logo

Genes within 1Mb (chr6:133410853:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 5.85e-01 0.0494 0.0904 0.239 B L1
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 1.11e-01 0.0573 0.0358 0.239 B L1
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0502 0.0676 0.239 B L1
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 7.05e-01 0.0155 0.0409 0.239 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00771 0.0631 0.239 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 5.31e-01 0.054 0.0861 0.239 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 8.36e-01 0.0137 0.0665 0.239 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 2.73e-01 0.0757 0.0689 0.239 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 8.19e-01 0.0137 0.0599 0.239 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0129 0.0407 0.239 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00623 0.0547 0.239 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 1.29e-01 0.125 0.0819 0.239 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 7.12e-01 0.0243 0.0657 0.239 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00355 0.0686 0.239 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0742 0.0799 0.239 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 7.27e-01 -0.00955 0.0274 0.239 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0195 0.0422 0.239 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 3.77e-01 0.0731 0.0826 0.239 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 7.37e-01 0.0336 0.0999 0.241 DC L1
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 8.77e-01 0.00961 0.0621 0.241 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 676088 sc-eQTL 1.77e-01 -0.104 0.0766 0.241 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 696798 sc-eQTL 1.74e-01 0.113 0.0827 0.241 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0132 0.0889 0.241 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 1.40e-01 -0.0734 0.0496 0.241 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 3.47e-01 0.0544 0.0577 0.241 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0636 0.0788 0.241 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 307725 sc-eQTL 3.31e-01 0.0698 0.0716 0.241 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -885448 sc-eQTL 6.58e-01 0.0397 0.0895 0.241 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 5.89e-01 0.0379 0.07 0.239 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 7.23e-01 0.0166 0.0468 0.239 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 676088 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0195 0.0804 0.239 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 696798 sc-eQTL 2.88e-02 0.188 0.0855 0.239 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0663 0.0609 0.239 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0306 0.0365 0.239 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 1.14e-01 0.0815 0.0514 0.239 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0732 0.0722 0.239 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -885448 sc-eQTL 3.73e-01 0.0634 0.071 0.239 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 6.45e-01 0.0353 0.0766 0.238 NK L1
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 6.79e-01 0.0294 0.0708 0.238 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 6.26e-01 -0.043 0.0881 0.238 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0153 0.0365 0.238 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00148 0.0675 0.238 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0859 0.0899 0.239 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 7.86e-02 0.124 0.0704 0.239 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0159 0.0857 0.239 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 8.20e-01 -0.00776 0.034 0.239 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 3.40e-01 0.0597 0.0624 0.239 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 6.37e-01 0.044 0.093 0.239 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0881 0.106 0.227 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0505 0.0907 0.227 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 1.99e-01 0.124 0.0962 0.227 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 9.89e-01 -0.000701 0.0518 0.227 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 9.70e-02 0.153 0.0916 0.227 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0886 0.0904 0.227 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 1.03e-01 0.162 0.0991 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 3.43e-02 0.121 0.0567 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0722 0.0862 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 9.99e-01 8.89e-05 0.0529 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00513 0.0914 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 4.08e-01 0.0789 0.0951 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 1.80e-01 -0.128 0.095 0.239 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 5.65e-03 0.189 0.0678 0.239 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 2.37e-01 0.107 0.09 0.239 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0111 0.0435 0.239 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 4.19e-02 0.162 0.079 0.239 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 1.57e-01 0.128 0.0903 0.239 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 7.33e-01 0.031 0.0907 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 2.16e-01 0.054 0.0435 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 1.76e-02 -0.2 0.0836 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 2.64e-01 0.0538 0.0481 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 5.70e-01 0.0429 0.0754 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0687 0.093 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0173 0.0964 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 2.91e-01 0.054 0.0511 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 3.41e-01 0.0895 0.0938 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 2.47e-01 0.0576 0.0496 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00866 0.088 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 8.97e-01 0.0123 0.095 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 3.39e-02 0.204 0.0955 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 5.11e-01 0.0631 0.0958 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 8.81e-01 0.0145 0.0968 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 9.48e-01 0.0029 0.0447 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 7.30e-01 0.0268 0.0775 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 1.09e-01 0.144 0.0896 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 1.16e-01 -0.12 0.076 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 2.50e-01 0.0862 0.0747 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 5.33e-01 0.0433 0.0694 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0148 0.045 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 6.10e-01 0.0282 0.0551 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 1.44e-01 0.127 0.0863 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 5.56e-01 0.0482 0.0818 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 6.44e-01 0.0381 0.0824 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 8.16e-02 -0.141 0.0807 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0507 0.042 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 4.68e-01 0.0428 0.0589 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 3.17e-01 0.0976 0.0973 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 5.75e-01 0.053 0.0944 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 7.22e-01 0.0337 0.0946 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 3.07e-01 0.0928 0.0906 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0392 0.0371 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 7.41e-01 0.0212 0.064 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 7.72e-02 0.163 0.0919 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 4.90e-01 0.0587 0.0849 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 9.83e-01 0.00174 0.0794 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0194 0.0902 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 7.28e-01 0.0168 0.0483 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 9.34e-02 0.137 0.081 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0427 0.0935 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 9.05e-01 0.0108 0.09 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 4.68e-01 0.0696 0.0958 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 1.14e-01 -0.131 0.0823 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0193 0.0474 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0487 0.0594 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 5.22e-01 0.061 0.095 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0855 0.0999 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 1.71e-01 0.127 0.0922 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0766 0.0918 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0313 0.0447 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 9.81e-02 0.122 0.0737 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 9.20e-01 0.00986 0.0982 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0603 0.093 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 1.89e-01 -0.133 0.101 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 1.92e-01 0.132 0.101 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 5.47e-02 0.104 0.0539 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 9.80e-01 0.00228 0.0891 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 7.37e-02 0.183 0.102 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0157 0.095 0.24 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 6.19e-01 0.045 0.0902 0.24 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 8.85e-01 0.0133 0.0918 0.24 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 4.05e-02 -0.0922 0.0447 0.24 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 3.52e-01 0.0592 0.0634 0.24 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00975 0.0946 0.24 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 8.50e-01 0.0199 0.105 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0643 0.0972 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0506 0.0987 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00352 0.055 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 6.30e-01 0.0396 0.0822 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 8.29e-01 0.0179 0.0824 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 9.29e-01 0.00674 0.0754 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 2.81e-01 -0.102 0.0941 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0131 0.0374 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 3.51e-01 0.0774 0.0827 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 3.75e-01 0.0923 0.104 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 8.05e-01 0.0233 0.0946 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0579 0.0957 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0149 0.0446 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 7.93e-01 0.0231 0.0881 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 7.62e-01 0.0259 0.0853 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 1.17e-01 0.129 0.0821 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 7.03e-01 0.0355 0.0928 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 7.67e-01 0.0149 0.0504 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 1.98e-01 -0.108 0.0835 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 2.45e-01 0.135 0.115 0.237 PB L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 4.11e-01 -0.068 0.0823 0.237 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0898 0.101 0.237 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 8.40e-02 -0.0985 0.0565 0.237 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 3.29e-01 0.0903 0.0921 0.237 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 6.92e-01 0.0426 0.107 0.237 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0575 0.0979 0.239 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 9.28e-02 0.147 0.0869 0.239 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0367 0.0938 0.239 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 7.87e-01 0.00959 0.0355 0.239 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 2.47e-01 0.0824 0.0709 0.239 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 5.54e-01 0.0543 0.0918 0.239 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0215 0.0976 0.239 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 3.55e-01 0.0851 0.0918 0.239 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 4.42e-01 0.0595 0.0773 0.239 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 3.59e-01 0.0314 0.0342 0.239 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 7.18e-01 0.0261 0.0721 0.239 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 9.47e-01 0.00642 0.0968 0.239 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 8.85e-01 0.0148 0.102 0.241 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 7.18e-01 0.029 0.0801 0.241 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 676088 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0414 0.0795 0.241 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 696798 sc-eQTL 2.89e-01 0.0991 0.0933 0.241 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 6.45e-01 -0.042 0.0911 0.241 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0543 0.0448 0.241 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 6.49e-02 0.139 0.0751 0.241 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 4.78e-01 0.0633 0.089 0.241 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 307725 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0575 0.0711 0.241 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -885448 sc-eQTL 9.09e-02 0.148 0.087 0.241 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 5.59e-01 0.0468 0.0799 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 9.10e-01 0.00687 0.0607 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 676088 sc-eQTL 7.00e-01 0.033 0.0857 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 696798 sc-eQTL 2.87e-02 0.188 0.0855 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0903 0.0689 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0144 0.0384 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 1.70e-01 0.0785 0.0571 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00318 0.0741 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -885448 sc-eQTL 3.40e-01 0.0737 0.077 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 8.94e-01 0.0121 0.0905 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 9.32e-02 0.11 0.0649 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 676088 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0659 0.0815 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 696798 sc-eQTL 1.15e-01 0.14 0.0881 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0287 0.058 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 8.53e-01 -0.00773 0.0418 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 5.00e-02 0.0934 0.0474 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 4.62e-02 -0.154 0.0767 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -885448 sc-eQTL 9.09e-01 0.00865 0.0757 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0685 0.122 0.252 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 1.58e-01 0.148 0.104 0.252 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 3.02e-01 -0.12 0.116 0.252 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0107 0.0442 0.252 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 1.20e-01 0.129 0.0827 0.252 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 7.49e-01 0.0365 0.114 0.252 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 5.32e-01 0.0574 0.0916 0.24 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00448 0.0876 0.24 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 676088 sc-eQTL 1.69e-01 -0.121 0.088 0.24 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 696798 sc-eQTL 1.11e-01 0.139 0.0869 0.24 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0389 0.0888 0.24 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0568 0.0385 0.24 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 4.39e-01 0.0503 0.0648 0.24 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 7.39e-01 0.0314 0.0941 0.24 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -885448 sc-eQTL 9.45e-01 0.00622 0.09 0.24 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 8.66e-01 0.0164 0.0972 0.238 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0265 0.0657 0.238 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 676088 sc-eQTL 6.10e-01 0.0474 0.0927 0.238 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 696798 sc-eQTL 5.25e-01 0.0585 0.0919 0.238 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00301 0.0885 0.238 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0117 0.0444 0.238 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 9.80e-03 0.161 0.0617 0.238 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 8.00e-01 0.0199 0.0784 0.238 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -885448 sc-eQTL 5.41e-02 0.159 0.0821 0.238 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 4.97e-01 -0.076 0.112 0.251 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0621 0.0742 0.251 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 676088 sc-eQTL 5.65e-02 -0.142 0.074 0.251 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 696798 sc-eQTL 3.12e-01 0.077 0.0759 0.251 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0612 0.0905 0.251 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0443 0.0624 0.251 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 4.11e-01 0.0522 0.0633 0.251 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 1.62e-02 -0.221 0.0907 0.251 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 307725 sc-eQTL 5.27e-01 0.056 0.0883 0.251 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -885448 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0489 0.0784 0.251 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 3.57e-01 0.0891 0.0965 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 1.03e-02 0.136 0.0524 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 2.20e-01 0.103 0.0839 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000443 0.048 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 3.83e-01 0.0654 0.0748 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 2.56e-01 0.0999 0.0877 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 7.54e-01 0.0284 0.0905 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 1.29e-01 0.0618 0.0406 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 2.00e-01 -0.101 0.0789 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 1.67e-01 0.0661 0.0477 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 7.94e-01 0.0194 0.0742 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0392 0.0903 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 7.62e-01 0.022 0.0726 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 4.68e-01 0.0366 0.0504 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 676088 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0141 0.0823 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 696798 sc-eQTL 1.14e-02 0.216 0.0845 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0553 0.0566 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0196 0.0389 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 1.79e-01 0.0711 0.0528 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0642 0.0691 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -885448 sc-eQTL 6.38e-01 0.0342 0.0726 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 7.99e-01 0.024 0.094 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0273 0.062 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 676088 sc-eQTL 4.30e-01 -0.072 0.0911 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 696798 sc-eQTL 2.10e-01 0.113 0.0901 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 8.93e-01 0.0115 0.0853 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0244 0.0361 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 2.95e-02 0.119 0.0541 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0149 0.0878 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -885448 sc-eQTL 2.31e-01 0.0951 0.0791 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -541317 sc-eQTL 5.95e-01 0.0404 0.0757 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 897655 sc-eQTL 6.19e-01 0.0355 0.0712 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 647394 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0493 0.0901 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 596284 sc-eQTL 6.83e-01 -0.015 0.0368 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -907259 sc-eQTL 9.61e-01 0.00375 0.076 0.239 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 897655 eQTL 4.83e-05 0.0763 0.0187 0.0 0.0 0.229
ENSG00000112299 VNN1 696798 pQTL 0.000672 0.139 0.0407 0.0 0.0 0.241
ENSG00000146409 SLC18B1 597514 eQTL 0.0288 0.0579 0.0264 0.0 0.0 0.229

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118515 \N -907259 2.6e-07 1.01e-07 3.31e-08 1.78e-07 9.91e-08 9.13e-08 1.39e-07 5.24e-08 1.37e-07 4.23e-08 1.63e-07 7.6e-08 1.27e-07 6.07e-08 5.44e-08 7.87e-08 5.12e-08 1.07e-07 5.19e-08 3.59e-08 1.06e-07 1.33e-07 1.31e-07 5.01e-08 1.32e-07 1.13e-07 1.13e-07 8.7e-08 1.03e-07 1.1e-07 9.75e-08 3.95e-08 2.74e-08 8.25e-08 9.14e-08 3.97e-08 4.67e-08 9.06e-08 8e-08 3.55e-08 3.61e-08 1.37e-07 4.12e-08 1.94e-08 8.79e-08 1.72e-08 1.35e-07 4.5e-09 4.74e-08