logo

Genes within 1Mb (chr6:133428350:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 5.75e-01 0.0508 0.0906 0.25 B L1
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 7.13e-02 0.0649 0.0358 0.25 B L1
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0645 0.0677 0.25 B L1
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 6.44e-01 0.019 0.041 0.25 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0164 0.0633 0.25 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 6.48e-01 0.0394 0.0863 0.25 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 6.96e-01 0.0259 0.0663 0.25 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 1.40e-01 0.102 0.0686 0.25 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 8.01e-01 0.015 0.0597 0.25 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 8.21e-01 -0.00919 0.0406 0.25 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 7.55e-01 -0.017 0.0546 0.25 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 1.11e-01 0.131 0.0816 0.25 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 6.89e-01 0.0264 0.0658 0.25 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0117 0.0687 0.25 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0997 0.0799 0.25 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 8.02e-01 -0.00687 0.0274 0.25 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0246 0.0422 0.25 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 3.06e-01 0.0849 0.0827 0.25 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 6.91e-01 0.0399 0.1 0.252 DC L1
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 9.22e-01 0.00608 0.0623 0.252 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 693585 sc-eQTL 2.19e-01 -0.095 0.077 0.252 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 714295 sc-eQTL 3.47e-01 0.0785 0.0833 0.252 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0373 0.0892 0.252 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 1.87e-01 -0.066 0.0498 0.252 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 3.20e-01 0.0577 0.0579 0.252 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0664 0.0791 0.252 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 325222 sc-eQTL 2.91e-01 0.0761 0.0719 0.252 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -867951 sc-eQTL 5.48e-01 0.054 0.0898 0.252 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 7.06e-01 0.0264 0.07 0.25 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 8.69e-01 0.00774 0.0468 0.25 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 693585 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0482 0.0803 0.25 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 714295 sc-eQTL 6.54e-02 0.159 0.0858 0.25 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0551 0.0609 0.25 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0438 0.0365 0.25 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 3.13e-01 0.0521 0.0515 0.25 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0663 0.0722 0.25 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -867951 sc-eQTL 4.62e-01 0.0523 0.071 0.25 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 7.45e-01 0.025 0.0768 0.249 NK L1
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 7.84e-01 0.0195 0.071 0.249 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 2.51e-01 -0.101 0.0881 0.249 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0314 0.0365 0.249 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00876 0.0677 0.249 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0967 0.0898 0.25 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 1.27e-01 0.108 0.0705 0.25 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0316 0.0857 0.25 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0118 0.034 0.25 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 6.04e-01 0.0325 0.0625 0.25 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 8.61e-01 0.0163 0.0931 0.25 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0599 0.105 0.24 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0424 0.0902 0.24 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 1.61e-01 0.135 0.0956 0.24 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000629 0.0515 0.24 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 1.26e-01 0.14 0.0912 0.24 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0781 0.09 0.24 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 1.64e-01 0.138 0.0991 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 4.51e-02 0.114 0.0566 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0665 0.086 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00449 0.0527 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 9.79e-01 0.00243 0.0912 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 4.23e-01 0.0762 0.0948 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0988 0.0949 0.25 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 7.98e-03 0.181 0.0677 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 1.84e-01 0.12 0.0897 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0051 0.0434 0.25 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 3.44e-02 0.168 0.0788 0.25 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 2.35e-01 0.108 0.0903 0.25 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 7.14e-01 0.0332 0.0905 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 1.91e-01 0.0568 0.0433 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 1.69e-02 -0.201 0.0833 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 3.12e-01 0.0487 0.048 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 7.85e-01 0.0205 0.0752 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0782 0.0927 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00955 0.0963 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 2.93e-01 0.0537 0.051 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 5.52e-01 0.0558 0.0938 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 2.84e-01 0.0532 0.0496 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00782 0.0878 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 8.75e-01 0.0149 0.0948 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 3.61e-02 0.202 0.0956 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 3.82e-01 0.0839 0.0958 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0111 0.0968 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 9.70e-01 0.00166 0.0447 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 6.76e-01 0.0324 0.0775 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 1.57e-01 0.128 0.0897 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 1.59e-01 -0.107 0.0759 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 1.02e-01 0.122 0.0743 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 4.56e-01 0.0516 0.0691 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 8.75e-01 -0.00709 0.0449 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 7.39e-01 0.0184 0.055 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 1.21e-01 0.134 0.086 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 6.85e-01 0.0331 0.0817 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 8.03e-01 0.0206 0.0823 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 5.12e-02 -0.158 0.0804 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0449 0.0419 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 6.71e-01 0.025 0.0588 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 2.66e-01 0.108 0.0971 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 5.49e-01 0.0567 0.0945 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 8.65e-01 0.0161 0.0947 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 2.82e-01 0.0977 0.0906 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0317 0.0372 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 9.14e-01 0.0069 0.064 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 1.02e-01 0.151 0.092 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 3.93e-01 0.073 0.0852 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 9.95e-01 0.000521 0.0798 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0508 0.0906 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 9.32e-01 0.00412 0.0485 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 8.68e-02 0.14 0.0814 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0581 0.094 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 8.26e-01 0.0198 0.0901 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 5.78e-01 0.0535 0.096 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 1.04e-01 -0.134 0.0824 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0225 0.0474 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0491 0.0595 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 1.99e-01 0.122 0.0948 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0914 0.0993 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 1.66e-01 0.127 0.0917 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0692 0.0913 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0459 0.0444 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 5.97e-02 0.138 0.0731 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 9.93e-01 0.000818 0.0977 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0298 0.093 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 1.91e-01 -0.133 0.101 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 2.78e-01 0.109 0.101 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 4.12e-02 0.11 0.0537 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0107 0.089 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 5.94e-02 0.193 0.102 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0171 0.0953 0.249 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 4.67e-01 0.0658 0.0904 0.249 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 8.31e-01 0.0196 0.0921 0.249 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 4.14e-02 -0.092 0.0448 0.249 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 3.25e-01 0.0627 0.0636 0.249 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00923 0.0949 0.249 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 9.67e-01 0.00437 0.105 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0477 0.0971 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0193 0.0987 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0164 0.055 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 4.42e-01 0.0633 0.0821 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 9.53e-01 0.00491 0.0825 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 9.78e-01 0.00206 0.0755 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 8.96e-02 -0.16 0.0938 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0247 0.0374 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 5.24e-01 0.053 0.083 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 4.69e-01 0.0755 0.104 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 9.43e-01 0.00674 0.0947 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 5.59e-01 -0.056 0.0958 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0204 0.0447 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 7.58e-01 0.0273 0.0883 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 9.52e-01 0.00515 0.0856 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 1.41e-01 0.122 0.0824 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0273 0.0932 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00085 0.0506 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0849 0.0839 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 2.15e-01 0.143 0.115 0.244 PB L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0824 0.0822 0.244 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0944 0.1 0.244 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 1.08e-01 -0.0918 0.0566 0.244 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 3.71e-01 0.0828 0.0922 0.244 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 6.89e-01 0.0431 0.107 0.244 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0545 0.0979 0.25 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 9.77e-02 0.145 0.0869 0.25 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0604 0.0937 0.25 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 7.73e-01 0.0102 0.0355 0.25 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 5.76e-01 0.0398 0.0711 0.25 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 6.60e-01 0.0405 0.0918 0.25 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00572 0.0971 0.25 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 1.60e-01 0.129 0.0911 0.25 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 5.41e-01 0.0471 0.077 0.25 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 2.86e-01 0.0363 0.034 0.25 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 8.45e-01 0.0141 0.0718 0.25 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 9.94e-01 0.000755 0.0963 0.25 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 7.41e-01 0.0338 0.102 0.251 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 7.33e-01 0.0273 0.0801 0.251 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 693585 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0383 0.0795 0.251 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 714295 sc-eQTL 4.49e-01 0.0708 0.0934 0.251 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0624 0.091 0.251 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0555 0.0448 0.251 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 5.24e-02 0.146 0.075 0.251 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 3.55e-01 0.0824 0.0889 0.251 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 325222 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0573 0.0711 0.251 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -867951 sc-eQTL 5.78e-02 0.166 0.0868 0.251 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 6.65e-01 0.0346 0.0798 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00716 0.0606 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 693585 sc-eQTL 9.34e-01 0.00713 0.0856 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 714295 sc-eQTL 6.64e-02 0.158 0.0857 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0745 0.0689 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 4.04e-01 -0.032 0.0383 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 3.92e-01 0.049 0.0571 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00595 0.074 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -867951 sc-eQTL 4.29e-01 0.0609 0.0769 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0241 0.0905 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 1.05e-01 0.106 0.065 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 693585 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0813 0.0815 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 714295 sc-eQTL 1.63e-01 0.124 0.0883 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0278 0.0581 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0259 0.0418 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 1.11e-01 0.0762 0.0475 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 7.48e-02 -0.138 0.0768 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -867951 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00139 0.0757 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0732 0.122 0.261 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 1.86e-01 0.139 0.104 0.261 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 2.63e-01 -0.13 0.116 0.261 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 9.10e-01 0.00499 0.0443 0.261 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 6.52e-02 0.153 0.0825 0.261 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00747 0.114 0.261 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 4.72e-01 0.0662 0.0918 0.251 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0305 0.0878 0.251 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 693585 sc-eQTL 1.19e-01 -0.138 0.0881 0.251 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 714295 sc-eQTL 1.80e-01 0.117 0.0872 0.251 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0271 0.089 0.251 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0507 0.0386 0.251 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 6.77e-01 0.0271 0.0651 0.251 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 6.92e-01 0.0374 0.0943 0.251 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -867951 sc-eQTL 8.29e-01 0.0195 0.0902 0.251 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 9.00e-01 0.0122 0.0972 0.249 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0204 0.0657 0.249 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 693585 sc-eQTL 5.86e-01 0.0505 0.0927 0.249 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 714295 sc-eQTL 5.18e-01 0.0595 0.092 0.249 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 8.99e-01 0.0113 0.0886 0.249 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0194 0.0444 0.249 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 1.02e-02 0.16 0.0618 0.249 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00099 0.0785 0.249 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -867951 sc-eQTL 2.61e-02 0.184 0.0819 0.249 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0892 0.112 0.26 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0512 0.0747 0.26 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 693585 sc-eQTL 7.00e-02 -0.136 0.0745 0.26 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 714295 sc-eQTL 4.44e-01 0.0587 0.0765 0.26 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0557 0.0911 0.26 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0325 0.0628 0.26 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 3.70e-01 0.0572 0.0637 0.26 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 1.04e-02 -0.236 0.091 0.26 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 325222 sc-eQTL 3.76e-01 0.0789 0.0888 0.26 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -867951 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0307 0.0789 0.26 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 3.80e-01 0.0849 0.0965 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 1.53e-02 0.128 0.0525 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 2.15e-01 0.104 0.0839 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 9.89e-01 0.000658 0.048 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 4.33e-01 0.0589 0.0749 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 2.44e-01 0.103 0.0878 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 7.54e-01 0.0284 0.0906 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 1.05e-01 0.066 0.0406 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 1.28e-01 -0.121 0.0789 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 2.09e-01 0.0602 0.0478 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00282 0.0743 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0513 0.0904 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0043 0.0725 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 5.77e-01 0.0281 0.0504 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 693585 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0409 0.0821 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 714295 sc-eQTL 3.07e-02 0.184 0.0848 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0431 0.0566 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0388 0.0388 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 4.03e-01 0.0443 0.0529 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0568 0.069 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -867951 sc-eQTL 7.72e-01 0.021 0.0725 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 6.65e-01 0.0408 0.094 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0451 0.062 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 693585 sc-eQTL 2.98e-01 -0.095 0.091 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 714295 sc-eQTL 2.41e-01 0.106 0.0902 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 7.51e-01 0.027 0.0853 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0188 0.0362 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 7.95e-02 0.0958 0.0544 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0102 0.0879 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -867951 sc-eQTL 2.00e-01 0.102 0.0791 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -523820 sc-eQTL 7.17e-01 0.0276 0.0759 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 915152 sc-eQTL 7.52e-01 0.0226 0.0713 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 664891 sc-eQTL 1.87e-01 -0.119 0.0899 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 613781 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0315 0.0368 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -889762 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00249 0.0762 0.25 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 915152 eQTL 0.00016 0.0697 0.0184 0.0 0.0 0.236
ENSG00000112299 VNN1 714295 pQTL 0.000906 0.134 0.0402 0.0 0.0 0.249
ENSG00000146409 SLC18B1 615011 eQTL 0.024 0.0586 0.0259 0.0 0.0 0.236

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina