logo

Genes within 1Mb (chr6:133394113:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0153 0.11 0.19 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 992638 sc-eQTL 3.38e-01 0.111 0.116 0.19 B L1
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 6.64e-01 -0.019 0.0437 0.19 B L1
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 7.30e-01 0.0284 0.0821 0.19 B L1
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 5.45e-01 0.0301 0.0496 0.19 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 6.13e-02 -0.143 0.076 0.19 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 5.82e-03 -0.286 0.103 0.19 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 4.35e-01 0.063 0.0806 0.19 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 9.35e-01 0.0068 0.0839 0.19 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 5.76e-01 0.0406 0.0726 0.19 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0351 0.0493 0.19 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 2.52e-01 -0.076 0.0662 0.19 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 1.43e-03 -0.315 0.0975 0.19 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 9.21e-02 0.133 0.0786 0.19 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 1.46e-01 0.12 0.0822 0.19 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 9.34e-01 0.00802 0.0965 0.19 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 5.69e-01 0.0188 0.0329 0.19 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0259 0.0508 0.19 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 2.49e-03 -0.299 0.0975 0.19 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 2.86e-01 -0.132 0.124 0.189 DC L1
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 4.59e-01 0.0571 0.077 0.189 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 659348 sc-eQTL 5.86e-01 0.0521 0.0955 0.189 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 680058 sc-eQTL 8.17e-02 -0.179 0.102 0.189 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0437 0.11 0.189 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0359 0.0618 0.189 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0466 0.0718 0.189 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0605 0.0979 0.189 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 290985 sc-eQTL 7.28e-01 -0.031 0.0891 0.189 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -902188 sc-eQTL 2.99e-01 -0.115 0.111 0.189 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0456 0.0854 0.19 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 7.14e-01 -0.021 0.0571 0.19 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 659348 sc-eQTL 7.11e-02 0.177 0.0973 0.19 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 680058 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0314 0.106 0.19 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0676 0.0743 0.19 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 2.44e-01 -0.052 0.0445 0.19 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 7.83e-01 0.0174 0.063 0.19 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 8.13e-01 0.0209 0.0883 0.19 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -902188 sc-eQTL 2.35e-01 -0.103 0.0865 0.19 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00842 0.0929 0.191 NK L1
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 1.82e-01 0.114 0.0855 0.191 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 6.41e-01 0.0499 0.107 0.191 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0189 0.0442 0.191 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0729 0.0816 0.191 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0652 0.11 0.19 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0671 0.0866 0.19 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 1.48e-01 -0.151 0.104 0.19 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 9.74e-01 0.00137 0.0416 0.19 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 2.34e-01 -0.091 0.0763 0.19 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 2.79e-01 -0.123 0.114 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0937 0.13 0.184 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 992638 sc-eQTL 9.71e-01 0.00425 0.119 0.184 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 2.48e-01 0.128 0.111 0.184 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 3.06e-01 -0.121 0.118 0.184 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 1.42e-01 0.093 0.063 0.184 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 1.03e-01 -0.184 0.112 0.184 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 7.51e-01 0.0353 0.111 0.184 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0642 0.122 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 992638 sc-eQTL 2.87e-01 0.115 0.107 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 6.19e-01 0.035 0.0703 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 1.78e-01 0.143 0.105 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 2.09e-01 0.0815 0.0646 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0697 0.112 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 1.58e-02 -0.28 0.115 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 2.68e-01 0.131 0.118 0.19 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 992638 sc-eQTL 5.47e-02 -0.209 0.108 0.19 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 7.75e-02 0.151 0.0848 0.19 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 7.51e-01 0.0355 0.112 0.19 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 9.19e-01 0.0055 0.0539 0.19 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 2.77e-01 -0.107 0.0985 0.19 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0944 0.112 0.19 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0693 0.109 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 992638 sc-eQTL 3.16e-01 0.12 0.119 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00203 0.0523 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0241 0.102 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0292 0.0579 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0403 0.0905 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 1.57e-01 -0.158 0.111 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 4.34e-01 0.0916 0.117 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 992638 sc-eQTL 1.62e-01 0.159 0.113 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00589 0.0621 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 3.77e-01 0.101 0.114 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 4.74e-01 0.0433 0.0603 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0522 0.107 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 2.08e-01 -0.145 0.115 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 2.64e-02 -0.25 0.112 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 7.95e-01 0.0292 0.112 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 5.29e-01 0.0714 0.113 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 8.83e-01 -0.00773 0.0523 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0528 0.0906 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0712 0.105 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 8.26e-01 0.0204 0.0924 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 1.40e-01 -0.133 0.0902 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 5.18e-01 0.0544 0.0839 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0417 0.0544 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 4.25e-02 -0.135 0.0661 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 1.31e-03 -0.333 0.102 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 1.21e-01 0.155 0.0996 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 5.20e-02 0.195 0.1 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 9.64e-01 0.00445 0.0994 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 9.51e-01 0.00314 0.0515 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00711 0.0721 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 1.37e-01 -0.177 0.119 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 2.72e-01 0.128 0.116 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 9.16e-01 0.0123 0.117 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 8.46e-01 0.0218 0.112 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0216 0.0459 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0167 0.0789 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0445 0.114 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 2.81e-01 0.109 0.101 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 8.87e-03 0.245 0.0927 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 7.65e-01 -0.032 0.107 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0458 0.0572 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0474 0.0967 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 1.87e-01 -0.146 0.111 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00506 0.107 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 6.11e-01 0.0581 0.114 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 6.04e-01 0.0511 0.0984 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 6.07e-01 -0.029 0.0563 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0199 0.0707 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 2.59e-02 -0.251 0.112 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0823 0.12 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 2.53e-01 0.127 0.111 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0205 0.11 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 7.70e-01 0.0158 0.0537 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 6.32e-02 -0.165 0.0882 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 6.97e-01 0.046 0.118 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0207 0.111 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 4.72e-01 -0.087 0.121 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00394 0.12 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0702 0.0645 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 3.69e-01 0.0954 0.106 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 1.93e-01 -0.159 0.122 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 4.84e-02 -0.224 0.113 0.19 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0988 0.108 0.19 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 1.48e-01 -0.159 0.109 0.19 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 1.62e-01 0.0755 0.0538 0.19 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0977 0.0758 0.19 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0375 0.113 0.19 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 6.52e-01 0.0554 0.123 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 3.17e-01 0.114 0.114 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0196 0.116 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0739 0.0642 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 7.73e-01 0.0278 0.0963 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0969 0.0997 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 5.17e-01 0.0593 0.0914 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 5.39e-01 0.0703 0.114 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0389 0.0453 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 3.11e-01 -0.102 0.1 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 9.35e-01 0.0102 0.125 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 9.92e-01 0.00111 0.114 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0968 0.115 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 6.32e-01 0.0257 0.0536 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0474 0.106 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 3.79e-01 0.0895 0.101 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 6.43e-01 0.0456 0.0984 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 3.81e-01 0.097 0.11 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0392 0.06 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 5.44e-02 -0.192 0.0991 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 4.51e-02 -0.297 0.146 0.193 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 992638 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0336 0.127 0.193 PB L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 2.36e-02 0.238 0.104 0.193 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 2.17e-01 0.16 0.129 0.193 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 2.88e-01 0.0782 0.0733 0.193 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 2.52e-02 -0.264 0.116 0.193 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 1.57e-01 0.195 0.137 0.193 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 6.97e-01 -0.045 0.115 0.189 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 8.39e-01 0.021 0.103 0.189 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0717 0.11 0.189 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0427 0.0417 0.189 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 7.49e-01 0.0269 0.0838 0.189 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 4.38e-01 0.0839 0.108 0.189 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 2.97e-01 0.123 0.118 0.19 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 2.39e-01 -0.131 0.111 0.19 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0687 0.0937 0.19 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 8.29e-01 0.00897 0.0415 0.19 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 4.34e-01 0.0685 0.0873 0.19 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 4.48e-04 -0.406 0.114 0.19 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 1.13e-01 -0.202 0.127 0.183 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 3.18e-01 0.1 0.0999 0.183 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 659348 sc-eQTL 1.85e-01 0.132 0.099 0.183 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 680058 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0652 0.117 0.183 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 6.91e-01 0.0454 0.114 0.183 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0124 0.0563 0.183 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 8.52e-02 -0.163 0.0941 0.183 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0331 0.111 0.183 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 290985 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0401 0.0891 0.183 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -902188 sc-eQTL 6.61e-02 -0.201 0.109 0.183 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0635 0.0965 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 8.11e-01 0.0175 0.0733 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 659348 sc-eQTL 4.40e-01 0.08 0.103 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 680058 sc-eQTL 7.51e-01 0.0332 0.104 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0294 0.0835 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0611 0.0462 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0156 0.0692 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0287 0.0895 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -902188 sc-eQTL 1.75e-01 -0.126 0.0928 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0467 0.11 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0458 0.0798 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 659348 sc-eQTL 2.13e-02 0.228 0.0985 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 680058 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0336 0.108 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0594 0.0708 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 1.11e-01 -0.0812 0.0508 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0504 0.0583 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 8.34e-01 0.0199 0.0945 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -902188 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0928 0.0922 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 4.19e-01 -0.12 0.148 0.188 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 4.08e-01 -0.106 0.128 0.188 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 1.46e-01 -0.205 0.14 0.188 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 2.91e-02 -0.117 0.053 0.188 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0314 0.102 0.188 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 2.26e-01 -0.169 0.139 0.188 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 6.72e-01 0.0484 0.114 0.187 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 4.40e-02 0.219 0.108 0.187 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 659348 sc-eQTL 1.45e-03 0.347 0.107 0.187 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 680058 sc-eQTL 9.19e-01 0.0111 0.109 0.187 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0332 0.111 0.187 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0492 0.048 0.187 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 4.99e-01 0.0546 0.0808 0.187 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 1.75e-02 -0.277 0.116 0.187 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -902188 sc-eQTL 9.63e-01 0.00526 0.112 0.187 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 4.99e-01 0.082 0.121 0.183 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0595 0.0817 0.183 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 659348 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0289 0.115 0.183 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 680058 sc-eQTL 1.23e-01 -0.177 0.114 0.183 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 2.72e-01 -0.121 0.11 0.183 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 4.75e-01 0.0395 0.0552 0.183 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0341 0.0782 0.183 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 1.74e-02 0.231 0.0963 0.183 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -902188 sc-eQTL 3.21e-01 -0.102 0.103 0.183 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 9.89e-01 0.00201 0.143 0.186 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 2.01e-01 0.122 0.0949 0.186 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 659348 sc-eQTL 6.62e-01 -0.042 0.096 0.186 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 680058 sc-eQTL 2.02e-02 -0.225 0.096 0.186 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0186 0.116 0.186 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 8.56e-02 -0.137 0.0794 0.186 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0145 0.0814 0.186 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0741 0.118 0.186 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 290985 sc-eQTL 4.25e-01 0.0906 0.113 0.186 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -902188 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0639 0.101 0.186 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 9.28e-01 0.0108 0.119 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 992638 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0118 0.116 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 9.16e-02 0.111 0.0652 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 4.60e-01 0.0768 0.104 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 8.25e-01 0.0131 0.0592 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 1.81e-01 -0.124 0.0921 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 1.08e-02 -0.275 0.107 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0496 0.109 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 992638 sc-eQTL 8.10e-02 0.207 0.118 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 8.22e-01 -0.011 0.0489 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 6.96e-01 0.0372 0.0949 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 9.90e-01 0.000732 0.0575 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0628 0.0888 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 3.21e-02 -0.231 0.107 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 3.98e-01 -0.075 0.0885 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0251 0.0616 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 659348 sc-eQTL 1.55e-01 0.143 0.1 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 680058 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00828 0.105 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0582 0.0692 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 1.05e-01 -0.0769 0.0472 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0139 0.0647 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0187 0.0845 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -902188 sc-eQTL 2.29e-01 -0.107 0.0884 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 3.82e-01 0.0998 0.114 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 4.60e-01 0.0558 0.0753 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 659348 sc-eQTL 2.14e-02 0.254 0.109 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 680058 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0908 0.11 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0951 0.103 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 8.72e-01 0.00707 0.0439 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 9.89e-01 0.000937 0.0665 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 sc-eQTL 2.68e-01 -0.118 0.106 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -902188 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0669 0.0964 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -558057 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0195 0.092 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 880915 sc-eQTL 2.36e-01 0.102 0.0861 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 630654 sc-eQTL 3.85e-01 0.095 0.109 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 579544 sc-eQTL 6.38e-01 -0.021 0.0446 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -923999 sc-eQTL 7.65e-02 -0.163 0.0915 0.192 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 659348 eQTL 0.000483 -0.0643 0.0184 0.0 0.0 0.189
ENSG00000112299 VNN1 680058 pQTL 0.00448 0.129 0.0452 0.0 0.0 0.188
ENSG00000112299 VNN1 680058 eQTL 0.0116 0.0693 0.0274 0.0 0.0 0.189
ENSG00000112303 VNN2 630654 pQTL 0.00435 -0.093 0.0326 0.0 0.0 0.188
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 eQTL 0.000381 -0.1 0.028 0.0 0.0 0.189
ENSG00000234484 AL032821.1 641438 eQTL 0.0283 0.0863 0.0393 0.0 0.0 0.189

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 SLC18B1 580774 2.66e-07 1.25e-07 4.98e-08 2.05e-07 9.91e-08 9.61e-08 1.44e-07 5.24e-08 1.41e-07 4.24e-08 1.59e-07 8.02e-08 1.41e-07 6.76e-08 5.44e-08 7.89e-08 4.48e-08 1.14e-07 5.19e-08 3.29e-08 1.05e-07 1.28e-07 1.3e-07 4.54e-08 1.37e-07 1.13e-07 1.12e-07 8.71e-08 1.03e-07 1.03e-07 9.58e-08 3.59e-08 2.74e-08 8.65e-08 8.96e-08 3.97e-08 5.54e-08 8.91e-08 8.3e-08 3.37e-08 3.46e-08 1.35e-07 3.82e-08 1.58e-08 9.88e-08 1.67e-08 1.37e-07 4.7e-09 4.61e-08