logo

Genes within 1Mb (chr6:133337094:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 8.07e-01 -0.031 0.126 0.122 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 935619 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0395 0.133 0.122 B L1
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 1.33e-01 0.0755 0.0501 0.122 B L1
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 2.60e-01 0.106 0.0943 0.122 B L1
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0199 0.0572 0.122 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 5.74e-01 0.0496 0.0882 0.122 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 3.30e-02 0.256 0.119 0.122 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 8.95e-02 0.156 0.0916 0.122 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 3.22e-01 0.095 0.0957 0.122 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 3.82e-01 0.0726 0.0829 0.122 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 3.81e-01 0.0495 0.0564 0.122 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 1.13e-01 0.12 0.0755 0.122 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 3.17e-01 0.114 0.114 0.122 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0226 0.0911 0.122 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0644 0.095 0.122 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0471 0.111 0.122 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0128 0.0379 0.122 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 8.17e-01 0.0136 0.0585 0.122 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00121 0.115 0.122 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 4.76e-02 0.28 0.14 0.122 DC L1
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 5.88e-01 0.0478 0.0881 0.122 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 602329 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0208 0.109 0.122 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 623039 sc-eQTL 8.82e-01 0.0175 0.118 0.122 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 1.46e-01 0.183 0.126 0.122 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 9.74e-01 0.00227 0.0708 0.122 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 6.23e-01 0.0404 0.0821 0.122 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 4.78e-01 0.0796 0.112 0.122 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 233966 sc-eQTL 8.77e-01 0.0158 0.102 0.122 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -959207 sc-eQTL 4.19e-01 0.103 0.127 0.122 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 3.58e-01 0.089 0.0966 0.122 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 4.48e-01 0.0492 0.0647 0.122 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 602329 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0474 0.111 0.122 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 623039 sc-eQTL 9.46e-01 0.0081 0.12 0.122 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0196 0.0844 0.122 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0332 0.0506 0.122 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 7.75e-01 0.0205 0.0714 0.122 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00233 0.1 0.122 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -959207 sc-eQTL 7.32e-01 0.0338 0.0984 0.122 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 3.33e-01 0.104 0.107 0.122 NK L1
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0298 0.0992 0.122 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0994 0.123 0.122 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0555 0.051 0.122 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 8.93e-01 0.0127 0.0945 0.122 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 1.15e-01 -0.197 0.124 0.122 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0221 0.0985 0.122 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 1.43e-01 0.174 0.119 0.122 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0161 0.0472 0.122 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 8.08e-01 0.0212 0.0869 0.122 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 7.08e-01 0.0485 0.129 0.122 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 9.13e-01 0.016 0.146 0.122 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 935619 sc-eQTL 6.32e-01 0.0639 0.133 0.122 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 1.50e-01 -0.18 0.124 0.122 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 1.30e-01 0.201 0.132 0.122 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0338 0.0713 0.122 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 8.35e-01 0.0265 0.127 0.122 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 4.44e-01 0.0957 0.125 0.122 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 2.18e-01 0.173 0.14 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 935619 sc-eQTL 1.20e-01 0.192 0.123 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 9.95e-02 0.133 0.0803 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 1.97e-01 0.157 0.121 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 9.72e-01 0.00261 0.0746 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 6.12e-02 0.241 0.128 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 2.67e-01 0.149 0.134 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 1.26e-02 -0.332 0.132 0.123 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 935619 sc-eQTL 7.08e-01 0.0463 0.123 0.123 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 9.11e-02 0.163 0.0962 0.123 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 3.20e-01 0.126 0.126 0.123 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 9.64e-01 0.00276 0.061 0.123 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 1.96e-01 0.144 0.111 0.123 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 1.99e-01 0.163 0.127 0.123 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 7.23e-01 -0.045 0.127 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 935619 sc-eQTL 9.56e-01 0.00774 0.14 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 5.33e-01 0.038 0.061 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 3.35e-01 -0.114 0.118 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 6.01e-01 0.0353 0.0674 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 2.00e-01 0.135 0.105 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 8.32e-01 0.0276 0.13 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 9.99e-01 0.000186 0.134 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 935619 sc-eQTL 8.53e-02 -0.225 0.13 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 5.84e-01 0.0391 0.0713 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 4.77e-01 0.0931 0.131 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 2.21e-01 0.0848 0.0691 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 8.36e-01 0.0254 0.123 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 1.07e-01 0.213 0.131 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 6.08e-03 0.369 0.133 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00203 0.135 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 2.60e-01 0.153 0.135 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 1.03e-01 0.102 0.0623 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 3.14e-01 0.11 0.108 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 1.09e-01 0.202 0.126 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0431 0.106 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 7.23e-01 0.0368 0.104 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 6.16e-01 0.0483 0.0962 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 8.41e-02 0.108 0.062 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 3.97e-02 0.157 0.0757 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 3.18e-01 0.12 0.12 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 1.68e-01 0.157 0.114 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 1.71e-01 0.157 0.114 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 6.78e-01 0.0471 0.113 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0133 0.0587 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 7.47e-01 0.0266 0.0822 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 3.23e-01 0.134 0.136 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 8.82e-01 0.0197 0.133 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 9.74e-02 -0.22 0.132 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 4.03e-01 0.107 0.127 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 2.72e-01 0.0575 0.0522 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 1.98e-01 0.116 0.0896 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 4.14e-01 0.106 0.13 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 4.26e-01 -0.093 0.117 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0687 0.109 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0551 0.124 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 3.56e-01 0.0613 0.0663 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 1.85e-01 0.149 0.112 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0174 0.129 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00886 0.126 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 5.47e-01 0.0807 0.134 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0668 0.116 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0127 0.0662 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 3.27e-01 0.0815 0.0829 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 8.36e-01 0.0274 0.133 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0209 0.145 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0641 0.134 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0681 0.133 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 4.20e-01 0.0523 0.0648 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 1.05e-01 0.174 0.107 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 5.63e-01 0.0823 0.142 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 8.00e-01 0.032 0.126 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0742 0.138 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 2.89e-01 0.145 0.137 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 7.02e-02 0.133 0.0731 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0934 0.121 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 5.00e-01 0.0942 0.139 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0296 0.133 0.121 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00447 0.127 0.121 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 2.32e-01 0.154 0.128 0.121 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0199 0.0633 0.121 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 7.35e-01 0.0302 0.0891 0.121 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0611 0.133 0.121 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 7.30e-01 0.05 0.144 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 9.33e-01 0.0112 0.134 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 7.16e-01 0.0495 0.136 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00911 0.0758 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 2.97e-01 0.118 0.113 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 2.86e-01 0.123 0.115 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0602 0.106 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 1.54e-01 -0.188 0.131 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0241 0.0524 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 7.60e-01 0.0355 0.116 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 1.77e-01 -0.186 0.138 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0869 0.126 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 9.84e-01 0.00252 0.127 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0594 0.0592 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 4.98e-01 0.0796 0.117 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 2.52e-01 0.136 0.119 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 5.13e-01 0.0755 0.115 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 4.30e-01 -0.102 0.13 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 5.23e-01 -0.045 0.0703 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 2.97e-01 -0.122 0.117 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 4.93e-01 0.105 0.152 0.137 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 935619 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0109 0.13 0.137 PB L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 2.19e-01 -0.133 0.108 0.137 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0429 0.132 0.137 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 1.07e-01 -0.121 0.0744 0.137 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00702 0.122 0.137 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0601 0.141 0.137 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 9.16e-01 0.0139 0.132 0.122 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 1.65e-01 0.164 0.118 0.122 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0294 0.127 0.122 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 9.39e-01 0.00368 0.0479 0.122 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 4.99e-01 0.065 0.0959 0.122 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 3.03e-02 0.267 0.123 0.122 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 6.08e-01 0.07 0.136 0.122 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 2.74e-02 0.282 0.127 0.122 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 3.97e-01 0.0915 0.108 0.122 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00239 0.0478 0.122 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 2.86e-01 0.107 0.1 0.122 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 3.57e-01 0.124 0.135 0.122 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 5.17e-02 0.286 0.146 0.12 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0602 0.116 0.12 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 602329 sc-eQTL 6.62e-01 0.0504 0.115 0.12 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 623039 sc-eQTL 8.10e-01 0.0326 0.135 0.12 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 8.94e-01 0.0177 0.132 0.12 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0374 0.0651 0.12 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 7.87e-01 0.0297 0.11 0.12 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 3.00e-02 0.279 0.127 0.12 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 233966 sc-eQTL 3.28e-01 -0.101 0.103 0.12 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -959207 sc-eQTL 5.05e-01 0.0847 0.127 0.12 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 4.98e-01 0.0775 0.114 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0218 0.0867 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 602329 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0119 0.123 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 623039 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0993 0.124 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 7.67e-01 0.0294 0.0989 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00693 0.0549 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 9.62e-01 0.0039 0.0819 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0352 0.106 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -959207 sc-eQTL 6.89e-01 0.0443 0.11 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 9.24e-01 0.0124 0.129 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 5.71e-01 0.053 0.0934 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 602329 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0165 0.117 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 623039 sc-eQTL 2.59e-01 0.143 0.126 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0221 0.083 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0227 0.0598 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 5.50e-01 0.0409 0.0683 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 7.87e-01 0.0299 0.111 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -959207 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0626 0.108 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 2.75e-01 -0.195 0.178 0.109 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 8.18e-01 0.0354 0.154 0.109 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0859 0.17 0.109 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 2.13e-01 0.0806 0.0644 0.109 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 1.05e-01 0.197 0.121 0.109 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00253 0.167 0.109 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 9.12e-01 0.0145 0.131 0.118 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0345 0.125 0.118 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 602329 sc-eQTL 5.94e-01 0.0674 0.126 0.118 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 623039 sc-eQTL 2.36e-01 0.148 0.125 0.118 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 1.86e-01 0.168 0.126 0.118 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00597 0.0553 0.118 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0464 0.0928 0.118 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0101 0.135 0.118 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -959207 sc-eQTL 7.27e-01 -0.045 0.129 0.118 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 5.14e-01 0.0875 0.134 0.12 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0576 0.0904 0.12 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 602329 sc-eQTL 3.65e-01 -0.116 0.127 0.12 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 623039 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0666 0.127 0.12 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 6.24e-01 0.0598 0.122 0.12 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0612 0.061 0.12 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 6.55e-01 0.0386 0.0865 0.12 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 2.72e-01 -0.119 0.108 0.12 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -959207 sc-eQTL 4.38e-01 0.0886 0.114 0.12 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 9.46e-01 0.0111 0.165 0.116 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0166 0.11 0.116 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 602329 sc-eQTL 8.44e-01 0.0217 0.11 0.116 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 623039 sc-eQTL 1.02e-01 0.183 0.111 0.116 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 6.82e-01 0.0549 0.134 0.116 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0715 0.092 0.116 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 5.25e-01 0.0595 0.0935 0.116 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0986 0.136 0.116 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 233966 sc-eQTL 9.72e-01 0.00459 0.131 0.116 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -959207 sc-eQTL 8.22e-01 0.026 0.116 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 4.18e-01 0.11 0.135 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 935619 sc-eQTL 5.13e-01 0.0862 0.132 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 5.33e-02 0.144 0.074 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 9.32e-02 0.198 0.117 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00252 0.0673 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 1.15e-01 0.165 0.105 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 1.36e-01 0.184 0.123 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 6.44e-01 -0.059 0.128 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 935619 sc-eQTL 3.98e-01 -0.118 0.14 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 3.19e-01 0.0574 0.0574 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0172 0.112 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 3.01e-01 0.0698 0.0674 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 3.13e-01 0.105 0.104 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 2.68e-01 0.141 0.127 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 4.80e-01 0.0723 0.102 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 4.96e-01 0.0485 0.0711 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 602329 sc-eQTL 8.23e-01 -0.026 0.116 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 623039 sc-eQTL 6.61e-01 0.0531 0.121 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 8.12e-01 0.019 0.0799 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0261 0.0548 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 9.67e-01 0.00308 0.0747 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 8.99e-01 0.0124 0.0975 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -959207 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0287 0.102 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 8.12e-01 0.031 0.13 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 7.62e-01 -0.026 0.0859 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 602329 sc-eQTL 1.93e-01 -0.164 0.126 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 623039 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0856 0.125 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 4.71e-01 0.0852 0.118 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00141 0.0501 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00127 0.0758 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 523755 sc-eQTL 5.00e-01 -0.082 0.121 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -959207 sc-eQTL 4.94e-01 0.0753 0.11 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -615076 sc-eQTL 1.87e-01 0.139 0.105 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 823896 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0425 0.0993 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 573635 sc-eQTL 2.95e-01 -0.132 0.125 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 522525 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0633 0.0511 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -981018 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0216 0.106 0.123 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 602329 eQTL 0.00534 0.0577 0.0207 0.0 0.0 0.146

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 602329 4.89e-07 2.4e-07 7.87e-08 2.43e-07 1.05e-07 1.25e-07 3.33e-07 8.17e-08 2.6e-07 1.5e-07 2.98e-07 2.09e-07 3.77e-07 8.26e-08 9.2e-08 1.46e-07 8.74e-08 2.9e-07 9.19e-08 8.69e-08 1.48e-07 2.3e-07 2.2e-07 4.91e-08 3.27e-07 2.13e-07 1.72e-07 1.54e-07 1.87e-07 1.85e-07 1.71e-07 4.78e-08 4.76e-08 1.23e-07 9.25e-08 5.32e-08 5.71e-08 6.78e-08 4.83e-08 8.2e-08 5.03e-08 2.19e-07 3.65e-08 1.1e-08 4.06e-08 1.03e-08 8.94e-08 0.0 4.52e-08
ENSG00000118515 \N -981018 2.67e-07 1.3e-07 5.14e-08 1.82e-07 9.24e-08 9.76e-08 1.61e-07 5.43e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.52e-07 1.01e-07 1.47e-07 7.13e-08 5.91e-08 7.5e-08 4.09e-08 1.4e-07 5.97e-08 4.16e-08 1.21e-07 1.24e-07 1.45e-07 2.95e-08 1.5e-07 1.26e-07 1.07e-07 9.61e-08 1.16e-07 1.03e-07 9.92e-08 3.64e-08 3.61e-08 8.23e-08 7.36e-08 3.53e-08 4.99e-08 9.26e-08 6.54e-08 3.87e-08 4.36e-08 1.36e-07 5.27e-08 3.06e-08 5.43e-08 1.83e-08 1.22e-07 3.83e-09 4.88e-08