logo

Genes within 1Mb (chr6:133427876:CTGTTA:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 8.85e-01 0.0219 0.151 0.079 B L1
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 1.00e+00 -6.77e-06 0.0601 0.079 B L1
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 7.65e-01 0.0338 0.113 0.079 B L1
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 7.29e-02 -0.122 0.0678 0.079 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0726 0.105 0.079 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 6.56e-01 0.064 0.144 0.079 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 8.74e-03 -0.285 0.108 0.079 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 1.22e-01 -0.176 0.113 0.079 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 3.24e-01 0.0974 0.0985 0.079 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0105 0.0671 0.079 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0519 0.0901 0.079 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0607 0.136 0.079 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 1.13e-01 -0.173 0.108 0.079 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 4.72e-02 -0.225 0.113 0.079 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 1.57e-01 0.188 0.132 0.079 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0381 0.0453 0.079 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 4.03e-01 0.0585 0.0698 0.079 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 5.15e-01 0.0894 0.137 0.079 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 6.83e-01 0.0675 0.165 0.083 DC L1
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0682 0.102 0.083 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 693111 sc-eQTL 4.34e-02 0.256 0.126 0.083 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 713821 sc-eQTL 5.04e-01 0.0918 0.137 0.083 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 9.01e-01 0.0182 0.147 0.083 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 8.86e-01 0.0118 0.0823 0.083 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 3.94e-02 -0.196 0.0945 0.083 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0907 0.13 0.083 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 324748 sc-eQTL 6.60e-01 0.0522 0.119 0.083 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -868425 sc-eQTL 7.34e-01 0.0503 0.148 0.083 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 7.50e-01 -0.037 0.116 0.079 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 3.78e-01 0.0683 0.0773 0.079 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 693111 sc-eQTL 1.86e-02 -0.311 0.131 0.079 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 713821 sc-eQTL 9.25e-01 0.0134 0.143 0.079 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 1.00e-01 0.166 0.1 0.079 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 6.43e-01 0.0281 0.0605 0.079 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0683 0.0853 0.079 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 9.31e-01 0.0103 0.12 0.079 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -868425 sc-eQTL 2.12e-01 -0.147 0.117 0.079 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 5.94e-01 0.0681 0.128 0.079 NK L1
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 9.74e-01 0.00385 0.118 0.079 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 9.99e-01 0.000122 0.147 0.079 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0634 0.0607 0.079 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 3.16e-01 -0.113 0.112 0.079 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 9.26e-01 0.0141 0.151 0.079 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0662 0.119 0.079 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 2.56e-02 0.319 0.142 0.079 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0293 0.0569 0.079 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 5.93e-01 -0.056 0.105 0.079 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 2.26e-01 -0.189 0.155 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 9.92e-02 0.299 0.18 0.082 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0485 0.155 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 4.27e-01 0.131 0.165 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 8.99e-01 0.0113 0.0887 0.082 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 9.99e-01 0.000149 0.158 0.082 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 3.49e-01 0.145 0.155 0.082 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 9.95e-01 0.000982 0.166 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0396 0.0954 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 6.91e-01 0.0572 0.144 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 1.14e-01 -0.139 0.0875 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0132 0.152 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0342 0.158 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 1.81e-01 0.218 0.162 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 2.89e-01 -0.125 0.117 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 2.08e-01 -0.194 0.153 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 3.59e-01 -0.068 0.074 0.08 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 9.90e-02 -0.224 0.135 0.08 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 8.88e-01 0.0219 0.155 0.08 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0906 0.151 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 7.68e-01 0.0215 0.0726 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 4.47e-01 0.107 0.141 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 6.42e-02 -0.148 0.0796 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 2.65e-01 -0.14 0.125 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 6.37e-03 0.419 0.152 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 5.25e-01 0.102 0.161 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 1.34e-01 0.128 0.085 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 3.54e-01 -0.146 0.157 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 1.73e-01 -0.113 0.0827 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 1.27e-01 0.224 0.146 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 1.05e-01 -0.257 0.158 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 6.42e-01 0.0752 0.161 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 1.38e-01 -0.238 0.159 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 3.32e-01 0.157 0.161 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 6.88e-01 0.03 0.0747 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 9.81e-01 0.00313 0.129 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 9.43e-01 0.0107 0.151 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 2.12e-01 -0.157 0.125 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 4.06e-02 -0.252 0.122 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0155 0.114 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0217 0.0741 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00468 0.0907 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 1.29e-01 -0.216 0.142 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 2.61e-02 -0.302 0.135 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 8.21e-01 0.0311 0.137 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 5.27e-04 0.463 0.132 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0155 0.0702 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 1.87e-02 -0.23 0.097 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 2.42e-02 0.365 0.161 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 4.51e-01 0.118 0.156 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 6.32e-01 0.0749 0.156 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 1.43e-01 -0.219 0.149 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 5.43e-01 0.0374 0.0615 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 1.67e-01 -0.146 0.105 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0195 0.153 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 4.29e-01 -0.11 0.139 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 3.59e-02 -0.273 0.129 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 3.97e-01 0.126 0.148 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0105 0.0793 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 1.80e-01 -0.179 0.133 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 3.48e-01 0.144 0.153 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0678 0.147 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0738 0.156 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 7.17e-01 0.049 0.135 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 4.18e-01 0.0627 0.0772 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 7.66e-01 0.0289 0.097 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 3.30e-01 -0.151 0.155 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0284 0.179 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 5.42e-01 -0.101 0.166 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 4.24e-01 0.132 0.164 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 1.68e-01 -0.111 0.0799 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 9.69e-01 0.00514 0.133 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00433 0.176 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 5.31e-01 0.0949 0.151 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 8.20e-01 0.0376 0.165 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 1.23e-01 0.253 0.163 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0219 0.0884 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 7.66e-01 0.0432 0.145 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 6.72e-01 0.0707 0.167 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 2.48e-01 -0.185 0.16 0.078 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 9.04e-02 -0.257 0.151 0.078 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 4.39e-01 0.12 0.155 0.078 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0126 0.0762 0.078 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000394 0.107 0.078 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 2.09e-01 -0.201 0.159 0.078 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 3.52e-01 -0.152 0.163 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0129 0.152 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0854 0.154 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 5.82e-01 0.0474 0.0858 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 2.29e-01 -0.154 0.128 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 3.49e-01 0.128 0.136 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 6.71e-01 -0.053 0.125 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0081 0.156 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0645 0.0617 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 4.21e-01 -0.11 0.137 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 2.42e-01 -0.198 0.169 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 6.13e-01 0.0782 0.154 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 2.59e-01 0.176 0.156 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 4.34e-01 -0.057 0.0726 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 4.29e-02 0.29 0.142 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0132 0.142 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 9.31e-01 0.0119 0.138 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0682 0.155 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0227 0.084 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 7.92e-01 0.037 0.14 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 5.13e-02 -0.385 0.196 0.078 PB L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0388 0.142 0.078 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 4.65e-01 0.127 0.173 0.078 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 5.25e-01 0.0626 0.0982 0.078 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 1.35e-01 -0.237 0.157 0.078 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 3.92e-01 -0.158 0.184 0.078 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 5.05e-01 0.104 0.156 0.08 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 8.42e-01 0.0279 0.139 0.08 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 2.81e-01 0.161 0.149 0.08 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0613 0.0564 0.08 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0353 0.113 0.08 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0483 0.146 0.08 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0966 0.16 0.079 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 3.82e-01 -0.132 0.151 0.079 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 6.42e-01 0.0591 0.127 0.079 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00226 0.0562 0.079 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 9.07e-01 0.0138 0.118 0.079 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0232 0.159 0.079 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 9.03e-01 0.0207 0.169 0.078 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 9.34e-01 0.011 0.133 0.078 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 693111 sc-eQTL 8.55e-01 0.024 0.132 0.078 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 713821 sc-eQTL 8.54e-01 0.0286 0.155 0.078 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 1.78e-01 0.203 0.15 0.078 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 2.06e-01 0.0941 0.0741 0.078 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 1.22e-01 -0.194 0.125 0.078 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0475 0.147 0.078 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 324748 sc-eQTL 4.75e-01 0.0843 0.118 0.078 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -868425 sc-eQTL 3.01e-01 -0.15 0.145 0.078 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0167 0.131 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 5.98e-01 0.0524 0.0993 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 693111 sc-eQTL 3.68e-02 -0.292 0.139 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 713821 sc-eQTL 2.93e-01 -0.149 0.141 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 3.46e-02 0.238 0.112 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 9.52e-01 0.00383 0.0629 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 2.60e-01 -0.106 0.0935 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0903 0.121 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -868425 sc-eQTL 1.60e-01 -0.177 0.126 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0512 0.149 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 4.95e-01 0.0737 0.108 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 693111 sc-eQTL 2.67e-02 -0.297 0.133 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 713821 sc-eQTL 3.94e-01 0.125 0.146 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 7.06e-01 0.0362 0.0958 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 7.00e-01 0.0266 0.069 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0234 0.0789 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 1.24e-01 0.196 0.127 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -868425 sc-eQTL 3.19e-01 -0.124 0.125 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 7.40e-02 0.384 0.213 0.067 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 9.14e-03 0.478 0.181 0.067 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 9.66e-01 0.00866 0.205 0.067 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0491 0.078 0.067 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 1.36e-01 0.219 0.146 0.067 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 1.51e-01 0.289 0.2 0.067 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 4.40e-01 -0.118 0.152 0.082 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 7.42e-01 -0.048 0.146 0.082 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 693111 sc-eQTL 2.58e-01 -0.166 0.147 0.082 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 713821 sc-eQTL 3.61e-01 0.133 0.145 0.082 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 3.85e-01 0.129 0.148 0.082 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 7.54e-01 0.0202 0.0643 0.082 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 1.97e-01 -0.139 0.108 0.082 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 2.59e-01 0.177 0.156 0.082 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -868425 sc-eQTL 9.45e-01 0.0104 0.15 0.082 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 8.36e-01 -0.033 0.16 0.081 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 3.41e-01 -0.103 0.108 0.081 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 693111 sc-eQTL 3.00e-01 -0.158 0.152 0.081 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 713821 sc-eQTL 5.74e-01 0.0852 0.151 0.081 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 3.58e-01 0.134 0.145 0.081 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 9.30e-01 0.00647 0.073 0.081 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 4.19e-01 0.0834 0.103 0.081 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 3.08e-01 -0.132 0.129 0.081 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -868425 sc-eQTL 9.18e-01 0.014 0.136 0.081 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0619 0.189 0.071 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 8.87e-01 0.018 0.126 0.071 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 693111 sc-eQTL 9.50e-02 0.211 0.126 0.071 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 713821 sc-eQTL 2.55e-01 0.147 0.128 0.071 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0798 0.153 0.071 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 6.28e-01 0.0513 0.106 0.071 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0233 0.107 0.071 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 7.01e-01 0.0602 0.157 0.071 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 324748 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0465 0.15 0.071 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -868425 sc-eQTL 1.32e-01 0.2 0.132 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 3.11e-01 0.162 0.16 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0743 0.0882 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0728 0.14 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0623 0.0795 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 9.95e-01 0.000798 0.124 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 3.29e-01 0.142 0.146 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0169 0.149 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 5.80e-01 0.0371 0.0669 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 7.15e-01 0.0475 0.13 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 3.79e-02 -0.163 0.0779 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0466 0.122 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 2.41e-01 0.174 0.148 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0161 0.12 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 2.79e-01 0.0902 0.083 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 693111 sc-eQTL 2.29e-02 -0.307 0.134 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 713821 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0158 0.142 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 9.24e-02 0.157 0.093 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 8.09e-01 0.0155 0.0642 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0777 0.0873 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 9.69e-01 0.00445 0.114 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -868425 sc-eQTL 1.27e-01 -0.183 0.119 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 4.63e-01 -0.115 0.156 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 1.69e-01 -0.142 0.103 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 693111 sc-eQTL 2.01e-01 -0.194 0.151 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 713821 sc-eQTL 7.82e-01 0.0418 0.15 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 2.67e-01 0.157 0.141 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 8.18e-01 0.0139 0.0602 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0397 0.0911 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 614537 sc-eQTL 9.25e-01 0.0138 0.146 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -868425 sc-eQTL 8.80e-01 -0.02 0.132 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -524294 sc-eQTL 5.37e-01 0.0781 0.126 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 914678 sc-eQTL 8.38e-01 0.0243 0.119 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 664417 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000504 0.15 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 613307 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0587 0.0611 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -890236 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0776 0.126 0.078 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118515 \N -890236 4e-06 4.16e-06 5.33e-07 1.38e-06 2.1e-07 7.23e-07 1.52e-06 2.88e-07 1.66e-06 4.32e-07 2.35e-06 1.32e-06 2.56e-06 1.39e-06 3.84e-07 4.91e-07 9.51e-07 1.12e-06 5.07e-07 3.06e-07 7.49e-07 1.45e-06 1.12e-06 5.61e-07 2.49e-06 6.58e-07 6.7e-07 5.33e-07 1.62e-06 1.3e-06 8.27e-07 2.93e-08 1.31e-07 5.48e-07 5.66e-07 4.67e-07 6.39e-08 1.56e-07 8.45e-08 2.77e-08 4.41e-08 2.23e-06 9.01e-07 1.51e-07 1.92e-07 1.24e-07 2.41e-07 2.94e-09 4.83e-08