logo

Genes within 1Mb (chr6:133387608:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 4.19e-01 0.0746 0.0922 0.263 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 986133 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00973 0.0975 0.263 B L1
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 1.26e-02 0.0913 0.0363 0.263 B L1
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 8.02e-01 0.0174 0.0692 0.263 B L1
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0233 0.0418 0.263 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0166 0.0645 0.263 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 1.69e-01 0.121 0.0876 0.263 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 1.37e-01 0.101 0.0674 0.263 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 4.64e-02 0.14 0.0698 0.263 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 3.40e-01 0.0582 0.0609 0.263 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0278 0.0414 0.263 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 7.13e-01 0.0205 0.0557 0.263 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 1.29e-01 0.127 0.0834 0.263 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 8.05e-01 0.0164 0.0664 0.263 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 5.45e-01 0.042 0.0693 0.263 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 8.29e-01 0.0175 0.0809 0.263 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0285 0.0276 0.263 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 5.94e-01 0.0227 0.0426 0.263 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 2.20e-01 0.103 0.0834 0.263 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 3.29e-01 0.0989 0.101 0.264 DC L1
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 3.24e-01 0.0621 0.0628 0.264 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 652843 sc-eQTL 1.14e-01 -0.123 0.0776 0.264 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 673553 sc-eQTL 2.53e-01 0.0964 0.084 0.264 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 5.13e-01 0.059 0.0901 0.264 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 2.47e-02 -0.113 0.0499 0.264 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 6.28e-01 0.0285 0.0587 0.264 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0296 0.08 0.264 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 284480 sc-eQTL 4.80e-01 0.0515 0.0728 0.264 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -908693 sc-eQTL 5.47e-01 0.0547 0.0907 0.264 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0166 0.0721 0.263 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 3.45e-01 0.0455 0.0481 0.263 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 652843 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0639 0.0826 0.263 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 673553 sc-eQTL 1.89e-02 0.208 0.0879 0.263 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 8.85e-01 0.00913 0.0628 0.263 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0103 0.0377 0.263 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 2.49e-01 0.0612 0.053 0.263 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0532 0.0744 0.263 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -908693 sc-eQTL 5.23e-01 0.0468 0.0731 0.263 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 3.63e-01 0.0709 0.0777 0.262 NK L1
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 5.05e-02 0.14 0.0714 0.262 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 6.80e-01 0.037 0.0896 0.262 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0383 0.037 0.262 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0684 0.0684 0.262 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0884 0.0905 0.263 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 1.67e-02 0.17 0.0704 0.263 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 4.85e-01 0.0604 0.0863 0.263 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 5.28e-02 -0.0661 0.0339 0.263 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 6.63e-01 0.0275 0.063 0.263 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 1.59e-01 0.132 0.0933 0.263 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 8.69e-01 0.0174 0.106 0.26 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 986133 sc-eQTL 6.92e-01 0.0383 0.0966 0.26 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0891 0.0903 0.26 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 4.57e-01 0.0717 0.0963 0.26 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 1.51e-01 -0.074 0.0514 0.26 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 3.31e-01 0.0896 0.0919 0.26 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00133 0.0905 0.26 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 1.07e-02 0.259 0.101 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 986133 sc-eQTL 5.25e-01 0.0571 0.0897 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 1.39e-02 0.144 0.0579 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0282 0.0884 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0432 0.0541 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 8.00e-01 0.0237 0.0936 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 3.30e-01 0.0951 0.0974 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 8.59e-02 -0.168 0.0973 0.265 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 986133 sc-eQTL 9.64e-01 0.00409 0.0904 0.265 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 4.37e-02 0.143 0.0702 0.265 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 9.03e-01 0.0113 0.0927 0.265 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0396 0.0446 0.265 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 1.43e-01 0.12 0.0815 0.265 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 1.20e-02 0.233 0.0918 0.265 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 7.39e-01 0.0309 0.0926 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 986133 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0248 0.102 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 2.85e-02 0.0971 0.044 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 1.67e-01 -0.119 0.0861 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 6.48e-01 0.0225 0.0492 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 7.90e-01 0.0205 0.077 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0088 0.095 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 2.33e-01 -0.118 0.0982 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 986133 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0691 0.0959 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 4.23e-01 0.0419 0.0523 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 2.75e-01 0.105 0.0958 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 6.93e-01 0.0201 0.0508 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0082 0.0899 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 6.89e-01 0.0389 0.097 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 8.38e-02 0.169 0.0971 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0224 0.0971 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 1.19e-01 0.153 0.0974 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0311 0.0452 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 2.15e-01 0.0973 0.0782 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 2.87e-01 0.0971 0.091 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0276 0.0776 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 4.12e-02 0.155 0.0754 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 4.81e-01 0.0497 0.0705 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0126 0.0458 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 3.37e-01 0.0538 0.0559 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 1.19e-01 0.137 0.0876 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 3.36e-01 0.0805 0.0834 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 6.12e-01 0.0427 0.0842 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0872 0.0828 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0593 0.0428 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 7.89e-01 0.0161 0.0602 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 3.07e-01 0.102 0.0994 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 5.25e-01 0.0611 0.0959 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 9.46e-01 0.00658 0.0961 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 2.22e-01 0.113 0.0919 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0452 0.0377 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 8.61e-01 0.0114 0.065 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 7.67e-02 0.166 0.0933 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0169 0.0851 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0405 0.0795 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 5.18e-01 0.0584 0.0903 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 6.05e-01 0.0251 0.0484 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 2.97e-01 0.0853 0.0815 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 9.51e-01 0.00574 0.0938 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 4.76e-01 0.0653 0.0916 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 2.83e-01 0.105 0.0974 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0757 0.0841 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0488 0.0481 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 7.43e-01 0.0199 0.0606 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 5.89e-01 0.0524 0.0968 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0806 0.102 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 4.94e-01 0.065 0.0949 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0134 0.0943 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0516 0.0458 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 6.24e-02 0.141 0.0754 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0566 0.101 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 5.49e-01 0.0555 0.0926 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00484 0.101 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 1.69e-01 0.138 0.1 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 1.39e-01 0.0799 0.0538 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 8.85e-01 0.0128 0.0887 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 2.55e-01 0.117 0.102 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 8.32e-01 0.0202 0.0951 0.262 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 1.14e-01 0.143 0.0899 0.262 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 4.31e-01 0.0724 0.0918 0.262 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 1.77e-02 -0.107 0.0446 0.262 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0166 0.0636 0.262 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 4.73e-01 0.068 0.0947 0.262 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0856 0.107 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 5.23e-01 0.0636 0.0994 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00859 0.101 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0203 0.0563 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0757 0.084 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 3.74e-01 0.0745 0.0836 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 1.74e-01 0.104 0.0764 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 9.99e-01 0.00015 0.0959 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0218 0.038 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 6.66e-01 0.0365 0.0843 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 3.36e-01 0.1 0.104 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 5.15e-01 0.0619 0.0949 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 6.84e-01 0.0392 0.0961 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0377 0.0447 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 7.66e-01 0.0263 0.0885 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 5.06e-01 0.058 0.087 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 2.31e-02 0.191 0.0833 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 6.56e-01 0.0424 0.0948 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0189 0.0515 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 1.44e-01 -0.125 0.0852 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 2.05e-01 0.148 0.116 0.27 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 986133 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0193 0.0999 0.27 PB L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 6.83e-02 -0.151 0.0822 0.27 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0704 0.102 0.27 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 3.46e-02 -0.121 0.0567 0.27 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 1.78e-01 0.126 0.0927 0.27 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 8.71e-01 0.0177 0.108 0.27 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0158 0.0989 0.263 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 4.81e-01 0.0623 0.0882 0.263 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0405 0.0947 0.263 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0181 0.0358 0.263 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 4.40e-01 0.0556 0.0718 0.263 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 2.02e-01 0.118 0.0924 0.263 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 3.82e-01 0.0876 0.1 0.263 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 2.12e-02 0.217 0.0933 0.263 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 1.40e-01 0.117 0.079 0.263 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0147 0.0351 0.263 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 4.31e-01 0.0584 0.0739 0.263 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0141 0.0993 0.263 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 5.99e-01 0.0546 0.104 0.263 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00954 0.0815 0.263 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 652843 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0338 0.0809 0.263 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 673553 sc-eQTL 1.26e-01 0.145 0.0945 0.263 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0115 0.0927 0.263 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 5.55e-02 -0.0873 0.0453 0.263 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 4.31e-01 0.0608 0.077 0.263 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 6.44e-01 0.0419 0.0906 0.263 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 284480 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00271 0.0725 0.263 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -908693 sc-eQTL 2.15e-01 0.111 0.0888 0.263 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 9.06e-01 0.00962 0.0818 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 7.40e-01 0.0206 0.062 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 652843 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0257 0.0877 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 673553 sc-eQTL 4.26e-02 0.179 0.0876 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0147 0.0707 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 9.27e-01 0.00362 0.0393 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 5.54e-01 0.0347 0.0585 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 7.37e-01 0.0255 0.0758 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -908693 sc-eQTL 5.19e-01 0.051 0.0788 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 9.81e-01 0.00228 0.0936 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 3.12e-02 0.145 0.0669 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 652843 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0523 0.0844 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 673553 sc-eQTL 2.71e-02 0.202 0.0906 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 8.66e-01 0.0102 0.06 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00161 0.0432 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 1.68e-01 0.0681 0.0492 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 7.75e-02 -0.141 0.0794 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -908693 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0235 0.0783 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0446 0.125 0.267 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 1.31e-02 0.265 0.105 0.267 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 8.76e-01 0.0187 0.119 0.267 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0275 0.0453 0.267 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 8.76e-02 0.146 0.0848 0.267 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00212 0.117 0.267 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0452 0.0942 0.262 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00843 0.09 0.262 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 652843 sc-eQTL 1.57e-01 -0.128 0.0904 0.262 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 673553 sc-eQTL 2.77e-01 0.0977 0.0896 0.262 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 2.90e-01 0.0967 0.0911 0.262 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 1.27e-01 -0.0605 0.0395 0.262 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0276 0.0667 0.262 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 6.52e-01 0.0436 0.0967 0.262 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -908693 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0339 0.0925 0.262 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 9.68e-01 0.00404 0.0996 0.26 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0116 0.0673 0.26 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 652843 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0828 0.0948 0.26 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 673553 sc-eQTL 6.39e-02 0.174 0.0935 0.26 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 1.61e-01 0.127 0.0902 0.26 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0292 0.0454 0.26 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 1.66e-01 0.089 0.064 0.26 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 1.83e-01 -0.107 0.08 0.26 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -908693 sc-eQTL 6.98e-01 0.033 0.0849 0.26 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0481 0.115 0.26 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 8.17e-01 0.0178 0.0766 0.26 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 652843 sc-eQTL 3.65e-02 -0.16 0.0761 0.26 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 673553 sc-eQTL 2.69e-01 0.0868 0.0782 0.26 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0489 0.0934 0.26 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 7.28e-02 -0.115 0.0637 0.26 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0322 0.0654 0.26 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 1.09e-01 -0.152 0.0945 0.26 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 284480 sc-eQTL 9.11e-01 0.0102 0.0912 0.26 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -908693 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0394 0.0808 0.26 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 6.53e-02 0.182 0.0984 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 986133 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00934 0.0964 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 7.72e-03 0.144 0.0537 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 5.06e-01 0.0575 0.0863 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0431 0.0491 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 2.47e-01 0.0891 0.0767 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 5.56e-02 0.172 0.0896 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0252 0.0923 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 986133 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0725 0.101 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 3.73e-02 0.0863 0.0412 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 6.57e-01 -0.036 0.0807 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 5.23e-01 0.0313 0.0488 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00599 0.0757 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 8.42e-01 0.0184 0.0922 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0144 0.0749 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 1.69e-01 0.0715 0.0518 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 652843 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0575 0.0848 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 673553 sc-eQTL 1.66e-02 0.211 0.0873 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 9.50e-01 0.0037 0.0585 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 9.03e-01 0.00489 0.0401 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 4.22e-01 0.0439 0.0546 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 5.85e-01 -0.039 0.0714 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -908693 sc-eQTL 8.71e-01 0.0122 0.0749 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0458 0.0963 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0189 0.0636 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 652843 sc-eQTL 2.18e-02 -0.214 0.0924 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 673553 sc-eQTL 1.23e-01 0.143 0.0922 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 5.67e-02 0.166 0.0866 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 3.46e-01 -0.035 0.037 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 3.88e-01 0.0484 0.056 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0518 0.09 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -908693 sc-eQTL 6.71e-01 0.0347 0.0814 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -564562 sc-eQTL 1.63e-01 0.107 0.0766 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 874410 sc-eQTL 4.54e-02 0.144 0.0716 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 624149 sc-eQTL 7.49e-01 0.0293 0.0915 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 573039 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0357 0.0373 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -930504 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0277 0.0772 0.263 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 874410 eQTL 9.32e-06 0.0756 0.017 0.0 0.0 0.282
ENSG00000093134 VNN3 652843 eQTL 0.033 0.0336 0.0157 0.0 0.0 0.282
ENSG00000112299 VNN1 673553 pQTL 0.00121 0.123 0.0379 0.0 0.0 0.29
ENSG00000146409 SLC18B1 574269 eQTL 0.0257 0.0536 0.024 0.0 0.0 0.282

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118515 \N -930504 2.74e-07 1.25e-07 4.48e-08 1.84e-07 9.25e-08 9.76e-08 1.49e-07 5.43e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.57e-07 8.68e-08 1.45e-07 6.76e-08 6.02e-08 7.36e-08 4.17e-08 1.27e-07 5.82e-08 4.04e-08 1.19e-07 1.27e-07 1.39e-07 3.23e-08 1.46e-07 1.21e-07 1.07e-07 9.65e-08 1.09e-07 1.03e-07 9.7e-08 3.65e-08 3.56e-08 8.34e-08 7.66e-08 3.62e-08 5.08e-08 9.23e-08 6.54e-08 3.77e-08 3.82e-08 1.35e-07 5.21e-08 1.58e-08 5.43e-08 1.99e-08 1.22e-07 3.8e-09 4.88e-08