logo

Genes within 1Mb (chr6:133326794:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0329 0.129 0.118 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 925319 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0269 0.137 0.118 B L1
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 1.66e-01 0.0714 0.0513 0.118 B L1
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 1.61e-01 0.136 0.0965 0.118 B L1
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0151 0.0586 0.118 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 5.56e-01 0.0533 0.0903 0.118 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 4.27e-02 0.249 0.122 0.118 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 9.78e-02 0.156 0.094 0.118 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 3.59e-01 0.0903 0.0982 0.118 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 2.75e-01 0.0931 0.085 0.118 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 2.38e-01 0.0683 0.0578 0.118 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 1.30e-01 0.118 0.0775 0.118 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 3.72e-01 0.105 0.117 0.118 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0143 0.0934 0.118 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0533 0.0975 0.118 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0637 0.114 0.118 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0107 0.0389 0.118 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 8.17e-01 0.0139 0.06 0.118 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000869 0.118 0.118 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 1.48e-02 0.354 0.144 0.117 DC L1
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 5.54e-01 0.0538 0.0907 0.117 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 592029 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0201 0.113 0.117 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 612739 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0112 0.122 0.117 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 9.22e-02 0.218 0.129 0.117 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 9.63e-01 0.0034 0.0729 0.117 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 9.88e-01 0.00127 0.0846 0.117 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 4.98e-01 0.0783 0.115 0.117 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 223666 sc-eQTL 7.17e-01 0.0382 0.105 0.117 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -969507 sc-eQTL 4.19e-01 0.106 0.131 0.117 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 4.33e-01 0.0781 0.0993 0.118 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 5.19e-01 0.0429 0.0665 0.118 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 592029 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0814 0.114 0.118 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 612739 sc-eQTL 9.86e-01 0.00222 0.123 0.118 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 9.26e-01 0.00808 0.0867 0.118 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0323 0.0519 0.118 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0179 0.0734 0.118 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 9.60e-01 0.00521 0.103 0.118 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -969507 sc-eQTL 9.35e-01 0.00821 0.101 0.118 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 3.89e-01 0.0946 0.11 0.118 NK L1
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0212 0.102 0.118 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0725 0.126 0.118 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0404 0.0522 0.118 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0157 0.0967 0.118 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 1.02e-01 -0.209 0.128 0.118 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0335 0.101 0.118 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 1.57e-01 0.173 0.122 0.118 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 8.59e-01 -0.00862 0.0485 0.118 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 7.54e-01 0.028 0.0892 0.118 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 7.38e-01 0.0445 0.133 0.118 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 9.22e-01 0.0144 0.147 0.12 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 925319 sc-eQTL 6.47e-01 0.0615 0.134 0.12 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 1.58e-01 -0.177 0.125 0.12 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 9.42e-02 0.223 0.133 0.12 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0174 0.0717 0.12 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 7.50e-01 0.0408 0.128 0.12 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 5.19e-01 0.081 0.125 0.12 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 1.10e-01 0.231 0.143 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 925319 sc-eQTL 1.81e-01 0.169 0.126 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 1.57e-01 0.117 0.0826 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 1.49e-01 0.18 0.124 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 9.31e-01 0.00668 0.0765 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 7.48e-02 0.235 0.131 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 1.56e-01 0.195 0.137 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 1.52e-02 -0.331 0.135 0.119 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 925319 sc-eQTL 8.19e-01 0.029 0.127 0.119 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 2.61e-01 0.112 0.0991 0.119 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 1.26e-01 0.199 0.129 0.119 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 6.98e-01 0.0243 0.0626 0.119 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 2.85e-01 0.123 0.115 0.119 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 2.58e-01 0.148 0.13 0.119 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 9.98e-01 0.000335 0.13 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 925319 sc-eQTL 8.36e-01 0.0297 0.143 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 4.26e-01 0.0498 0.0624 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 3.83e-01 -0.106 0.121 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 5.79e-01 0.0384 0.0691 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 2.60e-01 0.122 0.108 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 9.07e-01 0.0156 0.133 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0228 0.138 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 925319 sc-eQTL 9.97e-02 -0.22 0.133 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 8.89e-01 0.0102 0.073 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 4.16e-01 0.109 0.134 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 2.23e-01 0.0865 0.0708 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 9.84e-01 0.00256 0.125 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 1.15e-01 0.213 0.135 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 2.82e-03 0.414 0.137 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0285 0.139 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 1.96e-01 0.181 0.14 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 6.12e-02 0.121 0.0643 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 5.28e-01 0.071 0.112 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 5.60e-02 0.249 0.13 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0378 0.109 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 6.53e-01 0.048 0.107 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 4.67e-01 0.072 0.0987 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 4.80e-02 0.126 0.0635 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 4.65e-02 0.156 0.0778 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 4.28e-01 0.0979 0.123 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 2.35e-01 0.139 0.117 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 2.24e-01 0.143 0.118 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 6.44e-01 0.0538 0.116 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 8.77e-01 0.00931 0.0603 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 9.06e-01 0.00992 0.0843 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 2.33e-01 0.166 0.139 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 9.18e-01 0.014 0.136 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 1.07e-01 -0.22 0.136 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 2.60e-01 0.147 0.131 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 1.93e-01 0.0699 0.0535 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 2.23e-01 0.112 0.092 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 4.25e-01 0.106 0.133 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0781 0.12 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0585 0.112 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0265 0.127 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 2.68e-01 0.0754 0.068 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 3.02e-01 0.119 0.115 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00206 0.132 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 9.28e-01 0.0116 0.129 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 4.99e-01 0.0932 0.137 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 3.26e-01 -0.117 0.118 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 8.90e-01 -0.00943 0.0679 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 2.82e-01 0.0917 0.085 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 7.25e-01 0.048 0.136 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 9.20e-01 0.015 0.149 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0597 0.138 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 4.45e-01 -0.105 0.137 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 4.25e-01 0.0532 0.0666 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 1.74e-01 0.15 0.11 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 6.14e-01 0.0737 0.146 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 8.56e-01 0.0236 0.13 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0753 0.142 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 2.10e-01 0.177 0.14 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 3.71e-02 0.157 0.075 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0764 0.124 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 5.63e-01 0.0829 0.143 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0226 0.137 0.117 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 9.01e-01 0.0162 0.13 0.117 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 2.53e-01 0.151 0.132 0.117 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 9.91e-01 0.000718 0.0651 0.117 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 5.50e-01 0.0548 0.0915 0.117 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0691 0.136 0.117 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00628 0.148 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00391 0.138 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 6.88e-01 0.0562 0.14 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 8.24e-01 0.0173 0.0779 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 3.86e-01 0.101 0.116 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 2.64e-01 0.132 0.118 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0429 0.108 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 2.53e-01 -0.154 0.135 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 9.90e-01 0.000691 0.0536 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0108 0.119 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 1.79e-01 -0.191 0.141 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 3.64e-01 -0.117 0.129 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 7.45e-01 0.0427 0.131 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0451 0.0609 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 4.13e-01 0.0988 0.12 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 3.76e-01 0.108 0.122 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 4.58e-01 0.0879 0.118 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0988 0.133 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0167 0.0722 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 3.24e-01 -0.118 0.12 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 5.56e-01 0.0944 0.16 0.13 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 925319 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0875 0.136 0.13 PB L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 9.75e-02 -0.188 0.113 0.13 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0343 0.139 0.13 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 2.83e-01 -0.085 0.0788 0.13 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 9.66e-01 0.0055 0.128 0.13 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 2.94e-01 -0.156 0.148 0.13 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 9.75e-01 0.00434 0.136 0.117 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 2.11e-01 0.152 0.121 0.117 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 8.62e-01 0.0225 0.13 0.117 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 8.11e-01 0.0118 0.0492 0.117 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 6.56e-01 0.044 0.0986 0.117 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 2.61e-02 0.282 0.126 0.117 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 4.99e-01 0.0946 0.14 0.118 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 3.40e-02 0.278 0.13 0.118 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 4.01e-01 0.0932 0.111 0.118 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 8.76e-01 0.00767 0.049 0.118 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 3.92e-01 0.0885 0.103 0.118 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 3.00e-01 0.144 0.138 0.118 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 3.64e-02 0.318 0.151 0.115 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0769 0.12 0.115 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 592029 sc-eQTL 6.27e-01 0.0578 0.119 0.115 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 612739 sc-eQTL 9.36e-01 0.0113 0.14 0.115 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 7.21e-01 0.0487 0.136 0.115 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0383 0.0672 0.115 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0311 0.113 0.115 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 2.64e-02 0.294 0.131 0.115 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 223666 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0957 0.106 0.115 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -969507 sc-eQTL 4.70e-01 0.0948 0.131 0.115 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 5.90e-01 0.0635 0.118 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0285 0.0894 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 592029 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0542 0.126 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 612739 sc-eQTL 3.33e-01 -0.123 0.127 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 5.31e-01 0.0639 0.102 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00573 0.0566 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0471 0.0844 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0298 0.109 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -969507 sc-eQTL 9.42e-01 0.00835 0.114 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 9.04e-01 0.016 0.133 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 6.10e-01 0.0492 0.0962 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 592029 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0177 0.12 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 612739 sc-eQTL 2.18e-01 0.161 0.13 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 8.68e-01 0.0143 0.0855 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0224 0.0616 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 9.14e-01 0.00758 0.0704 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 7.34e-01 0.0388 0.114 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -969507 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0573 0.111 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 3.24e-01 -0.183 0.185 0.103 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 9.54e-01 0.00932 0.16 0.103 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 4.36e-01 -0.138 0.176 0.103 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 2.85e-01 0.0718 0.067 0.103 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 1.29e-01 0.192 0.126 0.103 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 9.31e-01 0.0152 0.174 0.103 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0143 0.135 0.113 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0502 0.129 0.113 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 592029 sc-eQTL 5.95e-01 0.0693 0.13 0.113 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 612739 sc-eQTL 3.19e-01 0.128 0.128 0.113 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 1.79e-01 0.176 0.13 0.113 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 9.41e-01 0.00421 0.0569 0.113 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0953 0.0953 0.113 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0233 0.138 0.113 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -969507 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0835 0.132 0.113 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 4.65e-01 0.1 0.137 0.115 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0685 0.0927 0.115 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 592029 sc-eQTL 2.80e-01 -0.142 0.131 0.115 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 612739 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0722 0.13 0.115 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 5.21e-01 0.0804 0.125 0.115 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0515 0.0626 0.115 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 8.31e-01 0.019 0.0888 0.115 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 2.91e-01 -0.117 0.111 0.115 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -969507 sc-eQTL 5.40e-01 0.0719 0.117 0.115 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 5.02e-01 0.115 0.172 0.11 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00607 0.114 0.11 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 592029 sc-eQTL 9.15e-01 0.0123 0.115 0.11 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 612739 sc-eQTL 9.19e-02 0.197 0.116 0.11 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 5.97e-01 0.0739 0.14 0.11 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0754 0.096 0.11 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 5.66e-01 0.0562 0.0976 0.11 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0956 0.142 0.11 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 223666 sc-eQTL 8.29e-01 0.0294 0.136 0.11 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -969507 sc-eQTL 9.49e-01 0.00781 0.121 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 2.82e-01 0.149 0.138 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 925319 sc-eQTL 5.65e-01 0.0778 0.135 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 1.18e-01 0.119 0.076 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 3.00e-02 0.261 0.12 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 9.40e-01 0.00517 0.0689 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 1.34e-01 0.161 0.107 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 8.62e-02 0.216 0.126 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0451 0.131 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 925319 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0927 0.143 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 3.97e-01 0.0499 0.0587 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000403 0.114 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 2.87e-01 0.0736 0.0689 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 3.93e-01 0.0914 0.107 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 3.11e-01 0.132 0.13 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 5.48e-01 0.0631 0.105 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 5.64e-01 0.0421 0.0729 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 592029 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0618 0.119 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 612739 sc-eQTL 6.92e-01 0.0492 0.124 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 5.50e-01 0.049 0.082 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0242 0.0562 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0439 0.0766 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 8.66e-01 0.017 0.1 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -969507 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0572 0.105 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 8.96e-01 0.0174 0.134 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0339 0.0881 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 592029 sc-eQTL 1.22e-01 -0.2 0.129 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 612739 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0973 0.128 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 4.40e-01 0.0936 0.121 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 8.79e-01 0.00781 0.0514 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0249 0.0778 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 513455 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0914 0.125 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -969507 sc-eQTL 5.94e-01 0.0601 0.113 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -625376 sc-eQTL 2.10e-01 0.136 0.108 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 813596 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0328 0.102 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 563335 sc-eQTL 4.33e-01 -0.101 0.129 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 512225 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0461 0.0524 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -991318 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0461 0.108 0.119 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 592029 eQTL 0.0102 0.0542 0.0211 0.0 0.0 0.139

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 592029 2.95e-07 5.74e-07 4.48e-08 2.87e-07 9.24e-08 9.91e-08 1.81e-07 5.53e-08 1.47e-07 6.75e-08 1.86e-07 1.86e-07 2.38e-07 1.07e-07 5.97e-08 7.53e-08 4.31e-08 1.51e-07 5.82e-08 4.42e-08 1.19e-07 1.25e-07 1.58e-07 3.03e-08 1.98e-07 1.22e-07 1.1e-07 1.06e-07 1.22e-07 1.03e-07 1.35e-07 3.64e-08 3.16e-08 8.89e-08 6.25e-08 3.11e-08 4.43e-08 9.26e-08 6.41e-08 8.34e-08 4.76e-08 1.55e-07 5.08e-08 3.36e-08 4.25e-08 1.65e-08 1.26e-07 3.79e-09 4.81e-08
ENSG00000118515 \N -991318 2.66e-07 1.27e-07 3.35e-08 1.84e-07 9.65e-08 9.32e-08 1.42e-07 5.35e-08 1.42e-07 4.38e-08 1.59e-07 8.14e-08 1.26e-07 6.76e-08 5.53e-08 7.87e-08 4.94e-08 1.1e-07 5.22e-08 3.29e-08 1.06e-07 1.33e-07 1.3e-07 4.82e-08 1.31e-07 1.15e-07 1.1e-07 8.7e-08 9.88e-08 1.1e-07 9.73e-08 3.84e-08 2.74e-08 8.68e-08 8.96e-08 3.77e-08 4.84e-08 9.25e-08 7.63e-08 3.87e-08 2.99e-08 1.35e-07 4.04e-08 0.0 7.91e-08 1.69e-08 1.44e-07 4.26e-09 4.85e-08