logo

Genes within 1Mb (chr6:133315673:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0566 0.1 0.226 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 914198 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0168 0.106 0.226 B L1
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 1.02e-01 -0.0651 0.0396 0.226 B L1
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0136 0.0749 0.226 B L1
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 8.01e-01 0.0115 0.0453 0.226 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 2.66e-01 -0.106 0.0951 0.226 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 8.13e-01 0.0174 0.0738 0.226 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0102 0.0768 0.226 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0145 0.0665 0.226 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 2.18e-01 0.0556 0.045 0.226 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0707 0.0913 0.226 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 9.07e-01 0.0086 0.0738 0.226 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0273 0.077 0.226 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 1.04e-01 -0.146 0.0894 0.226 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 8.55e-01 0.00561 0.0307 0.226 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 2.40e-01 -0.109 0.0927 0.226 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0175 0.111 0.225 DC L1
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 2.36e-01 -0.082 0.0691 0.225 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 580908 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0312 0.0859 0.225 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 601618 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0669 0.0926 0.225 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 1.51e-01 -0.142 0.0987 0.225 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 2.98e-01 0.0579 0.0555 0.225 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 2.01e-01 0.112 0.0877 0.225 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 212545 sc-eQTL 5.18e-02 -0.155 0.0794 0.225 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -980628 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0468 0.0998 0.225 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 4.30e-01 0.0607 0.0769 0.226 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0164 0.0515 0.226 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 580908 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00406 0.0884 0.226 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 601618 sc-eQTL 2.23e-01 -0.116 0.0948 0.226 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0823 0.0669 0.226 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 2.81e-01 0.0434 0.0401 0.226 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 9.83e-01 0.00167 0.0796 0.226 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -980628 sc-eQTL 7.70e-01 0.0229 0.0782 0.226 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0318 0.0844 0.225 NK L1
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 1.85e-02 -0.183 0.0771 0.225 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00918 0.0972 0.225 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 1.36e-01 0.0598 0.04 0.225 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 3.65e-01 0.0882 0.097 0.226 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0854 0.0763 0.226 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 2.64e-01 -0.103 0.0923 0.226 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 1.87e-01 0.0484 0.0365 0.226 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0437 0.1 0.226 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0696 0.116 0.232 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 914198 sc-eQTL 5.52e-01 0.0631 0.106 0.232 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 4.03e-01 0.0832 0.0992 0.232 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0283 0.106 0.232 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 8.77e-01 -0.00876 0.0567 0.232 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0598 0.0992 0.232 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0836 0.109 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 914198 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0895 0.096 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 2.85e-03 -0.186 0.0616 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0463 0.0948 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 2.41e-01 0.068 0.0579 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0525 0.105 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0416 0.104 0.224 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 914198 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0256 0.0956 0.224 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0682 0.0749 0.224 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0861 0.098 0.224 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 8.36e-01 -0.00979 0.0473 0.224 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 3.06e-01 -0.101 0.0984 0.224 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0681 0.0996 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 914198 sc-eQTL 7.99e-01 0.028 0.11 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0557 0.0478 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 1.21e-01 0.144 0.0925 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 3.57e-01 0.0488 0.0529 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 3.17e-01 -0.102 0.102 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0826 0.104 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 914198 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0932 0.101 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0444 0.0551 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0866 0.101 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 9.00e-01 0.00673 0.0537 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 2.99e-01 -0.106 0.102 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0342 0.104 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 2.39e-01 0.121 0.103 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 1.65e-02 -0.248 0.103 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 1.84e-01 0.0638 0.0479 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0677 0.0968 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 8.89e-01 0.0118 0.0845 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 5.30e-01 0.052 0.0827 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 7.04e-01 0.0292 0.0767 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 1.04e-01 0.0807 0.0495 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0725 0.0957 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 3.20e-01 -0.09 0.0903 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0867 0.091 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0245 0.0899 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 4.29e-01 0.0369 0.0465 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 2.16e-01 -0.133 0.108 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0205 0.104 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0835 0.104 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 7.22e-01 0.0357 0.1 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 8.67e-02 0.0702 0.0408 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0992 0.102 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0318 0.0932 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 9.28e-01 0.00792 0.0871 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 1.56e-01 -0.14 0.0985 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 7.18e-01 0.0191 0.053 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0839 0.102 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 4.17e-01 0.0793 0.0975 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 2.13e-01 -0.129 0.104 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0271 0.0897 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 9.23e-02 0.0863 0.051 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 2.81e-01 -0.111 0.103 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 7.43e-01 0.0363 0.111 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 5.79e-01 0.0569 0.102 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0278 0.102 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 7.38e-02 0.0884 0.0492 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0491 0.109 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 2.77e-01 0.107 0.098 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 5.35e-01 0.0666 0.107 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 9.64e-02 -0.177 0.106 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0205 0.0574 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 4.61e-01 -0.08 0.108 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 4.65e-01 0.0749 0.102 0.227 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0303 0.0972 0.227 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 2.17e-01 -0.122 0.0986 0.227 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 6.40e-02 0.0899 0.0483 0.227 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 7.26e-01 0.0358 0.102 0.227 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 3.32e-01 0.107 0.11 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0124 0.102 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 4.71e-01 0.0747 0.103 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0422 0.0576 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 8.95e-01 -0.012 0.0907 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 1.05e-01 -0.134 0.0825 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 6.08e-01 0.0533 0.104 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 3.82e-01 0.036 0.0411 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 8.76e-01 0.0179 0.114 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0778 0.104 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0763 0.105 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 7.15e-01 0.018 0.0491 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0307 0.0931 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 1.07e-01 -0.145 0.0897 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 7.57e-01 0.0314 0.101 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 8.07e-01 0.0135 0.055 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 4.99e-01 0.0868 0.128 0.233 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 914198 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0787 0.109 0.233 PB L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 6.00e-01 0.048 0.0913 0.233 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 2.36e-01 -0.132 0.111 0.233 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 1.28e-01 0.0961 0.0627 0.233 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 9.60e-01 0.00604 0.119 0.233 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 2.75e-01 0.113 0.104 0.228 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 1.43e-01 -0.136 0.0923 0.228 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00912 0.0995 0.228 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 3.33e-01 0.0364 0.0376 0.228 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0656 0.0973 0.228 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 9.99e-01 8.88e-05 0.106 0.226 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 9.97e-01 0.00036 0.0998 0.226 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0934 0.0837 0.226 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 9.00e-01 0.00465 0.0371 0.226 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 4.79e-02 0.207 0.104 0.226 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0517 0.111 0.229 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 6.96e-01 -0.034 0.087 0.229 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 580908 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0931 0.0862 0.229 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 601618 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0513 0.102 0.229 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 1.40e-01 -0.146 0.0985 0.229 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 9.64e-01 0.00223 0.0489 0.229 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0307 0.0968 0.229 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 212545 sc-eQTL 3.92e-02 -0.159 0.0765 0.229 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -980628 sc-eQTL 6.52e-01 0.043 0.0952 0.229 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0456 0.0873 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 9.48e-01 0.00429 0.0663 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 580908 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0441 0.0937 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 601618 sc-eQTL 2.52e-01 -0.108 0.0943 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0898 0.0754 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 5.53e-01 0.0249 0.042 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 8.54e-01 0.015 0.081 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -980628 sc-eQTL 4.86e-01 0.0588 0.0842 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 2.84e-01 0.107 0.0999 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0229 0.0724 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 580908 sc-eQTL 7.25e-01 0.0318 0.0904 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 601618 sc-eQTL 2.11e-01 -0.123 0.0978 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0643 0.0641 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 2.57e-01 0.0524 0.0461 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0414 0.0856 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -980628 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0638 0.0837 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0281 0.127 0.242 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 7.10e-02 -0.196 0.108 0.242 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 5.16e-01 0.0784 0.12 0.242 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 9.33e-01 0.00388 0.0459 0.242 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0937 0.118 0.242 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0407 0.102 0.222 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00882 0.0972 0.222 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 580908 sc-eQTL 1.36e-01 -0.146 0.0976 0.222 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 601618 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0443 0.097 0.222 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0687 0.0985 0.222 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 9.60e-01 0.00218 0.0429 0.222 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 8.18e-01 0.0241 0.104 0.222 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -980628 sc-eQTL 6.30e-01 0.0483 0.0999 0.222 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 4.83e-01 0.074 0.105 0.231 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0302 0.0713 0.231 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 580908 sc-eQTL 2.34e-01 -0.12 0.1 0.231 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 601618 sc-eQTL 1.13e-01 -0.158 0.0993 0.231 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0729 0.0959 0.231 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 8.82e-01 -0.00715 0.0482 0.231 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000117 0.0851 0.231 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -980628 sc-eQTL 6.23e-01 0.0443 0.0899 0.231 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 1.78e-01 0.165 0.122 0.234 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 2.16e-02 -0.186 0.0801 0.234 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 580908 sc-eQTL 1.91e-01 0.107 0.0816 0.234 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 601618 sc-eQTL 1.20e-01 -0.13 0.0829 0.234 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 9.60e-01 0.00493 0.0994 0.234 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 5.20e-01 0.044 0.0684 0.234 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 7.88e-02 0.178 0.1 0.234 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 212545 sc-eQTL 2.99e-01 -0.101 0.0966 0.234 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -980628 sc-eQTL 1.47e-01 -0.125 0.0854 0.234 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 2.64e-01 -0.117 0.105 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 914198 sc-eQTL 9.33e-01 0.0086 0.102 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 3.10e-02 -0.124 0.0571 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 2.47e-01 -0.106 0.0911 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 3.71e-01 0.0466 0.052 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 1.79e-01 -0.128 0.0951 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0611 0.0997 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 914198 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0404 0.11 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0368 0.0449 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 8.41e-01 0.0175 0.0873 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 5.63e-01 0.0306 0.0528 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0855 0.0995 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 5.09e-01 0.0529 0.08 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0131 0.0557 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 580908 sc-eQTL 9.21e-01 0.00904 0.0908 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 601618 sc-eQTL 1.98e-01 -0.122 0.0944 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0637 0.0625 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 4.04e-01 0.0359 0.0429 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00985 0.0764 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -980628 sc-eQTL 7.91e-01 0.0212 0.0801 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 8.97e-01 0.0132 0.102 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 9.77e-01 0.00194 0.0675 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 580908 sc-eQTL 9.27e-02 -0.167 0.0986 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 601618 sc-eQTL 1.01e-01 -0.161 0.0978 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 2.69e-01 -0.102 0.0925 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00356 0.0394 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 502334 sc-eQTL 2.21e-01 0.117 0.0952 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -980628 sc-eQTL 2.92e-01 0.0911 0.0862 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -636497 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0237 0.0834 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 802475 sc-eQTL 1.43e-02 -0.191 0.0773 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 552214 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0296 0.0992 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 501104 sc-eQTL 1.73e-01 0.0551 0.0403 0.224 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 601618 pQTL 0.00156 -0.128 0.0403 0.0 0.0 0.22

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000028839 \N -636497 9.39e-07 6.99e-07 1.59e-07 4.1e-07 1.07e-07 2.46e-07 6.18e-07 1.37e-07 6.18e-07 2.72e-07 9.46e-07 3.84e-07 1.37e-06 1.59e-07 2.48e-07 2.18e-07 3.93e-07 4.2e-07 2.57e-07 1.86e-07 1.92e-07 4.14e-07 3.77e-07 1.76e-07 1.2e-06 2.46e-07 2.62e-07 3.24e-07 4.06e-07 5.82e-07 4.47e-07 5.93e-08 5.39e-08 1.79e-07 3.8e-07 6.83e-08 1.82e-07 1.1e-07 8.06e-08 9.5e-09 1.16e-07 6.27e-07 2.92e-08 6.41e-08 1.23e-07 1.33e-08 8.01e-08 1.11e-08 5.71e-08