logo

Genes within 1Mb (chr6:133355332:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0188 0.11 0.205 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 953857 sc-eQTL 5.31e-01 0.0725 0.116 0.205 B L1
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 5.82e-01 0.0241 0.0436 0.205 B L1
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 7.23e-01 0.0291 0.0821 0.205 B L1
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 7.79e-01 0.014 0.0496 0.205 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0403 0.0765 0.205 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 9.95e-01 0.000623 0.104 0.205 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 3.80e-01 -0.071 0.0807 0.205 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0872 0.0839 0.205 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00578 0.0728 0.205 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0149 0.0495 0.205 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0163 0.0665 0.205 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 8.12e-01 0.0238 0.1 0.205 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 1.95e-01 -0.103 0.0796 0.205 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 5.06e-01 0.0555 0.0833 0.205 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0667 0.0972 0.205 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 3.01e-01 0.0344 0.0332 0.205 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0498 0.0512 0.205 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 7.04e-01 0.0383 0.101 0.205 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0174 0.123 0.207 DC L1
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0146 0.0764 0.207 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 620567 sc-eQTL 6.75e-01 0.0397 0.0947 0.207 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 641277 sc-eQTL 3.47e-01 0.0962 0.102 0.207 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0207 0.109 0.207 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0121 0.0613 0.207 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 3.69e-01 0.064 0.071 0.207 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0326 0.097 0.207 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 252204 sc-eQTL 5.54e-01 0.0523 0.0883 0.207 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -940969 sc-eQTL 8.74e-01 0.0174 0.11 0.207 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 8.65e-01 0.0144 0.0845 0.205 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 4.59e-02 -0.112 0.056 0.205 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 620567 sc-eQTL 7.78e-01 0.0273 0.097 0.205 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 641277 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0875 0.104 0.205 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 1.24e-01 0.113 0.0733 0.205 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 2.08e-01 -0.0555 0.044 0.205 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0222 0.0624 0.205 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 7.66e-01 -0.026 0.0874 0.205 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -940969 sc-eQTL 7.01e-01 0.0331 0.0858 0.205 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 6.34e-01 0.0439 0.0922 0.206 NK L1
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0602 0.0852 0.206 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0499 0.106 0.206 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 6.24e-01 0.0216 0.0439 0.206 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 5.78e-01 0.0452 0.0812 0.206 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 1.59e-01 0.154 0.109 0.205 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 3.28e-01 0.0841 0.0857 0.205 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0524 0.104 0.205 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0106 0.0412 0.205 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000551 0.0758 0.205 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 4.30e-01 -0.089 0.113 0.205 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 6.56e-01 0.0581 0.13 0.207 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 953857 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0117 0.119 0.207 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 2.93e-01 0.117 0.111 0.207 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 8.08e-01 0.029 0.119 0.207 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00363 0.0637 0.207 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 7.34e-01 0.0386 0.114 0.207 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0117 0.112 0.207 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 3.10e-01 -0.123 0.121 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 953857 sc-eQTL 3.01e-01 -0.11 0.106 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 9.42e-01 0.00505 0.0696 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 8.58e-01 0.0188 0.105 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 8.12e-01 0.0153 0.0642 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 5.92e-03 -0.303 0.109 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 2.56e-01 0.131 0.115 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0368 0.117 0.205 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 953857 sc-eQTL 6.72e-01 0.0458 0.108 0.205 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 5.89e-01 0.0458 0.0846 0.205 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 7.12e-01 0.0409 0.111 0.205 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 6.82e-01 0.0219 0.0534 0.205 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 1.19e-02 -0.245 0.0964 0.205 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 7.46e-03 -0.296 0.109 0.205 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0139 0.109 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 953857 sc-eQTL 5.12e-01 0.079 0.12 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 3.32e-01 0.051 0.0524 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0383 0.102 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 7.06e-01 0.022 0.0581 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 6.58e-01 0.0403 0.0909 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 8.18e-01 0.0259 0.112 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 3.92e-01 0.0992 0.116 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 953857 sc-eQTL 1.23e-01 0.174 0.112 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 9.20e-01 0.00615 0.0615 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 6.37e-01 0.0533 0.113 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00428 0.0598 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 8.06e-01 0.026 0.106 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 5.82e-01 0.0628 0.114 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 8.59e-01 0.0205 0.115 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0331 0.114 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0378 0.115 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 6.94e-01 0.021 0.0532 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 1.20e-01 -0.143 0.0918 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 2.53e-01 0.123 0.107 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 6.56e-01 0.0419 0.0938 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0247 0.092 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 7.35e-01 0.0289 0.0853 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0273 0.0553 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 6.26e-01 -0.033 0.0677 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 6.20e-01 0.0529 0.106 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0807 0.0989 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 1.01e-01 -0.163 0.0991 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 9.88e-01 0.00152 0.0983 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 5.99e-01 0.0268 0.0509 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 6.74e-01 0.03 0.0713 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 2.52e-01 -0.135 0.118 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 1.90e-01 -0.154 0.117 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 3.63e-01 0.107 0.118 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 2.00e-01 -0.145 0.113 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 6.36e-01 -0.022 0.0463 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 8.57e-01 0.0143 0.0796 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 3.68e-01 -0.104 0.115 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 8.55e-01 0.0187 0.102 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 2.00e-01 0.123 0.0953 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 2.52e-01 -0.125 0.108 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 5.15e-01 0.0379 0.0581 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 8.37e-01 0.0202 0.0983 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 5.64e-01 0.0651 0.113 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 2.19e-01 -0.133 0.108 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 9.69e-01 0.00452 0.115 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0363 0.0994 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 7.13e-01 0.021 0.0569 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00565 0.0714 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 2.87e-01 0.122 0.114 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0457 0.123 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 1.45e-01 -0.166 0.113 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 2.21e-01 0.138 0.113 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0511 0.0551 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00247 0.0914 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 1.13e-01 0.191 0.12 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 3.37e-02 -0.238 0.111 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 2.31e-01 -0.147 0.122 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0677 0.122 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 5.81e-01 0.0363 0.0656 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 9.35e-01 0.00872 0.108 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 2.84e-01 -0.133 0.124 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 9.00e-02 0.198 0.116 0.201 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 8.96e-01 0.0145 0.111 0.201 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 2.56e-01 0.129 0.113 0.201 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 8.86e-01 -0.008 0.0556 0.201 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 6.83e-01 -0.032 0.0783 0.201 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0617 0.117 0.201 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0569 0.121 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 6.17e-01 0.056 0.112 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 3.71e-01 0.102 0.113 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0331 0.0632 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0565 0.0945 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 1.25e-01 0.151 0.0981 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0827 0.0902 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0853 0.113 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 2.84e-01 0.048 0.0447 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 9.06e-01 0.0117 0.0993 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 8.96e-01 0.0159 0.122 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0633 0.111 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 9.77e-01 0.00319 0.112 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 6.98e-01 0.0203 0.0523 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0137 0.103 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 7.85e-01 0.028 0.102 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 5.72e-01 0.0561 0.099 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 3.68e-01 -0.1 0.111 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0117 0.0604 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 5.72e-02 0.191 0.0997 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 5.65e-01 0.0809 0.14 0.207 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 953857 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0396 0.12 0.207 PB L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0734 0.0998 0.207 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0818 0.122 0.207 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 9.07e-01 0.00809 0.0694 0.207 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0271 0.112 0.207 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 2.50e-01 -0.15 0.129 0.207 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 2.19e-01 -0.142 0.115 0.202 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 5.73e-01 0.0582 0.103 0.202 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0418 0.111 0.202 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000156 0.0419 0.202 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0487 0.0839 0.202 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0919 0.108 0.202 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 3.45e-01 -0.112 0.119 0.205 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 8.26e-01 0.0247 0.112 0.205 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 5.37e-01 0.0583 0.0942 0.205 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0268 0.0417 0.205 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0762 0.0878 0.205 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 1.35e-02 -0.289 0.116 0.205 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 4.52e-01 0.0978 0.13 0.21 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 4.25e-01 0.0813 0.102 0.21 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 620567 sc-eQTL 5.43e-01 0.0617 0.101 0.21 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 641277 sc-eQTL 6.42e-01 0.0555 0.119 0.21 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 3.16e-01 -0.116 0.116 0.21 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 2.65e-01 0.0638 0.057 0.21 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 7.11e-01 0.0358 0.0964 0.21 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 6.48e-01 0.0519 0.113 0.21 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 252204 sc-eQTL 7.97e-01 0.0233 0.0906 0.21 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -940969 sc-eQTL 6.49e-01 0.0508 0.111 0.21 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 2.08e-01 0.12 0.0952 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 4.88e-02 -0.142 0.0719 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 620567 sc-eQTL 5.29e-01 0.0646 0.102 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 641277 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0236 0.103 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 3.20e-01 0.0823 0.0825 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0263 0.0459 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 7.95e-01 0.0178 0.0685 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 4.03e-01 0.0741 0.0885 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -940969 sc-eQTL 4.34e-01 0.0723 0.0921 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0261 0.109 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 3.80e-01 -0.069 0.0785 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 620567 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0701 0.0981 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 641277 sc-eQTL 1.52e-01 -0.152 0.106 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 1.84e-01 0.0928 0.0696 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0352 0.0502 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 7.29e-01 0.02 0.0575 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0576 0.093 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -940969 sc-eQTL 4.24e-01 0.0728 0.0909 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 3.90e-01 0.129 0.15 0.197 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0634 0.129 0.197 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 4.65e-01 -0.105 0.143 0.197 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 4.09e-01 0.0451 0.0545 0.197 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 8.92e-01 0.0141 0.103 0.197 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 3.42e-01 -0.134 0.141 0.197 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 3.45e-01 0.104 0.11 0.211 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 6.99e-02 -0.19 0.104 0.211 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 620567 sc-eQTL 7.12e-01 0.0393 0.106 0.211 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 641277 sc-eQTL 9.02e-03 -0.273 0.103 0.211 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 3.54e-01 0.099 0.107 0.211 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 7.38e-01 0.0156 0.0465 0.211 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0625 0.078 0.211 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 8.04e-01 0.0281 0.113 0.211 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -940969 sc-eQTL 3.45e-01 -0.102 0.108 0.211 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 2.34e-02 -0.26 0.114 0.208 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 5.32e-01 0.0488 0.078 0.208 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 620567 sc-eQTL 1.96e-01 0.142 0.11 0.208 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 641277 sc-eQTL 4.87e-01 0.0761 0.109 0.208 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 2.48e-01 -0.122 0.105 0.208 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 4.30e-01 0.0417 0.0527 0.208 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 7.74e-01 0.0215 0.0746 0.208 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 5.75e-01 0.0523 0.0932 0.208 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -940969 sc-eQTL 1.24e-01 0.151 0.098 0.208 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0372 0.14 0.212 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00932 0.0933 0.212 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 620567 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00678 0.094 0.212 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 641277 sc-eQTL 7.32e-01 0.0328 0.0956 0.212 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 7.43e-01 0.0374 0.114 0.212 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 7.32e-01 0.0269 0.0784 0.212 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 1.71e-01 0.109 0.0792 0.212 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0939 0.116 0.212 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 252204 sc-eQTL 2.63e-01 0.124 0.111 0.212 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -940969 sc-eQTL 6.10e-01 0.0503 0.0984 0.212 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 3.65e-01 -0.106 0.116 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 953857 sc-eQTL 5.62e-01 0.0657 0.113 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 8.09e-01 0.0155 0.0641 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0229 0.101 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 5.32e-01 0.0361 0.0577 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 2.04e-02 -0.208 0.0891 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0083 0.106 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 7.16e-01 0.04 0.11 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 953857 sc-eQTL 3.70e-01 0.108 0.12 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 5.39e-01 0.0304 0.0494 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 8.23e-01 0.0215 0.096 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 8.23e-01 0.013 0.0581 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 7.32e-01 0.0309 0.0899 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 7.92e-01 0.029 0.11 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 3.56e-01 0.0804 0.0868 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 4.62e-02 -0.12 0.0599 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 620567 sc-eQTL 8.69e-01 0.0163 0.0986 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 641277 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0933 0.103 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 2.65e-01 0.0757 0.0678 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0329 0.0466 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 7.68e-01 0.0188 0.0635 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 8.23e-01 0.0186 0.083 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -940969 sc-eQTL 2.35e-01 0.103 0.0867 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 3.42e-01 -0.107 0.112 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0463 0.0741 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 620567 sc-eQTL 2.10e-01 0.137 0.109 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 641277 sc-eQTL 6.35e-01 0.0514 0.108 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0238 0.102 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00478 0.0433 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0404 0.0654 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 541993 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0144 0.105 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -940969 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0787 0.0948 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -596838 sc-eQTL 3.08e-01 0.093 0.0909 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 842134 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0523 0.0856 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 591873 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0774 0.108 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 540763 sc-eQTL 4.15e-01 0.0361 0.0442 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -962780 sc-eQTL 2.45e-01 0.106 0.0911 0.207 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 842134 pQTL 0.482 -0.0196 0.0279 0.00114 0.0 0.211
ENSG00000079950 STX7 842134 eQTL 0.0125 -0.0477 0.0191 0.0 0.0 0.215
ENSG00000112299 VNN1 641277 pQTL 0.0446 -0.0865 0.043 0.0 0.0 0.211

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina