logo

Genes within 1Mb (chr6:133423313:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 7.82e-01 0.034 0.122 0.143 B L1
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 8.81e-01 -0.00731 0.0488 0.143 B L1
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 9.35e-01 0.00746 0.0917 0.143 B L1
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 2.46e-01 0.0642 0.0553 0.143 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 8.16e-01 0.02 0.0855 0.143 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 1.76e-02 0.275 0.115 0.143 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0256 0.0925 0.143 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 4.73e-01 -0.069 0.0961 0.143 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 1.66e-01 -0.115 0.0829 0.143 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 7.86e-01 0.0154 0.0566 0.143 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0747 0.076 0.143 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 1.15e-01 0.18 0.114 0.143 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 1.82e-01 -0.12 0.0898 0.143 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 8.72e-01 0.0151 0.0941 0.143 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0394 0.11 0.143 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 1.67e-01 0.0519 0.0374 0.143 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 5.05e-02 -0.113 0.0574 0.143 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 1.08e-02 0.288 0.112 0.143 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00616 0.137 0.142 DC L1
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0935 0.0851 0.142 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 688548 sc-eQTL 5.78e-01 0.0589 0.106 0.142 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 709258 sc-eQTL 1.41e-01 0.168 0.114 0.142 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 5.95e-01 0.0651 0.122 0.142 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 4.96e-01 0.0467 0.0685 0.142 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0438 0.0795 0.142 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 8.04e-01 0.027 0.108 0.142 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 320185 sc-eQTL 8.34e-01 0.0208 0.0988 0.142 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -872988 sc-eQTL 6.60e-01 0.0541 0.123 0.142 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 4.71e-01 0.0693 0.0961 0.143 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 8.64e-01 -0.011 0.0644 0.143 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 688548 sc-eQTL 3.29e-01 0.108 0.11 0.143 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 709258 sc-eQTL 8.34e-02 -0.205 0.118 0.143 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 9.05e-02 0.142 0.0833 0.143 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0202 0.0503 0.143 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 1.32e-02 -0.175 0.07 0.143 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 5.50e-01 0.0595 0.0994 0.143 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -872988 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0804 0.0976 0.143 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0814 0.105 0.144 NK L1
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 8.45e-01 0.0191 0.0974 0.144 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0863 0.121 0.144 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 4.93e-01 0.0344 0.0501 0.144 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0588 0.0926 0.144 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 2.32e-01 0.146 0.121 0.143 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00694 0.0959 0.143 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0103 0.116 0.143 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0469 0.0459 0.143 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0724 0.0845 0.143 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 2.59e-01 0.142 0.126 0.143 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 2.30e-02 0.314 0.137 0.158 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00381 0.119 0.158 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 5.08e-01 0.0838 0.126 0.158 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 4.14e-01 0.0554 0.0676 0.158 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 2.80e-01 -0.131 0.12 0.158 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 2.46e-01 0.138 0.118 0.158 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 2.41e-01 -0.16 0.136 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00107 0.0783 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 9.89e-01 0.00162 0.118 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 5.55e-01 0.0427 0.0722 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 1.27e-02 -0.309 0.123 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 1.10e-01 0.208 0.129 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 4.87e-01 0.091 0.13 0.144 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 8.67e-02 -0.162 0.0939 0.144 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0777 0.124 0.144 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 1.31e-01 0.0897 0.0593 0.144 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0126 0.109 0.144 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 3.00e-01 -0.129 0.124 0.144 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 4.64e-01 0.0904 0.123 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0118 0.0593 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 6.99e-01 0.0446 0.115 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 3.67e-01 0.0592 0.0655 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 9.49e-01 0.00652 0.103 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 8.55e-02 0.217 0.126 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 6.42e-01 0.0607 0.13 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0164 0.0693 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 8.30e-01 0.0273 0.127 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 3.45e-01 0.0636 0.0672 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0705 0.119 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 6.68e-02 0.235 0.127 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 6.07e-01 0.0671 0.13 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0537 0.13 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0703 0.131 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 3.83e-01 0.0527 0.0603 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0978 0.104 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 9.16e-01 0.0129 0.122 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 2.02e-01 0.134 0.105 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0116 0.103 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 5.35e-02 -0.184 0.0949 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 8.24e-01 0.0138 0.0621 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0752 0.0759 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 3.91e-02 0.246 0.118 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 2.78e-01 -0.123 0.113 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 2.26e-01 -0.138 0.114 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 3.33e-01 0.109 0.112 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 6.85e-01 0.0237 0.0583 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 1.83e-01 -0.109 0.0813 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0326 0.135 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0174 0.134 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 6.47e-01 0.0615 0.134 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 1.02e-01 -0.21 0.128 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00603 0.0528 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 3.26e-02 -0.193 0.0897 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 9.71e-01 0.00474 0.131 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 5.11e-01 0.0761 0.116 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0877 0.108 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 9.07e-01 0.0144 0.123 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 7.52e-01 0.0208 0.0658 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 1.65e-02 -0.265 0.11 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 3.95e-01 0.109 0.127 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 7.60e-02 -0.216 0.121 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 4.81e-01 0.0919 0.13 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0667 0.112 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 2.00e-01 0.0824 0.0641 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 6.39e-02 -0.149 0.0801 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 3.54e-03 0.373 0.127 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0201 0.14 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 1.94e-01 -0.168 0.129 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 4.42e-01 0.0987 0.128 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0296 0.0625 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 1.15e-02 -0.26 0.102 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 8.67e-01 0.0231 0.137 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 3.39e-01 -0.12 0.125 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0674 0.137 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 3.12e-01 -0.138 0.136 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0433 0.0734 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 2.27e-01 -0.145 0.12 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0823 0.139 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 6.63e-01 0.0578 0.132 0.143 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 9.47e-01 0.00834 0.126 0.143 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 8.80e-02 0.218 0.127 0.143 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0734 0.0627 0.143 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0552 0.0884 0.143 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 4.46e-01 0.101 0.132 0.143 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 4.47e-01 -0.104 0.137 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 2.20e-01 -0.155 0.126 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 2.66e-01 -0.143 0.128 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0153 0.0717 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 9.30e-01 0.00944 0.107 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 2.08e-01 0.142 0.112 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 5.95e-01 0.055 0.103 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 9.41e-01 0.00959 0.129 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 2.19e-01 0.063 0.0511 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 1.58e-01 -0.16 0.113 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0121 0.147 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 3.04e-01 0.137 0.133 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 4.99e-01 0.0913 0.135 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00574 0.0629 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0615 0.124 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 8.17e-02 -0.202 0.116 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00694 0.113 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 1.41e-01 -0.186 0.126 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00121 0.0688 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 2.18e-01 0.141 0.114 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 6.19e-01 0.0767 0.154 0.156 PB L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 1.24e-01 -0.168 0.108 0.156 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 3.17e-01 0.134 0.133 0.156 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0273 0.076 0.156 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 7.83e-01 0.0338 0.123 0.156 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 1.76e-01 -0.192 0.141 0.156 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 9.32e-01 0.011 0.129 0.141 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 3.15e-01 -0.116 0.115 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 9.92e-01 0.00125 0.124 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0472 0.0468 0.141 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 1.03e-01 -0.153 0.0934 0.141 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00364 0.121 0.141 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 3.70e-01 -0.122 0.135 0.143 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0609 0.128 0.143 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 2.08e-01 0.135 0.107 0.143 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0551 0.0475 0.143 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 1.52e-01 -0.144 0.0998 0.143 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 4.07e-01 0.112 0.134 0.143 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 7.62e-01 0.0422 0.139 0.146 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0374 0.109 0.146 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 688548 sc-eQTL 3.38e-01 0.104 0.108 0.146 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 709258 sc-eQTL 4.58e-01 0.0946 0.127 0.146 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 2.29e-01 -0.149 0.124 0.146 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 5.72e-01 0.0347 0.0612 0.146 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 2.79e-01 -0.112 0.103 0.146 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00786 0.121 0.146 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 320185 sc-eQTL 1.26e-01 0.148 0.0964 0.146 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -872988 sc-eQTL 4.24e-01 0.0956 0.119 0.146 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 4.36e-01 0.0853 0.109 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0295 0.0831 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 688548 sc-eQTL 3.26e-01 0.115 0.117 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 709258 sc-eQTL 1.04e-01 -0.192 0.118 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 8.16e-02 0.165 0.0941 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00251 0.0526 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 1.27e-01 -0.12 0.078 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 2.16e-01 0.125 0.101 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -872988 sc-eQTL 9.29e-01 0.0094 0.106 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 6.59e-01 0.0547 0.124 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0721 0.0894 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 688548 sc-eQTL 3.07e-01 0.114 0.112 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 709258 sc-eQTL 2.07e-01 -0.153 0.121 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 2.14e-01 0.0988 0.0792 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0206 0.0572 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 8.86e-02 -0.111 0.065 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 3.43e-01 0.1 0.106 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -872988 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0407 0.104 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 9.69e-02 0.302 0.181 0.124 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 5.15e-01 -0.102 0.157 0.124 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0229 0.174 0.124 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 1.20e-01 0.103 0.0656 0.124 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 3.64e-02 -0.26 0.123 0.124 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 8.77e-01 0.0264 0.171 0.124 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 2.66e-01 0.141 0.126 0.144 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 2.79e-01 -0.131 0.12 0.144 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 688548 sc-eQTL 5.84e-01 0.0669 0.122 0.144 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 709258 sc-eQTL 1.60e-01 -0.169 0.12 0.144 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0531 0.122 0.144 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0216 0.0533 0.144 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 1.11e-01 -0.142 0.089 0.144 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 2.66e-01 -0.144 0.129 0.144 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -872988 sc-eQTL 3.05e-01 -0.127 0.124 0.144 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 5.20e-02 -0.256 0.131 0.145 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 1.97e-01 0.115 0.0891 0.145 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 688548 sc-eQTL 3.95e-01 0.107 0.126 0.145 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 709258 sc-eQTL 7.19e-01 0.0452 0.125 0.145 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 9.50e-01 0.00762 0.12 0.145 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0406 0.0604 0.145 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 2.62e-02 -0.189 0.0844 0.145 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 2.03e-01 -0.136 0.106 0.145 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -872988 sc-eQTL 5.58e-01 0.0662 0.113 0.145 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0589 0.159 0.138 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 6.82e-01 0.0435 0.106 0.138 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 688548 sc-eQTL 4.04e-01 0.089 0.106 0.138 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 709258 sc-eQTL 9.40e-02 0.181 0.108 0.138 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 8.74e-04 0.423 0.125 0.138 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 3.99e-01 0.075 0.0888 0.138 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 8.98e-01 0.0116 0.0904 0.138 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 8.67e-01 0.0221 0.132 0.138 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 320185 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0216 0.126 0.138 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -872988 sc-eQTL 3.34e-01 0.108 0.111 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 7.14e-01 -0.048 0.131 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0845 0.0718 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 2.91e-01 -0.12 0.114 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 3.16e-01 0.0651 0.0648 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 5.81e-02 -0.192 0.101 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 1.65e-01 0.165 0.119 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 6.36e-01 0.0582 0.123 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0266 0.0554 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 6.94e-01 0.0424 0.108 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 4.04e-01 0.0544 0.065 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0394 0.101 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 4.45e-02 0.246 0.122 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 4.14e-01 0.0812 0.0993 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0212 0.0692 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 688548 sc-eQTL 3.08e-01 0.115 0.112 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 709258 sc-eQTL 4.59e-02 -0.234 0.116 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 1.63e-01 0.108 0.0774 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 9.63e-01 0.00246 0.0533 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 7.39e-02 -0.13 0.0721 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 2.15e-01 0.118 0.0945 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -872988 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0149 0.0995 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0444 0.128 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 6.05e-01 0.0437 0.0844 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 688548 sc-eQTL 1.75e-01 0.168 0.124 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 709258 sc-eQTL 8.61e-01 0.0215 0.123 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 8.06e-01 0.0285 0.116 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0386 0.0492 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 4.12e-02 -0.152 0.0738 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 609974 sc-eQTL 2.46e-01 -0.139 0.119 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -872988 sc-eQTL 2.06e-01 -0.137 0.108 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -528857 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0594 0.104 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 910115 sc-eQTL 6.79e-01 0.0405 0.0977 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 659854 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0611 0.124 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 608744 sc-eQTL 3.69e-01 0.0454 0.0504 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -894799 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0472 0.104 0.144 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 709258 pQTL 0.00198 -0.156 0.0502 0.0 0.0 0.138

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina