logo

Genes within 1Mb (chr6:133337731:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 8.07e-01 -0.031 0.126 0.122 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 936256 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0395 0.133 0.122 B L1
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 1.33e-01 0.0755 0.0501 0.122 B L1
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 2.60e-01 0.106 0.0943 0.122 B L1
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0199 0.0572 0.122 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 5.74e-01 0.0496 0.0882 0.122 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 3.30e-02 0.256 0.119 0.122 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 8.95e-02 0.156 0.0916 0.122 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 3.22e-01 0.095 0.0957 0.122 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 3.82e-01 0.0726 0.0829 0.122 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 3.81e-01 0.0495 0.0564 0.122 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 1.13e-01 0.12 0.0755 0.122 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 3.17e-01 0.114 0.114 0.122 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0226 0.0911 0.122 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0644 0.095 0.122 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0471 0.111 0.122 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0128 0.0379 0.122 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 8.17e-01 0.0136 0.0585 0.122 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00121 0.115 0.122 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 4.76e-02 0.28 0.14 0.122 DC L1
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 5.88e-01 0.0478 0.0881 0.122 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 602966 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0208 0.109 0.122 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 623676 sc-eQTL 8.82e-01 0.0175 0.118 0.122 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 1.46e-01 0.183 0.126 0.122 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 9.74e-01 0.00227 0.0708 0.122 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 6.23e-01 0.0404 0.0821 0.122 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 4.78e-01 0.0796 0.112 0.122 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 234603 sc-eQTL 8.77e-01 0.0158 0.102 0.122 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -958570 sc-eQTL 4.19e-01 0.103 0.127 0.122 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 3.58e-01 0.089 0.0966 0.122 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 4.48e-01 0.0492 0.0647 0.122 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 602966 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0474 0.111 0.122 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 623676 sc-eQTL 9.46e-01 0.0081 0.12 0.122 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0196 0.0844 0.122 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0332 0.0506 0.122 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 7.75e-01 0.0205 0.0714 0.122 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00233 0.1 0.122 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -958570 sc-eQTL 7.32e-01 0.0338 0.0984 0.122 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 3.33e-01 0.104 0.107 0.122 NK L1
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0298 0.0992 0.122 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0994 0.123 0.122 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0555 0.051 0.122 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 8.93e-01 0.0127 0.0945 0.122 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 1.15e-01 -0.197 0.124 0.122 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0221 0.0985 0.122 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 1.43e-01 0.174 0.119 0.122 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0161 0.0472 0.122 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 8.08e-01 0.0212 0.0869 0.122 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 7.08e-01 0.0485 0.129 0.122 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 9.13e-01 0.016 0.146 0.122 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 936256 sc-eQTL 6.32e-01 0.0639 0.133 0.122 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 1.50e-01 -0.18 0.124 0.122 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 1.30e-01 0.201 0.132 0.122 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0338 0.0713 0.122 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 8.35e-01 0.0265 0.127 0.122 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 4.44e-01 0.0957 0.125 0.122 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 2.18e-01 0.173 0.14 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 936256 sc-eQTL 1.20e-01 0.192 0.123 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 9.95e-02 0.133 0.0803 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 1.97e-01 0.157 0.121 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 9.72e-01 0.00261 0.0746 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 6.12e-02 0.241 0.128 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 2.67e-01 0.149 0.134 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 1.26e-02 -0.332 0.132 0.123 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 936256 sc-eQTL 7.08e-01 0.0463 0.123 0.123 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 9.11e-02 0.163 0.0962 0.123 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 3.20e-01 0.126 0.126 0.123 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 9.64e-01 0.00276 0.061 0.123 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 1.96e-01 0.144 0.111 0.123 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 1.99e-01 0.163 0.127 0.123 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 7.23e-01 -0.045 0.127 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 936256 sc-eQTL 9.56e-01 0.00774 0.14 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 5.33e-01 0.038 0.061 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 3.35e-01 -0.114 0.118 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 6.01e-01 0.0353 0.0674 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 2.00e-01 0.135 0.105 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 8.32e-01 0.0276 0.13 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 9.99e-01 0.000186 0.134 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 936256 sc-eQTL 8.53e-02 -0.225 0.13 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 5.84e-01 0.0391 0.0713 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 4.77e-01 0.0931 0.131 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 2.21e-01 0.0848 0.0691 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 8.36e-01 0.0254 0.123 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 1.07e-01 0.213 0.131 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 6.08e-03 0.369 0.133 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00203 0.135 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 2.60e-01 0.153 0.135 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 1.03e-01 0.102 0.0623 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 3.14e-01 0.11 0.108 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 1.09e-01 0.202 0.126 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0431 0.106 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 7.23e-01 0.0368 0.104 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 6.16e-01 0.0483 0.0962 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 8.41e-02 0.108 0.062 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 3.97e-02 0.157 0.0757 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 3.18e-01 0.12 0.12 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 1.68e-01 0.157 0.114 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 1.71e-01 0.157 0.114 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 6.78e-01 0.0471 0.113 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0133 0.0587 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 7.47e-01 0.0266 0.0822 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 3.23e-01 0.134 0.136 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 8.82e-01 0.0197 0.133 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 9.74e-02 -0.22 0.132 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 4.03e-01 0.107 0.127 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 2.72e-01 0.0575 0.0522 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 1.98e-01 0.116 0.0896 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 4.14e-01 0.106 0.13 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 4.26e-01 -0.093 0.117 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0687 0.109 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0551 0.124 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 3.56e-01 0.0613 0.0663 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 1.85e-01 0.149 0.112 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0174 0.129 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00886 0.126 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 5.47e-01 0.0807 0.134 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0668 0.116 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0127 0.0662 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 3.27e-01 0.0815 0.0829 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 8.36e-01 0.0274 0.133 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0209 0.145 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0641 0.134 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0681 0.133 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 4.20e-01 0.0523 0.0648 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 1.05e-01 0.174 0.107 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 5.63e-01 0.0823 0.142 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 8.00e-01 0.032 0.126 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0742 0.138 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 2.89e-01 0.145 0.137 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 7.02e-02 0.133 0.0731 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0934 0.121 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 5.00e-01 0.0942 0.139 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0296 0.133 0.121 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00447 0.127 0.121 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 2.32e-01 0.154 0.128 0.121 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0199 0.0633 0.121 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 7.35e-01 0.0302 0.0891 0.121 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0611 0.133 0.121 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 7.30e-01 0.05 0.144 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 9.33e-01 0.0112 0.134 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 7.16e-01 0.0495 0.136 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00911 0.0758 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 2.97e-01 0.118 0.113 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 2.86e-01 0.123 0.115 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0602 0.106 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 1.54e-01 -0.188 0.131 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0241 0.0524 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 7.60e-01 0.0355 0.116 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 1.77e-01 -0.186 0.138 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0869 0.126 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 9.84e-01 0.00252 0.127 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0594 0.0592 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 4.98e-01 0.0796 0.117 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 2.52e-01 0.136 0.119 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 5.13e-01 0.0755 0.115 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 4.30e-01 -0.102 0.13 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 5.23e-01 -0.045 0.0703 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 2.97e-01 -0.122 0.117 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 4.93e-01 0.105 0.152 0.137 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 936256 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0109 0.13 0.137 PB L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 2.19e-01 -0.133 0.108 0.137 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0429 0.132 0.137 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 1.07e-01 -0.121 0.0744 0.137 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00702 0.122 0.137 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0601 0.141 0.137 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 9.16e-01 0.0139 0.132 0.122 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 1.65e-01 0.164 0.118 0.122 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0294 0.127 0.122 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 9.39e-01 0.00368 0.0479 0.122 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 4.99e-01 0.065 0.0959 0.122 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 3.03e-02 0.267 0.123 0.122 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 6.08e-01 0.07 0.136 0.122 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 2.74e-02 0.282 0.127 0.122 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 3.97e-01 0.0915 0.108 0.122 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00239 0.0478 0.122 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 2.86e-01 0.107 0.1 0.122 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 3.57e-01 0.124 0.135 0.122 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 5.17e-02 0.286 0.146 0.12 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0602 0.116 0.12 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 602966 sc-eQTL 6.62e-01 0.0504 0.115 0.12 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 623676 sc-eQTL 8.10e-01 0.0326 0.135 0.12 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 8.94e-01 0.0177 0.132 0.12 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0374 0.0651 0.12 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 7.87e-01 0.0297 0.11 0.12 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 3.00e-02 0.279 0.127 0.12 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 234603 sc-eQTL 3.28e-01 -0.101 0.103 0.12 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -958570 sc-eQTL 5.05e-01 0.0847 0.127 0.12 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 4.98e-01 0.0775 0.114 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0218 0.0867 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 602966 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0119 0.123 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 623676 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0993 0.124 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 7.67e-01 0.0294 0.0989 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00693 0.0549 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 9.62e-01 0.0039 0.0819 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0352 0.106 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -958570 sc-eQTL 6.89e-01 0.0443 0.11 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 9.24e-01 0.0124 0.129 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 5.71e-01 0.053 0.0934 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 602966 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0165 0.117 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 623676 sc-eQTL 2.59e-01 0.143 0.126 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0221 0.083 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0227 0.0598 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 5.50e-01 0.0409 0.0683 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 7.87e-01 0.0299 0.111 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -958570 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0626 0.108 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 2.75e-01 -0.195 0.178 0.109 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 8.18e-01 0.0354 0.154 0.109 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0859 0.17 0.109 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 2.13e-01 0.0806 0.0644 0.109 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 1.05e-01 0.197 0.121 0.109 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00253 0.167 0.109 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 9.12e-01 0.0145 0.131 0.118 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0345 0.125 0.118 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 602966 sc-eQTL 5.94e-01 0.0674 0.126 0.118 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 623676 sc-eQTL 2.36e-01 0.148 0.125 0.118 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 1.86e-01 0.168 0.126 0.118 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00597 0.0553 0.118 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0464 0.0928 0.118 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0101 0.135 0.118 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -958570 sc-eQTL 7.27e-01 -0.045 0.129 0.118 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 5.14e-01 0.0875 0.134 0.12 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0576 0.0904 0.12 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 602966 sc-eQTL 3.65e-01 -0.116 0.127 0.12 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 623676 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0666 0.127 0.12 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 6.24e-01 0.0598 0.122 0.12 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0612 0.061 0.12 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 6.55e-01 0.0386 0.0865 0.12 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 2.72e-01 -0.119 0.108 0.12 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -958570 sc-eQTL 4.38e-01 0.0886 0.114 0.12 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 9.46e-01 0.0111 0.165 0.116 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0166 0.11 0.116 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 602966 sc-eQTL 8.44e-01 0.0217 0.11 0.116 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 623676 sc-eQTL 1.02e-01 0.183 0.111 0.116 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 6.82e-01 0.0549 0.134 0.116 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0715 0.092 0.116 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 5.25e-01 0.0595 0.0935 0.116 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0986 0.136 0.116 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 234603 sc-eQTL 9.72e-01 0.00459 0.131 0.116 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -958570 sc-eQTL 8.22e-01 0.026 0.116 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 4.18e-01 0.11 0.135 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 936256 sc-eQTL 5.13e-01 0.0862 0.132 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 5.33e-02 0.144 0.074 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 9.32e-02 0.198 0.117 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00252 0.0673 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 1.15e-01 0.165 0.105 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 1.36e-01 0.184 0.123 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 6.44e-01 -0.059 0.128 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 936256 sc-eQTL 3.98e-01 -0.118 0.14 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 3.19e-01 0.0574 0.0574 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0172 0.112 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 3.01e-01 0.0698 0.0674 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 3.13e-01 0.105 0.104 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 2.68e-01 0.141 0.127 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 4.80e-01 0.0723 0.102 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 4.96e-01 0.0485 0.0711 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 602966 sc-eQTL 8.23e-01 -0.026 0.116 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 623676 sc-eQTL 6.61e-01 0.0531 0.121 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 8.12e-01 0.019 0.0799 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0261 0.0548 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 9.67e-01 0.00308 0.0747 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 8.99e-01 0.0124 0.0975 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -958570 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0287 0.102 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 8.12e-01 0.031 0.13 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 7.62e-01 -0.026 0.0859 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 602966 sc-eQTL 1.93e-01 -0.164 0.126 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 623676 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0856 0.125 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 4.71e-01 0.0852 0.118 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00141 0.0501 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00127 0.0758 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 524392 sc-eQTL 5.00e-01 -0.082 0.121 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -958570 sc-eQTL 4.94e-01 0.0753 0.11 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -614439 sc-eQTL 1.87e-01 0.139 0.105 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 824533 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0425 0.0993 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 574272 sc-eQTL 2.95e-01 -0.132 0.125 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 523162 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0633 0.0511 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -980381 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0216 0.106 0.123 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 602966 eQTL 0.00537 0.0577 0.0207 0.0 0.0 0.147

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 602966 3.02e-07 1.59e-07 5.82e-08 2.24e-07 1.03e-07 9.05e-08 1.9e-07 5.43e-08 1.44e-07 6.4e-08 1.62e-07 1.05e-07 2.29e-07 8.13e-08 5.98e-08 7.97e-08 4.31e-08 1.64e-07 6.92e-08 5.35e-08 1.22e-07 1.39e-07 1.58e-07 3.07e-08 1.85e-07 1.23e-07 1.12e-07 1.12e-07 1.34e-07 1.07e-07 1.09e-07 4.47e-08 3.13e-08 9.78e-08 3.71e-08 3.11e-08 4.06e-08 9.17e-08 6.39e-08 5.35e-08 5.87e-08 1.62e-07 4.83e-08 1.43e-08 3.55e-08 1.19e-08 1.2e-07 1.91e-09 4.83e-08
ENSG00000118515 \N -980381 2.64e-07 1.16e-07 3.56e-08 1.82e-07 8.92e-08 9.3e-08 1.38e-07 5.49e-08 1.41e-07 4.38e-08 1.59e-07 7.88e-08 1.33e-07 6.21e-08 5.4e-08 7.5e-08 3.88e-08 1.14e-07 5.19e-08 4.21e-08 1.05e-07 1.27e-07 1.26e-07 4.13e-08 1.31e-07 1.19e-07 1.12e-07 9.15e-08 1.03e-07 1.12e-07 9.58e-08 3.7e-08 3.09e-08 8.65e-08 8.82e-08 3.93e-08 5.01e-08 9.68e-08 7.47e-08 3.55e-08 3.89e-08 1.35e-07 3.99e-08 1.81e-08 5.75e-08 1.66e-08 1.25e-07 4.04e-09 4.73e-08