logo

Genes within 1Mb (chr6:133350652:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 9.10e-01 0.0127 0.111 0.147 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 949177 sc-eQTL 5.74e-01 0.0661 0.117 0.147 B L1
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 4.69e-01 0.0322 0.0443 0.147 B L1
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 6.56e-01 0.0372 0.0833 0.147 B L1
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 6.80e-01 0.0208 0.0504 0.147 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 6.80e-01 0.0321 0.0777 0.147 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 3.01e-02 0.229 0.105 0.147 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 8.05e-01 0.0201 0.0812 0.147 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 3.46e-01 0.0795 0.0842 0.147 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 4.24e-01 0.0585 0.073 0.147 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 8.15e-01 0.0117 0.0497 0.147 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 1.05e-01 0.108 0.0664 0.147 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 8.03e-02 0.175 0.0998 0.147 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 4.72e-01 0.0575 0.0799 0.147 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0217 0.0835 0.147 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0774 0.0973 0.147 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0115 0.0333 0.147 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 5.56e-01 0.0302 0.0513 0.147 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 5.44e-01 0.0612 0.101 0.147 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 2.68e-01 0.134 0.121 0.151 DC L1
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00693 0.0754 0.151 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 615887 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0214 0.0935 0.151 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 636597 sc-eQTL 4.09e-01 0.0834 0.101 0.151 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 5.93e-02 0.203 0.107 0.151 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0141 0.0606 0.151 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 8.38e-01 0.0144 0.0703 0.151 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 6.54e-01 0.043 0.0958 0.151 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 247524 sc-eQTL 6.19e-01 0.0434 0.0872 0.151 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -945649 sc-eQTL 7.91e-01 0.0289 0.109 0.151 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 1.26e-01 0.131 0.0856 0.147 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00404 0.0576 0.147 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 615887 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00619 0.0988 0.147 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 636597 sc-eQTL 9.03e-01 -0.013 0.106 0.147 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0288 0.075 0.147 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00208 0.045 0.147 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 8.50e-01 -0.012 0.0635 0.147 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0488 0.0889 0.147 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -945649 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0614 0.0873 0.147 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 5.07e-01 0.0626 0.094 0.148 NK L1
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 6.38e-01 -0.041 0.087 0.148 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 8.65e-01 0.0185 0.108 0.148 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0394 0.0448 0.148 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0443 0.0828 0.148 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 8.26e-02 -0.189 0.108 0.147 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 7.58e-01 0.0265 0.0858 0.147 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 3.49e-01 0.0972 0.104 0.147 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0536 0.041 0.147 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00184 0.0757 0.147 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 3.93e-01 0.0963 0.112 0.147 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 7.72e-01 0.0374 0.129 0.151 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 949177 sc-eQTL 6.78e-01 0.049 0.118 0.151 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 1.44e-01 -0.161 0.11 0.151 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 1.10e-01 0.188 0.117 0.151 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0392 0.0629 0.151 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 7.60e-01 0.0343 0.112 0.151 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 9.00e-01 0.0139 0.11 0.151 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 8.92e-02 0.209 0.122 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 949177 sc-eQTL 1.12e-02 0.272 0.106 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 4.13e-01 0.058 0.0707 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 7.13e-01 0.0392 0.107 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 6.88e-01 0.0262 0.0652 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 2.24e-01 0.137 0.112 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 3.52e-01 0.11 0.117 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 2.77e-03 -0.348 0.115 0.149 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 949177 sc-eQTL 8.55e-01 0.0198 0.108 0.149 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 9.97e-02 0.14 0.0844 0.149 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 2.14e-01 0.138 0.111 0.149 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 6.69e-01 0.0229 0.0535 0.149 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 2.54e-01 0.112 0.0979 0.149 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 5.05e-01 0.0746 0.112 0.149 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 9.65e-01 0.00493 0.111 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 949177 sc-eQTL 5.11e-01 0.0806 0.122 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 9.98e-01 -0.00011 0.0535 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 1.68e-01 -0.143 0.103 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 2.34e-01 0.0704 0.059 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 1.21e-01 0.144 0.0921 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 3.93e-01 0.0975 0.114 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0715 0.118 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 949177 sc-eQTL 2.49e-01 -0.133 0.115 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0343 0.0626 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 5.25e-01 0.0732 0.115 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 3.28e-02 0.129 0.0602 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 5.68e-01 0.0615 0.108 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 1.12e-01 0.184 0.115 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 3.68e-02 0.249 0.119 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 8.00e-01 0.0302 0.119 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 2.50e-02 0.268 0.119 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 6.05e-02 0.104 0.055 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 4.67e-01 0.0701 0.0961 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 1.00e-01 0.184 0.111 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 1.18e-01 -0.146 0.0927 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 7.57e-01 0.0284 0.0914 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 4.59e-01 0.0627 0.0846 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 2.77e-01 0.0597 0.0548 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 5.36e-02 0.129 0.0667 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 1.54e-01 0.151 0.105 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 4.98e-01 0.068 0.1 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 4.33e-01 0.0793 0.101 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0642 0.0996 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0624 0.0515 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 6.42e-01 0.0336 0.0722 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 1.32e-01 0.18 0.119 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0275 0.116 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 1.81e-01 -0.155 0.116 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 1.30e-01 0.169 0.111 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 9.73e-01 0.00157 0.0457 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 4.79e-01 0.0556 0.0785 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 1.43e-01 0.166 0.113 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 8.76e-01 -0.016 0.103 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0618 0.0958 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0854 0.109 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 5.48e-01 0.0351 0.0582 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 5.48e-01 0.0592 0.0983 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 9.61e-01 0.00554 0.113 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 5.77e-01 0.0617 0.11 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 4.16e-01 0.0957 0.117 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 2.09e-01 -0.128 0.101 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0508 0.058 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 5.19e-01 0.0471 0.0729 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 4.52e-01 0.0877 0.116 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0614 0.126 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0586 0.116 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0916 0.115 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 5.36e-01 0.0349 0.0563 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 1.29e-01 0.141 0.0927 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 9.47e-01 0.00829 0.123 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 7.88e-01 0.0297 0.11 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 2.30e-01 -0.145 0.12 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 2.03e-01 0.152 0.119 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 1.90e-01 0.0844 0.0641 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0516 0.105 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 2.28e-01 0.147 0.121 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0455 0.117 0.147 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 6.55e-01 0.0496 0.111 0.147 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 4.81e-01 0.0796 0.113 0.147 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 1.72e-01 -0.0758 0.0553 0.147 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 9.14e-01 0.00843 0.0781 0.147 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 7.37e-01 0.0392 0.116 0.147 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0506 0.129 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0253 0.12 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 6.52e-01 0.055 0.122 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 9.92e-01 0.000696 0.0679 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 7.56e-01 0.0316 0.101 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 6.69e-01 0.0433 0.101 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0971 0.0924 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0816 0.116 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0141 0.046 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 8.21e-01 0.023 0.102 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 5.65e-01 -0.071 0.123 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0245 0.112 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 6.83e-01 0.0465 0.114 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 5.45e-01 -0.032 0.0529 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 9.48e-01 0.00682 0.105 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 2.44e-01 0.122 0.104 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 2.27e-01 0.122 0.101 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 9.62e-01 0.00537 0.114 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 9.57e-01 0.00334 0.0619 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 1.13e-01 -0.163 0.102 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 7.05e-01 0.0536 0.141 0.144 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 949177 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0221 0.121 0.144 PB L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 1.63e-01 -0.14 0.0998 0.144 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0231 0.123 0.144 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 5.27e-02 -0.134 0.0687 0.144 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 7.88e-01 0.0304 0.113 0.144 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0294 0.131 0.144 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 9.60e-01 0.00591 0.117 0.148 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 1.84e-01 0.138 0.104 0.148 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00454 0.112 0.148 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0057 0.0422 0.148 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 8.67e-01 0.0142 0.0846 0.148 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 7.71e-02 0.193 0.108 0.148 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 9.70e-01 0.00452 0.119 0.147 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 5.30e-02 0.217 0.111 0.147 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 6.05e-01 0.0489 0.0945 0.147 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0246 0.0418 0.147 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 3.33e-01 0.0852 0.0879 0.147 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 1.54e-01 0.168 0.118 0.147 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 2.46e-01 0.144 0.124 0.149 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0909 0.0975 0.149 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 615887 sc-eQTL 8.86e-01 0.0139 0.097 0.149 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 636597 sc-eQTL 5.32e-01 0.0713 0.114 0.149 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 4.74e-01 0.0797 0.111 0.149 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0306 0.0548 0.149 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 8.18e-01 0.0214 0.0925 0.149 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 9.47e-02 0.181 0.108 0.149 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 247524 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0145 0.0869 0.149 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -945649 sc-eQTL 5.77e-01 0.0597 0.107 0.149 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 3.11e-01 0.1 0.0985 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0314 0.0749 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 615887 sc-eQTL 7.02e-01 0.0406 0.106 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 636597 sc-eQTL 6.01e-01 -0.056 0.107 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 7.94e-01 0.0223 0.0854 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 8.84e-01 0.00696 0.0474 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0206 0.0707 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0133 0.0915 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -945649 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0356 0.0953 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 4.63e-01 0.0824 0.112 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 7.47e-01 0.0262 0.081 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 615887 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0113 0.101 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 636597 sc-eQTL 2.73e-01 0.121 0.11 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0293 0.072 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 9.18e-01 0.00533 0.0518 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 9.19e-01 0.00602 0.0593 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 2.68e-01 -0.106 0.0957 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -945649 sc-eQTL 9.27e-02 -0.157 0.0932 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0848 0.155 0.139 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 3.74e-01 0.119 0.133 0.139 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0198 0.148 0.139 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 2.52e-01 0.0644 0.056 0.139 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 2.86e-01 0.113 0.106 0.139 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0675 0.145 0.139 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 5.73e-01 0.0633 0.112 0.147 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0938 0.107 0.147 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 615887 sc-eQTL 6.96e-01 0.0423 0.108 0.147 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 636597 sc-eQTL 3.64e-01 0.097 0.107 0.147 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 1.42e-01 0.16 0.108 0.147 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0286 0.0473 0.147 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0968 0.0792 0.147 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 8.49e-01 -0.022 0.115 0.147 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -945649 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0667 0.11 0.147 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 2.67e-01 0.13 0.117 0.147 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0962 0.0788 0.147 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 615887 sc-eQTL 9.40e-01 0.00845 0.112 0.147 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 636597 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0616 0.111 0.147 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 2.94e-01 0.112 0.106 0.147 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0385 0.0534 0.147 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 9.43e-01 0.00542 0.0756 0.147 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 1.00e-01 -0.155 0.0938 0.147 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -945649 sc-eQTL 7.86e-01 0.0271 0.0998 0.147 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0893 0.137 0.15 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0601 0.0915 0.15 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 615887 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0186 0.0922 0.15 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 636597 sc-eQTL 9.29e-02 0.157 0.093 0.15 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 3.69e-01 0.1 0.111 0.15 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0784 0.0767 0.15 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 4.28e-01 0.062 0.0781 0.15 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 2.10e-01 -0.143 0.113 0.15 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 247524 sc-eQTL 9.80e-01 0.00279 0.109 0.15 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -945649 sc-eQTL 3.63e-01 0.088 0.0964 0.15 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 3.89e-01 0.102 0.119 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 949177 sc-eQTL 3.05e-01 0.118 0.115 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 2.08e-01 0.0823 0.0651 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 8.21e-02 0.179 0.103 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 9.47e-01 0.00389 0.0589 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 2.36e-01 0.109 0.0918 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 4.73e-01 0.0777 0.108 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0189 0.112 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 949177 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0184 0.123 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 9.13e-01 0.00549 0.0504 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0621 0.0977 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 6.08e-02 0.111 0.0587 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 2.93e-01 0.0962 0.0913 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 1.30e-01 0.168 0.111 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 2.23e-01 0.109 0.0894 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 9.63e-01 0.00291 0.0624 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 615887 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00628 0.102 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 636597 sc-eQTL 7.37e-01 0.0357 0.106 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0198 0.0701 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 9.21e-01 0.00478 0.0481 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0123 0.0655 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0467 0.0855 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -945649 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0955 0.0895 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 4.00e-01 0.0964 0.114 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 1.79e-01 -0.102 0.0753 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 615887 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0554 0.111 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 636597 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0815 0.11 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 1.80e-01 0.139 0.104 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 8.57e-01 -0.00794 0.0441 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 6.98e-01 -0.026 0.0667 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 537313 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0767 0.107 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -945649 sc-eQTL 8.42e-01 0.0193 0.0968 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -601518 sc-eQTL 2.18e-01 0.114 0.0925 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 837454 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0341 0.0872 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 587193 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00609 0.11 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 536083 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0488 0.0449 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -967460 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0353 0.0931 0.149 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 615887 eQTL 0.0259 0.0451 0.0202 0.0 0.0 0.158

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 615887 2.77e-07 1.53e-07 5.49e-08 2.09e-07 9.24e-08 9.91e-08 1.67e-07 5.43e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.73e-07 1.15e-07 1.71e-07 7.64e-08 5.72e-08 7.23e-08 4.12e-08 1.44e-07 6.75e-08 4.8e-08 1.19e-07 1.25e-07 1.5e-07 2.64e-08 1.72e-07 1.25e-07 1.13e-07 1.04e-07 1.24e-07 1.05e-07 1.07e-07 2.93e-08 3.43e-08 8.23e-08 3.07e-08 3.05e-08 5.8e-08 8.93e-08 6.71e-08 3.75e-08 5.71e-08 1.5e-07 4.89e-08 7.43e-09 3.4e-08 1.87e-08 1.21e-07 1.95e-09 5e-08
ENSG00000118515 \N -967460 2.61e-07 1.16e-07 3.56e-08 1.82e-07 9.02e-08 9.3e-08 1.41e-07 5.49e-08 1.41e-07 4.38e-08 1.59e-07 7.78e-08 1.3e-07 6.21e-08 5.53e-08 7.5e-08 4.48e-08 1.14e-07 5.19e-08 4.03e-08 1.05e-07 1.28e-07 1.26e-07 4.54e-08 1.33e-07 1.19e-07 1.12e-07 9.32e-08 1.03e-07 1.09e-07 9.58e-08 4.07e-08 2.92e-08 8.68e-08 8.98e-08 3.97e-08 4.89e-08 9.56e-08 7.92e-08 3.18e-08 3.59e-08 1.31e-07 3.82e-08 2.1e-08 6.92e-08 1.69e-08 1.26e-07 3.95e-09 4.79e-08