logo

Genes within 1Mb (chr6:133403220:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0263 0.11 0.188 B L1
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0179 0.0439 0.188 B L1
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 8.61e-01 0.0144 0.0825 0.188 B L1
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 4.88e-01 0.0346 0.0498 0.188 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 8.39e-02 -0.133 0.0764 0.188 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 2.44e-03 -0.315 0.103 0.188 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 4.36e-01 0.0631 0.0807 0.188 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 7.39e-01 0.0281 0.084 0.188 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 6.68e-01 0.0312 0.0728 0.188 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0375 0.0494 0.188 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0697 0.0664 0.188 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 1.25e-03 -0.319 0.0977 0.188 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 9.06e-02 0.134 0.0787 0.188 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 9.31e-02 0.139 0.0822 0.188 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00139 0.0966 0.188 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 6.07e-01 0.017 0.033 0.188 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0267 0.0508 0.188 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 1.96e-03 -0.306 0.0975 0.188 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 3.10e-01 -0.126 0.124 0.187 DC L1
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 4.56e-01 0.0576 0.0772 0.187 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 668455 sc-eQTL 5.87e-01 0.0521 0.0958 0.187 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 689165 sc-eQTL 9.47e-02 -0.173 0.103 0.187 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0641 0.111 0.187 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0313 0.062 0.187 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0458 0.0719 0.187 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0928 0.098 0.187 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 300092 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0353 0.0894 0.187 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -893081 sc-eQTL 3.51e-01 -0.104 0.111 0.187 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0414 0.0857 0.188 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0221 0.0573 0.188 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 668455 sc-eQTL 7.07e-02 0.178 0.0977 0.188 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 689165 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0421 0.106 0.188 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0808 0.0746 0.188 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0501 0.0447 0.188 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 8.17e-01 0.0146 0.0633 0.188 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 8.03e-01 0.0222 0.0886 0.188 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -893081 sc-eQTL 2.17e-01 -0.107 0.0868 0.188 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00607 0.093 0.189 NK L1
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 1.35e-01 0.128 0.0856 0.189 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 7.37e-01 0.036 0.107 0.189 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0218 0.0443 0.189 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 3.17e-01 -0.082 0.0818 0.189 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0516 0.11 0.188 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0661 0.0868 0.188 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 1.37e-01 -0.156 0.105 0.188 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000138 0.0417 0.188 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0956 0.0764 0.188 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 2.97e-01 -0.119 0.114 0.188 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 4.38e-01 -0.101 0.13 0.181 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 2.32e-01 0.133 0.111 0.181 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 3.65e-01 -0.107 0.118 0.181 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 7.83e-02 0.111 0.0629 0.181 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 9.73e-02 -0.187 0.112 0.181 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 7.19e-01 0.04 0.111 0.181 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0727 0.123 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 4.82e-01 0.0496 0.0704 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 1.60e-01 0.149 0.106 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 1.98e-01 0.0836 0.0648 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0501 0.112 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 9.23e-03 -0.303 0.115 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 2.61e-01 0.133 0.118 0.188 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 8.87e-02 0.146 0.0851 0.188 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 7.47e-01 0.0362 0.112 0.188 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 8.92e-01 0.00734 0.054 0.188 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0981 0.0989 0.188 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 2.88e-01 -0.12 0.112 0.188 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0752 0.109 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00618 0.0525 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0583 0.102 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0289 0.058 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0399 0.0908 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 1.22e-01 -0.173 0.111 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 4.78e-01 0.0832 0.117 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00193 0.0623 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 3.92e-01 0.0979 0.114 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 4.84e-01 0.0424 0.0605 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0454 0.107 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 1.41e-01 -0.17 0.115 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 2.61e-02 -0.25 0.112 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 7.22e-01 0.04 0.112 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 5.06e-01 0.0753 0.113 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00757 0.0524 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0504 0.0907 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0815 0.105 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 8.26e-01 0.0204 0.0926 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 1.86e-01 -0.12 0.0904 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 6.44e-01 0.0389 0.084 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0457 0.0545 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 4.91e-02 -0.131 0.0662 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 1.28e-03 -0.334 0.102 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 9.25e-02 0.169 0.0997 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 3.40e-02 0.213 0.1 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 9.21e-01 0.00993 0.0996 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 9.96e-01 0.000273 0.0517 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 9.86e-01 0.00128 0.0723 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 1.20e-01 -0.186 0.119 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 3.18e-01 0.117 0.117 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 8.77e-01 0.0182 0.117 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 7.48e-01 0.036 0.112 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0285 0.046 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0274 0.0791 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0514 0.114 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 3.02e-01 0.104 0.101 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 4.51e-03 0.265 0.0924 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0337 0.107 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0533 0.0572 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0536 0.0967 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 1.50e-01 -0.16 0.11 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 9.44e-01 0.00754 0.107 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 6.20e-01 0.0567 0.114 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 6.83e-01 0.0403 0.0985 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0342 0.0564 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0179 0.0708 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 2.03e-02 -0.261 0.112 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0762 0.12 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 2.33e-01 0.133 0.111 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0229 0.11 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 6.72e-01 0.0228 0.0538 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 4.12e-02 -0.181 0.0882 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 6.43e-01 0.0548 0.118 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0265 0.111 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0891 0.121 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0145 0.12 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0672 0.0646 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 3.78e-01 0.0936 0.106 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 2.26e-01 -0.148 0.122 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 6.76e-02 -0.208 0.113 0.188 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0958 0.108 0.188 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 1.70e-01 -0.151 0.11 0.188 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 1.92e-01 0.0705 0.0539 0.188 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 1.59e-01 -0.107 0.0758 0.188 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0335 0.113 0.188 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 5.50e-01 0.0735 0.123 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 3.29e-01 0.111 0.114 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0358 0.116 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0736 0.0643 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 8.61e-01 0.0169 0.0964 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0948 0.0999 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 4.31e-01 0.0722 0.0915 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 6.10e-01 0.0585 0.115 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 3.67e-01 -0.041 0.0454 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 2.21e-01 -0.123 0.1 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 8.65e-01 0.0212 0.125 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 7.96e-01 0.0295 0.114 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 3.38e-01 -0.11 0.115 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 7.21e-01 0.0192 0.0536 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0364 0.106 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 4.06e-01 0.0846 0.102 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 6.00e-01 0.0517 0.0984 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 4.06e-01 0.0921 0.111 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0433 0.06 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 5.43e-02 -0.192 0.0991 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 4.51e-02 -0.297 0.146 0.193 PB L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 2.36e-02 0.238 0.104 0.193 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 2.17e-01 0.16 0.129 0.193 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 2.88e-01 0.0782 0.0733 0.193 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 2.52e-02 -0.264 0.116 0.193 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 1.57e-01 0.195 0.137 0.193 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0213 0.115 0.187 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0056 0.103 0.187 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0642 0.111 0.187 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0401 0.0418 0.187 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 6.46e-01 0.0386 0.0838 0.187 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 4.45e-01 0.0828 0.108 0.187 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 3.21e-01 0.118 0.118 0.188 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 3.05e-01 -0.114 0.111 0.188 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0823 0.0937 0.188 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 9.00e-01 0.0052 0.0415 0.188 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 3.54e-01 0.0811 0.0873 0.188 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 6.79e-04 -0.394 0.114 0.188 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 1.18e-01 -0.2 0.127 0.18 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 2.74e-01 0.11 0.1 0.18 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 668455 sc-eQTL 2.09e-01 0.125 0.0995 0.18 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 689165 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0537 0.117 0.18 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 7.82e-01 0.0318 0.114 0.18 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0137 0.0565 0.18 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 9.55e-02 -0.158 0.0945 0.18 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0465 0.112 0.18 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 300092 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0478 0.0894 0.18 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -893081 sc-eQTL 8.00e-02 -0.192 0.109 0.18 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0632 0.0966 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 8.49e-01 0.014 0.0734 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 668455 sc-eQTL 4.41e-01 0.08 0.104 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 689165 sc-eQTL 8.47e-01 0.0203 0.105 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0397 0.0837 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0608 0.0463 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0209 0.0693 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0283 0.0897 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -893081 sc-eQTL 1.81e-01 -0.125 0.093 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0464 0.111 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0413 0.08 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 668455 sc-eQTL 2.41e-02 0.224 0.0988 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 689165 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0482 0.108 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0749 0.0709 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 1.11e-01 -0.0815 0.0509 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0534 0.0584 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 8.16e-01 0.0221 0.0947 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -893081 sc-eQTL 2.67e-01 -0.103 0.0924 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 4.36e-01 -0.116 0.149 0.185 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0929 0.128 0.185 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 1.20e-01 -0.22 0.141 0.185 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 2.17e-02 -0.123 0.053 0.185 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0431 0.102 0.185 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 2.30e-01 -0.167 0.139 0.185 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 7.15e-01 0.0419 0.114 0.184 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 4.08e-02 0.223 0.108 0.184 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 668455 sc-eQTL 2.70e-03 0.328 0.108 0.184 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 689165 sc-eQTL 8.63e-01 0.0188 0.109 0.184 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0397 0.111 0.184 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0514 0.0481 0.184 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 5.12e-01 0.0532 0.081 0.184 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 1.62e-02 -0.281 0.116 0.184 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -893081 sc-eQTL 9.82e-01 0.00252 0.112 0.184 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 4.34e-01 0.0948 0.121 0.181 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0574 0.0819 0.181 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 668455 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0197 0.116 0.181 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 689165 sc-eQTL 7.15e-02 -0.206 0.114 0.181 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 2.72e-01 -0.121 0.11 0.181 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 4.63e-01 0.0407 0.0553 0.181 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0319 0.0783 0.181 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 1.46e-02 0.237 0.0964 0.181 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -893081 sc-eQTL 3.26e-01 -0.102 0.103 0.181 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 9.43e-01 0.0103 0.144 0.184 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 2.13e-01 0.119 0.0951 0.184 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 668455 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0297 0.0962 0.184 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 689165 sc-eQTL 1.70e-02 -0.232 0.0962 0.184 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0406 0.117 0.184 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 1.14e-01 -0.127 0.0797 0.184 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0222 0.0816 0.184 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 3.25e-01 -0.117 0.119 0.184 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 300092 sc-eQTL 4.51e-01 0.0859 0.114 0.184 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -893081 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0514 0.101 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 9.89e-01 0.00172 0.12 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 6.94e-02 0.119 0.0653 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 4.39e-01 0.0806 0.104 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 7.69e-01 0.0174 0.0593 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 2.39e-01 -0.109 0.0925 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 5.28e-03 -0.301 0.107 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0617 0.109 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0137 0.0489 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 9.50e-01 0.00603 0.095 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000472 0.0575 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0648 0.0889 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 1.93e-02 -0.252 0.107 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0739 0.0887 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0268 0.0618 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 668455 sc-eQTL 1.61e-01 0.141 0.1 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 689165 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0205 0.105 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0691 0.0693 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 1.05e-01 -0.0769 0.0473 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0184 0.0649 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0164 0.0847 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -893081 sc-eQTL 2.19e-01 -0.109 0.0885 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 3.75e-01 0.102 0.114 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 4.47e-01 0.0575 0.0755 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 668455 sc-eQTL 2.63e-02 0.246 0.11 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 689165 sc-eQTL 3.19e-01 -0.11 0.11 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0948 0.104 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 8.99e-01 0.00561 0.0441 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 9.74e-01 0.00215 0.0667 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 sc-eQTL 2.72e-01 -0.118 0.107 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -893081 sc-eQTL 4.70e-01 -0.07 0.0967 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -548950 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0214 0.0922 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 890022 sc-eQTL 1.74e-01 0.117 0.0862 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 639761 sc-eQTL 4.52e-01 0.0826 0.109 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 588651 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0248 0.0447 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -914892 sc-eQTL 6.06e-02 -0.173 0.0916 0.19 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 668455 eQTL 0.00036 -0.066 0.0184 0.0 0.0 0.188
ENSG00000112299 VNN1 689165 pQTL 0.00442 0.129 0.0454 0.0 0.0 0.188
ENSG00000112299 VNN1 689165 eQTL 0.0135 0.0681 0.0275 0.0 0.0 0.188
ENSG00000112303 VNN2 639761 pQTL 0.00465 -0.0926 0.0327 0.0 0.0 0.188
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 eQTL 0.000303 -0.102 0.0282 0.0 0.0 0.188
ENSG00000234484 AL032821.1 650545 eQTL 0.0295 0.0861 0.0395 0.0 0.0 0.188

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 668455 2.67e-07 1.42e-07 5.72e-08 2.07e-07 9.87e-08 8.33e-08 1.73e-07 5.53e-08 1.47e-07 6.08e-08 1.63e-07 1.11e-07 1.69e-07 7.64e-08 5.94e-08 7.23e-08 4.24e-08 1.4e-07 6.75e-08 4.95e-08 1.25e-07 1.25e-07 1.5e-07 2.83e-08 1.72e-07 1.26e-07 1.13e-07 1.04e-07 1.22e-07 9.49e-08 1.08e-07 3.84e-08 3.43e-08 8.72e-08 3.81e-08 2.69e-08 5.42e-08 8.89e-08 6.3e-08 4.08e-08 5.33e-08 1.46e-07 5.2e-08 1.14e-08 3.4e-08 1.77e-08 9.96e-08 2.07e-09 4.83e-08
ENSG00000146409 SLC18B1 589881 2.91e-07 1.67e-07 6.28e-08 2.31e-07 9.94e-08 8.63e-08 2.1e-07 5.62e-08 1.59e-07 8.53e-08 1.63e-07 1.23e-07 2.05e-07 8.07e-08 5.97e-08 7.98e-08 4.45e-08 1.64e-07 7.16e-08 5.75e-08 1.18e-07 1.47e-07 1.58e-07 3.42e-08 2.17e-07 1.31e-07 1.17e-07 1.12e-07 1.31e-07 1.06e-07 1.14e-07 4.93e-08 3.38e-08 9.78e-08 3.97e-08 2.74e-08 4.07e-08 7.63e-08 6.33e-08 6.19e-08 6.28e-08 1.59e-07 5.39e-08 2.1e-08 3.07e-08 1.19e-08 7.83e-08 0.0 4.67e-08