -0.153 0.0939 0.264 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0871 0.0958 0.264 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00432 0.0418 0.264 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 8.09e-01 -0.017 0.0702 0.264 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 1.29e-02 -0.251 0.1 0.264 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -862232 sc-eQTL 2.35e-01 -0.115 0.097 0.264 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 8.48e-01 -0.02 0.104 0.265 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 5.14e-01 0.0459 0.0703 0.265 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 699304 sc-eQTL 6.29e-01 0.048 0.0992 0.265 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 720014 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0684 0.0984 0.265 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0535 0.0947 0.265 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 9.63e-01 0.0022 0.0475 0.265 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 1.08e-01 -0.108 0.0668 0.265 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 7.66e-01 0.025 0.0839 0.265 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -862232 sc-eQTL 2.47e-01 -0.103 0.0885 0.265 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 6.06e-01 0.0608 0.118 0.249 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 1.14e-01 0.124 0.0778 0.249 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 699304 sc-eQTL 4.03e-01 0.066 0.0788 0.249 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 720014 sc-eQTL 3.42e-01 0.0763 0.0801 0.249 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 2.23e-03 0.289 0.0928 0.249 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 9.21e-01 0.00651 0.0659 0.249 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0193 0.0669 0.249 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0431 0.0975 0.249 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 330941 sc-eQTL 9.77e-01 0.00275 0.0933 0.249 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -862232 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0225 0.0827 0.249 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0667 0.102 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 4.86e-01 0.0391 0.0561 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000361 0.0889 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 8.69e-02 0.0865 0.0503 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 5.41e-02 -0.152 0.0785 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0682 0.0928 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 7.59e-01 0.0291 0.0946 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0146 0.0426 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 4.97e-01 0.0563 0.0827 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 3.37e-01 0.0481 0.05 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 2.67e-01 -0.086 0.0773 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 1.07e-01 0.152 0.0939 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 7.95e-01 0.0203 0.078 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 5.58e-01 0.0318 0.0542 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 699304 sc-eQTL 3.62e-02 0.184 0.0875 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 720014 sc-eQTL 4.80e-02 -0.182 0.0913 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 6.11e-01 0.0311 0.0609 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 7.03e-01 0.016 0.0418 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0762 0.0567 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 4.32e-01 0.0585 0.0743 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -862232 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0634 0.0779 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 5.94e-01 0.054 0.101 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 5.63e-01 0.0386 0.0667 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 699304 sc-eQTL 3.14e-02 0.21 0.0971 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 720014 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0658 0.0972 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0575 0.0917 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 7.77e-01 0.011 0.0389 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0596 0.0588 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 620730 sc-eQTL 1.24e-01 -0.145 0.094 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -862232 sc-eQTL 1.91e-02 -0.199 0.0843 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -518101 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0295 0.0825 0.269 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 920871 sc-eQTL 2.10e-02 0.178 0.0765 0.269 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 670610 sc-eQTL 7.51e-01 0.0311 0.0981 0.269 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 619500 sc-eQTL 3.64e-01 0.0363 0.04 0.269 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -884043 sc-eQTL 1.14e-01 -0.131 0.0822 0.269 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 720014 pQTL 0.003 -0.119 0.0402 0.0 0.0 0.232

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina