logo

Genes within 1Mb (chr6:133406854:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 3.36e-01 0.0904 0.0937 0.231 B L1
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 6.67e-02 0.0684 0.0371 0.231 B L1
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0318 0.0703 0.231 B L1
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 6.14e-01 0.0215 0.0425 0.231 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 9.00e-01 0.00822 0.0656 0.231 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 4.41e-01 0.0689 0.0894 0.231 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 1.30e-01 0.104 0.0685 0.231 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 6.55e-02 0.132 0.0711 0.231 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 4.39e-01 0.0481 0.062 0.231 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00435 0.0422 0.231 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 5.24e-01 0.0362 0.0567 0.231 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 1.70e-01 0.117 0.085 0.231 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 5.84e-01 0.0373 0.068 0.231 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 7.56e-01 0.0222 0.0711 0.231 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0395 0.0829 0.231 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 7.92e-01 -0.00748 0.0284 0.231 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 7.23e-01 0.0155 0.0437 0.231 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 4.13e-01 0.0702 0.0856 0.231 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 3.45e-01 0.098 0.103 0.232 DC L1
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 2.21e-01 0.0787 0.0642 0.232 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 672089 sc-eQTL 5.59e-02 -0.152 0.0792 0.232 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 692799 sc-eQTL 4.13e-01 0.0706 0.0861 0.232 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 8.21e-01 0.0209 0.0923 0.232 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 1.10e-01 -0.0825 0.0514 0.232 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 2.65e-01 0.0669 0.0598 0.232 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0724 0.0817 0.232 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 303726 sc-eQTL 5.60e-01 0.0435 0.0744 0.232 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -889447 sc-eQTL 1.08e-01 0.149 0.0923 0.232 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 7.32e-01 0.025 0.073 0.231 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 2.43e-01 0.057 0.0487 0.231 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 672089 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0807 0.0837 0.231 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 692799 sc-eQTL 4.31e-02 0.182 0.0894 0.231 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0374 0.0636 0.231 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 6.36e-01 0.0181 0.0381 0.231 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 1.61e-01 0.0754 0.0536 0.231 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 3.34e-01 -0.073 0.0753 0.231 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -889447 sc-eQTL 1.32e-01 0.112 0.0738 0.231 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 2.65e-01 0.0887 0.0793 0.23 NK L1
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 1.40e-01 0.108 0.0732 0.23 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 6.27e-01 0.0446 0.0915 0.23 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0139 0.0379 0.23 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0627 0.0699 0.23 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0888 0.0922 0.231 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 7.68e-02 0.128 0.0722 0.231 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 7.55e-01 0.0275 0.088 0.231 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0366 0.0348 0.231 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 3.74e-01 0.0571 0.0641 0.231 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 1.81e-01 0.128 0.0951 0.231 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 9.81e-01 0.00252 0.108 0.23 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 6.43e-01 -0.043 0.0926 0.23 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 4.35e-01 0.077 0.0985 0.23 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0597 0.0526 0.23 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 1.80e-01 0.126 0.0938 0.23 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0373 0.0925 0.23 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 3.19e-02 0.221 0.102 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 2.85e-02 0.13 0.0588 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0658 0.0895 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 8.33e-01 0.0116 0.0549 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 5.66e-01 0.0545 0.0948 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 5.35e-01 0.0613 0.0988 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 3.00e-01 -0.103 0.0991 0.233 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 4.35e-02 0.145 0.0712 0.233 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 7.73e-01 0.0272 0.094 0.233 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 9.38e-01 0.00354 0.0453 0.233 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 3.57e-02 0.174 0.0822 0.233 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 1.04e-02 0.241 0.0931 0.233 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 4.02e-01 0.079 0.094 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 1.40e-01 0.0667 0.045 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 3.28e-02 -0.187 0.0869 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 1.33e-01 0.0751 0.0498 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 6.64e-01 0.034 0.0782 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 2.84e-01 -0.103 0.0963 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0958 0.0999 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 7.05e-01 0.0202 0.0532 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 4.34e-01 0.0764 0.0975 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 1.88e-01 0.068 0.0515 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0442 0.0913 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 7.21e-01 0.0352 0.0986 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 4.34e-02 0.201 0.0987 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0336 0.099 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 3.36e-01 0.0961 0.0997 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0336 0.0461 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 2.77e-01 0.0871 0.0798 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 2.20e-01 0.114 0.0927 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 9.58e-01 0.00418 0.0791 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 6.73e-02 0.142 0.077 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 4.05e-01 0.0599 0.0718 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 8.74e-01 0.0074 0.0466 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 2.95e-01 0.0598 0.057 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 1.33e-01 0.135 0.0893 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 8.91e-01 0.0116 0.0851 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 5.41e-01 0.0524 0.0856 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 1.94e-01 -0.11 0.0842 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0316 0.0437 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 5.25e-01 0.039 0.0612 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 6.94e-01 0.0399 0.101 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 2.25e-01 0.118 0.0968 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00523 0.0972 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 1.60e-01 0.131 0.0929 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0141 0.0383 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 4.77e-01 0.0468 0.0657 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 8.05e-02 0.166 0.0944 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00559 0.0867 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0565 0.081 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 6.68e-01 0.0396 0.0921 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 6.39e-01 0.0231 0.0493 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 5.31e-02 0.161 0.0825 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00934 0.0955 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 3.91e-01 0.0801 0.0933 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 1.98e-01 0.128 0.0992 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0687 0.0858 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0206 0.0492 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 8.43e-01 0.0122 0.0617 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 8.58e-01 0.0177 0.0987 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0502 0.105 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 5.55e-01 0.0575 0.0973 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0338 0.0967 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0171 0.0471 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 9.61e-02 0.13 0.0775 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0758 0.103 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 6.46e-01 0.0437 0.0949 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0926 0.103 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 2.16e-01 0.127 0.103 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 1.43e-01 0.0811 0.0551 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 6.07e-01 0.0468 0.0907 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 9.58e-02 0.174 0.104 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 8.95e-01 0.0129 0.0971 0.232 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 2.73e-01 0.101 0.092 0.232 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 4.21e-01 0.0754 0.0937 0.232 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 1.19e-01 -0.0718 0.0459 0.232 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 8.43e-01 0.0129 0.0649 0.232 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 3.97e-01 0.0819 0.0966 0.232 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 9.21e-01 -0.011 0.111 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 6.72e-01 0.0436 0.103 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0556 0.104 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 5.03e-01 0.039 0.0581 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0835 0.0867 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 6.24e-01 0.042 0.0857 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 4.16e-01 0.0639 0.0784 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0214 0.0981 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0159 0.0389 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 6.01e-01 0.0452 0.0862 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 2.52e-01 0.122 0.106 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 5.19e-01 0.0624 0.0966 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 4.64e-01 0.0718 0.0978 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0191 0.0456 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00228 0.0901 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 1.70e-01 0.122 0.0889 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 5.36e-02 0.166 0.0857 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 3.21e-01 0.0965 0.097 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 8.89e-01 -0.00737 0.0528 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 2.15e-01 -0.109 0.0875 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 9.41e-02 0.197 0.117 0.237 PB L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 1.87e-01 -0.111 0.0836 0.237 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0618 0.103 0.237 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 3.72e-02 -0.121 0.0573 0.237 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 9.01e-02 0.159 0.0932 0.237 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 8.52e-01 0.0205 0.109 0.237 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0358 0.101 0.23 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 3.00e-01 0.0936 0.0901 0.23 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0364 0.0969 0.23 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 7.04e-01 -0.014 0.0367 0.23 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 1.80e-01 0.0986 0.0732 0.23 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 2.40e-01 0.112 0.0946 0.23 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 5.38e-01 0.0626 0.102 0.231 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 2.83e-02 0.209 0.0947 0.231 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 2.03e-01 0.103 0.0803 0.231 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 8.29e-01 0.00772 0.0357 0.231 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 2.48e-01 0.0867 0.0749 0.231 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 8.64e-01 0.0172 0.101 0.231 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 6.34e-01 0.0506 0.106 0.232 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 9.19e-01 0.0085 0.0833 0.232 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 672089 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0627 0.0826 0.232 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 692799 sc-eQTL 1.92e-01 0.127 0.0968 0.232 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0325 0.0947 0.232 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0492 0.0466 0.232 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 2.47e-01 0.0913 0.0785 0.232 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00955 0.0926 0.232 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 303726 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0247 0.074 0.232 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -889447 sc-eQTL 2.60e-02 0.202 0.0899 0.232 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 5.00e-01 0.0559 0.0828 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 7.56e-01 0.0195 0.0629 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 672089 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0682 0.0888 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 692799 sc-eQTL 7.02e-02 0.162 0.089 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0932 0.0714 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 3.49e-01 0.0373 0.0397 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 2.46e-01 0.0689 0.0592 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 9.08e-01 0.00891 0.0768 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -889447 sc-eQTL 7.50e-02 0.142 0.0794 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 9.06e-01 0.0112 0.0942 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 2.96e-02 0.147 0.0673 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 672089 sc-eQTL 5.25e-01 -0.054 0.0849 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 692799 sc-eQTL 9.12e-02 0.155 0.0916 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0265 0.0604 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 5.30e-01 0.0273 0.0435 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 1.28e-01 0.0755 0.0495 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 2.88e-02 -0.175 0.0796 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -889447 sc-eQTL 9.55e-01 0.00448 0.0788 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0906 0.128 0.245 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 1.59e-01 0.155 0.109 0.245 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 9.71e-01 0.00446 0.122 0.245 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0178 0.0463 0.245 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 8.52e-02 0.15 0.0866 0.245 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0758 0.12 0.245 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 9.76e-01 0.00293 0.0953 0.229 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 7.47e-01 0.0294 0.091 0.229 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 672089 sc-eQTL 2.71e-01 -0.101 0.0916 0.229 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 692799 sc-eQTL 2.59e-01 0.103 0.0906 0.229 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 6.39e-01 0.0434 0.0923 0.229 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0273 0.0401 0.229 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 7.14e-01 0.0248 0.0675 0.229 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 9.85e-01 0.00187 0.0978 0.229 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -889447 sc-eQTL 8.10e-01 0.0226 0.0936 0.229 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 9.23e-01 0.00983 0.101 0.229 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 9.80e-01 0.00176 0.0685 0.229 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 672089 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0592 0.0965 0.229 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 692799 sc-eQTL 3.94e-01 0.0818 0.0958 0.229 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 2.39e-01 0.109 0.0919 0.229 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 8.91e-01 -0.00634 0.0463 0.229 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 1.14e-01 0.103 0.065 0.229 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00273 0.0817 0.229 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -889447 sc-eQTL 3.86e-01 0.0749 0.0862 0.229 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0589 0.116 0.234 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00904 0.0776 0.234 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 672089 sc-eQTL 3.56e-02 -0.163 0.077 0.234 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 692799 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00722 0.0795 0.234 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0998 0.0943 0.234 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0869 0.0648 0.234 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0135 0.0662 0.234 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 4.59e-02 -0.192 0.0952 0.234 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 303726 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00631 0.0923 0.234 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -889447 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0318 0.0818 0.234 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 3.49e-02 0.212 0.0999 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 5.80e-03 0.152 0.0546 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 3.93e-01 0.075 0.0877 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0144 0.0501 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 1.49e-01 0.113 0.0779 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 1.98e-01 0.118 0.0916 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 8.87e-01 0.0133 0.0937 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 1.23e-01 0.065 0.042 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0991 0.0817 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 9.11e-02 0.0836 0.0493 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 9.34e-01 0.0064 0.0768 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0499 0.0935 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 7.18e-01 0.0275 0.0761 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 1.49e-01 0.0763 0.0527 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 672089 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0798 0.0861 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 692799 sc-eQTL 2.92e-02 0.195 0.089 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0414 0.0594 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 3.46e-01 0.0385 0.0407 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 2.55e-01 0.0632 0.0554 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0612 0.0725 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -889447 sc-eQTL 3.31e-01 0.0739 0.0759 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00865 0.0973 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 6.49e-01 0.0293 0.0642 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 672089 sc-eQTL 8.81e-02 -0.161 0.0938 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 692799 sc-eQTL 4.16e-01 0.0762 0.0934 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 2.49e-01 0.102 0.088 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0237 0.0374 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 1.72e-01 0.0773 0.0564 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0439 0.0909 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -889447 sc-eQTL 1.96e-01 0.106 0.0819 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -545316 sc-eQTL 1.51e-01 0.113 0.0783 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 893656 sc-eQTL 1.39e-01 0.109 0.0735 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 643395 sc-eQTL 6.68e-01 0.0402 0.0935 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 592285 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0192 0.0382 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -911258 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0151 0.0789 0.231 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 893656 eQTL 8.51e-05 0.0689 0.0175 0.0 0.0 0.252
ENSG00000112299 VNN1 692799 pQTL 0.00837 0.102 0.0388 0.0 0.0 0.258
ENSG00000146409 SLC18B1 593515 eQTL 0.00856 0.0649 0.0246 0.0 0.0 0.252

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 692799 3.02e-07 1.53e-07 5.72e-08 2.07e-07 1.03e-07 8.45e-08 2.1e-07 5.62e-08 1.66e-07 7.6e-08 1.61e-07 1.22e-07 2.29e-07 8.13e-08 5.82e-08 7.98e-08 4.18e-08 1.64e-07 6.75e-08 5.33e-08 1.27e-07 1.42e-07 1.62e-07 3.4e-08 2.02e-07 1.26e-07 1.17e-07 1.1e-07 1.34e-07 1.06e-07 1.14e-07 3.6e-08 3.59e-08 9.8e-08 3.71e-08 2.68e-08 5.51e-08 9.17e-08 6.28e-08 3.67e-08 5.94e-08 1.59e-07 5.21e-08 1.18e-08 3.81e-08 1.68e-08 1e-07 1.92e-09 5.02e-08
ENSG00000118515 \N -911258 2.74e-07 1.3e-07 3.88e-08 1.84e-07 9.21e-08 1e-07 1.53e-07 5.4e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.57e-07 8.68e-08 1.52e-07 6.76e-08 5.99e-08 7.3e-08 3.87e-08 1.26e-07 5.36e-08 4.04e-08 1.08e-07 1.28e-07 1.39e-07 3.49e-08 1.46e-07 1.14e-07 1.06e-07 9.65e-08 1.09e-07 1.02e-07 9.7e-08 3.64e-08 3.16e-08 8.34e-08 7.66e-08 3.6e-08 5.05e-08 9.25e-08 6.54e-08 3.77e-08 5.13e-08 1.36e-07 4.14e-08 1.86e-08 5.75e-08 1.99e-08 1.19e-07 3.86e-09 5.09e-08