logo

Genes within 1Mb (chr6:133402097:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0153 0.11 0.19 B L1
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 6.64e-01 -0.019 0.0437 0.19 B L1
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 7.30e-01 0.0284 0.0821 0.19 B L1
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 5.45e-01 0.0301 0.0496 0.19 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 6.13e-02 -0.143 0.076 0.19 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 5.82e-03 -0.286 0.103 0.19 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 4.35e-01 0.063 0.0806 0.19 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 9.35e-01 0.0068 0.0839 0.19 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 5.76e-01 0.0406 0.0726 0.19 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0351 0.0493 0.19 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 2.52e-01 -0.076 0.0662 0.19 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 1.43e-03 -0.315 0.0975 0.19 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 9.21e-02 0.133 0.0786 0.19 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 1.46e-01 0.12 0.0822 0.19 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 9.34e-01 0.00802 0.0965 0.19 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 5.69e-01 0.0188 0.0329 0.19 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0259 0.0508 0.19 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 2.49e-03 -0.299 0.0975 0.19 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 2.86e-01 -0.132 0.124 0.189 DC L1
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 4.59e-01 0.0571 0.077 0.189 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 667332 sc-eQTL 5.86e-01 0.0521 0.0955 0.189 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 688042 sc-eQTL 8.17e-02 -0.179 0.102 0.189 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0437 0.11 0.189 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0359 0.0618 0.189 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0466 0.0718 0.189 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0605 0.0979 0.189 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 298969 sc-eQTL 7.28e-01 -0.031 0.0891 0.189 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -894204 sc-eQTL 2.99e-01 -0.115 0.111 0.189 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0456 0.0854 0.19 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 7.14e-01 -0.021 0.0571 0.19 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 667332 sc-eQTL 7.11e-02 0.177 0.0973 0.19 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 688042 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0314 0.106 0.19 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0676 0.0743 0.19 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 2.44e-01 -0.052 0.0445 0.19 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 7.83e-01 0.0174 0.063 0.19 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 8.13e-01 0.0209 0.0883 0.19 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -894204 sc-eQTL 2.35e-01 -0.103 0.0865 0.19 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00842 0.0929 0.191 NK L1
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 1.82e-01 0.114 0.0855 0.191 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 6.41e-01 0.0499 0.107 0.191 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0189 0.0442 0.191 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0729 0.0816 0.191 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0652 0.11 0.19 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0671 0.0866 0.19 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 1.48e-01 -0.151 0.104 0.19 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 9.74e-01 0.00137 0.0416 0.19 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 2.34e-01 -0.091 0.0763 0.19 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 2.79e-01 -0.123 0.114 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0937 0.13 0.184 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 2.48e-01 0.128 0.111 0.184 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 3.06e-01 -0.121 0.118 0.184 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 1.42e-01 0.093 0.063 0.184 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 1.03e-01 -0.184 0.112 0.184 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 7.51e-01 0.0353 0.111 0.184 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0642 0.122 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 6.19e-01 0.035 0.0703 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 1.78e-01 0.143 0.105 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 2.09e-01 0.0815 0.0646 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0697 0.112 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 1.58e-02 -0.28 0.115 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 2.68e-01 0.131 0.118 0.19 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 7.75e-02 0.151 0.0848 0.19 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 7.51e-01 0.0355 0.112 0.19 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 9.19e-01 0.0055 0.0539 0.19 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 2.77e-01 -0.107 0.0985 0.19 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0944 0.112 0.19 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0693 0.109 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00203 0.0523 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0241 0.102 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0292 0.0579 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0403 0.0905 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 1.57e-01 -0.158 0.111 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 4.34e-01 0.0916 0.117 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00589 0.0621 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 3.77e-01 0.101 0.114 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 4.74e-01 0.0433 0.0603 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0522 0.107 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 2.08e-01 -0.145 0.115 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 2.64e-02 -0.25 0.112 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 7.95e-01 0.0292 0.112 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 5.29e-01 0.0714 0.113 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 8.83e-01 -0.00773 0.0523 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0528 0.0906 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0712 0.105 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 8.26e-01 0.0204 0.0924 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 1.40e-01 -0.133 0.0902 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 5.18e-01 0.0544 0.0839 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0417 0.0544 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 4.25e-02 -0.135 0.0661 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 1.31e-03 -0.333 0.102 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 1.21e-01 0.155 0.0996 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 5.20e-02 0.195 0.1 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 9.64e-01 0.00445 0.0994 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 9.51e-01 0.00314 0.0515 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00711 0.0721 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 1.37e-01 -0.177 0.119 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 2.72e-01 0.128 0.116 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 9.16e-01 0.0123 0.117 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 8.46e-01 0.0218 0.112 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0216 0.0459 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0167 0.0789 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0445 0.114 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 2.81e-01 0.109 0.101 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 8.87e-03 0.245 0.0927 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 7.65e-01 -0.032 0.107 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0458 0.0572 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0474 0.0967 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 1.87e-01 -0.146 0.111 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00506 0.107 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 6.11e-01 0.0581 0.114 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 6.04e-01 0.0511 0.0984 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 6.07e-01 -0.029 0.0563 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0199 0.0707 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 2.59e-02 -0.251 0.112 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0823 0.12 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 2.53e-01 0.127 0.111 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0205 0.11 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 7.70e-01 0.0158 0.0537 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 6.32e-02 -0.165 0.0882 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 6.97e-01 0.046 0.118 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0207 0.111 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 4.72e-01 -0.087 0.121 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00394 0.12 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0702 0.0645 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 3.69e-01 0.0954 0.106 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 1.93e-01 -0.159 0.122 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 4.84e-02 -0.224 0.113 0.19 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0988 0.108 0.19 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 1.48e-01 -0.159 0.109 0.19 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 1.62e-01 0.0755 0.0538 0.19 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0977 0.0758 0.19 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0375 0.113 0.19 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 6.52e-01 0.0554 0.123 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 3.17e-01 0.114 0.114 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0196 0.116 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0739 0.0642 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 7.73e-01 0.0278 0.0963 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0969 0.0997 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 5.17e-01 0.0593 0.0914 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 5.39e-01 0.0703 0.114 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0389 0.0453 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 3.11e-01 -0.102 0.1 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 9.35e-01 0.0102 0.125 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 9.92e-01 0.00111 0.114 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0968 0.115 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 6.32e-01 0.0257 0.0536 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0474 0.106 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 3.79e-01 0.0895 0.101 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 6.43e-01 0.0456 0.0984 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 3.81e-01 0.097 0.11 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0392 0.06 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 5.44e-02 -0.192 0.0991 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 4.51e-02 -0.297 0.146 0.193 PB L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 2.36e-02 0.238 0.104 0.193 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 2.17e-01 0.16 0.129 0.193 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 2.88e-01 0.0782 0.0733 0.193 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 2.52e-02 -0.264 0.116 0.193 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 1.57e-01 0.195 0.137 0.193 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 6.97e-01 -0.045 0.115 0.189 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 8.39e-01 0.021 0.103 0.189 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0717 0.11 0.189 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0427 0.0417 0.189 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 7.49e-01 0.0269 0.0838 0.189 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 4.38e-01 0.0839 0.108 0.189 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 2.97e-01 0.123 0.118 0.19 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 2.39e-01 -0.131 0.111 0.19 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0687 0.0937 0.19 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 8.29e-01 0.00897 0.0415 0.19 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 4.34e-01 0.0685 0.0873 0.19 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 4.48e-04 -0.406 0.114 0.19 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 1.13e-01 -0.202 0.127 0.183 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 3.18e-01 0.1 0.0999 0.183 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 667332 sc-eQTL 1.85e-01 0.132 0.099 0.183 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 688042 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0652 0.117 0.183 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 6.91e-01 0.0454 0.114 0.183 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0124 0.0563 0.183 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 8.52e-02 -0.163 0.0941 0.183 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0331 0.111 0.183 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 298969 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0401 0.0891 0.183 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -894204 sc-eQTL 6.61e-02 -0.201 0.109 0.183 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0635 0.0965 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 8.11e-01 0.0175 0.0733 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 667332 sc-eQTL 4.40e-01 0.08 0.103 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 688042 sc-eQTL 7.51e-01 0.0332 0.104 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0294 0.0835 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0611 0.0462 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0156 0.0692 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0287 0.0895 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -894204 sc-eQTL 1.75e-01 -0.126 0.0928 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0467 0.11 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0458 0.0798 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 667332 sc-eQTL 2.13e-02 0.228 0.0985 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 688042 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0336 0.108 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0594 0.0708 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 1.11e-01 -0.0812 0.0508 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0504 0.0583 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 8.34e-01 0.0199 0.0945 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -894204 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0928 0.0922 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 4.19e-01 -0.12 0.148 0.188 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 4.08e-01 -0.106 0.128 0.188 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 1.46e-01 -0.205 0.14 0.188 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 2.91e-02 -0.117 0.053 0.188 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0314 0.102 0.188 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 2.26e-01 -0.169 0.139 0.188 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 6.72e-01 0.0484 0.114 0.187 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 4.40e-02 0.219 0.108 0.187 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 667332 sc-eQTL 1.45e-03 0.347 0.107 0.187 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 688042 sc-eQTL 9.19e-01 0.0111 0.109 0.187 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0332 0.111 0.187 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0492 0.048 0.187 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 4.99e-01 0.0546 0.0808 0.187 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 1.75e-02 -0.277 0.116 0.187 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -894204 sc-eQTL 9.63e-01 0.00526 0.112 0.187 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 4.99e-01 0.082 0.121 0.183 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0595 0.0817 0.183 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 667332 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0289 0.115 0.183 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 688042 sc-eQTL 1.23e-01 -0.177 0.114 0.183 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 2.72e-01 -0.121 0.11 0.183 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 4.75e-01 0.0395 0.0552 0.183 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0341 0.0782 0.183 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 1.74e-02 0.231 0.0963 0.183 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -894204 sc-eQTL 3.21e-01 -0.102 0.103 0.183 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 9.89e-01 0.00201 0.143 0.186 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 2.01e-01 0.122 0.0949 0.186 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 667332 sc-eQTL 6.62e-01 -0.042 0.096 0.186 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 688042 sc-eQTL 2.02e-02 -0.225 0.096 0.186 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0186 0.116 0.186 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 8.56e-02 -0.137 0.0794 0.186 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0145 0.0814 0.186 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0741 0.118 0.186 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 298969 sc-eQTL 4.25e-01 0.0906 0.113 0.186 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -894204 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0639 0.101 0.186 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 9.28e-01 0.0108 0.119 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 9.16e-02 0.111 0.0652 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 4.60e-01 0.0768 0.104 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 8.25e-01 0.0131 0.0592 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 1.81e-01 -0.124 0.0921 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 1.08e-02 -0.275 0.107 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0496 0.109 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 8.22e-01 -0.011 0.0489 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 6.96e-01 0.0372 0.0949 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 9.90e-01 0.000732 0.0575 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0628 0.0888 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 3.21e-02 -0.231 0.107 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 3.98e-01 -0.075 0.0885 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0251 0.0616 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 667332 sc-eQTL 1.55e-01 0.143 0.1 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 688042 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00828 0.105 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0582 0.0692 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 1.05e-01 -0.0769 0.0472 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0139 0.0647 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0187 0.0845 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -894204 sc-eQTL 2.29e-01 -0.107 0.0884 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 3.82e-01 0.0998 0.114 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 4.60e-01 0.0558 0.0753 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 667332 sc-eQTL 2.14e-02 0.254 0.109 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 688042 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0908 0.11 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0951 0.103 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 8.72e-01 0.00707 0.0439 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 9.89e-01 0.000937 0.0665 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 sc-eQTL 2.68e-01 -0.118 0.106 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -894204 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0669 0.0964 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -550073 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0195 0.092 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 888899 sc-eQTL 2.36e-01 0.102 0.0861 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 638638 sc-eQTL 3.85e-01 0.095 0.109 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 587528 sc-eQTL 6.38e-01 -0.021 0.0446 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -916015 sc-eQTL 7.65e-02 -0.163 0.0915 0.192 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 667332 eQTL 0.00049 -0.0643 0.0184 0.0 0.0 0.189
ENSG00000112299 VNN1 688042 pQTL 0.00453 0.129 0.0452 0.0 0.0 0.188
ENSG00000112299 VNN1 688042 eQTL 0.0107 0.0702 0.0274 0.0 0.0 0.189
ENSG00000112303 VNN2 638638 pQTL 0.00443 -0.0928 0.0326 0.0 0.0 0.188
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 eQTL 0.000362 -0.1 0.0281 0.0 0.0 0.189
ENSG00000234484 AL032821.1 649422 eQTL 0.0275 0.0868 0.0393 0.0 0.0 0.189

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 SLC18B1 588758 2.74e-07 1.59e-07 5.64e-08 2.26e-07 1.01e-07 8.45e-08 1.9e-07 5.75e-08 1.5e-07 6.08e-08 1.59e-07 1.11e-07 1.87e-07 8e-08 5.72e-08 7.23e-08 4.18e-08 1.44e-07 7.18e-08 5.04e-08 1.26e-07 1.31e-07 1.58e-07 2.83e-08 2.02e-07 1.23e-07 1.18e-07 1.01e-07 1.22e-07 1.17e-07 1.14e-07 3.1e-08 4.02e-08 8.72e-08 3.46e-08 3.04e-08 5.42e-08 9.03e-08 6.39e-08 3.67e-08 5.43e-08 1.59e-07 5.21e-08 1.73e-08 4.92e-08 1.86e-08 1.21e-07 1.88e-09 4.99e-08