logo

Genes within 1Mb (chr6:133340326:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0232 0.118 0.145 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 938851 sc-eQTL 5.01e-01 0.0839 0.125 0.145 B L1
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 2.13e-01 0.0585 0.0468 0.145 B L1
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 6.44e-01 0.0409 0.0883 0.145 B L1
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 8.27e-01 0.0117 0.0534 0.145 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 5.62e-01 0.0478 0.0823 0.145 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 2.00e-02 0.26 0.111 0.145 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 3.98e-01 0.0727 0.086 0.145 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 2.90e-01 0.0947 0.0893 0.145 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 4.52e-01 0.0584 0.0774 0.145 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 4.81e-01 0.0372 0.0526 0.145 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 1.44e-01 0.103 0.0705 0.145 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 2.79e-01 0.115 0.106 0.145 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0073 0.0849 0.145 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0311 0.0886 0.145 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0336 0.103 0.145 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0224 0.0353 0.145 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 9.00e-01 0.00689 0.0545 0.145 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0321 0.107 0.145 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 1.81e-01 0.173 0.129 0.149 DC L1
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 8.24e-01 0.018 0.0806 0.149 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 605561 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00228 0.0999 0.149 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 626271 sc-eQTL 2.96e-01 0.113 0.108 0.149 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 1.89e-01 0.152 0.115 0.149 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00869 0.0647 0.149 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 5.70e-01 0.0427 0.075 0.149 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 3.99e-01 0.0865 0.102 0.149 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 237198 sc-eQTL 2.89e-01 0.0988 0.093 0.149 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -955975 sc-eQTL 5.86e-01 0.0633 0.116 0.149 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 3.47e-01 0.0848 0.09 0.145 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 7.06e-01 0.0228 0.0603 0.145 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 605561 sc-eQTL 9.11e-01 0.0116 0.104 0.145 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 626271 sc-eQTL 7.18e-01 0.0404 0.111 0.145 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0246 0.0787 0.145 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0206 0.0471 0.145 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 9.02e-01 0.00822 0.0666 0.145 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0223 0.0933 0.145 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -955975 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0385 0.0916 0.145 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 5.49e-01 0.0604 0.101 0.146 NK L1
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0418 0.093 0.146 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0514 0.116 0.146 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 1.80e-01 -0.0642 0.0477 0.146 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00496 0.0886 0.146 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 6.98e-02 -0.21 0.116 0.145 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 6.06e-01 0.0473 0.0916 0.145 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 1.24e-01 0.17 0.11 0.145 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0441 0.0438 0.145 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 9.85e-01 0.00156 0.0808 0.145 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 8.03e-01 0.03 0.12 0.145 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 9.93e-01 0.00115 0.138 0.145 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 938851 sc-eQTL 3.76e-01 0.112 0.126 0.145 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 2.00e-01 -0.151 0.118 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 9.83e-02 0.207 0.125 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0288 0.0674 0.145 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 6.34e-01 0.0573 0.12 0.145 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 7.92e-01 0.0312 0.118 0.145 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 1.50e-01 0.188 0.13 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 938851 sc-eQTL 3.96e-02 0.235 0.114 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 1.41e-01 0.11 0.0747 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 7.17e-01 0.0411 0.113 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 8.61e-01 0.0122 0.0692 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 1.03e-01 0.195 0.119 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 2.61e-01 0.14 0.124 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 3.73e-03 -0.355 0.121 0.147 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 938851 sc-eQTL 4.34e-01 0.0892 0.114 0.147 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 1.88e-01 0.118 0.0891 0.147 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 2.80e-01 0.126 0.117 0.147 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 7.30e-01 0.0195 0.0564 0.147 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 2.46e-01 0.12 0.103 0.147 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 4.66e-01 0.0859 0.117 0.147 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 8.69e-01 0.0196 0.118 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 938851 sc-eQTL 4.19e-01 0.105 0.13 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 6.24e-01 0.0279 0.0569 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 2.76e-01 -0.12 0.11 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 2.98e-01 0.0655 0.0628 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 1.17e-01 0.154 0.0979 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 4.45e-01 0.0929 0.121 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0409 0.125 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 938851 sc-eQTL 2.02e-01 -0.155 0.121 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 9.99e-01 7.93e-05 0.0664 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 5.60e-01 0.0711 0.122 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 7.33e-02 0.115 0.064 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 8.01e-01 0.0288 0.114 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 3.55e-02 0.258 0.122 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 3.33e-02 0.264 0.123 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 8.06e-01 0.0304 0.124 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 8.21e-02 0.216 0.124 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 5.45e-02 0.11 0.0571 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 4.30e-01 0.079 0.0998 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 4.07e-02 0.237 0.115 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 1.92e-01 -0.129 0.0985 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 7.87e-01 0.0263 0.097 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 5.00e-01 0.0607 0.0898 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 1.62e-01 0.0814 0.058 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 1.06e-01 0.115 0.0709 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 3.17e-01 0.112 0.112 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 2.00e-01 0.136 0.106 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 2.12e-01 0.134 0.107 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0321 0.106 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0255 0.0548 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 3.69e-01 0.0689 0.0765 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 3.04e-01 0.13 0.127 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 7.60e-01 0.0378 0.123 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 1.68e-01 -0.17 0.123 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 1.83e-01 0.158 0.118 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 6.20e-01 0.0241 0.0486 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 4.48e-01 0.0634 0.0834 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 4.59e-01 0.0895 0.121 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0514 0.109 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 3.22e-01 -0.101 0.102 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0155 0.116 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 9.80e-01 0.00157 0.0619 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 5.57e-01 0.0614 0.104 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0671 0.12 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 6.88e-01 0.0472 0.117 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 2.27e-01 0.151 0.124 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 2.48e-01 -0.125 0.107 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0327 0.0617 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 5.75e-01 0.0435 0.0774 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 5.49e-01 0.0741 0.124 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0756 0.133 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0743 0.123 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0183 0.122 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 6.39e-01 0.0279 0.0595 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 1.87e-01 0.13 0.0981 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 9.01e-01 0.0163 0.13 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 8.36e-01 0.0242 0.117 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0822 0.128 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 4.22e-01 0.102 0.127 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 4.20e-01 0.0552 0.0682 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0666 0.112 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 1.05e-01 0.209 0.128 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0469 0.124 0.145 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 7.29e-01 0.0408 0.117 0.145 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 3.41e-01 0.114 0.119 0.145 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0461 0.0587 0.145 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 7.14e-01 0.0304 0.0827 0.145 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0228 0.123 0.145 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0709 0.133 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0962 0.123 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 7.20e-01 0.0449 0.125 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 8.26e-01 0.0153 0.0696 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 4.21e-01 0.0838 0.104 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 7.40e-01 0.0359 0.108 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 3.08e-01 -0.101 0.0986 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 1.33e-01 -0.185 0.123 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0387 0.049 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 8.20e-01 0.0247 0.109 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0458 0.129 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00846 0.117 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 7.35e-01 0.0402 0.119 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 2.55e-01 -0.063 0.0552 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 9.68e-01 0.00442 0.11 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 3.44e-01 0.106 0.111 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 3.44e-01 0.102 0.108 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0184 0.121 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0388 0.0658 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0968 0.109 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 4.83e-01 0.106 0.151 0.144 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 938851 sc-eQTL 9.66e-01 0.00555 0.129 0.144 PB L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 1.17e-01 -0.168 0.106 0.144 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0101 0.131 0.144 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 9.57e-02 -0.124 0.0736 0.144 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0146 0.12 0.144 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0819 0.14 0.144 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00631 0.124 0.146 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 1.08e-01 0.178 0.11 0.146 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 5.47e-01 0.0716 0.119 0.146 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 8.75e-01 -0.00705 0.0449 0.146 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 7.14e-01 0.033 0.09 0.146 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 1.53e-01 0.166 0.116 0.146 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 9.79e-01 -0.0033 0.127 0.145 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 7.27e-02 0.214 0.119 0.145 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 4.07e-01 0.0835 0.1 0.145 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0108 0.0445 0.145 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 4.06e-01 0.078 0.0937 0.145 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 3.91e-01 0.108 0.126 0.145 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 7.44e-02 0.237 0.132 0.144 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0904 0.105 0.144 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 605561 sc-eQTL 8.27e-01 0.0228 0.104 0.144 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 626271 sc-eQTL 2.86e-01 0.131 0.122 0.144 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 8.83e-01 0.0176 0.119 0.144 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 6.84e-01 -0.024 0.0588 0.144 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 6.56e-01 0.0443 0.0991 0.144 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 8.95e-02 0.197 0.116 0.144 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 237198 sc-eQTL 9.41e-01 0.00687 0.0932 0.144 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -955975 sc-eQTL 4.00e-01 0.0964 0.114 0.144 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 6.13e-01 0.0524 0.104 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0285 0.0786 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 605561 sc-eQTL 6.58e-01 0.0493 0.111 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 626271 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0168 0.112 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 7.03e-01 0.0342 0.0897 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0108 0.0498 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 8.98e-01 0.00957 0.0743 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 8.01e-01 0.0243 0.0961 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -955975 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0344 0.1 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 6.40e-01 0.0551 0.118 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 5.69e-01 0.0484 0.0849 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 605561 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00505 0.106 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 626271 sc-eQTL 1.46e-01 0.167 0.115 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0478 0.0754 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 7.14e-01 -0.02 0.0543 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 6.74e-01 0.0262 0.0621 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0876 0.1 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -955975 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0901 0.0981 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 3.88e-01 -0.139 0.16 0.133 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 5.29e-01 0.0869 0.138 0.133 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0338 0.153 0.133 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 2.31e-01 0.0695 0.0578 0.133 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 3.01e-01 0.114 0.109 0.133 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0239 0.15 0.133 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 4.95e-01 0.0807 0.118 0.144 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0194 0.113 0.144 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 605561 sc-eQTL 6.81e-01 0.0468 0.114 0.144 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 626271 sc-eQTL 2.54e-01 0.128 0.112 0.144 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 3.16e-01 0.115 0.114 0.144 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 8.83e-01 0.00732 0.0498 0.144 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 1.58e-01 -0.118 0.0832 0.144 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0378 0.121 0.144 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -955975 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0599 0.116 0.144 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 3.49e-01 0.117 0.124 0.143 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0697 0.0841 0.143 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 605561 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0104 0.119 0.143 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 626271 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0369 0.118 0.143 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 4.80e-01 0.0801 0.113 0.143 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0639 0.0567 0.143 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 6.74e-01 0.0339 0.0805 0.143 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 1.20e-01 -0.156 0.0999 0.143 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -955975 sc-eQTL 7.63e-01 0.0321 0.106 0.143 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0836 0.15 0.144 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0726 0.0995 0.144 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 605561 sc-eQTL 8.09e-01 0.0243 0.1 0.144 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 626271 sc-eQTL 3.44e-02 0.215 0.101 0.144 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 5.94e-01 0.065 0.121 0.144 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0918 0.0834 0.144 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 5.28e-01 0.0538 0.085 0.144 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 2.32e-01 -0.148 0.123 0.144 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 237198 sc-eQTL 4.48e-01 0.0901 0.118 0.144 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -955975 sc-eQTL 4.80e-01 0.0744 0.105 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 5.31e-01 0.0789 0.126 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 938851 sc-eQTL 1.77e-01 0.165 0.122 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 5.67e-02 0.131 0.0686 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 2.03e-01 0.139 0.109 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 9.92e-01 0.000635 0.0624 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 9.95e-02 0.16 0.0969 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 2.91e-01 0.121 0.114 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0256 0.119 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 938851 sc-eQTL 9.75e-01 -0.0041 0.131 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 4.14e-01 0.0438 0.0535 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0434 0.104 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 1.18e-01 0.0982 0.0626 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 2.92e-01 0.103 0.0972 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 8.08e-02 0.207 0.118 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 5.52e-01 0.0561 0.0942 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 7.51e-01 0.0208 0.0655 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 605561 sc-eQTL 9.04e-01 0.0129 0.107 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 626271 sc-eQTL 4.31e-01 0.0877 0.111 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0103 0.0737 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 6.77e-01 -0.021 0.0505 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 8.23e-01 0.0155 0.0688 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0143 0.0899 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -955975 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0769 0.0941 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 5.19e-01 0.0778 0.12 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0411 0.0795 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 605561 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0414 0.117 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 626271 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0587 0.116 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 4.91e-01 0.0754 0.109 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00167 0.0464 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 6.39e-01 -0.033 0.0702 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 526987 sc-eQTL 3.35e-01 -0.109 0.112 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -955975 sc-eQTL 8.63e-01 0.0176 0.102 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -611844 sc-eQTL 3.04e-01 0.102 0.0988 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 827128 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0335 0.093 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 576867 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0659 0.118 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 525757 sc-eQTL 1.42e-01 -0.0705 0.0478 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -977786 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0159 0.0993 0.147 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 605561 eQTL 0.00465 0.0574 0.0202 0.0 0.0 0.155

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 605561 2.77e-07 1.33e-07 5.03e-08 2.05e-07 1.01e-07 9.05e-08 1.73e-07 5.66e-08 1.5e-07 6.4e-08 1.73e-07 1.11e-07 1.79e-07 7.64e-08 5.98e-08 7.74e-08 4.18e-08 1.51e-07 6.32e-08 4.8e-08 1.25e-07 1.26e-07 1.58e-07 2.83e-08 1.68e-07 1.22e-07 1.13e-07 1.06e-07 1.26e-07 9.88e-08 1.07e-07 3.39e-08 3.51e-08 8.7e-08 3.52e-08 3.22e-08 5.74e-08 8.68e-08 6.71e-08 3.75e-08 5.42e-08 1.5e-07 5.21e-08 1.11e-08 3.41e-08 1.77e-08 1.2e-07 1.9e-09 4.99e-08
ENSG00000118515 \N -977786 2.61e-07 1.1e-07 3.62e-08 1.79e-07 8.92e-08 9.57e-08 1.38e-07 5.33e-08 1.41e-07 4.4e-08 1.59e-07 7.75e-08 1.3e-07 6.21e-08 5.55e-08 7.5e-08 4.48e-08 1.14e-07 5.19e-08 4.03e-08 1.04e-07 1.27e-07 1.26e-07 4.13e-08 1.31e-07 1.19e-07 1.12e-07 9.15e-08 1.03e-07 1.12e-07 9.58e-08 4.22e-08 3.09e-08 8.82e-08 8.93e-08 3.96e-08 4.89e-08 9.55e-08 7.63e-08 3e-08 4.41e-08 1.35e-07 3.91e-08 2.1e-08 6.92e-08 1.68e-08 1.26e-07 4.04e-09 4.79e-08