logo

Genes within 1Mb (chr6:133345766:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 5.18e-01 -0.065 0.1 0.222 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 944291 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0492 0.106 0.222 B L1
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0476 0.0399 0.222 B L1
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0117 0.0752 0.222 B L1
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 9.00e-01 0.00571 0.0455 0.222 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 4.66e-02 0.139 0.0695 0.222 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 2.57e-01 -0.109 0.0954 0.222 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 7.51e-01 0.0234 0.0739 0.222 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00157 0.0768 0.222 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00698 0.0665 0.222 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 2.09e-01 0.0568 0.0451 0.222 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 6.75e-02 0.111 0.0603 0.222 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 1.92e-01 -0.119 0.0911 0.222 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 6.80e-01 0.0305 0.0737 0.222 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0388 0.0769 0.222 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 1.58e-01 -0.127 0.0894 0.222 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 9.20e-01 0.00309 0.0307 0.222 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 1.47e-01 0.0685 0.0471 0.222 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 1.89e-01 -0.122 0.0925 0.222 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0386 0.111 0.218 DC L1
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0783 0.0688 0.218 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 611001 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0159 0.0855 0.218 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 631711 sc-eQTL 2.06e-01 -0.117 0.092 0.218 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0894 0.0986 0.218 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 3.43e-01 0.0525 0.0553 0.218 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0421 0.0642 0.218 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 1.83e-01 0.117 0.0873 0.218 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 242638 sc-eQTL 9.31e-02 -0.134 0.0792 0.218 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -950535 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0486 0.0994 0.218 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 9.06e-01 0.00908 0.077 0.222 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 9.88e-01 -0.000782 0.0515 0.222 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 611001 sc-eQTL 9.16e-01 0.00939 0.0885 0.222 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 631711 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0934 0.095 0.222 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 1.53e-01 -0.0958 0.0669 0.222 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 3.60e-01 0.0368 0.0402 0.222 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 7.54e-01 0.0178 0.0568 0.222 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0359 0.0796 0.222 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -950535 sc-eQTL 6.34e-01 0.0373 0.0782 0.222 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0289 0.0846 0.221 NK L1
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 2.74e-02 -0.172 0.0774 0.221 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 9.19e-01 0.00991 0.0974 0.221 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 1.66e-01 0.0558 0.0401 0.221 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 4.14e-02 0.151 0.0738 0.221 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 6.91e-01 0.0386 0.0969 0.222 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0645 0.0762 0.222 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 2.65e-01 -0.103 0.092 0.222 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 1.92e-01 0.0477 0.0364 0.222 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 3.58e-02 0.141 0.0666 0.222 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0973 0.1 0.222 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0526 0.115 0.23 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 944291 sc-eQTL 5.29e-01 0.0662 0.105 0.23 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 4.72e-01 0.071 0.0984 0.23 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0946 0.105 0.23 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0397 0.0561 0.23 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 3.88e-01 0.0866 0.1 0.23 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0872 0.0982 0.23 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 2.35e-01 -0.13 0.109 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 944291 sc-eQTL 2.02e-01 -0.122 0.0955 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 1.32e-02 -0.155 0.0619 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0757 0.0944 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 1.89e-01 0.0759 0.0576 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 5.14e-02 0.194 0.0992 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0467 0.104 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0399 0.104 0.22 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 944291 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0221 0.096 0.22 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0462 0.0753 0.22 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0785 0.0984 0.22 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 8.66e-01 -0.00801 0.0475 0.22 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 3.32e-01 0.0845 0.0869 0.22 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0673 0.0989 0.22 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0645 0.0997 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 944291 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0344 0.11 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0258 0.0479 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 1.38e-01 0.138 0.0927 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 2.85e-01 0.0567 0.0529 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 2.42e-01 0.0971 0.0828 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 2.87e-01 -0.109 0.102 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 4.62e-01 -0.077 0.104 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 944291 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0902 0.102 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0376 0.0555 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0623 0.102 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 8.97e-01 0.00701 0.054 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 5.55e-01 0.0564 0.0954 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0908 0.103 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 9.06e-01 0.0123 0.103 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 3.22e-01 0.102 0.102 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 1.59e-02 -0.248 0.102 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 3.06e-01 0.049 0.0477 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 3.89e-01 0.0715 0.0828 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0929 0.0963 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 7.97e-01 0.0218 0.0845 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 6.18e-01 0.0413 0.0828 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 6.55e-01 0.0343 0.0767 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 8.70e-02 0.085 0.0494 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 2.19e-02 0.139 0.0602 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 2.20e-01 -0.117 0.0955 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 1.32e-01 -0.137 0.0904 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0475 0.0914 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0491 0.0901 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 4.19e-01 0.0378 0.0467 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 1.41e-01 0.0961 0.0651 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 1.25e-01 -0.166 0.108 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 9.23e-01 0.0102 0.105 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0414 0.105 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 3.71e-01 0.0899 0.1 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 6.69e-02 0.0753 0.0409 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 7.53e-02 0.126 0.0703 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 2.82e-01 -0.11 0.102 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0179 0.0932 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0397 0.0871 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 2.49e-01 -0.114 0.0987 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 6.45e-01 0.0244 0.053 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 2.81e-01 0.0965 0.0893 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 2.25e-01 -0.125 0.102 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 5.11e-01 0.0641 0.0974 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0979 0.104 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0152 0.0896 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 9.46e-02 0.0856 0.051 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 1.97e-02 0.149 0.0636 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 3.18e-01 -0.103 0.103 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 7.46e-01 0.036 0.111 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 7.85e-01 0.0282 0.103 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0277 0.102 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 6.85e-02 0.0905 0.0494 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 3.69e-01 0.0741 0.0823 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0864 0.109 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 1.32e-01 0.147 0.0971 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 2.75e-01 0.116 0.106 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 1.89e-01 -0.139 0.106 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00353 0.057 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 1.76e-01 -0.126 0.093 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0768 0.108 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 6.71e-01 0.0438 0.103 0.223 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 9.75e-01 0.00306 0.0979 0.223 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 1.06e-01 -0.16 0.099 0.223 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 8.20e-02 0.085 0.0486 0.223 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 1.62e-01 0.0963 0.0686 0.223 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0394 0.103 0.223 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 3.25e-01 0.108 0.11 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0396 0.102 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 4.13e-01 0.0847 0.103 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0392 0.0576 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 9.56e-02 0.143 0.0856 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 9.96e-01 0.000487 0.0909 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 2.17e-01 -0.103 0.083 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 6.41e-01 0.0486 0.104 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 4.88e-01 0.0287 0.0413 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 5.19e-01 0.0591 0.0915 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0324 0.115 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 3.45e-01 -0.099 0.105 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0808 0.106 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 8.19e-01 0.0113 0.0494 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 2.58e-01 -0.11 0.0973 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0412 0.0937 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 9.31e-02 -0.152 0.0901 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 7.73e-01 0.0294 0.102 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 7.71e-01 0.0161 0.0553 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 2.50e-02 0.206 0.091 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 6.68e-01 0.0547 0.127 0.226 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 944291 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0345 0.109 0.226 PB L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 6.62e-01 0.0396 0.0906 0.226 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 3.08e-01 -0.113 0.11 0.226 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 1.44e-01 0.0917 0.0623 0.226 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 3.96e-01 0.0862 0.101 0.226 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 9.92e-01 0.00123 0.118 0.226 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 3.73e-01 0.0927 0.104 0.224 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0679 0.0928 0.224 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 9.18e-01 0.0102 0.0997 0.224 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 4.55e-01 0.0282 0.0377 0.224 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 1.55e-01 0.107 0.0752 0.224 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0897 0.0974 0.224 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 9.65e-01 0.00473 0.106 0.222 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 8.05e-01 0.0247 0.1 0.222 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 2.02e-01 -0.107 0.084 0.222 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 7.23e-01 0.0132 0.0373 0.222 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 6.74e-01 0.0331 0.0785 0.222 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 6.57e-02 0.193 0.105 0.222 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 6.86e-01 -0.045 0.111 0.224 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0262 0.0873 0.224 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 611001 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0854 0.0865 0.224 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 631711 sc-eQTL 3.14e-01 -0.103 0.102 0.224 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 1.70e-01 -0.136 0.0988 0.224 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 8.17e-01 0.0114 0.049 0.224 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00173 0.0826 0.224 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0246 0.0971 0.224 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 242638 sc-eQTL 2.98e-02 -0.168 0.0767 0.224 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -950535 sc-eQTL 7.89e-01 0.0256 0.0955 0.224 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0937 0.0873 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 7.76e-01 0.0189 0.0664 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 611001 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0195 0.0939 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 631711 sc-eQTL 1.85e-01 -0.126 0.0943 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 9.56e-02 -0.126 0.0752 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 6.34e-01 0.02 0.042 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 8.11e-01 0.015 0.0627 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0132 0.0811 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -950535 sc-eQTL 4.05e-01 0.0703 0.0843 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 3.98e-01 0.0849 0.1 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0447 0.0725 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 611001 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00986 0.0906 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 631711 sc-eQTL 2.37e-01 -0.116 0.098 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0738 0.0642 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 3.01e-01 0.048 0.0463 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 4.77e-01 0.0378 0.053 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0764 0.0857 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -950535 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0129 0.084 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0391 0.127 0.239 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 6.82e-02 -0.199 0.108 0.239 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 4.40e-01 0.0937 0.121 0.239 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 7.98e-01 0.0119 0.0462 0.239 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 3.48e-01 0.0819 0.0869 0.239 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 2.39e-01 -0.141 0.119 0.239 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 7.67e-01 -0.03 0.101 0.22 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 9.86e-01 0.00167 0.0965 0.22 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 611001 sc-eQTL 7.92e-02 -0.17 0.0967 0.22 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 631711 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0787 0.0961 0.22 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 2.81e-01 -0.106 0.0976 0.22 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 7.36e-01 0.0144 0.0426 0.22 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 2.49e-01 0.0823 0.0713 0.22 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 9.54e-01 0.00596 0.104 0.22 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -950535 sc-eQTL 7.58e-01 0.0305 0.0991 0.22 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 8.59e-01 0.0192 0.108 0.226 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0272 0.0728 0.226 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 611001 sc-eQTL 2.33e-01 -0.122 0.102 0.226 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 631711 sc-eQTL 1.51e-01 -0.146 0.102 0.226 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0915 0.0979 0.226 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 9.85e-01 0.000896 0.0492 0.226 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0147 0.0696 0.226 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00223 0.0869 0.226 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -950535 sc-eQTL 5.30e-01 0.0578 0.0918 0.226 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 2.37e-01 0.145 0.122 0.223 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 2.90e-02 -0.178 0.0806 0.223 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 611001 sc-eQTL 3.30e-01 0.0803 0.0821 0.223 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 631711 sc-eQTL 6.02e-02 -0.157 0.0829 0.223 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 9.52e-01 0.00601 0.0998 0.223 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 4.43e-01 0.0528 0.0686 0.223 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0406 0.0698 0.223 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 3.43e-02 0.214 0.1 0.223 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 242638 sc-eQTL 2.88e-01 -0.104 0.097 0.223 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -950535 sc-eQTL 1.85e-01 -0.114 0.0859 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 1.98e-01 -0.134 0.104 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 944291 sc-eQTL 8.67e-01 -0.017 0.102 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 7.73e-02 -0.101 0.0571 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 1.37e-01 -0.135 0.0905 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 3.47e-01 0.0488 0.0518 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 5.66e-02 0.154 0.0804 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 2.12e-01 -0.119 0.0948 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0471 0.1 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 944291 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0941 0.11 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 6.90e-01 -0.018 0.0451 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 7.54e-01 0.0275 0.0876 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 4.84e-01 0.0371 0.053 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 1.64e-01 0.114 0.0817 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0892 0.0999 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 9.91e-01 0.000942 0.0803 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00389 0.0558 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 611001 sc-eQTL 7.94e-01 0.0238 0.091 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 631711 sc-eQTL 2.89e-01 -0.101 0.0947 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0695 0.0626 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 4.67e-01 0.0313 0.043 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 7.36e-01 0.0198 0.0586 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0283 0.0766 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -950535 sc-eQTL 7.35e-01 0.0272 0.0803 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0176 0.103 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 8.54e-01 0.0125 0.068 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 611001 sc-eQTL 1.55e-01 -0.142 0.0996 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 631711 sc-eQTL 1.42e-01 -0.145 0.0986 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 1.54e-01 -0.133 0.093 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00329 0.0397 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 5.02e-01 0.0403 0.06 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 532427 sc-eQTL 4.42e-01 0.0741 0.0962 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -950535 sc-eQTL 2.88e-01 0.0924 0.0868 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -606404 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0234 0.0837 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 832568 sc-eQTL 2.36e-02 -0.177 0.0777 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 582307 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0186 0.0995 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 531197 sc-eQTL 2.44e-01 0.0473 0.0405 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -972346 sc-eQTL 6.57e-02 0.154 0.0832 0.22 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 631711 pQTL 0.00213 -0.125 0.0408 0.0 0.0 0.221

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina