logo

Genes within 1Mb (chr6:133408626:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 9.73e-01 0.00328 0.0966 0.256 B L1
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 7.32e-01 0.0132 0.0385 0.256 B L1
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 7.89e-01 0.0193 0.0723 0.256 B L1
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 6.00e-02 0.082 0.0434 0.256 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 1.50e-01 -0.0968 0.0671 0.256 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 6.39e-01 0.0432 0.092 0.256 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 2.37e-01 0.0865 0.073 0.256 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0179 0.0762 0.256 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00471 0.066 0.256 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 3.36e-01 0.0431 0.0448 0.256 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 3.77e-02 -0.125 0.0597 0.256 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0591 0.0906 0.256 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 7.32e-01 0.0244 0.0713 0.256 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 8.38e-02 0.128 0.0739 0.256 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 3.69e-01 0.078 0.0867 0.256 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 8.73e-02 0.0506 0.0295 0.256 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 6.76e-02 -0.0834 0.0454 0.256 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 5.75e-01 0.0504 0.0897 0.256 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0102 0.109 0.25 DC L1
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 9.46e-01 0.00458 0.0677 0.25 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 673861 sc-eQTL 2.15e-01 0.104 0.0836 0.25 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 694571 sc-eQTL 3.46e-01 0.0854 0.0904 0.25 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 2.94e-01 0.102 0.0966 0.25 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 3.21e-01 0.0539 0.0542 0.25 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0483 0.063 0.25 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 1.71e-01 -0.117 0.0856 0.25 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 305498 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00659 0.0783 0.25 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -887675 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0466 0.0975 0.25 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0192 0.0762 0.256 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 2.68e-01 0.0565 0.0508 0.256 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 673861 sc-eQTL 3.87e-03 0.25 0.0858 0.256 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 694571 sc-eQTL 2.13e-01 -0.117 0.0938 0.256 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 3.26e-01 0.0652 0.0663 0.256 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 6.51e-01 -0.018 0.0398 0.256 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 1.16e-01 -0.0882 0.0559 0.256 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00118 0.0787 0.256 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -887675 sc-eQTL 1.50e-01 -0.111 0.077 0.256 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0317 0.0846 0.258 NK L1
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 1.54e-02 0.189 0.0772 0.258 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0456 0.0974 0.258 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 8.64e-01 0.00693 0.0403 0.258 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 1.77e-01 -0.101 0.0742 0.258 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0274 0.0991 0.256 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 9.77e-01 0.00226 0.078 0.256 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00839 0.0944 0.256 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0219 0.0374 0.256 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 6.18e-02 -0.128 0.0683 0.256 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 6.52e-01 0.0463 0.102 0.256 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 4.47e-02 0.222 0.11 0.26 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 4.00e-01 0.0802 0.0951 0.26 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 7.37e-01 0.0341 0.101 0.26 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 6.18e-01 0.0271 0.0543 0.26 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 1.65e-01 -0.134 0.0963 0.26 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 1.81e-01 0.127 0.0947 0.26 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 6.56e-01 -0.048 0.108 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 6.74e-01 0.0261 0.0619 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 4.94e-01 0.0639 0.0932 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 1.60e-01 0.0802 0.0569 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 2.80e-02 -0.216 0.0976 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0804 0.103 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 5.01e-01 0.0705 0.105 0.256 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 8.28e-01 0.0165 0.0758 0.256 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0958 0.099 0.256 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 2.26e-02 0.108 0.0472 0.256 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0508 0.0876 0.256 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 1.78e-01 -0.134 0.0993 0.256 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 4.41e-01 0.0739 0.0957 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 8.92e-01 0.00625 0.0461 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 3.80e-01 0.0785 0.0893 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 6.92e-01 0.0202 0.0509 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0651 0.0796 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 4.85e-01 0.0687 0.0982 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 8.04e-01 0.0259 0.104 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 2.86e-01 0.059 0.0552 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 8.82e-01 0.0151 0.102 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 2.96e-01 0.0562 0.0536 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0808 0.0949 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 1.09e-01 0.164 0.102 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0812 0.104 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0574 0.104 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 8.34e-01 0.022 0.105 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 7.84e-01 0.0132 0.0483 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0989 0.0835 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0617 0.0973 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 3.17e-01 0.0836 0.0834 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 1.94e-01 -0.106 0.0816 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0598 0.0758 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 4.36e-01 0.0384 0.0492 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 9.88e-03 -0.155 0.0594 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 6.66e-01 -0.041 0.0948 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 6.29e-02 0.168 0.0897 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 2.06e-01 0.115 0.0907 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 3.25e-01 0.0883 0.0895 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 1.16e-01 0.0731 0.0462 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0749 0.0649 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0466 0.108 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 2.22e-01 0.127 0.103 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 7.29e-01 0.036 0.104 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 5.35e-01 0.0619 0.0996 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0115 0.0409 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 6.96e-02 -0.127 0.0697 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0438 0.102 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 1.57e-01 0.128 0.0903 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 1.94e-02 0.197 0.0837 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 4.85e-01 0.0674 0.0963 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0135 0.0516 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 4.42e-03 -0.246 0.0854 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 7.93e-01 0.0263 0.0999 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0445 0.0958 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 3.75e-01 0.0907 0.102 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 7.72e-01 0.0256 0.0881 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 1.72e-01 0.0689 0.0502 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 2.83e-02 -0.138 0.0626 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 1.57e-01 0.143 0.101 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0371 0.108 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 5.84e-01 0.0551 0.1 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 2.84e-01 0.107 0.0994 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 6.18e-01 0.0243 0.0486 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 2.39e-02 -0.181 0.0794 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0168 0.106 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 1.54e-01 -0.145 0.101 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0427 0.111 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 2.49e-01 -0.127 0.11 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0292 0.0594 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0272 0.0973 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0881 0.112 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 9.40e-02 -0.174 0.103 0.26 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 3.48e-01 0.0926 0.0985 0.26 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 6.37e-01 0.0475 0.1 0.26 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 7.99e-01 0.0126 0.0494 0.26 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0803 0.0693 0.26 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 5.97e-01 0.0548 0.103 0.26 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 7.66e-01 0.033 0.11 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0373 0.102 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0709 0.104 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00732 0.0579 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0476 0.0866 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00614 0.0911 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 2.02e-02 0.193 0.0823 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 8.02e-01 0.0262 0.104 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 5.12e-01 0.0271 0.0413 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 2.58e-02 -0.203 0.0906 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 8.39e-01 -0.023 0.113 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 1.22e-01 0.159 0.103 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0854 0.104 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 9.62e-01 0.00232 0.0486 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 6.46e-01 0.0442 0.0961 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0305 0.0935 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 7.69e-01 0.0267 0.0906 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0396 0.102 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 9.60e-01 0.00276 0.0553 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 2.20e-01 -0.113 0.0916 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 2.78e-01 -0.133 0.122 0.256 PB L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 9.85e-01 0.00166 0.0875 0.256 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 1.08e-01 0.171 0.106 0.256 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 8.20e-01 0.0138 0.0606 0.256 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 6.86e-02 -0.178 0.0966 0.256 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 8.06e-01 -0.028 0.114 0.256 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 8.22e-01 0.0228 0.102 0.257 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0804 0.0906 0.257 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 9.39e-01 0.00752 0.0974 0.257 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 6.46e-02 -0.0679 0.0365 0.257 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0825 0.0736 0.257 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00768 0.0953 0.257 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0491 0.108 0.256 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 2.38e-01 -0.12 0.101 0.256 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 6.86e-01 0.0345 0.0855 0.256 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0252 0.0378 0.256 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0515 0.0796 0.256 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 7.49e-01 0.0342 0.107 0.256 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 8.98e-01 0.014 0.11 0.246 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0314 0.086 0.246 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 673861 sc-eQTL 2.70e-01 0.0942 0.0851 0.246 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 694571 sc-eQTL 1.72e-01 0.137 0.0999 0.246 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 8.59e-01 0.0174 0.0979 0.246 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 2.22e-01 0.059 0.0481 0.246 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 4.60e-02 -0.162 0.0805 0.246 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0941 0.0954 0.246 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 305498 sc-eQTL 2.09e-01 0.096 0.0762 0.246 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -887675 sc-eQTL 1.22e-01 -0.145 0.0935 0.246 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0638 0.0868 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 9.97e-02 0.108 0.0656 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 673861 sc-eQTL 2.88e-02 0.203 0.0922 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 694571 sc-eQTL 2.46e-01 -0.109 0.0938 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 4.03e-01 0.0629 0.0751 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0127 0.0418 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 1.57e-01 -0.0881 0.062 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0243 0.0806 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -887675 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0633 0.0838 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 5.46e-01 0.0595 0.0984 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0436 0.0711 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 673861 sc-eQTL 4.26e-03 0.252 0.0871 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 694571 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0919 0.0963 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 3.23e-01 0.0624 0.063 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0317 0.0454 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 8.78e-02 -0.0886 0.0517 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 2.88e-01 0.0894 0.084 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -887675 sc-eQTL 4.69e-02 -0.163 0.0816 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 8.33e-01 0.028 0.132 0.255 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00781 0.114 0.255 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0749 0.126 0.255 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 8.64e-01 -0.00825 0.0479 0.255 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 4.31e-03 -0.255 0.0879 0.255 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0493 0.124 0.255 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 9.80e-01 0.00247 0.101 0.253 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 3.08e-01 0.0978 0.0958 0.253 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 673861 sc-eQTL 3.46e-02 0.204 0.0958 0.253 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 694571 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0938 0.0956 0.253 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0371 0.0974 0.253 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0149 0.0424 0.253 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00875 0.0712 0.253 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 2.87e-02 -0.225 0.102 0.253 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -887675 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0601 0.0986 0.253 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 7.11e-01 0.0394 0.106 0.253 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 4.68e-01 0.0522 0.0718 0.253 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 673861 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0131 0.101 0.253 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 694571 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0457 0.101 0.253 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0123 0.0968 0.253 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0143 0.0485 0.253 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 2.05e-01 -0.087 0.0684 0.253 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 8.55e-01 0.0157 0.0857 0.253 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -887675 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0387 0.0906 0.253 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 7.09e-01 0.0447 0.119 0.237 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 9.91e-02 0.131 0.0788 0.237 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 673861 sc-eQTL 1.45e-01 0.117 0.0795 0.237 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 694571 sc-eQTL 4.73e-01 0.0584 0.0813 0.237 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 2.11e-03 0.294 0.094 0.237 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 9.93e-01 0.000619 0.0668 0.237 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 5.46e-01 -0.041 0.0678 0.237 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0298 0.0988 0.237 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 305498 sc-eQTL 9.10e-01 0.0107 0.0946 0.237 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -887675 sc-eQTL 7.02e-01 0.0321 0.0839 0.237 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0193 0.104 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 6.40e-01 0.0268 0.0571 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0355 0.0904 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 1.05e-01 0.0834 0.0512 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 3.98e-02 -0.165 0.0797 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0984 0.0943 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 8.73e-01 0.0154 0.0961 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 6.91e-01 0.0172 0.0433 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 5.79e-01 0.0466 0.084 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 4.43e-01 0.0391 0.0508 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0993 0.0784 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 3.14e-01 0.0967 0.0957 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0271 0.079 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 2.89e-01 0.0583 0.0548 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 673861 sc-eQTL 7.92e-03 0.236 0.0881 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 694571 sc-eQTL 1.37e-01 -0.139 0.093 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 4.83e-01 0.0434 0.0617 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0197 0.0423 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 9.77e-02 -0.0954 0.0574 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 9.75e-01 0.00234 0.0754 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -887675 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0807 0.0789 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 5.89e-01 0.0557 0.103 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 2.18e-01 0.0836 0.0677 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 673861 sc-eQTL 5.46e-02 0.191 0.0991 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 694571 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0174 0.099 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 9.84e-01 0.00192 0.0934 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00048 0.0396 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0553 0.0598 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 595287 sc-eQTL 1.35e-01 -0.143 0.0957 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -887675 sc-eQTL 1.26e-01 -0.133 0.0865 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -543544 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0142 0.0842 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 895428 sc-eQTL 1.03e-02 0.202 0.0778 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 645167 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0102 0.1 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 594057 sc-eQTL 8.37e-01 0.00839 0.0409 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -909486 sc-eQTL 5.08e-02 -0.164 0.0836 0.259 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 694571 pQTL 0.0141 -0.101 0.041 0.0 0.0 0.221

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina