logo

Genes within 1Mb (chr6:133413973:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00841 0.157 0.077 B L1
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0223 0.0626 0.077 B L1
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 7.48e-01 0.0378 0.118 0.077 B L1
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 1.16e-01 -0.112 0.0707 0.077 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0687 0.11 0.077 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 6.40e-01 0.07 0.15 0.077 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 6.34e-03 -0.309 0.112 0.077 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 4.71e-02 -0.234 0.117 0.077 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 3.14e-01 0.103 0.102 0.077 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0059 0.0698 0.077 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0422 0.0937 0.077 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0651 0.141 0.077 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 1.25e-01 -0.174 0.113 0.077 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 3.35e-02 -0.251 0.117 0.077 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 1.81e-01 0.185 0.138 0.077 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0407 0.0471 0.077 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 3.20e-01 0.0723 0.0726 0.077 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 5.60e-01 0.0832 0.143 0.077 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 6.15e-01 0.0866 0.172 0.081 DC L1
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0753 0.107 0.081 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 679208 sc-eQTL 3.06e-02 0.285 0.131 0.081 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 699918 sc-eQTL 5.35e-01 0.0888 0.143 0.081 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 8.13e-01 0.0364 0.153 0.081 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 7.54e-01 0.0269 0.0859 0.081 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 4.09e-02 -0.203 0.0986 0.081 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0983 0.136 0.081 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 310845 sc-eQTL 5.19e-01 0.0798 0.124 0.081 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -882328 sc-eQTL 6.53e-01 0.0695 0.154 0.081 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0151 0.121 0.077 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 5.32e-01 0.0505 0.0806 0.077 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 679208 sc-eQTL 1.59e-02 -0.332 0.137 0.077 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 699918 sc-eQTL 9.99e-01 0.000209 0.149 0.077 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 1.23e-01 0.162 0.105 0.077 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 5.12e-01 0.0414 0.063 0.077 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 3.40e-01 -0.085 0.0888 0.077 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 7.83e-01 0.0344 0.125 0.077 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -882328 sc-eQTL 2.41e-01 -0.144 0.122 0.077 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 6.97e-01 0.0519 0.133 0.077 NK L1
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0334 0.123 0.077 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 9.18e-01 0.0159 0.153 0.077 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 3.29e-01 -0.062 0.0634 0.077 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 3.01e-01 -0.122 0.117 0.077 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 9.37e-01 0.0124 0.157 0.077 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0995 0.124 0.077 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 2.24e-02 0.34 0.148 0.077 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 6.74e-01 -0.025 0.0593 0.077 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0612 0.109 0.077 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 2.39e-01 -0.191 0.162 0.077 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 1.10e-01 0.305 0.19 0.079 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0533 0.163 0.079 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 3.67e-01 0.157 0.174 0.079 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 7.42e-01 0.0307 0.0932 0.079 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0171 0.166 0.079 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 2.45e-01 0.19 0.163 0.079 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00254 0.173 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0564 0.0993 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 7.79e-01 0.0421 0.15 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 1.27e-01 -0.14 0.0912 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0187 0.159 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0352 0.165 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 1.93e-01 0.221 0.169 0.078 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 2.31e-01 -0.147 0.123 0.078 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 1.51e-01 -0.23 0.16 0.078 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 4.62e-01 -0.057 0.0774 0.078 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 8.34e-02 -0.245 0.141 0.078 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 9.77e-01 0.00476 0.162 0.078 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 4.73e-01 -0.113 0.157 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0123 0.0756 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 3.59e-01 0.135 0.147 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 7.85e-02 -0.147 0.083 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 2.48e-01 -0.151 0.13 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 6.17e-03 0.439 0.159 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 6.83e-01 0.0687 0.168 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 2.27e-01 0.107 0.0888 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 5.04e-01 -0.109 0.163 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 2.12e-01 -0.108 0.0863 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 1.42e-01 0.224 0.152 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 1.07e-01 -0.266 0.164 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 6.09e-01 0.0862 0.168 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 6.85e-02 -0.304 0.166 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 3.33e-01 0.163 0.169 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 5.58e-01 0.0457 0.078 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 9.71e-01 0.005 0.135 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0309 0.157 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 2.19e-01 -0.161 0.13 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 1.91e-02 -0.299 0.127 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0194 0.119 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 6.97e-01 -0.03 0.077 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 9.12e-01 0.0105 0.0944 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 1.37e-01 -0.22 0.148 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 1.44e-02 -0.345 0.14 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00884 0.143 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 5.05e-04 0.484 0.137 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 9.97e-01 0.000308 0.073 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 2.40e-02 -0.23 0.101 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 2.02e-02 0.391 0.167 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 5.22e-01 0.104 0.163 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 7.85e-01 0.0445 0.163 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 1.24e-01 -0.24 0.155 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 4.62e-01 0.0472 0.064 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 1.68e-01 -0.152 0.11 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00212 0.159 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 4.47e-01 -0.111 0.145 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 2.04e-02 -0.314 0.134 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 3.91e-01 0.133 0.154 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000187 0.0827 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 1.31e-01 -0.211 0.139 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 3.88e-01 0.139 0.16 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0531 0.153 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0722 0.163 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 7.69e-01 0.0414 0.141 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 4.70e-01 0.0582 0.0804 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 7.14e-01 0.0371 0.101 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 2.90e-01 -0.171 0.161 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000277 0.189 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 4.37e-01 -0.136 0.174 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 3.83e-01 0.151 0.173 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 1.58e-01 -0.119 0.084 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 9.44e-01 0.00975 0.14 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0164 0.185 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 6.02e-01 0.0824 0.158 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 9.58e-01 0.00918 0.173 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 1.62e-01 0.239 0.171 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00837 0.0923 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 7.92e-01 0.0398 0.151 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 7.60e-01 0.0535 0.174 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 2.97e-01 -0.175 0.167 0.076 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 4.02e-02 -0.325 0.157 0.076 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 3.55e-01 0.15 0.161 0.076 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 9.37e-01 0.0063 0.0796 0.076 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0106 0.112 0.076 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 1.86e-01 -0.221 0.166 0.076 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 3.16e-01 -0.171 0.17 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0291 0.158 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 5.21e-01 -0.103 0.16 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 3.83e-01 0.078 0.0892 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 1.44e-01 -0.195 0.133 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 4.21e-01 0.114 0.142 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 3.86e-01 -0.113 0.13 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 9.27e-01 0.0148 0.162 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0622 0.0643 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 3.66e-01 -0.129 0.142 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 2.84e-01 -0.19 0.177 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 6.96e-01 0.0631 0.161 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 2.65e-01 0.182 0.163 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0384 0.0759 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 6.55e-02 0.276 0.149 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0246 0.149 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0127 0.144 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0807 0.162 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0079 0.0878 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 7.22e-01 0.0521 0.146 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 1.35e-01 -0.321 0.213 0.074 PB L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 8.31e-01 0.0328 0.153 0.074 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 8.02e-01 0.0471 0.187 0.074 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 4.58e-01 0.0789 0.106 0.074 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 1.83e-01 -0.228 0.17 0.074 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 5.91e-01 -0.107 0.199 0.074 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 4.01e-01 0.137 0.162 0.078 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 8.29e-01 0.0314 0.145 0.078 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 3.26e-01 0.153 0.155 0.078 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0592 0.0588 0.078 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0353 0.118 0.078 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0446 0.152 0.078 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 5.35e-01 -0.103 0.166 0.077 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 3.09e-01 -0.159 0.156 0.077 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 6.57e-01 0.0587 0.132 0.077 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 9.26e-01 0.00545 0.0584 0.077 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 8.72e-01 0.0198 0.123 0.077 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0535 0.165 0.077 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00361 0.176 0.076 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0124 0.138 0.076 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 679208 sc-eQTL 8.00e-01 0.035 0.137 0.076 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 699918 sc-eQTL 8.89e-01 0.0225 0.162 0.076 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 1.03e-01 0.256 0.156 0.076 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 1.19e-01 0.121 0.0772 0.076 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 1.15e-01 -0.206 0.13 0.076 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 7.51e-01 -0.049 0.154 0.076 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 310845 sc-eQTL 3.23e-01 0.122 0.123 0.076 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -882328 sc-eQTL 3.52e-01 -0.141 0.151 0.076 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 9.90e-01 0.00166 0.136 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 8.20e-01 0.0236 0.104 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 679208 sc-eQTL 3.31e-02 -0.311 0.145 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 699918 sc-eQTL 2.61e-01 -0.166 0.147 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 4.40e-02 0.237 0.117 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 8.92e-01 0.00892 0.0656 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 2.27e-01 -0.118 0.0975 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0723 0.126 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -882328 sc-eQTL 1.83e-01 -0.175 0.131 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0298 0.156 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 5.37e-01 0.0694 0.112 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 679208 sc-eQTL 2.26e-02 -0.318 0.139 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 699918 sc-eQTL 4.46e-01 0.116 0.152 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 6.87e-01 0.0403 0.0998 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 5.89e-01 0.0388 0.0718 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0406 0.0822 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 8.86e-02 0.226 0.132 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -882328 sc-eQTL 3.16e-01 -0.13 0.13 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 8.06e-02 0.4 0.227 0.064 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 9.16e-03 0.509 0.193 0.064 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00848 0.218 0.064 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0247 0.0831 0.064 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 1.13e-01 0.248 0.156 0.064 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 1.10e-01 0.343 0.213 0.064 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 4.50e-01 -0.12 0.158 0.08 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0764 0.151 0.08 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 679208 sc-eQTL 2.02e-01 -0.195 0.152 0.08 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 699918 sc-eQTL 4.84e-01 0.106 0.151 0.08 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 3.91e-01 0.132 0.153 0.08 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 5.86e-01 0.0365 0.0669 0.08 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 1.84e-01 -0.149 0.112 0.08 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 2.89e-01 0.173 0.162 0.08 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -882328 sc-eQTL 8.32e-01 0.0332 0.156 0.08 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0371 0.167 0.079 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 2.45e-01 -0.131 0.112 0.079 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 679208 sc-eQTL 2.75e-01 -0.173 0.158 0.079 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 699918 sc-eQTL 6.94e-01 0.0621 0.158 0.079 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 4.70e-01 0.11 0.152 0.079 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 7.82e-01 0.0211 0.0761 0.079 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 4.93e-01 0.0738 0.108 0.079 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 3.27e-01 -0.132 0.134 0.079 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -882328 sc-eQTL 9.80e-01 0.00355 0.142 0.079 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0197 0.2 0.068 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 8.24e-01 0.0298 0.133 0.068 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 679208 sc-eQTL 7.48e-02 0.239 0.133 0.068 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 699918 sc-eQTL 3.31e-01 0.133 0.136 0.068 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0877 0.163 0.068 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 5.14e-01 0.0733 0.112 0.068 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0353 0.114 0.068 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 6.72e-01 0.0704 0.166 0.068 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 310845 sc-eQTL 8.50e-01 -0.03 0.159 0.068 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -882328 sc-eQTL 2.09e-01 0.177 0.14 0.068 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 3.39e-01 0.16 0.167 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0898 0.0919 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 4.89e-01 -0.101 0.146 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0555 0.083 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 9.94e-01 0.000933 0.13 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 3.33e-01 0.148 0.152 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0513 0.154 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 8.67e-01 0.0117 0.0696 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 5.62e-01 0.0785 0.135 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 4.88e-02 -0.161 0.081 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 7.05e-01 -0.048 0.127 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 2.44e-01 0.18 0.154 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 9.75e-01 0.00395 0.125 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 4.12e-01 0.0712 0.0866 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 679208 sc-eQTL 2.03e-02 -0.327 0.14 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 699918 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0287 0.147 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 1.15e-01 0.153 0.0969 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 7.50e-01 0.0213 0.0669 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0929 0.0909 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 8.07e-01 0.0291 0.119 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -882328 sc-eQTL 1.50e-01 -0.179 0.124 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 5.06e-01 -0.108 0.163 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 1.09e-01 -0.172 0.107 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 679208 sc-eQTL 1.67e-01 -0.218 0.157 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 699918 sc-eQTL 9.33e-01 0.0132 0.157 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 3.31e-01 0.144 0.147 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 6.56e-01 0.028 0.0626 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0527 0.0947 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 600634 sc-eQTL 8.90e-01 0.0211 0.152 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -882328 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0168 0.137 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -538197 sc-eQTL 6.32e-01 0.0631 0.132 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 900775 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0142 0.124 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 650514 sc-eQTL 9.00e-01 0.0197 0.157 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 599404 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0575 0.0638 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -904139 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0838 0.132 0.075 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118515 \N -904139 2.76e-07 1.27e-07 5.64e-08 1.82e-07 9.87e-08 9.05e-08 1.67e-07 5.62e-08 1.47e-07 6.4e-08 1.57e-07 1.08e-07 1.59e-07 7.37e-08 6.18e-08 7.23e-08 4.18e-08 1.44e-07 6.92e-08 4.89e-08 1.25e-07 1.26e-07 1.5e-07 2.87e-08 1.55e-07 1.23e-07 1.18e-07 9.74e-08 1.23e-07 9.49e-08 1.02e-07 2.99e-08 3.43e-08 8.89e-08 5.64e-08 2.95e-08 5.65e-08 8.68e-08 6.43e-08 4.19e-08 5.37e-08 1.33e-07 5.08e-08 1.57e-08 3.84e-08 1.92e-08 1.15e-07 1.9e-09 4.8e-08