logo

Genes within 1Mb (chr6:133418136:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 6.30e-01 0.0436 0.0904 0.239 B L1
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 1.20e-01 0.0559 0.0358 0.239 B L1
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 6.16e-01 -0.034 0.0677 0.239 B L1
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 6.21e-01 0.0203 0.0409 0.239 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0143 0.0631 0.239 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 3.93e-01 0.0736 0.086 0.239 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 6.52e-01 0.03 0.0664 0.239 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 2.09e-01 0.0867 0.0688 0.239 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 7.78e-01 0.0169 0.0598 0.239 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 8.12e-01 -0.00969 0.0406 0.239 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0139 0.0546 0.239 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 8.61e-02 0.141 0.0817 0.239 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 5.66e-01 0.0378 0.0657 0.239 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00172 0.0686 0.239 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0701 0.0799 0.239 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 7.99e-01 -0.00699 0.0274 0.239 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0255 0.0421 0.239 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 3.95e-01 0.0704 0.0826 0.239 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 7.19e-01 0.036 0.1 0.241 DC L1
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00261 0.0622 0.241 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 683371 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0985 0.0769 0.241 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 704081 sc-eQTL 2.40e-01 0.0979 0.083 0.241 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 7.45e-01 -0.029 0.0891 0.241 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 1.57e-01 -0.0706 0.0497 0.241 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 4.27e-01 0.0461 0.0579 0.241 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0591 0.079 0.241 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 315008 sc-eQTL 2.52e-01 0.0824 0.0718 0.241 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -878165 sc-eQTL 5.20e-01 0.0578 0.0896 0.241 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 6.18e-01 0.035 0.0701 0.239 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 8.05e-01 0.0116 0.0469 0.239 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 683371 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0441 0.0804 0.239 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 704081 sc-eQTL 3.56e-02 0.181 0.0857 0.239 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0529 0.061 0.239 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0337 0.0366 0.239 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 1.59e-01 0.0727 0.0515 0.239 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0746 0.0723 0.239 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -878165 sc-eQTL 4.03e-01 0.0596 0.0711 0.239 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 6.80e-01 0.0317 0.0767 0.238 NK L1
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 7.17e-01 0.0258 0.071 0.238 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0462 0.0883 0.238 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 6.82e-01 -0.015 0.0365 0.238 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00317 0.0676 0.238 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0832 0.09 0.239 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 9.47e-02 0.118 0.0705 0.239 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0223 0.0858 0.239 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0143 0.034 0.239 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 3.21e-01 0.0621 0.0625 0.239 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 5.15e-01 0.0607 0.093 0.239 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0579 0.106 0.227 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0554 0.0908 0.227 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 1.93e-01 0.126 0.0962 0.227 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 9.40e-01 0.00393 0.0518 0.227 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 1.51e-01 0.133 0.0918 0.227 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0709 0.0906 0.227 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 1.93e-01 0.13 0.0993 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 4.61e-02 0.114 0.0568 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0647 0.0862 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 9.60e-01 0.00265 0.0528 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0145 0.0913 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 2.46e-01 0.11 0.0949 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 1.27e-01 -0.145 0.0949 0.239 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 1.69e-02 0.164 0.0681 0.239 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 1.94e-01 0.117 0.0899 0.239 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 8.62e-01 -0.00759 0.0435 0.239 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 7.12e-02 0.144 0.0792 0.239 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 2.67e-01 0.101 0.0905 0.239 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 6.94e-01 0.0358 0.0907 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 2.18e-01 0.0537 0.0435 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 2.63e-02 -0.187 0.0837 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 2.27e-01 0.0583 0.0481 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 6.26e-01 0.0368 0.0754 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0568 0.093 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0345 0.0963 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 3.35e-01 0.0493 0.0511 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 2.80e-01 0.102 0.0937 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 2.20e-01 0.061 0.0496 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0195 0.0879 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 8.15e-01 0.0222 0.0949 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 3.41e-02 0.204 0.0955 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 5.21e-01 0.0616 0.0959 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 7.20e-01 0.0347 0.0968 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 9.59e-01 0.00233 0.0447 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 7.00e-01 0.0299 0.0775 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 7.84e-02 0.158 0.0895 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0952 0.076 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 1.68e-01 0.103 0.0745 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 4.72e-01 0.0498 0.0692 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00651 0.0449 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 7.52e-01 0.0174 0.055 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 8.79e-02 0.147 0.0859 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 5.78e-01 0.0455 0.0817 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 6.67e-01 0.0355 0.0823 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 9.14e-02 -0.137 0.0806 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0516 0.0419 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 5.55e-01 0.0348 0.0588 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 2.95e-01 0.102 0.0972 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 6.32e-01 0.0453 0.0945 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 6.93e-01 0.0374 0.0946 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 3.08e-01 0.0926 0.0906 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0367 0.0372 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 7.99e-01 0.0163 0.064 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 6.19e-02 0.172 0.0918 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 4.57e-01 0.0632 0.0848 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 9.89e-01 0.00109 0.0794 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0186 0.0902 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 8.64e-01 0.0083 0.0483 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 9.22e-02 0.137 0.081 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0476 0.0935 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 6.84e-01 0.0367 0.0899 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 3.90e-01 0.0824 0.0957 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 1.80e-01 -0.111 0.0823 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0182 0.0473 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 3.81e-01 -0.052 0.0593 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 5.32e-01 0.0594 0.0949 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 3.53e-01 -0.093 0.0999 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 2.21e-01 0.113 0.0923 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 3.39e-01 -0.088 0.0918 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0317 0.0448 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 1.61e-01 0.104 0.0739 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0114 0.0983 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0387 0.0929 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 2.53e-01 -0.116 0.101 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 1.54e-01 0.144 0.1 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 8.87e-02 0.0921 0.0539 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0136 0.0889 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 4.40e-02 0.206 0.102 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0309 0.095 0.24 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 6.49e-01 0.0411 0.0903 0.24 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 8.71e-01 0.0149 0.0918 0.24 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 2.10e-02 -0.104 0.0446 0.24 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 2.78e-01 0.069 0.0634 0.24 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 9.55e-01 0.00534 0.0947 0.24 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 8.98e-01 0.0135 0.105 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0531 0.0973 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0393 0.0989 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 8.83e-01 -0.00812 0.0551 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 4.95e-01 0.0563 0.0823 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 8.80e-01 0.0125 0.0825 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00168 0.0755 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 2.15e-01 -0.117 0.0941 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0172 0.0375 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 4.02e-01 0.0696 0.0829 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 4.25e-01 0.083 0.104 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 8.28e-01 0.0206 0.0946 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0207 0.0958 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 8.30e-01 -0.00958 0.0446 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 8.31e-01 0.0189 0.0882 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 7.67e-01 0.0254 0.0855 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 1.13e-01 0.131 0.0823 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 7.04e-01 0.0355 0.0931 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 8.00e-01 0.0128 0.0505 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0955 0.0838 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 1.90e-01 0.152 0.115 0.241 PB L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0808 0.0822 0.241 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0815 0.101 0.241 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 7.04e-02 -0.103 0.0564 0.241 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 3.51e-01 0.0862 0.0922 0.241 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 6.44e-01 0.0497 0.107 0.241 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0469 0.0982 0.239 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 1.01e-01 0.144 0.0872 0.239 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0447 0.094 0.239 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 8.27e-01 0.00779 0.0356 0.239 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 2.24e-01 0.0868 0.0711 0.239 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 5.15e-01 0.06 0.092 0.239 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00099 0.0975 0.239 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 2.85e-01 0.0983 0.0917 0.239 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 5.22e-01 0.0496 0.0773 0.239 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 3.59e-01 0.0314 0.0342 0.239 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 8.25e-01 0.0159 0.0721 0.239 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 8.07e-01 0.0236 0.0967 0.239 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 8.99e-01 0.013 0.102 0.241 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 8.10e-01 0.0193 0.0801 0.241 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 683371 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0356 0.0795 0.241 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 704081 sc-eQTL 3.77e-01 0.0826 0.0934 0.241 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0592 0.0911 0.241 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0575 0.0448 0.241 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 8.36e-02 0.131 0.0752 0.241 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 3.96e-01 0.0757 0.089 0.241 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 315008 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0541 0.0712 0.241 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -878165 sc-eQTL 5.48e-02 0.168 0.0868 0.241 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 6.00e-01 0.042 0.0799 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 9.66e-01 0.00262 0.0607 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 683371 sc-eQTL 9.30e-01 0.0075 0.0858 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 704081 sc-eQTL 2.59e-02 0.192 0.0855 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 3.12e-01 -0.07 0.069 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0217 0.0384 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 2.19e-01 0.0704 0.0571 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0106 0.0741 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -878165 sc-eQTL 3.49e-01 0.0724 0.077 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00239 0.0908 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 9.73e-02 0.108 0.0651 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 683371 sc-eQTL 3.16e-01 -0.082 0.0817 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 704081 sc-eQTL 1.55e-01 0.126 0.0885 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0386 0.0582 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 7.93e-01 -0.011 0.0419 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 5.50e-02 0.0917 0.0475 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 4.62e-02 -0.154 0.0769 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -878165 sc-eQTL 9.24e-01 0.00723 0.0759 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0637 0.122 0.248 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 1.48e-01 0.152 0.104 0.248 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 3.20e-01 -0.116 0.116 0.248 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00557 0.0443 0.248 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 8.89e-02 0.142 0.0828 0.248 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 6.49e-01 0.0523 0.114 0.248 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 5.31e-01 0.0575 0.0918 0.24 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0135 0.0877 0.24 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 683371 sc-eQTL 9.19e-02 -0.149 0.0879 0.24 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 704081 sc-eQTL 1.04e-01 0.142 0.087 0.24 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 8.31e-01 -0.019 0.089 0.24 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 1.25e-01 -0.0593 0.0385 0.24 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 5.30e-01 0.0408 0.065 0.24 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 5.69e-01 0.0537 0.0942 0.24 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -878165 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00189 0.0902 0.24 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 7.89e-01 0.0261 0.0972 0.238 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0263 0.0657 0.238 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 683371 sc-eQTL 6.53e-01 0.0417 0.0927 0.238 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 704081 sc-eQTL 5.71e-01 0.0522 0.092 0.238 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 9.13e-01 0.00965 0.0885 0.238 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0194 0.0444 0.238 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 1.34e-02 0.154 0.0618 0.238 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 9.13e-01 0.00857 0.0784 0.238 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -878165 sc-eQTL 5.19e-02 0.161 0.0821 0.238 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0875 0.112 0.251 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0643 0.0742 0.251 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 683371 sc-eQTL 5.27e-02 -0.145 0.074 0.251 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 704081 sc-eQTL 4.10e-01 0.0628 0.0761 0.251 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0656 0.0906 0.251 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0252 0.0625 0.251 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 4.51e-01 0.0479 0.0634 0.251 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 1.78e-02 -0.218 0.0909 0.251 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 315008 sc-eQTL 3.58e-01 0.0814 0.0883 0.251 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -878165 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0397 0.0785 0.251 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 5.14e-01 0.0632 0.0967 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 1.92e-02 0.124 0.0526 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 1.92e-01 0.11 0.0839 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 9.80e-01 0.00122 0.048 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 5.31e-01 0.0471 0.075 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 1.76e-01 0.119 0.0878 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 7.77e-01 0.0257 0.0906 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 1.52e-01 0.0584 0.0406 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0859 0.079 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 1.44e-01 0.07 0.0477 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 9.17e-01 0.00774 0.0742 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0259 0.0904 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 8.64e-01 0.0124 0.0727 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 4.90e-01 0.0349 0.0505 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 683371 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0395 0.0823 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 704081 sc-eQTL 1.33e-02 0.211 0.0847 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0453 0.0567 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0246 0.0389 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 2.16e-01 0.0656 0.0529 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0678 0.0692 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -878165 sc-eQTL 6.72e-01 0.0308 0.0727 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 7.35e-01 0.0319 0.094 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0301 0.062 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 683371 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0891 0.0911 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 704081 sc-eQTL 2.43e-01 0.106 0.0902 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 7.64e-01 0.0256 0.0853 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 4.24e-01 -0.029 0.0361 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 4.66e-02 0.109 0.0543 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00688 0.0879 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -878165 sc-eQTL 2.62e-01 0.0892 0.0792 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -534034 sc-eQTL 6.76e-01 0.0318 0.0759 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 904938 sc-eQTL 6.44e-01 0.033 0.0713 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 654677 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0542 0.0902 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 603567 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0156 0.0368 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -899976 sc-eQTL 9.97e-01 0.000278 0.0761 0.239 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 904938 eQTL 7.2e-05 0.0741 0.0186 0.0 0.0 0.229
ENSG00000112299 VNN1 704081 pQTL 0.000597 0.14 0.0406 0.0 0.0 0.24
ENSG00000146409 SLC18B1 604797 eQTL 0.0292 0.0574 0.0263 0.0 0.0 0.229

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118515 \N -899976 2.8e-07 1.27e-07 5.35e-08 1.82e-07 9.8e-08 9.05e-08 1.6e-07 5.43e-08 1.45e-07 6.08e-08 1.52e-07 1.05e-07 1.53e-07 7.37e-08 5.98e-08 7.23e-08 4.12e-08 1.4e-07 6.32e-08 4.78e-08 1.26e-07 1.26e-07 1.44e-07 2.91e-08 1.63e-07 1.22e-07 1.18e-07 9.92e-08 1.23e-07 1.05e-07 1.02e-07 2.9e-08 3.96e-08 8.72e-08 3.63e-08 2.99e-08 5.22e-08 8.71e-08 6.59e-08 4.47e-08 4.69e-08 1.4e-07 5.27e-08 1.58e-08 3.42e-08 1.89e-08 1.2e-07 1.89e-09 5e-08