logo

Genes within 1Mb (chr6:133401487:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 2.99e-01 0.0956 0.0918 0.237 B L1
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 4.22e-02 0.0742 0.0363 0.237 B L1
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0206 0.0689 0.237 B L1
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 5.74e-01 0.0234 0.0416 0.237 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 6.88e-01 0.0258 0.0642 0.237 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 3.09e-01 0.0891 0.0874 0.237 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 1.72e-01 0.092 0.0672 0.237 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 1.24e-01 0.108 0.0698 0.237 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 4.42e-01 0.0468 0.0607 0.237 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0118 0.0413 0.237 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 6.50e-01 0.0252 0.0555 0.237 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 1.11e-01 0.133 0.0831 0.237 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 7.07e-01 0.0251 0.0666 0.237 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 7.46e-01 0.0226 0.0696 0.237 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 8.34e-01 -0.017 0.0812 0.237 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0108 0.0278 0.237 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 8.76e-01 0.00666 0.0428 0.237 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 3.12e-01 0.0849 0.0837 0.237 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 3.86e-01 0.088 0.101 0.236 DC L1
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 1.19e-01 0.0983 0.0627 0.236 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 666722 sc-eQTL 4.73e-02 -0.155 0.0775 0.236 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 687432 sc-eQTL 5.17e-01 0.0547 0.0844 0.236 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 8.24e-01 0.0201 0.0904 0.236 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 9.41e-02 -0.0846 0.0503 0.236 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 2.72e-01 0.0646 0.0586 0.236 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0641 0.0801 0.236 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 298359 sc-eQTL 5.18e-01 0.0473 0.0729 0.236 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -894814 sc-eQTL 2.80e-01 0.0984 0.0907 0.236 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0116 0.0716 0.237 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 2.45e-01 0.0557 0.0478 0.237 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 666722 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0535 0.0821 0.237 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 687432 sc-eQTL 3.61e-02 0.185 0.0876 0.237 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0181 0.0624 0.237 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 8.40e-01 0.00755 0.0374 0.237 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 9.04e-02 0.0893 0.0525 0.237 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 2.40e-01 -0.087 0.0738 0.237 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -894814 sc-eQTL 1.66e-01 0.101 0.0724 0.237 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 5.64e-01 0.045 0.0778 0.236 NK L1
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 1.43e-01 0.105 0.0716 0.236 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 7.77e-01 0.0254 0.0895 0.236 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0193 0.037 0.236 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 7.59e-01 -0.021 0.0685 0.236 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0733 0.0908 0.237 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 6.12e-02 0.134 0.071 0.237 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 8.82e-01 0.0128 0.0866 0.237 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0421 0.0342 0.237 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 4.57e-01 0.047 0.0631 0.237 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 1.01e-01 0.154 0.0934 0.237 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 8.28e-01 0.023 0.105 0.232 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0603 0.0901 0.232 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 3.55e-01 0.0888 0.0958 0.232 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0591 0.0513 0.232 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 1.25e-01 0.141 0.0912 0.232 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0465 0.0901 0.232 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 3.05e-02 0.219 0.1 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 2.44e-02 0.131 0.0576 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0683 0.0877 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 8.96e-01 0.00701 0.0538 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 5.92e-01 0.0499 0.093 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 4.86e-01 0.0676 0.0968 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0992 0.0971 0.239 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 4.12e-02 0.143 0.0697 0.239 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 7.46e-01 0.0299 0.0921 0.239 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 9.86e-01 -0.000763 0.0444 0.239 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 3.44e-02 0.172 0.0806 0.239 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 8.43e-03 0.242 0.0911 0.239 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 5.40e-01 0.0566 0.0922 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 1.34e-01 0.0663 0.0441 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 4.41e-02 -0.173 0.0853 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 1.73e-01 0.0667 0.0488 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 5.58e-01 0.045 0.0766 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0682 0.0945 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0704 0.0979 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 5.93e-01 0.0279 0.052 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 3.93e-01 0.0817 0.0954 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 2.89e-01 0.0536 0.0505 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0534 0.0894 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 7.51e-01 0.0307 0.0965 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 6.72e-02 0.178 0.0969 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0143 0.0971 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 4.33e-01 0.0768 0.0978 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 3.89e-01 -0.039 0.0452 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 4.63e-01 0.0577 0.0784 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 3.81e-01 0.0799 0.0911 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0087 0.0774 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 1.22e-01 0.117 0.0755 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 4.15e-01 0.0573 0.0702 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 8.49e-01 -0.00871 0.0456 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 3.91e-01 0.0479 0.0558 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 7.74e-02 0.155 0.0871 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 7.58e-01 0.0257 0.0832 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 7.25e-01 0.0295 0.0838 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 1.55e-01 -0.117 0.0822 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0351 0.0427 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 5.82e-01 0.033 0.0599 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 6.61e-01 0.0435 0.0991 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 6.44e-01 0.044 0.0951 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 7.63e-01 0.0287 0.0952 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 2.07e-01 0.115 0.0911 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0316 0.0374 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 6.67e-01 0.0278 0.0644 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 5.04e-02 0.182 0.0924 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00871 0.0848 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0494 0.0792 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 6.30e-01 0.0434 0.09 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 6.99e-01 0.0187 0.0482 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 1.57e-01 0.115 0.081 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0274 0.0934 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 6.90e-01 0.0364 0.0914 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 2.87e-01 0.104 0.0971 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0434 0.084 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0275 0.0481 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0172 0.0604 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 6.58e-01 0.0427 0.0965 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0393 0.103 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 4.44e-01 0.0729 0.095 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0405 0.0944 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0291 0.046 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 1.14e-01 0.12 0.0757 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0757 0.101 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 6.29e-01 0.0448 0.0926 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0811 0.101 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 3.59e-01 0.0923 0.1 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 2.20e-01 0.0663 0.0539 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 6.59e-01 0.0392 0.0886 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 1.06e-01 0.165 0.102 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 7.51e-01 0.0301 0.0948 0.238 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 1.30e-01 0.136 0.0896 0.238 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 5.57e-01 0.0539 0.0915 0.238 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 4.29e-02 -0.0909 0.0446 0.238 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 8.06e-01 0.0156 0.0634 0.238 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 3.67e-01 0.0852 0.0943 0.238 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00993 0.108 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 9.87e-01 0.00166 0.1 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0483 0.102 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 6.98e-01 0.022 0.0567 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0682 0.0847 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 9.57e-01 0.00454 0.0837 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 3.32e-01 0.0744 0.0765 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0064 0.0959 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0162 0.038 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 2.96e-01 0.088 0.0841 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 2.62e-01 0.117 0.104 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 3.98e-01 0.0799 0.0943 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 7.93e-01 0.0251 0.0956 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0353 0.0445 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0136 0.0881 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 3.25e-01 0.0858 0.0869 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 5.84e-02 0.159 0.0836 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 5.51e-01 0.0565 0.0947 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0164 0.0514 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0963 0.0854 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 8.11e-02 0.203 0.115 0.241 PB L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 2.00e-01 -0.106 0.0826 0.241 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0711 0.101 0.241 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 5.57e-02 -0.11 0.0568 0.241 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 6.09e-02 0.174 0.0918 0.241 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 7.74e-01 0.0311 0.108 0.241 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0162 0.099 0.237 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 2.78e-01 0.0959 0.0881 0.237 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0351 0.0948 0.237 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 8.70e-01 -0.00586 0.0359 0.237 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 2.23e-01 0.0875 0.0716 0.237 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 1.62e-01 0.13 0.0924 0.237 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 4.79e-01 0.0703 0.0993 0.237 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 4.31e-02 0.189 0.0928 0.237 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 1.83e-01 0.105 0.0785 0.237 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 9.76e-01 0.00104 0.0349 0.237 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 2.49e-01 0.0847 0.0732 0.237 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 6.08e-01 0.0506 0.0984 0.237 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 7.47e-01 0.0339 0.105 0.237 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 6.24e-01 0.0404 0.0823 0.237 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 666722 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0456 0.0817 0.237 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 687432 sc-eQTL 2.77e-01 0.105 0.0958 0.237 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0375 0.0936 0.237 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0451 0.0461 0.237 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 1.83e-01 0.104 0.0775 0.237 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 9.95e-01 0.000548 0.0916 0.237 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 298359 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0267 0.0732 0.237 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -894814 sc-eQTL 7.86e-02 0.158 0.0893 0.237 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 7.42e-01 0.0268 0.0813 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 6.50e-01 0.0281 0.0617 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 666722 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0318 0.0872 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 687432 sc-eQTL 4.88e-02 0.173 0.0872 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 3.41e-01 -0.067 0.0702 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 5.18e-01 0.0253 0.039 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 1.64e-01 0.0809 0.058 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 9.74e-01 -0.0025 0.0754 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -894814 sc-eQTL 9.10e-02 0.132 0.078 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0393 0.0926 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 1.21e-02 0.167 0.0659 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 666722 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0498 0.0835 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 687432 sc-eQTL 1.10e-01 0.145 0.0902 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0124 0.0594 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 7.56e-01 0.0133 0.0428 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 4.77e-02 0.0966 0.0485 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 1.62e-02 -0.189 0.0781 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -894814 sc-eQTL 8.66e-01 0.0131 0.0774 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0793 0.124 0.252 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 1.13e-01 0.169 0.106 0.252 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 8.49e-01 0.0226 0.118 0.252 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 8.50e-01 -0.00849 0.0449 0.252 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 1.25e-01 0.13 0.0841 0.252 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0355 0.116 0.252 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0481 0.0933 0.236 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 7.79e-01 0.0251 0.0892 0.236 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 666722 sc-eQTL 1.73e-01 -0.123 0.0896 0.236 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 687432 sc-eQTL 2.17e-01 0.11 0.0887 0.236 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 5.94e-01 0.0483 0.0904 0.236 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0348 0.0393 0.236 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 6.80e-01 0.0273 0.0661 0.236 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0133 0.0959 0.236 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -894814 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0212 0.0917 0.236 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 9.63e-01 0.00455 0.099 0.233 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00289 0.0669 0.233 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 666722 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0318 0.0944 0.233 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 687432 sc-eQTL 3.45e-01 0.0886 0.0936 0.233 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 2.62e-01 0.101 0.0899 0.233 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0298 0.0452 0.233 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 8.58e-02 0.11 0.0635 0.233 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00778 0.0799 0.233 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -894814 sc-eQTL 5.20e-01 0.0544 0.0844 0.233 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0352 0.114 0.24 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 8.22e-01 0.0172 0.0762 0.24 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 666722 sc-eQTL 2.29e-02 -0.173 0.0754 0.24 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 687432 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000511 0.078 0.24 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 2.18e-01 -0.114 0.0925 0.24 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 1.15e-01 -0.101 0.0635 0.24 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0129 0.065 0.24 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 9.00e-02 -0.16 0.0939 0.24 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 298359 sc-eQTL 9.13e-01 0.00991 0.0906 0.24 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -894814 sc-eQTL 7.00e-01 -0.031 0.0803 0.24 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 3.83e-02 0.204 0.0976 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 5.94e-03 0.148 0.0533 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 3.66e-01 0.0776 0.0857 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0137 0.0489 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 1.41e-01 0.113 0.0761 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 1.46e-01 0.13 0.0894 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 9.09e-01 0.0105 0.0917 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 1.16e-01 0.0648 0.0411 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0926 0.08 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 1.23e-01 0.0748 0.0483 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 8.59e-01 0.0134 0.0751 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0337 0.0915 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0114 0.0746 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 1.05e-01 0.084 0.0516 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 666722 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0542 0.0845 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 687432 sc-eQTL 2.70e-02 0.194 0.0872 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0226 0.0583 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 5.12e-01 0.0262 0.04 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 1.39e-01 0.0805 0.0542 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0735 0.071 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -894814 sc-eQTL 3.17e-01 0.0746 0.0745 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0455 0.0953 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 7.70e-01 0.0185 0.0629 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 666722 sc-eQTL 9.44e-02 -0.154 0.0919 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 687432 sc-eQTL 3.25e-01 0.0902 0.0915 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 2.05e-01 0.11 0.0862 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 3.99e-01 -0.031 0.0366 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 1.26e-01 0.0849 0.0552 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0397 0.089 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -894814 sc-eQTL 4.34e-01 0.0631 0.0804 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -550683 sc-eQTL 4.04e-01 0.0642 0.0768 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 888289 sc-eQTL 1.29e-01 0.109 0.0719 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 638028 sc-eQTL 8.30e-01 0.0196 0.0915 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 586918 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0207 0.0373 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -916625 sc-eQTL 8.26e-01 0.017 0.0771 0.237 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 888289 eQTL 9.92e-05 0.0685 0.0175 0.0 0.0 0.255
ENSG00000112299 VNN1 687432 pQTL 0.00739 0.103 0.0385 0.0 0.0 0.263
ENSG00000146409 SLC18B1 588148 eQTL 0.0061 0.0679 0.0247 0.0 0.0 0.255

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 687432 2.77e-07 1.33e-07 5.91e-08 2.05e-07 9.94e-08 8.45e-08 1.81e-07 5.85e-08 1.44e-07 7.6e-08 1.67e-07 1.19e-07 1.79e-07 7.95e-08 5.69e-08 7.89e-08 4.45e-08 1.56e-07 7.18e-08 5.33e-08 1.22e-07 1.31e-07 1.58e-07 3.07e-08 1.72e-07 1.23e-07 1.17e-07 1.04e-07 1.26e-07 1.07e-07 1.07e-07 3.9e-08 3.21e-08 8.89e-08 2.97e-08 2.74e-08 5.51e-08 8.17e-08 6.3e-08 3.99e-08 5.71e-08 1.46e-07 4.87e-08 1.11e-08 3.29e-08 1.55e-08 8.67e-08 2.07e-09 4.69e-08
ENSG00000118515 \N -916625 2.69e-07 1.19e-07 4.48e-08 1.8e-07 9.25e-08 9.8e-08 1.49e-07 5.37e-08 1.44e-07 4.94e-08 1.6e-07 8.55e-08 1.41e-07 6.56e-08 6.02e-08 7.3e-08 3.87e-08 1.21e-07 5.82e-08 4.1e-08 1.13e-07 1.27e-07 1.34e-07 3.49e-08 1.4e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.57e-08 1.08e-07 1.07e-07 9.64e-08 3.68e-08 3.56e-08 8.55e-08 8.21e-08 3.62e-08 5.08e-08 8.93e-08 6.54e-08 4.02e-08 5.13e-08 1.35e-07 5.24e-08 1.23e-08 4.92e-08 1.84e-08 1.19e-07 1.88e-09 4.88e-08