logo

Genes within 1Mb (chr6:133392076:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 3.28e-01 0.103 0.105 0.179 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 990601 sc-eQTL 9.44e-01 0.00784 0.111 0.179 B L1
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 1.26e-01 0.064 0.0416 0.179 B L1
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 7.12e-01 -0.029 0.0786 0.179 B L1
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 8.61e-01 0.00836 0.0475 0.179 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 5.32e-01 0.0459 0.0732 0.179 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 4.62e-01 0.0737 0.0999 0.179 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 1.45e-01 0.112 0.0766 0.179 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 8.37e-02 0.138 0.0795 0.179 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 3.86e-01 0.0601 0.0692 0.179 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0116 0.0472 0.179 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00446 0.0634 0.179 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 2.86e-01 0.102 0.0951 0.179 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00325 0.0765 0.179 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 5.60e-01 0.0466 0.0798 0.179 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0104 0.0932 0.179 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0246 0.0318 0.179 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 5.54e-01 0.029 0.049 0.179 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 2.27e-01 0.116 0.0959 0.179 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 8.68e-01 0.0194 0.117 0.18 DC L1
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 1.11e-01 0.115 0.072 0.18 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 657311 sc-eQTL 3.98e-02 -0.184 0.0889 0.18 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 678021 sc-eQTL 9.68e-01 0.00393 0.097 0.18 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 6.83e-01 0.0425 0.104 0.18 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 5.36e-02 -0.112 0.0577 0.18 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 2.60e-01 0.076 0.0673 0.18 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 2.41e-01 -0.108 0.0918 0.18 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 288948 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0157 0.0838 0.18 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -904225 sc-eQTL 1.09e-01 0.167 0.104 0.18 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0412 0.0823 0.179 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 2.60e-01 0.062 0.0549 0.179 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 657311 sc-eQTL 6.12e-01 -0.048 0.0945 0.179 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 678021 sc-eQTL 1.86e-01 0.135 0.101 0.179 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0264 0.0718 0.179 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 8.88e-01 0.00609 0.043 0.179 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 2.83e-01 0.0652 0.0606 0.179 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0593 0.085 0.179 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -904225 sc-eQTL 1.64e-01 0.116 0.0833 0.179 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 2.22e-01 0.109 0.0889 0.178 NK L1
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 3.07e-01 0.0843 0.0823 0.178 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0425 0.103 0.178 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0342 0.0424 0.178 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 2.79e-01 -0.085 0.0784 0.178 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 2.26e-01 -0.125 0.103 0.179 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 4.40e-01 0.0629 0.0814 0.179 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 6.10e-01 0.0503 0.0985 0.179 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0376 0.039 0.179 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 5.96e-01 0.0382 0.0719 0.179 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 2.06e-01 0.135 0.107 0.179 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 6.77e-01 0.0509 0.122 0.176 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 990601 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0427 0.111 0.176 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 1.47e-01 -0.151 0.104 0.176 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0239 0.111 0.176 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 1.01e-01 -0.0973 0.059 0.176 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 1.50e-01 0.152 0.105 0.176 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0178 0.104 0.176 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 1.50e-02 0.281 0.114 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 990601 sc-eQTL 7.08e-01 0.0382 0.102 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 6.04e-02 0.125 0.0661 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 9.30e-01 0.00889 0.1 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00168 0.0615 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 6.01e-01 0.0557 0.106 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 9.69e-01 0.00431 0.111 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0395 0.111 0.181 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 990601 sc-eQTL 3.29e-01 -0.1 0.103 0.181 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 1.25e-01 0.124 0.0802 0.181 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00745 0.105 0.181 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0119 0.0508 0.181 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 6.72e-02 0.17 0.0924 0.181 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 1.32e-02 0.261 0.104 0.181 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 4.85e-01 0.0735 0.105 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 990601 sc-eQTL 7.95e-01 -0.03 0.116 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 8.17e-02 0.0877 0.0502 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 1.11e-01 -0.156 0.0975 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 2.98e-01 0.0581 0.0557 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 9.74e-01 0.0029 0.0874 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 1.80e-01 -0.144 0.107 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 1.68e-01 -0.155 0.112 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 990601 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0242 0.109 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 9.01e-01 0.00743 0.0596 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 9.76e-01 0.00334 0.109 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 4.93e-01 0.0398 0.0579 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000104 0.102 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 5.57e-01 0.065 0.111 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 1.75e-01 0.151 0.111 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0441 0.111 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 1.64e-01 0.155 0.111 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 7.60e-02 -0.0914 0.0512 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 1.54e-01 0.127 0.0891 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0183 0.104 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 6.63e-01 0.0387 0.0885 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 2.67e-02 0.192 0.0858 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 6.11e-01 0.0409 0.0804 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 9.68e-01 0.00211 0.0522 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 5.50e-01 0.0383 0.0639 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 4.60e-02 0.2 0.0995 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 7.54e-01 0.0298 0.0951 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 9.24e-01 0.00914 0.0958 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0646 0.0943 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0487 0.0488 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 7.48e-01 0.022 0.0685 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0612 0.113 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 3.79e-01 0.0965 0.109 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 8.80e-01 0.0166 0.11 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 1.94e-01 0.137 0.105 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0292 0.0431 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 5.00e-01 0.05 0.0741 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 1.73e-01 0.146 0.107 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0896 0.0972 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0217 0.091 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 8.09e-01 -0.025 0.103 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 7.57e-01 0.0171 0.0553 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 4.49e-02 0.187 0.0926 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 7.13e-01 0.0395 0.107 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 5.56e-01 0.0619 0.105 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 3.68e-01 0.101 0.112 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 6.05e-01 0.0501 0.0967 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0189 0.0554 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 7.84e-01 0.019 0.0695 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0335 0.111 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0762 0.119 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 5.52e-01 0.0657 0.11 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0438 0.11 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 8.70e-01 -0.00876 0.0534 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 8.56e-02 0.152 0.0878 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0491 0.117 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 4.63e-01 0.0771 0.105 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0827 0.114 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 2.91e-01 0.12 0.114 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 4.03e-01 0.0512 0.0612 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 6.64e-01 0.0437 0.1 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 1.66e-01 0.16 0.115 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000946 0.11 0.18 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00365 0.104 0.18 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 4.46e-01 0.0808 0.106 0.18 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 8.65e-02 -0.0891 0.0517 0.18 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0132 0.0733 0.18 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 8.17e-01 0.0253 0.109 0.18 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 4.07e-01 0.103 0.124 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 8.17e-01 0.0265 0.115 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0918 0.116 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0442 0.0649 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 2.04e-01 -0.123 0.0967 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 5.75e-01 0.0534 0.0952 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 3.87e-01 0.0754 0.0871 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0348 0.109 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0366 0.0432 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 9.09e-01 -0.011 0.0959 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 5.30e-01 0.0745 0.119 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 7.04e-01 0.0411 0.108 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00108 0.109 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0541 0.0508 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0532 0.101 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 7.91e-02 0.176 0.0999 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 3.35e-01 0.0939 0.0972 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 9.81e-01 0.00255 0.11 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0363 0.0594 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 8.94e-02 -0.168 0.0982 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 1.75e-01 0.178 0.13 0.193 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 990601 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0442 0.112 0.193 PB L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0895 0.0933 0.193 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0455 0.114 0.193 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 8.99e-03 -0.168 0.063 0.193 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 3.04e-02 0.225 0.103 0.193 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 5.81e-01 0.0673 0.122 0.193 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0488 0.114 0.18 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 5.05e-01 0.0679 0.102 0.18 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 1.58e-01 -0.154 0.109 0.18 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0388 0.0412 0.18 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 1.45e-01 0.121 0.0824 0.18 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 3.54e-01 0.099 0.107 0.18 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 5.18e-01 0.0728 0.113 0.179 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 4.29e-02 0.214 0.105 0.179 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 4.77e-01 0.0636 0.0893 0.179 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 5.66e-01 0.0227 0.0395 0.179 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 6.50e-01 0.0379 0.0832 0.179 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0414 0.112 0.179 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0219 0.121 0.18 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 8.04e-01 0.0235 0.0949 0.18 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 657311 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0779 0.0941 0.18 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 678021 sc-eQTL 7.15e-01 0.0405 0.111 0.18 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0498 0.108 0.18 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0741 0.053 0.18 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 2.52e-01 0.103 0.0895 0.18 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0557 0.105 0.18 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 288948 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0924 0.0841 0.18 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -904225 sc-eQTL 5.55e-02 0.198 0.103 0.18 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 6.90e-01 0.0373 0.0934 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 9.05e-01 0.00843 0.0709 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 657311 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0403 0.1 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 678021 sc-eQTL 1.27e-01 0.154 0.101 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0855 0.0806 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 6.20e-01 0.0223 0.0449 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 4.09e-01 0.0553 0.0669 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 7.17e-01 0.0314 0.0866 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -904225 sc-eQTL 9.49e-02 0.15 0.0896 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0377 0.106 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 2.34e-02 0.173 0.0759 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 657311 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0305 0.0959 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 678021 sc-eQTL 4.30e-01 0.0823 0.104 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0142 0.0682 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 8.47e-01 0.00948 0.0491 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 1.45e-01 0.0819 0.0559 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 1.57e-02 -0.218 0.0897 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -904225 sc-eQTL 4.44e-01 0.0681 0.0888 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0618 0.145 0.194 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 2.60e-01 0.141 0.125 0.194 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 2.38e-01 0.163 0.138 0.194 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0386 0.0526 0.194 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 1.98e-01 0.128 0.099 0.194 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0173 0.136 0.194 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0814 0.108 0.178 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 6.28e-01 0.0503 0.104 0.178 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 657311 sc-eQTL 1.28e-01 -0.159 0.104 0.178 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 678021 sc-eQTL 3.47e-01 0.0973 0.103 0.178 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 5.91e-01 0.0565 0.105 0.178 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0526 0.0456 0.178 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 3.42e-01 0.0731 0.0767 0.178 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 9.85e-01 0.00208 0.111 0.178 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -904225 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0145 0.107 0.178 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0829 0.115 0.176 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00547 0.0776 0.176 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 657311 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0876 0.109 0.176 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 678021 sc-eQTL 2.43e-01 0.127 0.108 0.176 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 4.46e-01 0.0797 0.104 0.176 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 4.93e-01 -0.036 0.0524 0.176 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 3.33e-01 0.0718 0.074 0.176 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0366 0.0926 0.176 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -904225 sc-eQTL 9.65e-01 0.00433 0.0979 0.176 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0643 0.132 0.181 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 5.14e-01 0.0574 0.0876 0.181 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 657311 sc-eQTL 2.47e-02 -0.197 0.0869 0.181 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 678021 sc-eQTL 8.68e-01 -0.015 0.0899 0.181 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 2.56e-01 -0.122 0.107 0.181 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0958 0.0733 0.181 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0584 0.0748 0.181 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 1.65e-01 -0.151 0.108 0.181 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 288948 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0604 0.104 0.181 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -904225 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0673 0.0924 0.181 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 2.08e-02 0.26 0.112 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 990601 sc-eQTL 2.80e-01 -0.119 0.11 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 6.23e-02 0.116 0.0617 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 4.34e-01 0.077 0.0983 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0162 0.0561 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 1.83e-01 0.117 0.0873 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 4.03e-01 0.0861 0.103 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0344 0.105 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 990601 sc-eQTL 6.47e-01 -0.053 0.116 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 1.15e-01 0.0747 0.0472 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 1.60e-01 -0.129 0.0917 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 2.94e-01 0.0585 0.0556 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 9.55e-01 0.00482 0.0863 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0547 0.105 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00271 0.0854 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 1.85e-01 0.0787 0.0592 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 657311 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0503 0.0968 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 678021 sc-eQTL 1.54e-01 0.144 0.101 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0335 0.0667 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 6.06e-01 0.0236 0.0458 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 3.32e-01 0.0605 0.0623 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0612 0.0814 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -904225 sc-eQTL 2.15e-01 0.106 0.0851 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 3.05e-01 -0.113 0.11 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 7.49e-01 0.0233 0.0728 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 657311 sc-eQTL 4.04e-02 -0.219 0.106 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 678021 sc-eQTL 3.21e-01 0.105 0.106 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 3.56e-01 0.0924 0.0999 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0419 0.0424 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 3.72e-01 0.0574 0.0642 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 578737 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0805 0.103 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -904225 sc-eQTL 8.65e-01 0.0159 0.0932 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -560094 sc-eQTL 1.09e-01 0.141 0.0877 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 878878 sc-eQTL 3.03e-01 0.0854 0.0827 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 628617 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0478 0.105 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 577507 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0404 0.0427 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -926036 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0574 0.0884 0.179 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 878878 eQTL 0.000396 0.0685 0.0193 0.0 0.0 0.207
ENSG00000112299 VNN1 678021 pQTL 0.00628 0.117 0.0428 0.0 0.0 0.211

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 678021 1.26e-06 9.23e-07 1.76e-07 5.92e-07 1.09e-07 3.32e-07 7.02e-07 1.91e-07 7.08e-07 2.87e-07 1.13e-06 6.07e-07 1.21e-06 2.57e-07 4.15e-07 2.89e-07 5.41e-07 4.39e-07 3.06e-07 3.96e-07 2.52e-07 5.37e-07 4.01e-07 2.89e-07 1.47e-06 2.6e-07 4.83e-07 4.92e-07 4.63e-07 7.71e-07 4.47e-07 6.37e-08 5.71e-08 1.79e-07 4.66e-07 2.15e-07 2.9e-07 1.02e-07 6.33e-08 1.82e-08 9.91e-08 8.45e-07 6.24e-08 1.28e-08 1.33e-07 3.92e-08 1.27e-07 2.48e-08 5.43e-08