logo

Genes within 1Mb (chr6:133361079:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0311 0.18 0.062 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 959604 sc-eQTL 7.55e-01 0.0595 0.19 0.062 B L1
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 3.87e-01 0.0621 0.0716 0.062 B L1
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 4.37e-01 0.105 0.135 0.062 B L1
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0465 0.0815 0.062 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 1.79e-01 -0.169 0.125 0.062 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 2.00e-01 0.219 0.171 0.062 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0827 0.131 0.062 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00918 0.136 0.062 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0209 0.118 0.062 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0236 0.0802 0.062 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 1.82e-01 0.144 0.107 0.062 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 1.59e-01 0.228 0.162 0.062 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 4.51e-01 0.0994 0.132 0.062 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0237 0.137 0.062 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 7.85e-01 0.0438 0.16 0.062 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0346 0.0548 0.062 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 8.37e-01 0.0174 0.0845 0.062 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 6.15e-01 0.0836 0.166 0.062 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 9.09e-02 0.337 0.198 0.063 DC L1
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 3.25e-01 -0.122 0.124 0.063 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 626314 sc-eQTL 3.78e-01 0.136 0.153 0.063 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 647024 sc-eQTL 1.60e-01 0.233 0.165 0.063 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 9.76e-01 0.00532 0.178 0.063 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0144 0.0996 0.063 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0903 0.115 0.063 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 3.98e-01 0.133 0.157 0.063 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 257951 sc-eQTL 9.74e-02 0.237 0.142 0.063 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -935222 sc-eQTL 3.46e-01 -0.169 0.178 0.063 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 2.05e-01 0.174 0.137 0.062 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0227 0.0921 0.062 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 626314 sc-eQTL 7.35e-01 0.0535 0.158 0.062 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 647024 sc-eQTL 3.26e-01 0.167 0.17 0.062 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0247 0.12 0.062 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0246 0.072 0.062 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0595 0.102 0.062 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 8.36e-01 0.0294 0.142 0.062 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -935222 sc-eQTL 4.39e-01 -0.108 0.14 0.062 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 7.03e-01 0.0581 0.152 0.062 NK L1
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 8.15e-01 0.0329 0.141 0.062 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 4.39e-01 0.135 0.175 0.062 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0543 0.0723 0.062 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0556 0.134 0.062 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0555 0.18 0.062 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 2.43e-02 0.318 0.14 0.062 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 6.48e-01 0.0784 0.172 0.062 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 4.24e-02 -0.138 0.0674 0.062 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0207 0.125 0.062 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 5.79e-01 0.103 0.186 0.062 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0399 0.207 0.066 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 959604 sc-eQTL 1.46e-01 0.275 0.188 0.066 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0185 0.177 0.066 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 4.52e-02 0.376 0.187 0.066 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0158 0.101 0.066 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0849 0.18 0.066 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 7.96e-01 0.046 0.177 0.066 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 9.58e-01 0.0106 0.203 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 959604 sc-eQTL 1.34e-01 0.267 0.178 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 3.69e-01 0.105 0.117 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0469 0.176 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00802 0.108 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 7.16e-01 0.0679 0.186 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 1.81e-01 0.259 0.193 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 1.28e-02 -0.476 0.19 0.062 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 959604 sc-eQTL 4.25e-01 0.142 0.177 0.062 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 5.28e-01 0.0879 0.139 0.062 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 3.29e-01 0.178 0.182 0.062 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 7.79e-01 0.0247 0.0878 0.062 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0754 0.161 0.062 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 5.92e-01 0.0982 0.183 0.062 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 6.78e-01 0.0742 0.179 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 959604 sc-eQTL 6.51e-01 0.089 0.196 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 9.24e-01 0.00819 0.0858 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 5.94e-01 -0.089 0.167 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 7.32e-01 0.0325 0.0949 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 4.51e-01 0.112 0.148 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 2.90e-01 0.194 0.183 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 7.20e-01 0.0684 0.191 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 959604 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0436 0.186 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0236 0.101 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 2.63e-01 0.208 0.185 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 4.92e-01 0.0677 0.0984 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 4.71e-01 -0.125 0.174 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 4.12e-01 0.154 0.188 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 4.85e-01 0.135 0.193 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 9.58e-01 0.0101 0.192 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 3.63e-01 0.177 0.194 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 6.31e-02 0.166 0.0889 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 4.72e-01 -0.112 0.155 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 3.95e-02 0.371 0.179 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 9.52e-02 -0.25 0.149 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 6.44e-01 -0.068 0.147 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 4.79e-01 0.0964 0.136 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 7.87e-01 -0.024 0.0883 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 1.89e-01 0.142 0.108 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 7.92e-01 0.0448 0.17 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 6.48e-01 0.0737 0.161 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 7.79e-01 0.0456 0.162 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 6.65e-02 -0.293 0.159 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0209 0.083 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 3.33e-01 0.112 0.116 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 7.19e-03 0.513 0.189 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 5.31e-01 0.119 0.19 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 4.00e-01 -0.16 0.19 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 4.72e-01 0.132 0.183 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00806 0.0749 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 4.13e-01 -0.105 0.129 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 5.68e-01 0.107 0.186 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 2.02e-01 0.217 0.17 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0984 0.159 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 2.01e-01 0.231 0.18 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0247 0.0968 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0124 0.164 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0662 0.188 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 3.23e-01 0.173 0.175 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 2.30e-01 0.224 0.186 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 1.36e-02 -0.395 0.159 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 2.25e-01 -0.112 0.0919 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 5.36e-01 0.0717 0.116 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 9.74e-03 0.475 0.182 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 6.06e-01 -0.106 0.205 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 8.97e-01 0.0245 0.19 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 9.24e-01 0.0181 0.188 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0356 0.0918 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 3.18e-01 0.152 0.152 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 7.81e-01 0.0561 0.201 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 6.96e-01 -0.073 0.186 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0326 0.204 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 2.73e-01 0.222 0.202 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 3.99e-01 0.0919 0.109 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 5.57e-01 -0.105 0.178 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 4.39e-01 0.16 0.206 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 8.05e-01 0.0469 0.19 0.061 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 2.01e-02 0.417 0.178 0.061 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 6.13e-01 0.0929 0.183 0.061 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0872 0.09 0.061 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 1.79e-01 0.171 0.126 0.061 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 4.57e-01 0.141 0.189 0.061 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 4.58e-02 -0.402 0.2 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 7.38e-01 0.0626 0.187 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 8.06e-01 0.0468 0.19 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 3.11e-01 0.107 0.106 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 4.98e-01 0.107 0.158 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 5.25e-01 0.104 0.163 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 3.87e-01 -0.13 0.149 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 4.03e-01 -0.157 0.187 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 9.70e-01 -0.0028 0.0743 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 9.79e-01 0.00439 0.165 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 7.57e-01 0.0616 0.199 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0474 0.181 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 2.37e-01 0.217 0.183 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00249 0.0855 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 4.44e-01 0.129 0.169 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 7.93e-01 -0.044 0.168 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 2.10e-01 0.203 0.162 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 5.61e-01 0.106 0.182 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 8.08e-01 0.0241 0.099 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0584 0.165 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 4.19e-01 0.211 0.26 0.052 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 959604 sc-eQTL 7.93e-01 0.0583 0.222 0.052 PB L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 1.47e-01 -0.268 0.184 0.052 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 5.52e-01 -0.135 0.226 0.052 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 8.10e-01 -0.031 0.129 0.052 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 3.58e-01 -0.191 0.207 0.052 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 4.49e-01 -0.183 0.241 0.052 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 5.92e-01 0.103 0.192 0.061 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 6.49e-01 0.0782 0.172 0.061 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 1.45e-01 0.268 0.183 0.061 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0153 0.0697 0.061 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0649 0.14 0.061 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 4.00e-01 0.152 0.18 0.061 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 9.46e-01 0.013 0.192 0.062 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 6.73e-01 0.0767 0.181 0.062 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 6.01e-02 0.286 0.151 0.062 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0831 0.0673 0.062 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 8.33e-01 0.03 0.142 0.062 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 3.45e-01 0.18 0.19 0.062 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 2.34e-01 0.242 0.202 0.061 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 3.33e-01 -0.154 0.159 0.061 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 626314 sc-eQTL 3.20e-01 0.157 0.158 0.061 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 647024 sc-eQTL 1.43e-01 0.273 0.185 0.061 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 6.22e-01 0.0895 0.181 0.061 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0148 0.0895 0.061 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0791 0.151 0.061 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 1.88e-01 0.233 0.177 0.061 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 257951 sc-eQTL 2.10e-01 0.178 0.141 0.061 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -935222 sc-eQTL 4.27e-01 -0.138 0.174 0.061 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 7.06e-01 0.06 0.159 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0355 0.12 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 626314 sc-eQTL 7.24e-01 0.0603 0.17 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 647024 sc-eQTL 8.17e-01 0.0398 0.172 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 8.28e-01 0.0298 0.137 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0313 0.0763 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0692 0.114 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 9.25e-01 0.0138 0.147 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -935222 sc-eQTL 3.71e-01 -0.137 0.153 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 9.90e-01 0.00219 0.181 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 9.03e-01 -0.016 0.131 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 626314 sc-eQTL 4.18e-01 0.132 0.163 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 647024 sc-eQTL 1.20e-01 0.275 0.176 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0415 0.116 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00783 0.0836 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0645 0.0955 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 4.66e-01 0.113 0.155 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -935222 sc-eQTL 1.95e-01 -0.196 0.151 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 4.36e-01 -0.199 0.254 0.055 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 6.27e-02 0.406 0.216 0.055 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 4.32e-01 -0.191 0.242 0.055 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 5.04e-01 0.0618 0.0922 0.055 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 2.93e-01 0.183 0.174 0.055 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 3.66e-01 -0.216 0.238 0.055 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 2.32e-01 0.217 0.181 0.062 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 2.60e-01 -0.196 0.173 0.062 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 626314 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0305 0.176 0.062 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 647024 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0199 0.174 0.062 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 7.75e-01 0.0504 0.176 0.062 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 7.99e-01 0.0196 0.0768 0.062 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 2.68e-02 -0.284 0.127 0.062 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 5.41e-01 0.114 0.187 0.062 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -935222 sc-eQTL 8.44e-01 0.0351 0.179 0.062 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 8.35e-02 0.33 0.189 0.063 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0767 0.129 0.063 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 626314 sc-eQTL 3.88e-01 0.157 0.182 0.063 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 647024 sc-eQTL 5.45e-01 -0.109 0.181 0.063 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 2.29e-01 0.209 0.173 0.063 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 7.73e-01 0.0252 0.0872 0.063 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 7.38e-01 0.0413 0.123 0.063 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 1.74e-01 -0.209 0.153 0.063 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -935222 sc-eQTL 7.93e-01 0.0427 0.163 0.063 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 6.43e-01 0.109 0.235 0.056 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 3.49e-01 -0.146 0.156 0.056 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 626314 sc-eQTL 6.70e-01 0.0671 0.157 0.056 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 647024 sc-eQTL 7.17e-03 0.426 0.156 0.056 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 4.66e-01 0.139 0.19 0.056 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 2.19e-01 -0.161 0.131 0.056 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 5.92e-01 0.0717 0.133 0.056 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 2.62e-01 -0.218 0.194 0.056 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 257951 sc-eQTL 2.23e-01 0.227 0.185 0.056 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -935222 sc-eQTL 3.67e-01 0.149 0.165 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0521 0.193 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 959604 sc-eQTL 1.20e-01 0.292 0.187 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 1.63e-01 0.148 0.106 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 6.14e-01 0.0851 0.168 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0466 0.0959 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0752 0.15 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 1.77e-01 0.238 0.175 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 5.00e-01 0.121 0.18 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 959604 sc-eQTL 8.28e-01 0.043 0.198 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 8.33e-01 0.0171 0.0811 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 6.40e-01 0.0738 0.157 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 4.35e-01 0.0744 0.0952 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 9.69e-01 0.00576 0.148 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 2.76e-01 0.196 0.179 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 9.41e-01 0.0106 0.143 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0134 0.0998 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 626314 sc-eQTL 7.53e-01 0.0511 0.163 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 647024 sc-eQTL 2.51e-01 0.195 0.169 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0181 0.112 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0348 0.0769 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0853 0.105 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 6.48e-01 0.0624 0.137 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -935222 sc-eQTL 1.80e-01 -0.192 0.143 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 5.75e-02 0.35 0.183 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 2.83e-01 -0.131 0.121 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 626314 sc-eQTL 9.78e-01 0.00495 0.179 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 647024 sc-eQTL 4.36e-01 -0.138 0.177 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 2.78e-01 0.181 0.167 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 4.94e-01 0.0486 0.0709 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0587 0.107 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 547740 sc-eQTL 8.80e-01 0.0262 0.172 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -935222 sc-eQTL 6.02e-01 0.0815 0.156 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -591091 sc-eQTL 5.61e-01 0.0872 0.15 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 847881 sc-eQTL 8.44e-01 0.0277 0.141 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 597620 sc-eQTL 5.02e-01 0.12 0.178 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 546510 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0441 0.0727 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -957033 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0436 0.15 0.062 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 847881 eQTL 0.0158 0.0821 0.034 0.0 0.0 0.0584
ENSG00000093134 VNN3 626314 eQTL 0.0457 0.0625 0.0313 0.0 0.0 0.0584
ENSG00000112299 VNN1 647024 eQTL 0.0375 0.0969 0.0465 0.0 0.0 0.0584

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118515 \N -957033 2.67e-07 1.3e-07 3.71e-08 1.82e-07 8.83e-08 9.61e-08 1.49e-07 5.19e-08 1.44e-07 4.57e-08 1.62e-07 9e-08 1.41e-07 6.56e-08 6.02e-08 7.37e-08 3.9e-08 1.21e-07 5.21e-08 4.21e-08 1.05e-07 1.23e-07 1.34e-07 4.16e-08 1.37e-07 1.14e-07 1.06e-07 9.36e-08 1.08e-07 1.12e-07 9.92e-08 3.96e-08 3.26e-08 8.65e-08 7.66e-08 3.93e-08 4.89e-08 9.65e-08 7.47e-08 3.77e-08 3.57e-08 1.33e-07 4.14e-08 2.02e-08 4.7e-08 1.83e-08 1.26e-07 3.95e-09 4.79e-08