logo

Genes within 1Mb (chr6:133403167:C:CA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 8.91e-01 -0.022 0.161 0.081 B L1
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00187 0.064 0.081 B L1
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 9.31e-01 0.0104 0.12 0.081 B L1
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 1.66e-01 -0.101 0.0724 0.081 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 1.52e-01 -0.161 0.112 0.081 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 3.19e-01 0.152 0.153 0.081 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 9.87e-03 -0.3 0.115 0.081 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 3.94e-02 -0.25 0.12 0.081 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 6.61e-01 0.0462 0.105 0.081 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 7.19e-01 0.0258 0.0716 0.081 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0972 0.096 0.081 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00451 0.145 0.081 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 3.80e-02 -0.24 0.115 0.081 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 4.03e-02 -0.248 0.12 0.081 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 1.17e-01 0.222 0.141 0.081 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0229 0.0484 0.081 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 6.60e-01 0.0328 0.0746 0.081 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 3.06e-01 0.15 0.146 0.081 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 3.05e-01 0.181 0.176 0.086 DC L1
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 1.87e-01 -0.145 0.109 0.086 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 668402 sc-eQTL 3.78e-02 0.282 0.135 0.086 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 689112 sc-eQTL 3.73e-01 0.131 0.147 0.086 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 9.13e-01 0.0173 0.157 0.086 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 9.77e-01 0.00259 0.0882 0.086 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 2.43e-02 -0.229 0.101 0.086 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 2.57e-01 -0.158 0.139 0.086 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 300039 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0253 0.127 0.086 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -893134 sc-eQTL 7.22e-01 0.0564 0.158 0.086 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 9.37e-01 0.00982 0.124 0.081 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 4.98e-01 0.0562 0.0827 0.081 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 668402 sc-eQTL 9.02e-03 -0.369 0.14 0.081 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 689112 sc-eQTL 9.74e-01 0.00506 0.153 0.081 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 2.25e-01 0.131 0.108 0.081 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 5.12e-01 0.0424 0.0646 0.081 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 1.68e-01 -0.126 0.0909 0.081 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 7.63e-01 0.0385 0.128 0.081 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -893134 sc-eQTL 1.74e-01 -0.171 0.125 0.081 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 6.84e-01 0.0556 0.137 0.082 NK L1
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00884 0.126 0.082 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 4.72e-01 0.113 0.157 0.082 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 2.02e-01 -0.083 0.0648 0.082 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 1.40e-01 -0.178 0.12 0.082 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 7.12e-01 0.0594 0.161 0.081 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0665 0.126 0.081 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 3.35e-02 0.324 0.151 0.081 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 9.39e-01 0.00464 0.0606 0.081 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 3.35e-01 -0.108 0.111 0.081 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 1.18e-01 -0.259 0.165 0.081 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 2.05e-01 0.248 0.195 0.084 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0254 0.168 0.084 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 6.03e-01 0.0929 0.179 0.084 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 8.94e-01 0.0127 0.0957 0.084 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 9.59e-01 0.0088 0.171 0.084 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 7.29e-02 0.3 0.166 0.084 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00123 0.177 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0465 0.102 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 4.25e-01 0.122 0.153 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 1.39e-01 -0.139 0.0935 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0661 0.162 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00169 0.169 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 3.64e-01 0.158 0.173 0.082 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 2.45e-01 -0.146 0.125 0.082 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 4.16e-02 -0.334 0.163 0.082 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 5.54e-01 -0.047 0.0792 0.082 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 3.83e-02 -0.3 0.144 0.082 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0441 0.165 0.082 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0615 0.161 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 9.84e-01 0.00152 0.0776 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 3.56e-01 0.139 0.15 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 1.06e-01 -0.139 0.0852 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 5.69e-02 -0.255 0.133 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 5.91e-03 0.452 0.163 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 9.66e-01 0.00723 0.171 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 3.08e-01 0.0928 0.0908 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 4.92e-01 -0.115 0.167 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 1.83e-01 -0.118 0.0881 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 1.26e-01 0.239 0.155 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 4.22e-01 -0.136 0.169 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 9.71e-01 -0.0062 0.173 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 1.95e-01 -0.223 0.171 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 2.35e-01 0.206 0.173 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 5.18e-01 0.0519 0.0802 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 9.31e-01 0.012 0.139 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 8.63e-01 0.028 0.162 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 3.96e-01 -0.114 0.134 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 1.60e-02 -0.316 0.13 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 3.69e-01 -0.11 0.122 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0114 0.0792 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0619 0.0969 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 2.82e-01 -0.164 0.152 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 3.54e-02 -0.303 0.143 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0658 0.145 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 8.88e-04 0.471 0.14 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 6.53e-01 0.0335 0.0743 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 2.03e-02 -0.24 0.103 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 6.05e-03 0.469 0.169 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 7.57e-01 0.0517 0.167 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 9.38e-01 -0.013 0.167 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 2.03e-01 -0.204 0.16 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 3.25e-01 0.0647 0.0655 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 1.78e-01 -0.152 0.112 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0698 0.163 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 4.21e-01 -0.12 0.149 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 3.41e-02 -0.294 0.138 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 1.87e-01 0.209 0.158 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 9.34e-01 0.00699 0.0848 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 2.08e-01 -0.18 0.143 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 2.80e-01 0.178 0.164 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0511 0.157 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 3.51e-01 -0.156 0.167 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 7.26e-01 0.0507 0.145 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 4.84e-01 0.058 0.0827 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0105 0.104 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0695 0.166 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0689 0.195 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 2.74e-01 -0.198 0.18 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 3.67e-01 0.162 0.179 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 2.21e-01 -0.107 0.0871 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 9.49e-01 0.0092 0.145 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0582 0.192 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 8.69e-01 0.0269 0.163 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 3.60e-01 0.163 0.177 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 2.71e-01 0.195 0.176 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 8.27e-01 0.0207 0.095 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 7.07e-01 0.0587 0.156 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 7.09e-01 0.0671 0.18 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 3.33e-01 -0.166 0.171 0.08 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 8.30e-02 -0.282 0.162 0.08 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 2.05e-01 0.21 0.165 0.08 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 6.55e-01 0.0365 0.0815 0.08 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0241 0.115 0.08 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 1.22e-01 -0.264 0.17 0.08 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 2.92e-01 -0.184 0.174 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0418 0.162 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0626 0.164 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 3.98e-01 0.0774 0.0914 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 1.70e-01 -0.188 0.136 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 5.26e-01 0.0921 0.145 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 5.78e-01 -0.074 0.133 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 5.67e-01 0.0952 0.166 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0783 0.0657 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 2.11e-01 -0.183 0.146 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 2.48e-01 -0.209 0.181 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 7.11e-01 0.0612 0.165 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 9.75e-02 0.276 0.166 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0551 0.0777 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 5.32e-02 0.296 0.152 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0432 0.153 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 9.19e-01 -0.015 0.148 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 9.02e-01 0.0206 0.166 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0153 0.0902 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0547 0.15 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 1.88e-01 -0.283 0.213 0.078 PB L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 8.84e-01 0.0224 0.153 0.078 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 7.63e-01 0.0566 0.187 0.078 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 4.26e-01 0.0847 0.106 0.078 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 1.67e-01 -0.237 0.17 0.078 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 6.13e-01 -0.101 0.199 0.078 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 3.33e-01 0.161 0.166 0.083 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0286 0.149 0.083 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 4.88e-01 0.11 0.159 0.083 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0487 0.0602 0.083 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0797 0.121 0.083 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0846 0.156 0.083 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0753 0.17 0.081 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 3.03e-01 -0.166 0.16 0.081 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 7.95e-01 0.0352 0.135 0.081 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 7.42e-01 0.0197 0.0598 0.081 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 8.62e-01 -0.022 0.126 0.081 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 7.13e-01 0.0623 0.169 0.081 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 8.08e-01 0.0443 0.182 0.08 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 2.29e-01 -0.172 0.142 0.08 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 668402 sc-eQTL 8.04e-01 0.0353 0.142 0.08 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 689112 sc-eQTL 7.98e-01 0.0428 0.167 0.08 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 7.02e-02 0.293 0.161 0.08 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 5.40e-01 0.0492 0.0801 0.08 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 7.70e-02 -0.238 0.134 0.08 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 3.93e-01 -0.136 0.159 0.08 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 300039 sc-eQTL 3.78e-01 0.112 0.127 0.08 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -893134 sc-eQTL 2.79e-01 -0.169 0.156 0.08 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 8.81e-01 -0.021 0.14 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 7.68e-01 0.0314 0.106 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 668402 sc-eQTL 4.50e-02 -0.3 0.149 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 689112 sc-eQTL 3.69e-01 -0.136 0.151 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 4.83e-02 0.238 0.12 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 8.10e-01 0.0162 0.0672 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 1.42e-01 -0.147 0.0998 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 3.67e-01 -0.117 0.129 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -893134 sc-eQTL 1.01e-01 -0.221 0.134 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 9.12e-01 0.0178 0.16 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 3.41e-01 0.11 0.115 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 668402 sc-eQTL 1.29e-02 -0.356 0.142 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 689112 sc-eQTL 2.82e-01 0.168 0.156 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 8.92e-01 0.014 0.102 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 5.39e-01 0.0453 0.0737 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0777 0.0842 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 6.71e-02 0.249 0.136 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -893134 sc-eQTL 3.00e-01 -0.139 0.133 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 6.88e-02 0.436 0.238 0.067 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 2.25e-02 0.469 0.203 0.067 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0568 0.229 0.067 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 8.19e-01 -0.02 0.0872 0.067 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 2.01e-01 0.21 0.164 0.067 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 1.30e-01 0.341 0.224 0.067 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 3.47e-01 -0.154 0.163 0.082 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0619 0.156 0.082 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 668402 sc-eQTL 2.44e-01 -0.184 0.157 0.082 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 689112 sc-eQTL 6.04e-01 0.0811 0.156 0.082 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 3.50e-01 0.148 0.158 0.082 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 7.54e-01 0.0217 0.0691 0.082 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 1.35e-01 -0.173 0.115 0.082 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 2.39e-01 0.198 0.168 0.082 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -893134 sc-eQTL 7.89e-01 0.043 0.161 0.082 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 6.32e-01 0.0818 0.171 0.084 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 2.33e-01 -0.138 0.115 0.084 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 668402 sc-eQTL 1.81e-01 -0.218 0.162 0.084 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 689112 sc-eQTL 8.82e-01 0.0239 0.162 0.084 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 4.87e-01 0.108 0.155 0.084 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 7.80e-01 0.0218 0.078 0.084 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 5.81e-01 0.061 0.11 0.084 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0785 0.138 0.084 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -893134 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0216 0.146 0.084 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 6.33e-01 0.0997 0.209 0.073 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0288 0.139 0.073 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 668402 sc-eQTL 6.01e-02 0.262 0.138 0.073 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 689112 sc-eQTL 2.41e-01 0.167 0.142 0.073 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0971 0.169 0.073 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 5.37e-01 0.0722 0.117 0.073 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0521 0.119 0.073 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 8.13e-01 -0.041 0.173 0.073 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 300039 sc-eQTL 4.09e-01 -0.137 0.165 0.073 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -893134 sc-eQTL 1.83e-01 0.195 0.146 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 5.42e-01 0.105 0.172 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0716 0.0946 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0994 0.15 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0316 0.0853 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0515 0.133 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 2.07e-01 0.198 0.156 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 7.96e-01 -0.041 0.158 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 7.76e-01 0.0203 0.0712 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 5.62e-01 0.0803 0.138 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 5.85e-02 -0.158 0.083 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 3.01e-01 -0.134 0.129 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 1.08e-01 0.253 0.157 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 9.17e-01 0.0133 0.128 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 3.39e-01 0.0852 0.089 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 668402 sc-eQTL 1.74e-02 -0.344 0.143 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 689112 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00798 0.152 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 2.07e-01 0.126 0.0998 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 7.06e-01 0.0259 0.0687 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 1.68e-01 -0.129 0.0932 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 9.50e-01 0.00774 0.122 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -893134 sc-eQTL 9.17e-02 -0.216 0.127 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0103 0.167 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 1.20e-01 -0.171 0.109 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 668402 sc-eQTL 1.19e-01 -0.252 0.161 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 689112 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0402 0.16 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 3.28e-01 0.148 0.151 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 5.77e-01 0.0359 0.0642 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 3.76e-01 -0.086 0.097 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 589828 sc-eQTL 6.08e-01 0.08 0.156 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -893134 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0329 0.141 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -549003 sc-eQTL 7.05e-01 0.051 0.135 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 889969 sc-eQTL 8.98e-01 0.0163 0.127 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 639708 sc-eQTL 4.59e-01 0.119 0.16 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 588598 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0754 0.0652 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -914945 sc-eQTL 1.67e-01 -0.186 0.135 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112303 VNN2 639708 eQTL 0.0389 0.0477 0.0231 0.0 0.0 0.078

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118515 \N -914945 5.37e-07 9.33e-07 2.91e-07 3.04e-07 1.06e-07 1.57e-07 6.08e-07 5.75e-08 4.61e-07 1.21e-07 4.39e-07 1.57e-07 1.48e-06 1.41e-07 1.45e-07 1.49e-07 3.24e-07 4.16e-07 1.81e-07 1.17e-07 2.17e-07 4.31e-07 4.12e-07 3.59e-08 7.71e-07 2.29e-07 2.57e-07 2.69e-07 4.06e-07 1.33e-07 3.32e-07 3.08e-08 3.74e-08 1.15e-07 3.57e-07 5.14e-08 1.09e-07 6e-08 4.9e-08 9.44e-09 2.95e-08 9.59e-07 5.24e-08 1.74e-07 3.29e-08 8.76e-08 9.83e-08 1.95e-09 5.02e-08