logo

Genes within 1Mb (chr6:133356202:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 6.38e-01 0.05 0.106 0.252 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 954727 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0221 0.112 0.252 B L1
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 8.42e-01 -0.00846 0.0423 0.252 B L1
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 6.84e-01 0.0324 0.0795 0.252 B L1
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0386 0.048 0.252 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 4.19e-01 0.0599 0.074 0.252 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0161 0.101 0.252 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0742 0.079 0.252 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0351 0.0823 0.252 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 8.62e-01 0.0124 0.0713 0.252 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 3.12e-01 -0.049 0.0483 0.252 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 6.20e-01 0.0323 0.0651 0.252 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 3.39e-01 0.0937 0.0978 0.252 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0478 0.078 0.252 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 1.80e-01 0.109 0.0811 0.252 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0296 0.0951 0.252 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 8.83e-01 0.00477 0.0325 0.252 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0152 0.0501 0.252 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 7.85e-01 0.0269 0.0983 0.252 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 8.13e-01 0.0286 0.12 0.257 DC L1
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00937 0.0749 0.257 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 621437 sc-eQTL 6.31e-01 0.0447 0.0928 0.257 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 642147 sc-eQTL 2.71e-01 0.11 0.0999 0.257 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 8.72e-01 0.0174 0.107 0.257 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0289 0.0601 0.257 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 2.87e-02 0.152 0.0689 0.257 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 9.70e-01 0.00359 0.0952 0.257 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 253074 sc-eQTL 3.29e-01 0.0845 0.0864 0.257 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -940099 sc-eQTL 7.17e-01 0.0392 0.108 0.257 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00247 0.0828 0.252 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 2.88e-02 -0.121 0.0547 0.252 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 621437 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00411 0.095 0.252 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 642147 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0563 0.102 0.252 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 1.54e-02 0.174 0.0712 0.252 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0406 0.0432 0.252 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 5.82e-01 0.0337 0.061 0.252 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 9.23e-01 0.0083 0.0856 0.252 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -940099 sc-eQTL 1.14e-01 0.133 0.0836 0.252 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0382 0.0905 0.253 NK L1
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0602 0.0837 0.253 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0532 0.104 0.253 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 7.15e-01 0.0157 0.0431 0.253 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 6.67e-01 0.0344 0.0797 0.253 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 5.12e-01 0.0703 0.107 0.252 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 6.53e-01 0.038 0.0842 0.252 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0326 0.102 0.252 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0227 0.0404 0.252 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 5.40e-01 0.0456 0.0743 0.252 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0234 0.111 0.252 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 9.50e-01 0.00789 0.127 0.253 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 954727 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0924 0.116 0.253 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 5.20e-01 0.0699 0.108 0.253 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0211 0.115 0.253 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 9.57e-01 0.00333 0.0619 0.253 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 7.13e-01 0.0406 0.11 0.253 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0585 0.108 0.253 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 1.36e-01 -0.176 0.118 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 954727 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0714 0.104 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0101 0.0679 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 8.87e-01 0.0145 0.102 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0564 0.0625 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 1.97e-01 -0.139 0.108 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 5.45e-01 0.0683 0.113 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 6.12e-01 0.0578 0.114 0.252 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 954727 sc-eQTL 3.79e-01 0.0924 0.105 0.252 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0606 0.0822 0.252 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 6.57e-01 0.0478 0.108 0.252 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 9.86e-01 -0.000908 0.0519 0.252 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 2.59e-01 -0.107 0.0948 0.252 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 2.49e-02 -0.242 0.107 0.252 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 9.72e-01 0.00374 0.105 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 954727 sc-eQTL 9.87e-01 0.00185 0.116 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0164 0.0506 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0436 0.0983 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 6.42e-01 -0.026 0.056 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 2.64e-01 0.0978 0.0874 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0154 0.108 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 2.77e-02 0.246 0.111 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 954727 sc-eQTL 1.65e-01 0.152 0.109 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0127 0.0597 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 6.61e-01 0.0481 0.109 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0408 0.0579 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 7.20e-01 0.0367 0.102 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 3.54e-01 0.103 0.11 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 6.09e-01 0.0575 0.112 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0138 0.112 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0546 0.113 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0161 0.052 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 7.64e-02 -0.159 0.0895 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 2.84e-01 0.112 0.105 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 3.17e-01 0.0912 0.0909 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 8.51e-01 0.0168 0.0893 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 6.99e-01 0.032 0.0827 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0464 0.0536 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 6.85e-01 0.0267 0.0657 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 1.74e-01 0.14 0.103 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 1.22e-01 -0.15 0.0967 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 2.53e-01 -0.112 0.0976 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 8.52e-01 0.018 0.0965 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00558 0.05 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 2.48e-01 0.0808 0.0698 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 6.17e-01 -0.058 0.116 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 8.32e-02 -0.202 0.116 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 4.73e-02 0.231 0.116 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 3.18e-01 -0.112 0.112 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0393 0.046 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00613 0.0791 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 2.15e-01 -0.142 0.114 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 8.25e-01 0.0221 0.0999 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 2.31e-01 0.112 0.0931 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0706 0.106 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 4.85e-01 0.0397 0.0567 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 6.84e-01 0.039 0.0959 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 3.06e-01 0.113 0.11 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 4.84e-01 -0.074 0.106 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 4.88e-01 0.0782 0.112 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 5.94e-01 0.0518 0.0971 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0465 0.0555 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 6.52e-01 0.0315 0.0697 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 6.41e-01 0.0521 0.112 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 3.19e-01 0.12 0.12 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 1.73e-01 -0.152 0.111 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 4.28e-01 0.0877 0.111 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 1.36e-01 -0.0804 0.0537 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 4.13e-01 0.0732 0.0892 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 1.04e-01 0.192 0.117 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 5.26e-02 -0.211 0.108 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 3.59e-01 -0.109 0.119 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0629 0.119 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 7.52e-01 0.0202 0.0638 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 4.13e-01 0.0857 0.104 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 1.03e-01 -0.196 0.12 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 1.46e-01 0.167 0.114 0.249 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0275 0.109 0.249 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 2.70e-01 0.122 0.111 0.249 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 5.46e-01 -0.033 0.0545 0.249 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 7.95e-01 -0.02 0.0768 0.249 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 6.41e-01 0.0534 0.114 0.249 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0741 0.119 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 3.18e-01 0.11 0.11 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 2.73e-01 0.123 0.112 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 7.10e-01 0.0233 0.0625 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0501 0.0934 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 6.19e-01 0.0484 0.0973 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0432 0.0891 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 2.77e-01 -0.121 0.111 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 3.92e-01 0.0379 0.0442 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 8.32e-01 0.0208 0.098 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 9.60e-01 0.00607 0.12 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0672 0.109 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00264 0.111 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 4.91e-01 0.0355 0.0514 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 8.86e-01 0.0146 0.102 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0434 0.101 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 8.90e-01 0.0136 0.0975 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0913 0.109 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 7.25e-01 -0.021 0.0595 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 5.75e-02 0.188 0.0982 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 8.18e-01 0.032 0.139 0.248 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 954727 sc-eQTL 8.52e-01 0.0222 0.119 0.248 PB L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0546 0.099 0.248 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0667 0.121 0.248 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00933 0.0687 0.248 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0348 0.111 0.248 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0594 0.129 0.248 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 1.80e-01 -0.151 0.112 0.248 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 6.72e-01 0.0427 0.101 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0403 0.108 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 6.98e-01 0.0159 0.0408 0.248 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 8.64e-01 0.014 0.0819 0.248 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0825 0.106 0.248 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 3.73e-01 -0.104 0.116 0.252 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00628 0.11 0.252 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 4.79e-01 0.0653 0.0922 0.252 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0266 0.0408 0.252 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0604 0.0859 0.252 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 1.40e-01 -0.17 0.115 0.252 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 2.79e-01 0.135 0.125 0.261 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 8.59e-01 0.0175 0.0981 0.261 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 621437 sc-eQTL 3.14e-01 0.0981 0.0971 0.261 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 642147 sc-eQTL 5.90e-01 0.0618 0.114 0.261 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 6.74e-01 -0.047 0.112 0.261 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 6.86e-01 0.0223 0.0551 0.261 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 6.39e-02 0.171 0.092 0.261 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 5.05e-01 0.0728 0.109 0.261 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 253074 sc-eQTL 4.21e-01 0.0702 0.0871 0.261 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -940099 sc-eQTL 5.55e-01 0.0634 0.107 0.261 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 4.93e-01 0.0646 0.0942 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 6.57e-02 -0.131 0.071 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 621437 sc-eQTL 9.78e-01 0.00274 0.101 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 642147 sc-eQTL 9.94e-01 0.000774 0.102 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 1.75e-01 0.111 0.0812 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0146 0.0453 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 2.35e-01 0.0802 0.0673 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 4.41e-01 0.0673 0.0872 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -940099 sc-eQTL 5.53e-02 0.174 0.0902 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0147 0.107 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 1.23e-01 -0.119 0.0767 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 621437 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0745 0.0962 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 642147 sc-eQTL 2.23e-01 -0.127 0.104 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 2.20e-02 0.156 0.0677 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0344 0.0493 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 5.41e-01 0.0345 0.0564 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 9.83e-01 0.00193 0.0913 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -940099 sc-eQTL 6.58e-02 0.164 0.0886 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 5.51e-01 0.0877 0.147 0.248 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 7.70e-01 -0.037 0.126 0.248 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0819 0.14 0.248 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 6.24e-01 0.0261 0.0532 0.248 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 9.88e-01 0.00156 0.1 0.248 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0993 0.137 0.248 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 3.27e-01 0.106 0.108 0.26 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 2.96e-02 -0.224 0.102 0.26 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 621437 sc-eQTL 5.95e-01 0.0555 0.104 0.26 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 642147 sc-eQTL 2.84e-02 -0.225 0.102 0.26 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 4.52e-01 0.079 0.105 0.26 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 4.93e-01 0.0313 0.0456 0.26 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0151 0.0767 0.26 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 2.21e-01 0.136 0.111 0.26 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -940099 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0606 0.106 0.26 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 5.78e-02 -0.216 0.113 0.258 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 2.61e-01 0.0866 0.0768 0.258 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 621437 sc-eQTL 7.99e-03 0.286 0.107 0.258 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 642147 sc-eQTL 2.37e-01 0.128 0.108 0.258 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0238 0.104 0.258 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 9.75e-01 0.00161 0.0521 0.258 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 7.79e-01 0.0207 0.0737 0.258 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 7.43e-01 0.0301 0.092 0.258 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -940099 sc-eQTL 3.56e-01 0.0898 0.097 0.258 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 9.72e-01 0.00472 0.136 0.263 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0139 0.0903 0.263 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 621437 sc-eQTL 9.62e-01 0.00433 0.0909 0.263 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 642147 sc-eQTL 3.09e-01 0.0941 0.0922 0.263 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0223 0.11 0.263 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 4.54e-01 0.0569 0.0758 0.263 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 8.22e-02 0.134 0.0764 0.263 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0129 0.112 0.263 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 253074 sc-eQTL 3.77e-01 0.095 0.107 0.263 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -940099 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00253 0.0953 0.263 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0984 0.113 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 954727 sc-eQTL 8.27e-01 0.0241 0.11 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0617 0.0622 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0229 0.0987 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0192 0.0562 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0806 0.0877 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 9.93e-01 0.000917 0.103 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 1.57e-01 0.149 0.105 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 954727 sc-eQTL 8.07e-01 0.0282 0.116 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0196 0.0475 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 8.36e-01 0.0191 0.0922 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0278 0.0557 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 2.19e-01 0.106 0.086 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 7.53e-01 0.0331 0.105 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 5.95e-01 0.0455 0.0854 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 2.37e-02 -0.134 0.0587 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 621437 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0259 0.0969 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 642147 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0721 0.101 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 5.90e-02 0.126 0.0663 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 6.95e-01 -0.018 0.0458 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 2.88e-01 0.0663 0.0623 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 6.51e-01 0.0369 0.0815 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -940099 sc-eQTL 1.20e-02 0.214 0.0842 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0874 0.11 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0437 0.0727 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 621437 sc-eQTL 3.15e-02 0.229 0.106 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 642147 sc-eQTL 3.52e-01 0.0986 0.106 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 7.54e-01 0.0313 0.1 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0206 0.0424 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0074 0.0642 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 542863 sc-eQTL 4.65e-01 0.0754 0.103 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -940099 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0542 0.093 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -595968 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00152 0.0895 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 843004 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0735 0.0839 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 592743 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0816 0.106 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 541633 sc-eQTL 6.31e-01 0.0209 0.0434 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -961910 sc-eQTL 3.59e-01 0.0823 0.0896 0.254 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 843004 eQTL 0.0397 -0.0373 0.0181 0.0 0.0 0.253

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina