logo

Genes within 1Mb (chr6:133415427:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 6.66e-02 -0.195 0.106 0.229 B L1
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0557 0.0422 0.229 B L1
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0362 0.0796 0.229 B L1
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0292 0.0481 0.229 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 5.97e-02 0.139 0.0737 0.229 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 1.17e-01 -0.159 0.101 0.229 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 7.56e-01 0.0246 0.079 0.229 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0374 0.0821 0.229 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0643 0.071 0.229 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 6.74e-01 0.0204 0.0484 0.229 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 3.70e-02 0.135 0.0644 0.229 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 5.29e-02 -0.189 0.097 0.229 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0546 0.0795 0.229 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0328 0.0831 0.229 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 2.27e-01 -0.117 0.0967 0.229 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0185 0.0331 0.229 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 2.58e-01 0.0578 0.0509 0.229 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 6.20e-02 -0.186 0.0994 0.229 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0406 0.119 0.223 DC L1
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0364 0.0737 0.223 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 680662 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0514 0.0913 0.223 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 701372 sc-eQTL 1.13e-01 -0.156 0.0981 0.223 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 2.21e-01 -0.129 0.105 0.223 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 7.76e-01 0.0169 0.0592 0.223 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00361 0.0687 0.223 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 2.53e-01 0.107 0.0934 0.223 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 312299 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0982 0.085 0.223 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -880874 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00936 0.106 0.223 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 8.36e-01 0.0171 0.0828 0.229 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 3.21e-01 -0.055 0.0553 0.229 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 680662 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0107 0.0951 0.229 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 701372 sc-eQTL 7.69e-01 0.0301 0.102 0.229 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 4.20e-02 -0.146 0.0715 0.229 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 3.75e-01 0.0385 0.0432 0.229 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 4.43e-01 0.0469 0.0611 0.229 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 2.27e-01 -0.103 0.0854 0.229 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -880874 sc-eQTL 3.94e-01 0.0717 0.084 0.229 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 9.81e-01 0.00222 0.091 0.227 NK L1
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 1.82e-01 -0.112 0.0838 0.227 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 8.87e-01 0.0149 0.105 0.227 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 7.64e-01 0.013 0.0433 0.227 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 2.36e-01 0.095 0.0799 0.227 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 6.18e-01 0.0521 0.104 0.229 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0979 0.0818 0.229 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 2.61e-01 -0.112 0.099 0.229 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 2.42e-01 0.0461 0.0392 0.229 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 1.79e-01 0.0972 0.0721 0.229 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 1.28e-01 -0.164 0.107 0.229 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0935 0.121 0.235 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0476 0.104 0.235 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0849 0.11 0.235 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0551 0.059 0.235 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 2.80e-01 0.114 0.105 0.235 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 1.89e-01 -0.136 0.103 0.235 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0743 0.117 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 7.90e-03 -0.178 0.0662 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0701 0.101 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 8.03e-01 0.0155 0.0621 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 1.86e-01 0.142 0.107 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0574 0.112 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0834 0.112 0.226 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0858 0.0807 0.226 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 2.86e-01 -0.113 0.106 0.226 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0534 0.0509 0.226 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 8.40e-01 0.019 0.0936 0.226 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0513 0.106 0.226 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 1.22e-01 -0.164 0.106 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0254 0.0511 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 2.01e-01 0.127 0.0989 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 9.53e-01 0.00336 0.0565 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 3.17e-01 0.0885 0.0882 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 8.99e-02 -0.185 0.108 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 3.35e-02 -0.24 0.112 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0719 0.06 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0851 0.11 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0357 0.0584 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 2.83e-01 0.111 0.103 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 1.93e-01 -0.145 0.111 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0112 0.112 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 7.40e-01 -0.037 0.111 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 1.23e-01 -0.173 0.112 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 8.38e-01 0.0106 0.0519 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0127 0.0899 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0661 0.104 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 8.52e-01 0.0168 0.09 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 4.13e-01 0.0723 0.0881 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0279 0.0817 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 4.66e-01 0.0387 0.053 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 3.64e-02 0.135 0.0643 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 2.34e-01 -0.121 0.102 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 8.94e-01 -0.013 0.0974 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 2.85e-01 -0.105 0.0978 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0555 0.0966 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 9.59e-01 0.0026 0.0501 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 1.69e-01 0.0964 0.0698 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 5.49e-03 -0.32 0.114 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00328 0.113 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0361 0.113 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 7.29e-01 0.0376 0.108 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 4.69e-01 0.0321 0.0443 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 6.24e-02 0.142 0.0757 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 7.59e-02 -0.195 0.11 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 2.16e-01 -0.124 0.0998 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0176 0.0936 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 1.81e-01 -0.142 0.106 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 9.57e-01 0.0031 0.0569 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 5.32e-01 0.0602 0.0961 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0913 0.11 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 7.88e-01 0.0282 0.105 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 8.69e-02 -0.191 0.111 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 8.41e-01 0.0193 0.0963 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 9.62e-01 0.0026 0.0551 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 1.38e-02 0.169 0.0682 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 1.56e-01 -0.157 0.11 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 6.57e-01 0.0534 0.12 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 8.02e-01 0.0279 0.111 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0188 0.11 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 8.51e-02 0.0922 0.0533 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 1.83e-01 0.118 0.0885 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 1.21e-01 -0.182 0.117 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0302 0.105 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 2.92e-02 0.25 0.114 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 3.29e-01 -0.112 0.114 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0443 0.0615 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 2.31e-01 -0.121 0.101 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 8.10e-01 -0.028 0.116 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 9.15e-02 0.186 0.11 0.229 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0313 0.105 0.229 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 3.37e-02 -0.226 0.106 0.229 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 1.77e-01 0.071 0.0523 0.229 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 7.03e-01 0.0282 0.074 0.229 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 9.75e-02 -0.182 0.109 0.229 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 8.51e-01 0.0224 0.119 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 8.62e-01 0.0193 0.11 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 2.76e-01 0.122 0.112 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 6.97e-02 -0.113 0.0619 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 3.70e-01 0.0836 0.0931 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 7.13e-01 0.0361 0.0979 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0608 0.0895 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 4.21e-01 0.0902 0.112 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 9.61e-01 0.0022 0.0445 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 8.40e-01 0.0199 0.0986 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 4.67e-01 0.0885 0.121 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 3.54e-01 -0.103 0.11 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0423 0.112 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00412 0.0522 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 1.33e-01 -0.155 0.103 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 8.59e-01 -0.018 0.101 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0976 0.0979 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0468 0.11 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0515 0.0598 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 1.10e-01 0.159 0.099 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 5.15e-01 0.0887 0.136 0.233 PB L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 6.36e-01 0.046 0.0968 0.233 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 7.63e-02 -0.209 0.117 0.233 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 4.67e-01 0.0489 0.0671 0.233 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 3.77e-01 0.096 0.108 0.233 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 7.82e-01 -0.035 0.126 0.233 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 4.77e-01 0.0805 0.113 0.23 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0752 0.101 0.23 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 9.13e-01 0.0118 0.108 0.23 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 3.36e-01 0.0394 0.0409 0.23 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 5.05e-01 0.0548 0.082 0.23 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0233 0.106 0.23 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00636 0.114 0.229 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00917 0.108 0.229 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 1.92e-01 -0.118 0.0903 0.229 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00276 0.0401 0.229 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0234 0.0845 0.229 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 4.69e-01 0.0821 0.113 0.229 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0236 0.12 0.229 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 7.34e-01 -0.032 0.0941 0.229 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 680662 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0702 0.0934 0.229 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 701372 sc-eQTL 3.14e-01 -0.111 0.11 0.229 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 7.74e-02 -0.189 0.106 0.229 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0227 0.0529 0.229 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 8.59e-01 0.0158 0.0891 0.229 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0327 0.105 0.229 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 312299 sc-eQTL 1.65e-01 -0.116 0.0833 0.229 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -880874 sc-eQTL 7.75e-01 0.0295 0.103 0.229 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0381 0.0941 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 1.46e-01 -0.104 0.0711 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 680662 sc-eQTL 9.52e-01 0.00607 0.101 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 701372 sc-eQTL 9.32e-01 0.00876 0.102 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 3.72e-02 -0.169 0.0806 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 5.96e-01 0.024 0.0452 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 6.96e-01 0.0264 0.0675 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0888 0.0871 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -880874 sc-eQTL 5.11e-01 0.0598 0.0908 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 3.41e-01 0.102 0.107 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 5.53e-01 -0.046 0.0775 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 680662 sc-eQTL 2.68e-01 -0.107 0.0966 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 701372 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0558 0.105 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 1.30e-01 -0.104 0.0685 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 4.02e-01 0.0416 0.0495 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 3.03e-01 0.0584 0.0566 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 2.19e-01 -0.113 0.0915 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -880874 sc-eQTL 5.22e-01 0.0575 0.0897 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 5.47e-01 -0.085 0.141 0.239 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 6.11e-02 -0.226 0.12 0.239 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 2.62e-01 0.15 0.134 0.239 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 5.47e-01 0.0308 0.0511 0.239 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 5.48e-01 0.0581 0.0964 0.239 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0951 0.132 0.239 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 3.22e-01 -0.109 0.11 0.227 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0388 0.105 0.227 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 680662 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0714 0.106 0.227 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 701372 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0663 0.105 0.227 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 3.17e-01 -0.107 0.106 0.227 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 6.34e-01 0.0221 0.0464 0.227 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 4.16e-01 0.0634 0.0778 0.227 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 6.88e-01 0.0454 0.113 0.227 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -880874 sc-eQTL 8.04e-01 0.0268 0.108 0.227 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 6.26e-01 0.0566 0.116 0.231 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 4.85e-01 0.0548 0.0784 0.231 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 680662 sc-eQTL 1.68e-01 -0.153 0.11 0.231 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 701372 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0204 0.11 0.231 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 6.47e-02 -0.195 0.105 0.231 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 7.26e-01 0.0186 0.053 0.231 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0219 0.075 0.231 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0439 0.0936 0.231 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -880874 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0186 0.099 0.231 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 7.41e-01 0.0435 0.132 0.232 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 1.88e-02 -0.205 0.0861 0.232 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 680662 sc-eQTL 9.83e-01 0.00188 0.0883 0.232 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 701372 sc-eQTL 2.35e-02 -0.202 0.0884 0.232 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0905 0.107 0.232 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000164 0.0737 0.232 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0191 0.0748 0.232 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 3.20e-02 0.233 0.107 0.232 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 312299 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0344 0.104 0.232 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -880874 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0141 0.0925 0.232 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 2.31e-01 -0.134 0.111 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 1.68e-02 -0.146 0.0607 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 1.44e-01 -0.142 0.0969 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00296 0.0555 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 2.29e-01 0.104 0.0864 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 1.81e-01 -0.136 0.101 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 3.87e-02 -0.221 0.106 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0273 0.0482 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 8.96e-01 0.0123 0.0937 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0216 0.0567 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 1.00e-01 0.144 0.0872 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 1.73e-01 -0.146 0.106 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 4.83e-01 0.0603 0.0859 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 1.46e-01 -0.0869 0.0595 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 680662 sc-eQTL 9.59e-01 -0.005 0.0975 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 701372 sc-eQTL 9.46e-01 0.00692 0.102 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 8.56e-02 -0.115 0.0668 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 4.60e-01 0.0341 0.046 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 5.49e-01 0.0376 0.0628 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 2.07e-01 -0.104 0.0817 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -880874 sc-eQTL 5.15e-01 0.0561 0.086 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0882 0.112 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 4.36e-01 0.0575 0.0737 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 680662 sc-eQTL 1.31e-01 -0.164 0.108 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 701372 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0982 0.107 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 4.70e-02 -0.201 0.101 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 7.75e-01 0.0123 0.0431 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 7.07e-01 0.0245 0.0652 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 sc-eQTL 5.43e-01 0.0636 0.104 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -880874 sc-eQTL 4.59e-01 0.0701 0.0944 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -536743 sc-eQTL 7.76e-01 0.0257 0.0901 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 902229 sc-eQTL 1.16e-01 -0.133 0.0842 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 651968 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0173 0.107 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 600858 sc-eQTL 7.74e-01 0.0126 0.0437 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -902685 sc-eQTL 3.50e-01 0.0845 0.0902 0.226 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 701372 pQTL 0.0127 -0.102 0.0408 0.0 0.0 0.224
ENSG00000146409 SLC18B1 602088 eQTL 0.0271 -0.0571 0.0258 0.0 0.0 0.225

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000220378 \N -883268 2.64e-07 1.34e-07 3.59e-08 1.86e-07 8.92e-08 9.87e-08 1.42e-07 5.49e-08 1.4e-07 4.38e-08 1.62e-07 8.14e-08 1.41e-07 7.13e-08 5.84e-08 7.5e-08 3.94e-08 1.14e-07 5.21e-08 4.03e-08 1.05e-07 1.26e-07 1.26e-07 4.13e-08 1.37e-07 1.19e-07 1.12e-07 9.15e-08 1.03e-07 1.12e-07 9.64e-08 3.76e-08 2.74e-08 8.49e-08 8.38e-08 4.02e-08 4.72e-08 9.13e-08 7.92e-08 3.09e-08 3.61e-08 1.33e-07 3.82e-08 2.03e-08 8.16e-08 1.69e-08 1.25e-07 4.33e-09 4.77e-08