logo

Genes within 1Mb (chr6:133369651:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 8.81e-01 0.0166 0.111 0.15 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 968176 sc-eQTL 7.78e-01 0.033 0.117 0.15 B L1
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 4.91e-01 0.0304 0.0441 0.15 B L1
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 6.11e-01 0.0423 0.0829 0.15 B L1
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 7.69e-01 0.0147 0.0502 0.15 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 5.57e-01 0.0455 0.0773 0.15 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 4.61e-02 0.21 0.105 0.15 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 9.29e-01 0.00724 0.0811 0.15 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 2.55e-01 0.096 0.0841 0.15 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 4.61e-01 0.0538 0.0729 0.15 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 8.86e-01 0.00711 0.0496 0.15 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 1.05e-01 0.108 0.0663 0.15 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 1.40e-01 0.148 0.0999 0.15 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 4.98e-01 0.054 0.0795 0.15 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0109 0.0831 0.15 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0723 0.0969 0.15 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0112 0.0331 0.15 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 5.48e-01 0.0307 0.051 0.15 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 6.21e-01 0.0497 0.1 0.15 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 2.27e-01 0.146 0.12 0.153 DC L1
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 9.46e-01 0.00511 0.0749 0.153 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 634886 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0256 0.0928 0.153 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 655596 sc-eQTL 4.88e-01 0.0696 0.1 0.153 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 7.97e-02 0.187 0.106 0.153 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 6.65e-01 -0.026 0.0601 0.153 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 8.25e-01 0.0154 0.0698 0.153 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 7.03e-01 0.0364 0.0951 0.153 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 266523 sc-eQTL 6.63e-01 0.0378 0.0866 0.153 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -926650 sc-eQTL 5.12e-01 0.0709 0.108 0.153 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 1.75e-01 0.116 0.0853 0.15 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0354 0.0573 0.15 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 634886 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0122 0.0984 0.15 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 655596 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0295 0.106 0.15 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00411 0.0747 0.15 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 8.38e-01 -0.00915 0.0448 0.15 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00498 0.0632 0.15 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0494 0.0885 0.15 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -926650 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0428 0.087 0.15 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 4.60e-01 0.0692 0.0935 0.15 NK L1
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0325 0.0866 0.15 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 9.68e-01 0.00434 0.108 0.15 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0571 0.0444 0.15 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 6.62e-01 -0.036 0.0825 0.15 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 6.90e-02 -0.197 0.108 0.15 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 6.72e-01 0.0362 0.0854 0.15 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 3.52e-01 0.0961 0.103 0.15 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0548 0.0408 0.15 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 7.30e-01 0.0261 0.0754 0.15 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 3.46e-01 0.106 0.112 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 7.72e-01 0.0374 0.129 0.151 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 968176 sc-eQTL 6.78e-01 0.049 0.118 0.151 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 1.44e-01 -0.161 0.11 0.151 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 1.10e-01 0.188 0.117 0.151 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0392 0.0629 0.151 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 7.60e-01 0.0343 0.112 0.151 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 9.00e-01 0.0139 0.11 0.151 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 9.08e-02 0.207 0.122 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 968176 sc-eQTL 1.67e-02 0.256 0.106 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 3.87e-01 0.061 0.0703 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 8.57e-01 0.0192 0.106 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 8.29e-01 0.014 0.0649 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 1.69e-01 0.154 0.112 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 3.00e-01 0.121 0.117 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 4.21e-03 -0.332 0.115 0.151 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 968176 sc-eQTL 8.73e-01 0.0173 0.108 0.151 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 6.25e-02 0.157 0.0839 0.151 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 1.86e-01 0.146 0.11 0.151 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 8.67e-01 0.00892 0.0533 0.151 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 2.19e-01 0.12 0.0975 0.151 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 4.97e-01 0.0756 0.111 0.151 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00248 0.111 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 968176 sc-eQTL 6.07e-01 0.0627 0.122 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 9.07e-01 0.00626 0.0533 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 1.51e-01 -0.148 0.103 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 2.49e-01 0.0679 0.0587 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 7.65e-02 0.163 0.0915 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 5.08e-01 0.0753 0.114 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0696 0.117 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 968176 sc-eQTL 1.89e-01 -0.15 0.114 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0425 0.0623 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 4.11e-01 0.0941 0.114 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 3.36e-02 0.128 0.06 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 4.34e-01 0.0838 0.107 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 1.59e-01 0.163 0.115 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 4.61e-02 0.237 0.118 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 7.33e-01 0.0406 0.119 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 2.00e-02 0.277 0.118 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 7.21e-02 0.0992 0.0548 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 4.70e-01 0.0693 0.0957 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 1.00e-01 0.183 0.111 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 6.39e-02 -0.172 0.0922 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 5.52e-01 0.0543 0.0911 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 5.14e-01 0.0552 0.0844 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 3.49e-01 0.0513 0.0547 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 5.33e-02 0.129 0.0665 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 2.45e-01 0.123 0.105 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 4.04e-01 0.0839 0.1 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 3.47e-01 0.0951 0.101 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0632 0.0995 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0647 0.0514 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 4.86e-01 0.0504 0.0722 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 1.88e-01 0.157 0.119 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0428 0.115 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 2.77e-01 -0.126 0.115 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 1.38e-01 0.164 0.11 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00232 0.0454 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 4.90e-01 0.0539 0.078 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 2.02e-01 0.144 0.112 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0111 0.102 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0489 0.0954 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0833 0.108 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 4.93e-01 0.0398 0.058 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 4.83e-01 0.0688 0.0979 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 9.77e-01 0.00326 0.112 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 6.19e-01 0.0548 0.11 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 3.54e-01 0.109 0.117 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 2.19e-01 -0.124 0.101 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0529 0.0577 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 4.00e-01 0.0611 0.0725 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 4.94e-01 0.0795 0.116 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 5.44e-01 -0.076 0.125 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0289 0.116 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 3.10e-01 -0.117 0.115 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 4.51e-01 0.0422 0.0559 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 1.08e-01 0.149 0.0921 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 9.63e-01 0.00573 0.123 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 8.49e-01 0.0209 0.11 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 2.45e-01 -0.14 0.12 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 1.88e-01 0.157 0.119 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 1.22e-01 0.0992 0.0638 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0368 0.105 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 2.85e-01 0.13 0.121 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 7.44e-01 -0.038 0.116 0.149 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 6.48e-01 0.0505 0.11 0.149 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 4.52e-01 0.0844 0.112 0.149 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 1.58e-01 -0.0778 0.0549 0.149 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 7.85e-01 0.0212 0.0777 0.149 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 6.53e-01 0.0521 0.116 0.149 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 6.98e-01 -0.05 0.129 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 9.80e-01 0.00299 0.119 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 6.31e-01 0.0582 0.121 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0116 0.0675 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 8.42e-01 0.0202 0.101 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 6.03e-01 0.0524 0.101 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0892 0.0919 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0959 0.115 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0311 0.0457 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 8.02e-01 0.0254 0.101 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0597 0.123 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0256 0.112 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 8.01e-01 0.0285 0.113 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0423 0.0527 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 7.11e-01 0.0387 0.104 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 2.44e-01 0.121 0.104 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 1.70e-01 0.138 0.1 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00248 0.113 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0147 0.0615 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 1.66e-01 -0.141 0.102 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 7.92e-01 0.0369 0.14 0.148 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 968176 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0501 0.119 0.148 PB L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 1.01e-01 -0.163 0.0985 0.148 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 8.89e-01 -0.017 0.122 0.148 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 4.61e-02 -0.137 0.0679 0.148 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 8.13e-01 0.0264 0.112 0.148 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0206 0.13 0.148 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 9.88e-01 0.00171 0.116 0.15 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 1.54e-01 0.148 0.103 0.15 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00686 0.111 0.15 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 8.33e-01 -0.00889 0.042 0.15 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 7.48e-01 0.0271 0.0842 0.15 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 6.65e-02 0.199 0.108 0.15 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 9.62e-01 0.00567 0.119 0.15 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 9.39e-02 0.187 0.111 0.15 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 4.94e-01 0.0645 0.0941 0.15 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0214 0.0417 0.15 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 3.33e-01 0.0851 0.0876 0.15 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 2.56e-01 0.134 0.117 0.15 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 2.79e-01 0.133 0.123 0.151 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 4.43e-01 -0.074 0.0964 0.151 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 634886 sc-eQTL 9.18e-01 0.00991 0.0959 0.151 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 655596 sc-eQTL 5.70e-01 0.0642 0.113 0.151 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 4.85e-01 0.0768 0.11 0.151 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 4.96e-01 -0.037 0.0542 0.151 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 7.52e-01 0.0289 0.0913 0.151 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 8.62e-02 0.184 0.107 0.151 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 266523 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0161 0.0858 0.151 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -926650 sc-eQTL 5.31e-01 0.0663 0.106 0.151 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 3.73e-01 0.0876 0.0981 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0537 0.0745 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 634886 sc-eQTL 6.74e-01 0.0444 0.105 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 655596 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0642 0.106 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 5.29e-01 0.0536 0.085 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 9.51e-01 0.0029 0.0472 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0123 0.0705 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00441 0.0911 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -926650 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0235 0.0949 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 5.69e-01 0.0637 0.112 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 1.00e+00 -3.15e-05 0.0807 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 634886 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0357 0.101 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 655596 sc-eQTL 4.28e-01 0.0867 0.109 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0135 0.0717 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 8.01e-01 -0.013 0.0516 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 8.06e-01 0.0145 0.059 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 2.00e-01 -0.122 0.0952 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -926650 sc-eQTL 1.56e-01 -0.132 0.093 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 4.55e-01 -0.115 0.154 0.142 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 3.95e-01 0.113 0.132 0.142 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0432 0.147 0.142 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 3.29e-01 0.0546 0.0558 0.142 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 1.29e-01 0.16 0.105 0.142 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0896 0.144 0.142 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 6.38e-01 0.0526 0.112 0.149 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 3.43e-01 -0.101 0.107 0.149 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 634886 sc-eQTL 8.04e-01 0.0267 0.108 0.149 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 655596 sc-eQTL 3.98e-01 0.0902 0.106 0.149 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 9.64e-02 0.18 0.108 0.149 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0313 0.0471 0.149 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0901 0.079 0.149 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00236 0.115 0.149 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -926650 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0534 0.11 0.149 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 2.58e-01 0.132 0.116 0.149 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0943 0.0787 0.149 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 634886 sc-eQTL 9.30e-01 0.00976 0.111 0.149 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 655596 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0779 0.111 0.149 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 3.23e-01 0.105 0.106 0.149 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0354 0.0533 0.149 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 8.22e-01 0.017 0.0755 0.149 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 1.42e-01 -0.138 0.0937 0.149 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -926650 sc-eQTL 5.47e-01 0.0601 0.0996 0.149 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0893 0.137 0.15 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0601 0.0915 0.15 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 634886 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0186 0.0922 0.15 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 655596 sc-eQTL 9.29e-02 0.157 0.093 0.15 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 3.69e-01 0.1 0.111 0.15 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0784 0.0767 0.15 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 4.28e-01 0.062 0.0781 0.15 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 2.10e-01 -0.143 0.113 0.15 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 266523 sc-eQTL 9.80e-01 0.00279 0.109 0.15 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -926650 sc-eQTL 3.63e-01 0.088 0.0964 0.15 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 2.93e-01 0.124 0.118 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 968176 sc-eQTL 3.92e-01 0.0983 0.115 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 1.78e-01 0.0876 0.0648 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 8.39e-02 0.177 0.102 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00408 0.0586 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 1.82e-01 0.122 0.0913 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 3.84e-01 0.0937 0.107 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0166 0.111 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 968176 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0405 0.122 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 8.85e-01 0.00723 0.0502 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0521 0.0973 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 6.21e-02 0.11 0.0585 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 1.94e-01 0.118 0.0909 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 1.94e-01 0.144 0.111 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 3.02e-01 0.0922 0.0891 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0216 0.0621 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 634886 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0135 0.101 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 655596 sc-eQTL 8.78e-01 0.0162 0.106 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 9.43e-01 0.00501 0.0698 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 8.90e-01 -0.00663 0.0479 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0037 0.0652 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0465 0.0851 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -926650 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0748 0.0892 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 4.75e-01 0.0818 0.114 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 1.74e-01 -0.102 0.0751 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 634886 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0728 0.111 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 655596 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0904 0.11 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 1.23e-01 0.16 0.103 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 8.78e-01 -0.00679 0.044 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0185 0.0666 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 556312 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0642 0.107 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -926650 sc-eQTL 7.41e-01 0.032 0.0966 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -582519 sc-eQTL 1.87e-01 0.122 0.092 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 856453 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0261 0.0868 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 606192 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0222 0.11 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 555082 sc-eQTL 1.36e-01 -0.0667 0.0446 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -948461 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0198 0.0926 0.151 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 634886 eQTL 0.0298 0.0438 0.0201 0.0 0.0 0.16

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 634886 3.62e-07 2.89e-07 7.97e-08 2.79e-07 9.82e-08 8.4e-08 3.25e-07 5.78e-08 2.12e-07 1.21e-07 2.38e-07 1.82e-07 3.77e-07 8.55e-08 9.12e-08 1.14e-07 1.18e-07 2.66e-07 7.76e-08 8.69e-08 1.35e-07 2.24e-07 2.11e-07 3.41e-08 3.98e-07 1.82e-07 1.29e-07 1.54e-07 1.47e-07 1.85e-07 1.71e-07 5.54e-08 4.96e-08 1.02e-07 7.44e-08 3.57e-08 6.87e-08 7.63e-08 4.72e-08 6.31e-08 4.51e-08 2.91e-07 3.18e-08 1.9e-08 3.66e-08 1.01e-08 7.52e-08 0.0 4.61e-08
ENSG00000118515 \N -948461 2.74e-07 1.34e-07 5.35e-08 1.89e-07 9.01e-08 1e-07 1.61e-07 5.2e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.54e-07 9e-08 1.52e-07 7.13e-08 6.12e-08 7.36e-08 4.24e-08 1.27e-07 5.75e-08 4.31e-08 1.21e-07 1.24e-07 1.45e-07 2.95e-08 1.63e-07 1.21e-07 1.07e-07 9.74e-08 1.12e-07 1.07e-07 1.02e-07 2.96e-08 3.73e-08 8.34e-08 7.36e-08 3.65e-08 5.61e-08 9.25e-08 6.43e-08 4.02e-08 5.44e-08 1.46e-07 5.24e-08 1.43e-08 4.92e-08 1.84e-08 1.21e-07 1.88e-09 5.02e-08