logo

Genes within 1Mb (chr6:133378084:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0226 0.111 0.205 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 976609 sc-eQTL 4.48e-01 0.0889 0.117 0.205 B L1
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 5.98e-01 0.0233 0.0441 0.205 B L1
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 8.94e-01 0.0111 0.083 0.205 B L1
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 8.10e-01 0.0121 0.0502 0.205 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0517 0.0773 0.205 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 8.79e-01 0.0161 0.106 0.205 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0586 0.082 0.205 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 1.86e-01 -0.113 0.085 0.205 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0135 0.0739 0.205 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0199 0.0502 0.205 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0129 0.0675 0.205 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 5.34e-01 0.0632 0.102 0.205 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0978 0.0807 0.205 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 6.30e-01 0.0408 0.0845 0.205 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0845 0.0985 0.205 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 4.66e-01 0.0246 0.0337 0.205 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0544 0.0518 0.205 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 6.85e-01 0.0414 0.102 0.205 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0251 0.124 0.207 DC L1
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0432 0.077 0.207 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 643319 sc-eQTL 7.04e-01 0.0363 0.0955 0.207 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 664029 sc-eQTL 3.48e-01 0.0967 0.103 0.207 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0148 0.11 0.207 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0061 0.0618 0.207 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 3.33e-01 0.0695 0.0716 0.207 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0317 0.0978 0.207 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 274956 sc-eQTL 4.84e-01 0.0624 0.089 0.207 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -918217 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0393 0.111 0.207 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 7.11e-01 0.0319 0.0858 0.205 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 1.36e-01 -0.0854 0.0571 0.205 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 643319 sc-eQTL 7.97e-01 0.0254 0.0986 0.205 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 664029 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0692 0.106 0.205 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 2.10e-01 0.0938 0.0746 0.205 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0622 0.0447 0.205 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0298 0.0633 0.205 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00599 0.0888 0.205 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -918217 sc-eQTL 7.85e-01 0.0238 0.0872 0.205 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 6.55e-01 0.0418 0.0936 0.206 NK L1
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0681 0.0865 0.206 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0621 0.108 0.206 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 4.38e-01 0.0346 0.0445 0.206 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 6.10e-01 0.0421 0.0824 0.206 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 9.25e-02 0.186 0.11 0.205 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 4.67e-01 0.0636 0.0872 0.205 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0513 0.105 0.205 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0147 0.0418 0.205 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0251 0.077 0.205 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 3.27e-01 -0.112 0.114 0.205 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 6.57e-01 0.0581 0.131 0.209 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 976609 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0168 0.119 0.209 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 3.85e-01 0.0972 0.112 0.209 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 8.58e-01 0.0213 0.119 0.209 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0197 0.0637 0.209 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 6.88e-01 0.0457 0.114 0.209 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0191 0.112 0.209 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 3.22e-01 -0.122 0.123 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 976609 sc-eQTL 2.76e-01 -0.118 0.108 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00216 0.0708 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 6.97e-01 0.0415 0.107 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 7.91e-01 0.0174 0.0653 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 4.77e-03 -0.316 0.111 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 2.70e-01 0.13 0.117 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0609 0.119 0.205 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 976609 sc-eQTL 7.41e-01 0.0362 0.109 0.205 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 7.71e-01 0.025 0.0859 0.205 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 8.45e-01 0.022 0.112 0.205 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 5.35e-01 0.0336 0.0541 0.205 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 1.42e-02 -0.242 0.0979 0.205 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 4.68e-03 -0.317 0.111 0.205 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 9.65e-01 0.00482 0.111 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 976609 sc-eQTL 5.21e-01 0.0781 0.122 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 4.20e-01 0.0429 0.0531 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0438 0.103 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 7.91e-01 0.0156 0.0589 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 8.38e-01 0.0188 0.0921 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 6.75e-01 0.0477 0.114 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 4.23e-01 0.094 0.117 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 976609 sc-eQTL 9.28e-02 0.192 0.114 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 8.42e-01 0.0124 0.0624 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 8.00e-01 0.0291 0.114 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0125 0.0606 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 9.55e-01 0.00605 0.107 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 4.76e-01 0.0825 0.116 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 6.99e-01 0.0454 0.117 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0424 0.117 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0549 0.118 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 7.81e-01 0.0151 0.0544 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 1.18e-01 -0.147 0.0937 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 2.56e-01 0.125 0.109 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 4.04e-01 0.0791 0.0946 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0589 0.0928 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 7.29e-01 0.0299 0.0861 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0277 0.0558 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0243 0.0684 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 3.61e-01 0.0982 0.107 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 1.81e-01 -0.134 0.1 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 7.29e-02 -0.181 0.1 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 7.94e-01 -0.026 0.0996 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 7.02e-01 0.0198 0.0516 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 6.48e-01 0.033 0.0722 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0888 0.119 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 2.48e-01 -0.138 0.119 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 5.36e-01 0.074 0.119 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 1.78e-01 -0.154 0.114 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0219 0.047 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 8.65e-01 0.0137 0.0808 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0975 0.117 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 7.61e-01 0.0317 0.104 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 2.79e-01 0.105 0.097 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 1.95e-01 -0.143 0.11 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 7.51e-01 0.0188 0.0592 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 8.64e-01 0.0171 0.0999 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 5.59e-01 0.067 0.115 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 3.27e-01 -0.108 0.11 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0281 0.117 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0284 0.101 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 7.61e-01 0.0176 0.0578 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0109 0.0726 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 3.60e-01 0.106 0.116 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0358 0.126 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 1.25e-01 -0.178 0.116 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 1.52e-01 0.165 0.115 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0769 0.056 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 9.05e-01 0.0112 0.0931 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 1.29e-01 0.187 0.123 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 3.06e-02 -0.246 0.113 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 2.21e-01 -0.153 0.124 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0821 0.124 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 9.43e-01 0.0048 0.0668 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0106 0.109 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 3.18e-01 -0.126 0.126 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 9.81e-02 0.196 0.118 0.201 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00651 0.113 0.201 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 2.76e-01 0.125 0.115 0.201 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0158 0.0565 0.201 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 6.70e-01 -0.034 0.0795 0.201 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0941 0.118 0.201 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0451 0.123 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 8.17e-01 0.0264 0.114 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 3.96e-01 0.0981 0.115 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0347 0.0643 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0449 0.0961 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 1.27e-01 0.153 0.0996 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0892 0.0915 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0941 0.115 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 1.97e-01 0.0586 0.0454 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 8.76e-01 0.0158 0.101 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 8.41e-01 0.0249 0.124 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 6.64e-01 -0.049 0.113 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 8.77e-01 0.0176 0.114 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 7.20e-01 0.0191 0.0531 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0622 0.105 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 7.75e-01 0.0297 0.104 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 6.75e-01 0.0422 0.101 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 2.95e-01 -0.119 0.113 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0108 0.0614 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 7.33e-02 0.182 0.101 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 6.89e-01 0.058 0.145 0.207 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 976609 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0251 0.124 0.207 PB L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0564 0.103 0.207 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 3.22e-01 -0.125 0.125 0.207 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 9.58e-01 0.00379 0.0716 0.207 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0406 0.116 0.207 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 2.68e-01 -0.148 0.133 0.207 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 3.55e-01 -0.109 0.117 0.202 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 6.38e-01 0.0495 0.105 0.202 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0476 0.113 0.202 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 9.93e-01 0.000395 0.0426 0.202 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0571 0.0854 0.202 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 3.48e-01 -0.103 0.11 0.202 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 2.82e-01 -0.129 0.12 0.205 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 6.45e-01 0.0522 0.113 0.205 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 5.68e-01 0.0545 0.0953 0.205 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0346 0.0421 0.205 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 3.68e-01 -0.08 0.0887 0.205 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 2.73e-02 -0.262 0.118 0.205 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 5.03e-01 0.0867 0.129 0.21 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 6.91e-01 0.0403 0.101 0.21 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 643319 sc-eQTL 5.65e-01 0.058 0.101 0.21 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 664029 sc-eQTL 6.86e-01 0.0479 0.118 0.21 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 3.33e-01 -0.112 0.115 0.21 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 2.09e-01 0.0716 0.0568 0.21 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 7.33e-01 0.0329 0.096 0.21 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 6.96e-01 0.0441 0.113 0.21 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 274956 sc-eQTL 5.96e-01 0.0479 0.0902 0.21 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -918217 sc-eQTL 7.63e-01 0.0335 0.111 0.21 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 1.89e-01 0.127 0.0965 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 9.03e-02 -0.124 0.073 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 643319 sc-eQTL 5.86e-01 0.0566 0.104 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 664029 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00856 0.105 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 5.26e-01 0.0532 0.0838 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0355 0.0465 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 8.55e-01 0.0127 0.0695 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 3.17e-01 0.09 0.0896 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -918217 sc-eQTL 4.43e-01 0.0719 0.0934 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0198 0.11 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0445 0.0796 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 643319 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0574 0.0995 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 664029 sc-eQTL 2.53e-01 -0.124 0.108 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 2.49e-01 0.0815 0.0706 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0274 0.0509 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 8.40e-01 0.0118 0.0583 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0317 0.0943 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -918217 sc-eQTL 4.66e-01 0.0673 0.0922 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 2.63e-01 0.172 0.153 0.197 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0788 0.132 0.197 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 6.05e-01 -0.076 0.146 0.197 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 5.00e-01 0.0377 0.0557 0.197 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0413 0.105 0.197 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 4.26e-01 -0.115 0.144 0.197 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 2.37e-01 0.132 0.112 0.211 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 8.52e-02 -0.184 0.106 0.211 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 643319 sc-eQTL 6.75e-01 0.0453 0.108 0.211 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 664029 sc-eQTL 8.57e-03 -0.279 0.105 0.211 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 4.12e-01 0.0891 0.108 0.211 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 7.87e-01 0.0128 0.0472 0.211 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0689 0.0792 0.211 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 9.22e-01 0.0112 0.115 0.211 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -918217 sc-eQTL 2.59e-01 -0.124 0.11 0.211 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 3.59e-02 -0.245 0.116 0.208 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 5.86e-01 0.0432 0.0791 0.208 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 643319 sc-eQTL 2.25e-01 0.136 0.111 0.208 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 664029 sc-eQTL 3.97e-01 0.0939 0.111 0.208 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 2.26e-01 -0.129 0.106 0.208 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 4.52e-01 0.0402 0.0534 0.208 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 8.92e-01 0.0102 0.0757 0.208 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 6.69e-01 0.0404 0.0944 0.208 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -918217 sc-eQTL 1.97e-01 0.129 0.0995 0.208 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0184 0.14 0.215 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0251 0.0929 0.215 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 643319 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0129 0.0935 0.215 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 664029 sc-eQTL 7.72e-01 0.0276 0.0952 0.215 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 8.80e-01 0.0172 0.113 0.215 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 8.08e-01 0.019 0.078 0.215 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 1.27e-01 0.121 0.0787 0.215 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 3.74e-01 -0.103 0.115 0.215 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 274956 sc-eQTL 3.50e-01 0.103 0.11 0.215 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -918217 sc-eQTL 6.94e-01 0.0386 0.098 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 2.81e-01 -0.127 0.118 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 976609 sc-eQTL 5.45e-01 0.0696 0.115 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0015 0.0651 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0282 0.103 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 5.02e-01 0.0394 0.0586 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 1.75e-02 -0.217 0.0904 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0202 0.108 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 7.22e-01 0.0395 0.111 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 976609 sc-eQTL 3.20e-01 0.121 0.122 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 5.73e-01 0.0282 0.05 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 9.59e-01 0.00495 0.0971 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 9.29e-01 0.00524 0.0588 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 9.55e-01 0.00511 0.091 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 6.53e-01 0.0499 0.111 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 3.11e-01 0.0892 0.0879 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 1.04e-01 -0.0995 0.0609 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 643319 sc-eQTL 8.66e-01 0.0168 0.0999 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 664029 sc-eQTL 4.84e-01 -0.073 0.104 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 4.30e-01 0.0544 0.0688 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0351 0.0472 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 8.57e-01 0.0116 0.0644 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 6.33e-01 0.0402 0.084 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -918217 sc-eQTL 2.56e-01 0.1 0.0879 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0725 0.114 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0506 0.0752 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 643319 sc-eQTL 1.86e-01 0.146 0.11 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 664029 sc-eQTL 5.82e-01 0.0605 0.11 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0518 0.103 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00592 0.0439 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0512 0.0664 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 564745 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0304 0.107 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -918217 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0948 0.0962 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -574086 sc-eQTL 3.18e-01 0.0925 0.0923 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 864886 sc-eQTL 4.90e-01 -0.06 0.0868 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 614625 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0882 0.11 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 563515 sc-eQTL 2.73e-01 0.0492 0.0448 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -940028 sc-eQTL 2.96e-01 0.0969 0.0925 0.207 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 864886 eQTL 0.0103 -0.0488 0.019 0.0 0.0 0.216
ENSG00000112299 VNN1 664029 pQTL 0.0282 -0.0944 0.043 0.0 0.0 0.212
ENSG00000112303 VNN2 614625 eQTL 0.237 0.0184 0.0155 0.00103 0.0 0.216

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina