logo

Genes within 1Mb (chr6:133366211:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 8.81e-01 0.0166 0.111 0.15 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 964736 sc-eQTL 7.78e-01 0.033 0.117 0.15 B L1
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 4.91e-01 0.0304 0.0441 0.15 B L1
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 6.11e-01 0.0423 0.0829 0.15 B L1
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 7.69e-01 0.0147 0.0502 0.15 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 5.57e-01 0.0455 0.0773 0.15 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 4.61e-02 0.21 0.105 0.15 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 9.29e-01 0.00724 0.0811 0.15 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 2.55e-01 0.096 0.0841 0.15 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 4.61e-01 0.0538 0.0729 0.15 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 8.86e-01 0.00711 0.0496 0.15 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 1.05e-01 0.108 0.0663 0.15 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 1.40e-01 0.148 0.0999 0.15 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 4.98e-01 0.054 0.0795 0.15 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0109 0.0831 0.15 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0723 0.0969 0.15 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0112 0.0331 0.15 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 5.48e-01 0.0307 0.051 0.15 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 6.21e-01 0.0497 0.1 0.15 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 2.27e-01 0.146 0.12 0.153 DC L1
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 9.46e-01 0.00511 0.0749 0.153 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 631446 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0256 0.0928 0.153 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 652156 sc-eQTL 4.88e-01 0.0696 0.1 0.153 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 7.97e-02 0.187 0.106 0.153 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 6.65e-01 -0.026 0.0601 0.153 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 8.25e-01 0.0154 0.0698 0.153 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 7.03e-01 0.0364 0.0951 0.153 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 263083 sc-eQTL 6.63e-01 0.0378 0.0866 0.153 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -930090 sc-eQTL 5.12e-01 0.0709 0.108 0.153 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 1.75e-01 0.116 0.0853 0.15 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0354 0.0573 0.15 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 631446 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0122 0.0984 0.15 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 652156 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0295 0.106 0.15 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00411 0.0747 0.15 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 8.38e-01 -0.00915 0.0448 0.15 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00498 0.0632 0.15 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0494 0.0885 0.15 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -930090 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0428 0.087 0.15 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 4.60e-01 0.0692 0.0935 0.15 NK L1
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0325 0.0866 0.15 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 9.68e-01 0.00434 0.108 0.15 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0571 0.0444 0.15 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 6.62e-01 -0.036 0.0825 0.15 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 6.90e-02 -0.197 0.108 0.15 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 6.72e-01 0.0362 0.0854 0.15 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 3.52e-01 0.0961 0.103 0.15 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0548 0.0408 0.15 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 7.30e-01 0.0261 0.0754 0.15 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 3.46e-01 0.106 0.112 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 7.72e-01 0.0374 0.129 0.151 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 964736 sc-eQTL 6.78e-01 0.049 0.118 0.151 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 1.44e-01 -0.161 0.11 0.151 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 1.10e-01 0.188 0.117 0.151 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0392 0.0629 0.151 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 7.60e-01 0.0343 0.112 0.151 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 9.00e-01 0.0139 0.11 0.151 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 9.08e-02 0.207 0.122 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 964736 sc-eQTL 1.67e-02 0.256 0.106 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 3.87e-01 0.061 0.0703 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 8.57e-01 0.0192 0.106 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 8.29e-01 0.014 0.0649 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 1.69e-01 0.154 0.112 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 3.00e-01 0.121 0.117 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 4.21e-03 -0.332 0.115 0.151 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 964736 sc-eQTL 8.73e-01 0.0173 0.108 0.151 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 6.25e-02 0.157 0.0839 0.151 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 1.86e-01 0.146 0.11 0.151 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 8.67e-01 0.00892 0.0533 0.151 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 2.19e-01 0.12 0.0975 0.151 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 4.97e-01 0.0756 0.111 0.151 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00248 0.111 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 964736 sc-eQTL 6.07e-01 0.0627 0.122 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 9.07e-01 0.00626 0.0533 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 1.51e-01 -0.148 0.103 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 2.49e-01 0.0679 0.0587 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 7.65e-02 0.163 0.0915 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 5.08e-01 0.0753 0.114 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0696 0.117 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 964736 sc-eQTL 1.89e-01 -0.15 0.114 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0425 0.0623 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 4.11e-01 0.0941 0.114 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 3.36e-02 0.128 0.06 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 4.34e-01 0.0838 0.107 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 1.59e-01 0.163 0.115 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 4.61e-02 0.237 0.118 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 7.33e-01 0.0406 0.119 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 2.00e-02 0.277 0.118 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 7.21e-02 0.0992 0.0548 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 4.70e-01 0.0693 0.0957 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 1.00e-01 0.183 0.111 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 6.39e-02 -0.172 0.0922 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 5.52e-01 0.0543 0.0911 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 5.14e-01 0.0552 0.0844 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 3.49e-01 0.0513 0.0547 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 5.33e-02 0.129 0.0665 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 2.45e-01 0.123 0.105 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 4.04e-01 0.0839 0.1 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 3.47e-01 0.0951 0.101 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0632 0.0995 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0647 0.0514 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 4.86e-01 0.0504 0.0722 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 1.88e-01 0.157 0.119 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0428 0.115 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 2.77e-01 -0.126 0.115 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 1.38e-01 0.164 0.11 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00232 0.0454 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 4.90e-01 0.0539 0.078 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 2.02e-01 0.144 0.112 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0111 0.102 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0489 0.0954 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0833 0.108 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 4.93e-01 0.0398 0.058 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 4.83e-01 0.0688 0.0979 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 9.77e-01 0.00326 0.112 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 6.19e-01 0.0548 0.11 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 3.54e-01 0.109 0.117 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 2.19e-01 -0.124 0.101 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0529 0.0577 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 4.00e-01 0.0611 0.0725 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 4.94e-01 0.0795 0.116 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 5.44e-01 -0.076 0.125 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0289 0.116 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 3.10e-01 -0.117 0.115 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 4.51e-01 0.0422 0.0559 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 1.08e-01 0.149 0.0921 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 9.63e-01 0.00573 0.123 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 8.49e-01 0.0209 0.11 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 2.45e-01 -0.14 0.12 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 1.88e-01 0.157 0.119 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 1.22e-01 0.0992 0.0638 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0368 0.105 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 2.85e-01 0.13 0.121 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 7.44e-01 -0.038 0.116 0.149 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 6.48e-01 0.0505 0.11 0.149 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 4.52e-01 0.0844 0.112 0.149 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 1.58e-01 -0.0778 0.0549 0.149 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 7.85e-01 0.0212 0.0777 0.149 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 6.53e-01 0.0521 0.116 0.149 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 6.98e-01 -0.05 0.129 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 9.80e-01 0.00299 0.119 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 6.31e-01 0.0582 0.121 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0116 0.0675 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 8.42e-01 0.0202 0.101 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 6.03e-01 0.0524 0.101 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0892 0.0919 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0959 0.115 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0311 0.0457 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 8.02e-01 0.0254 0.101 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0597 0.123 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0256 0.112 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 8.01e-01 0.0285 0.113 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0423 0.0527 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 7.11e-01 0.0387 0.104 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 2.44e-01 0.121 0.104 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 1.70e-01 0.138 0.1 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00248 0.113 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0147 0.0615 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 1.66e-01 -0.141 0.102 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 7.92e-01 0.0369 0.14 0.148 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 964736 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0501 0.119 0.148 PB L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 1.01e-01 -0.163 0.0985 0.148 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 8.89e-01 -0.017 0.122 0.148 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 4.61e-02 -0.137 0.0679 0.148 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 8.13e-01 0.0264 0.112 0.148 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0206 0.13 0.148 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 9.88e-01 0.00171 0.116 0.15 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 1.54e-01 0.148 0.103 0.15 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00686 0.111 0.15 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 8.33e-01 -0.00889 0.042 0.15 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 7.48e-01 0.0271 0.0842 0.15 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 6.65e-02 0.199 0.108 0.15 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 9.62e-01 0.00567 0.119 0.15 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 9.39e-02 0.187 0.111 0.15 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 4.94e-01 0.0645 0.0941 0.15 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0214 0.0417 0.15 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 3.33e-01 0.0851 0.0876 0.15 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 2.56e-01 0.134 0.117 0.15 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 2.79e-01 0.133 0.123 0.151 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 4.43e-01 -0.074 0.0964 0.151 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 631446 sc-eQTL 9.18e-01 0.00991 0.0959 0.151 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 652156 sc-eQTL 5.70e-01 0.0642 0.113 0.151 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 4.85e-01 0.0768 0.11 0.151 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 4.96e-01 -0.037 0.0542 0.151 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 7.52e-01 0.0289 0.0913 0.151 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 8.62e-02 0.184 0.107 0.151 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 263083 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0161 0.0858 0.151 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -930090 sc-eQTL 5.31e-01 0.0663 0.106 0.151 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 3.73e-01 0.0876 0.0981 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0537 0.0745 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 631446 sc-eQTL 6.74e-01 0.0444 0.105 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 652156 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0642 0.106 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 5.29e-01 0.0536 0.085 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 9.51e-01 0.0029 0.0472 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0123 0.0705 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00441 0.0911 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -930090 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0235 0.0949 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 5.69e-01 0.0637 0.112 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 1.00e+00 -3.15e-05 0.0807 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 631446 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0357 0.101 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 652156 sc-eQTL 4.28e-01 0.0867 0.109 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0135 0.0717 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 8.01e-01 -0.013 0.0516 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 8.06e-01 0.0145 0.059 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 2.00e-01 -0.122 0.0952 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -930090 sc-eQTL 1.56e-01 -0.132 0.093 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 4.55e-01 -0.115 0.154 0.142 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 3.95e-01 0.113 0.132 0.142 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0432 0.147 0.142 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 3.29e-01 0.0546 0.0558 0.142 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 1.29e-01 0.16 0.105 0.142 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0896 0.144 0.142 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 6.38e-01 0.0526 0.112 0.149 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 3.43e-01 -0.101 0.107 0.149 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 631446 sc-eQTL 8.04e-01 0.0267 0.108 0.149 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 652156 sc-eQTL 3.98e-01 0.0902 0.106 0.149 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 9.64e-02 0.18 0.108 0.149 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0313 0.0471 0.149 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0901 0.079 0.149 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00236 0.115 0.149 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -930090 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0534 0.11 0.149 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 2.58e-01 0.132 0.116 0.149 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0943 0.0787 0.149 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 631446 sc-eQTL 9.30e-01 0.00976 0.111 0.149 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 652156 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0779 0.111 0.149 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 3.23e-01 0.105 0.106 0.149 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0354 0.0533 0.149 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 8.22e-01 0.017 0.0755 0.149 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 1.42e-01 -0.138 0.0937 0.149 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -930090 sc-eQTL 5.47e-01 0.0601 0.0996 0.149 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0893 0.137 0.15 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0601 0.0915 0.15 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 631446 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0186 0.0922 0.15 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 652156 sc-eQTL 9.29e-02 0.157 0.093 0.15 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 3.69e-01 0.1 0.111 0.15 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0784 0.0767 0.15 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 4.28e-01 0.062 0.0781 0.15 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 2.10e-01 -0.143 0.113 0.15 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 263083 sc-eQTL 9.80e-01 0.00279 0.109 0.15 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -930090 sc-eQTL 3.63e-01 0.088 0.0964 0.15 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 2.93e-01 0.124 0.118 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 964736 sc-eQTL 3.92e-01 0.0983 0.115 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 1.78e-01 0.0876 0.0648 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 8.39e-02 0.177 0.102 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00408 0.0586 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 1.82e-01 0.122 0.0913 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 3.84e-01 0.0937 0.107 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0166 0.111 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 964736 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0405 0.122 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 8.85e-01 0.00723 0.0502 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0521 0.0973 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 6.21e-02 0.11 0.0585 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 1.94e-01 0.118 0.0909 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 1.94e-01 0.144 0.111 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 3.02e-01 0.0922 0.0891 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0216 0.0621 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 631446 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0135 0.101 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 652156 sc-eQTL 8.78e-01 0.0162 0.106 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 9.43e-01 0.00501 0.0698 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 8.90e-01 -0.00663 0.0479 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0037 0.0652 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0465 0.0851 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -930090 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0748 0.0892 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 4.75e-01 0.0818 0.114 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 1.74e-01 -0.102 0.0751 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 631446 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0728 0.111 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 652156 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0904 0.11 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 1.23e-01 0.16 0.103 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 8.78e-01 -0.00679 0.044 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0185 0.0666 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 552872 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0642 0.107 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -930090 sc-eQTL 7.41e-01 0.032 0.0966 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -585959 sc-eQTL 1.87e-01 0.122 0.092 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 853013 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0261 0.0868 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 602752 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0222 0.11 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 551642 sc-eQTL 1.36e-01 -0.0667 0.0446 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -951901 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0198 0.0926 0.151 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 631446 eQTL 0.0255 0.0452 0.0202 0.0 0.0 0.159

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 631446 3.62e-07 1.76e-07 6.57e-08 2.31e-07 1.08e-07 8.4e-08 2.63e-07 7.56e-08 1.98e-07 1.11e-07 2.07e-07 1.72e-07 2.45e-07 8.55e-08 6.53e-08 1.1e-07 6.17e-08 2.33e-07 7.53e-08 6.16e-08 1.39e-07 1.98e-07 1.81e-07 3.27e-08 2.36e-07 1.76e-07 1.29e-07 1.36e-07 1.44e-07 1.38e-07 1.35e-07 5.01e-08 4.34e-08 1.03e-07 5.65e-08 4.77e-08 6.04e-08 8.17e-08 6.29e-08 7.92e-08 5.1e-08 1.63e-07 3.02e-08 1.22e-08 3.34e-08 6.68e-09 7.26e-08 2.16e-09 4.54e-08
ENSG00000118515 \N -951901 2.67e-07 1.3e-07 5.14e-08 1.82e-07 9.24e-08 9.76e-08 1.53e-07 5.43e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.55e-07 1.01e-07 1.45e-07 7.13e-08 5.91e-08 7.49e-08 4.09e-08 1.33e-07 5.97e-08 4.1e-08 1.21e-07 1.24e-07 1.45e-07 3.03e-08 1.46e-07 1.25e-07 1.07e-07 9.61e-08 1.16e-07 1.02e-07 9.92e-08 3.66e-08 3.66e-08 8.11e-08 7.51e-08 3.04e-08 5.04e-08 9.23e-08 6.54e-08 3.92e-08 5.13e-08 1.33e-07 5.22e-08 3.16e-08 5.15e-08 1.83e-08 1.22e-07 3.81e-09 5.02e-08