logo

Genes within 1Mb (chr6:133380191:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 9.06e-01 0.0132 0.112 0.197 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 978716 sc-eQTL 7.42e-01 0.0389 0.118 0.197 B L1
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 7.68e-01 0.0131 0.0445 0.197 B L1
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 8.42e-01 0.0167 0.0836 0.197 B L1
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00304 0.0506 0.197 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0371 0.0779 0.197 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 8.96e-01 -0.014 0.106 0.197 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0787 0.0825 0.197 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 1.68e-01 -0.118 0.0856 0.197 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0167 0.0744 0.197 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0373 0.0505 0.197 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00611 0.068 0.197 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 4.13e-01 0.0838 0.102 0.197 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0827 0.0817 0.197 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 4.37e-01 0.0666 0.0854 0.197 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0703 0.0997 0.197 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 9.81e-01 0.000835 0.0341 0.197 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0573 0.0524 0.197 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 4.81e-01 0.0727 0.103 0.197 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 9.94e-01 0.000943 0.124 0.2 DC L1
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0608 0.077 0.2 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 645426 sc-eQTL 8.04e-01 0.0237 0.0957 0.2 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 666136 sc-eQTL 4.40e-01 0.0798 0.103 0.2 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 7.24e-01 -0.039 0.11 0.2 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 7.97e-01 -0.016 0.0619 0.2 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 2.39e-01 0.0845 0.0716 0.2 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0232 0.098 0.2 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 277063 sc-eQTL 7.09e-01 0.0334 0.0892 0.2 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -916110 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0647 0.111 0.2 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 8.17e-01 0.02 0.0862 0.197 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 1.33e-01 -0.0866 0.0574 0.197 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 645426 sc-eQTL 7.45e-01 0.0322 0.099 0.197 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 666136 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0931 0.106 0.197 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 2.38e-01 0.0887 0.0749 0.197 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 1.13e-01 -0.0714 0.0448 0.197 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0304 0.0636 0.197 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 9.59e-01 0.0046 0.0891 0.197 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -916110 sc-eQTL 7.31e-01 0.0302 0.0876 0.197 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 7.96e-01 0.0244 0.0942 0.197 NK L1
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 2.35e-01 -0.104 0.0868 0.197 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 2.91e-01 -0.115 0.108 0.197 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 6.31e-01 0.0216 0.0449 0.197 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 7.55e-01 0.026 0.083 0.197 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 8.75e-02 0.19 0.111 0.197 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 3.84e-01 0.0763 0.0876 0.197 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0758 0.106 0.197 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0341 0.042 0.197 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 4.54e-01 -0.058 0.0773 0.197 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 1.24e-01 -0.177 0.115 0.197 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 7.28e-01 0.0457 0.131 0.199 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 978716 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0319 0.12 0.199 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 3.47e-01 0.106 0.112 0.199 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0182 0.12 0.199 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0184 0.0641 0.199 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 9.08e-01 0.0132 0.114 0.199 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0407 0.112 0.199 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0815 0.124 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 978716 sc-eQTL 1.70e-01 -0.149 0.108 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0301 0.0713 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 7.21e-01 0.0384 0.107 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 8.20e-01 0.0149 0.0657 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 3.96e-02 -0.233 0.113 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 2.74e-01 0.13 0.118 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 6.05e-01 -0.062 0.12 0.196 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 978716 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0244 0.11 0.196 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 9.75e-01 0.00272 0.0867 0.196 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 5.69e-01 0.0646 0.113 0.196 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 6.47e-01 0.025 0.0546 0.196 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 7.89e-02 -0.176 0.0995 0.196 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 3.40e-03 -0.331 0.112 0.196 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 5.67e-01 0.0639 0.111 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 978716 sc-eQTL 6.49e-01 0.0559 0.123 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 4.87e-01 0.0373 0.0535 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0466 0.104 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 9.22e-01 0.00579 0.0593 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 8.65e-01 0.0158 0.0927 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 9.92e-01 0.00116 0.114 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 3.17e-01 0.118 0.118 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 978716 sc-eQTL 1.50e-01 0.166 0.115 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00163 0.0629 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 7.47e-01 0.0373 0.115 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0264 0.0611 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 8.70e-01 0.0177 0.108 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 5.07e-01 0.0773 0.117 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00928 0.118 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 9.04e-01 0.0142 0.118 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0632 0.118 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 8.68e-01 -0.00911 0.0548 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 1.13e-01 -0.15 0.0944 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 6.26e-01 0.0539 0.11 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 5.44e-01 0.0579 0.0952 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 6.85e-01 -0.038 0.0934 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 6.12e-01 0.0439 0.0865 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0453 0.0561 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0217 0.0688 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 2.41e-01 0.127 0.108 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 1.98e-01 -0.13 0.101 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 7.14e-02 -0.183 0.101 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0486 0.1 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 9.60e-01 0.00262 0.0519 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 4.95e-01 0.0496 0.0726 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0729 0.12 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 3.39e-01 -0.115 0.12 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 5.56e-01 0.0708 0.12 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 2.06e-01 -0.146 0.115 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0435 0.0472 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 7.64e-01 0.0244 0.0812 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 2.91e-01 -0.124 0.117 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 6.95e-01 0.0412 0.105 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 1.67e-01 0.135 0.0977 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 3.44e-01 -0.105 0.111 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0222 0.0597 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 6.88e-01 0.0405 0.101 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 6.30e-01 0.0558 0.116 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 3.08e-01 -0.112 0.11 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 9.40e-01 0.00883 0.118 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0249 0.101 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 9.21e-01 0.00579 0.0581 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0255 0.0729 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 2.22e-01 0.142 0.116 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0125 0.127 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 1.05e-01 -0.19 0.116 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 1.46e-01 0.169 0.116 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 1.98e-01 -0.073 0.0565 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 8.77e-01 0.0146 0.0939 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 7.16e-02 0.223 0.123 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 5.31e-02 -0.225 0.115 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 2.39e-01 -0.15 0.127 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 4.17e-01 -0.103 0.126 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0643 0.0679 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 8.34e-01 0.0234 0.111 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0802 0.129 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 1.02e-01 0.196 0.119 0.193 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 9.88e-01 0.00177 0.114 0.193 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 3.98e-01 0.098 0.116 0.193 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0301 0.057 0.193 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0236 0.0802 0.193 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 2.02e-01 -0.153 0.119 0.193 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 9.59e-01 0.00644 0.125 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 9.74e-01 0.00371 0.115 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 4.81e-01 0.0826 0.117 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0589 0.0652 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0235 0.0976 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 2.66e-01 0.112 0.101 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 2.06e-01 -0.117 0.0921 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 2.56e-01 -0.131 0.115 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 3.74e-01 0.0408 0.0458 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0238 0.102 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00956 0.124 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0626 0.113 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0353 0.115 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 7.95e-01 0.0139 0.0534 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0749 0.105 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 6.26e-01 0.051 0.104 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00568 0.101 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 1.66e-01 -0.158 0.113 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0216 0.0617 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 1.04e-01 0.167 0.102 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 9.68e-01 0.00585 0.145 0.196 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 978716 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0672 0.124 0.196 PB L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0695 0.103 0.196 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 2.26e-01 -0.153 0.126 0.196 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 8.89e-01 -0.01 0.0717 0.196 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0558 0.116 0.196 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 3.69e-01 -0.121 0.134 0.196 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0826 0.118 0.193 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 6.46e-01 0.0485 0.106 0.193 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0425 0.113 0.193 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0042 0.0429 0.193 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0456 0.0859 0.193 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0784 0.111 0.193 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0712 0.121 0.197 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 9.53e-01 0.00678 0.114 0.197 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 6.47e-01 0.044 0.0959 0.197 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0543 0.0423 0.197 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 4.08e-01 -0.074 0.0893 0.197 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 3.54e-02 -0.251 0.119 0.197 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 3.84e-01 0.113 0.129 0.202 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 8.96e-01 0.0133 0.102 0.202 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 645426 sc-eQTL 7.51e-01 0.032 0.101 0.202 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 666136 sc-eQTL 8.38e-01 0.0242 0.119 0.202 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 3.76e-01 -0.102 0.115 0.202 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 3.45e-01 0.0539 0.0569 0.202 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 5.41e-01 0.0589 0.0961 0.202 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 5.28e-01 0.0715 0.113 0.202 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 277063 sc-eQTL 9.02e-01 0.0111 0.0904 0.202 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -916110 sc-eQTL 9.11e-01 0.0125 0.111 0.202 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 4.32e-01 0.0767 0.0974 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 6.00e-02 -0.139 0.0734 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 645426 sc-eQTL 6.10e-01 0.0534 0.105 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 666136 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0169 0.106 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 4.90e-01 0.0582 0.0843 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 2.49e-01 -0.054 0.0467 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 8.89e-01 0.0098 0.0699 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 2.53e-01 0.103 0.0901 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -916110 sc-eQTL 3.63e-01 0.0856 0.0939 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00715 0.111 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0217 0.0803 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 645426 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0568 0.1 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 666136 sc-eQTL 1.73e-01 -0.148 0.108 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 4.12e-01 0.0585 0.0712 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0284 0.0513 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 8.65e-01 0.01 0.0587 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0279 0.095 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -916110 sc-eQTL 4.32e-01 0.0731 0.0928 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 2.15e-01 0.193 0.155 0.191 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0902 0.134 0.191 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0245 0.148 0.191 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 5.16e-01 0.0367 0.0563 0.191 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0149 0.106 0.191 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 2.73e-01 -0.159 0.145 0.191 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 2.07e-01 0.142 0.112 0.202 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 8.26e-02 -0.186 0.107 0.202 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 645426 sc-eQTL 9.35e-01 0.00878 0.108 0.202 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 666136 sc-eQTL 8.68e-03 -0.279 0.105 0.202 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 5.15e-01 0.0708 0.109 0.202 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 6.90e-01 0.0189 0.0473 0.202 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0728 0.0794 0.202 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0141 0.115 0.202 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -916110 sc-eQTL 3.52e-01 -0.103 0.11 0.202 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 5.81e-02 -0.222 0.117 0.199 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 6.27e-01 0.0387 0.0795 0.199 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 645426 sc-eQTL 1.19e-01 0.175 0.112 0.199 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 666136 sc-eQTL 7.97e-01 0.0287 0.111 0.199 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 2.43e-01 -0.125 0.107 0.199 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 5.84e-01 0.0295 0.0537 0.199 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 5.87e-01 0.0414 0.076 0.199 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 6.92e-01 0.0377 0.0949 0.199 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -916110 sc-eQTL 4.69e-01 0.0727 0.1 0.199 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0175 0.139 0.209 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0556 0.0924 0.209 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 645426 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0232 0.0931 0.209 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 666136 sc-eQTL 6.83e-01 0.0387 0.0947 0.209 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00876 0.113 0.209 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 7.27e-01 0.0272 0.0777 0.209 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 6.12e-02 0.147 0.0781 0.209 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 3.29e-01 -0.112 0.115 0.209 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 277063 sc-eQTL 3.32e-01 0.107 0.11 0.209 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -916110 sc-eQTL 6.92e-01 0.0388 0.0976 0.209 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0923 0.119 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 978716 sc-eQTL 7.16e-01 0.042 0.115 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0262 0.0653 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 8.32e-01 -0.022 0.103 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 7.18e-01 0.0213 0.0589 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 3.17e-02 -0.197 0.0911 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0274 0.108 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 3.98e-01 0.0946 0.112 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 978716 sc-eQTL 4.12e-01 0.101 0.123 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 6.72e-01 0.0214 0.0504 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 9.62e-01 0.00464 0.0979 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00376 0.0592 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 9.63e-01 0.00423 0.0917 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 8.82e-01 0.0166 0.112 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 5.43e-01 0.054 0.0886 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 1.01e-01 -0.101 0.0613 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 645426 sc-eQTL 8.41e-01 0.0201 0.1 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 666136 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0776 0.105 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 4.27e-01 0.0551 0.0692 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0481 0.0474 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 9.10e-01 0.00729 0.0647 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 5.13e-01 0.0554 0.0845 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -916110 sc-eQTL 2.10e-01 0.111 0.0883 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 7.08e-01 -0.043 0.115 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0317 0.0756 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 645426 sc-eQTL 1.67e-01 0.154 0.111 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 666136 sc-eQTL 9.29e-01 0.00981 0.11 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0866 0.104 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00048 0.0441 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0276 0.0667 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 566852 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0511 0.107 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -916110 sc-eQTL 2.73e-01 -0.106 0.0965 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -571979 sc-eQTL 4.95e-01 0.0636 0.093 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 866993 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0955 0.0872 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 616732 sc-eQTL 1.99e-01 -0.142 0.11 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 565622 sc-eQTL 4.50e-01 0.0342 0.0451 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -937921 sc-eQTL 3.98e-01 0.079 0.0932 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 866993 eQTL 0.0101 -0.0492 0.0191 0.0 0.0 0.211
ENSG00000112299 VNN1 666136 pQTL 0.0246 -0.0972 0.0432 0.0 0.0 0.207

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina