logo

Genes within 1Mb (chr6:133313892:CTT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0566 0.1 0.226 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 912417 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0168 0.106 0.226 B L1
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 1.02e-01 -0.0651 0.0396 0.226 B L1
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0136 0.0749 0.226 B L1
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 8.01e-01 0.0115 0.0453 0.226 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 2.66e-01 -0.106 0.0951 0.226 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 8.13e-01 0.0174 0.0738 0.226 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0102 0.0768 0.226 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0145 0.0665 0.226 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 2.18e-01 0.0556 0.045 0.226 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0707 0.0913 0.226 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 9.07e-01 0.0086 0.0738 0.226 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0273 0.077 0.226 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 1.04e-01 -0.146 0.0894 0.226 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 8.55e-01 0.00561 0.0307 0.226 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 2.40e-01 -0.109 0.0927 0.226 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0175 0.111 0.225 DC L1
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 2.36e-01 -0.082 0.0691 0.225 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 579127 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0312 0.0859 0.225 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 599837 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0669 0.0926 0.225 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 1.51e-01 -0.142 0.0987 0.225 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 2.98e-01 0.0579 0.0555 0.225 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 2.01e-01 0.112 0.0877 0.225 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 210764 sc-eQTL 5.18e-02 -0.155 0.0794 0.225 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -982409 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0468 0.0998 0.225 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 4.30e-01 0.0607 0.0769 0.226 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0164 0.0515 0.226 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 579127 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00406 0.0884 0.226 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 599837 sc-eQTL 2.23e-01 -0.116 0.0948 0.226 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0823 0.0669 0.226 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 2.81e-01 0.0434 0.0401 0.226 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 9.83e-01 0.00167 0.0796 0.226 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -982409 sc-eQTL 7.70e-01 0.0229 0.0782 0.226 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0318 0.0844 0.225 NK L1
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 1.85e-02 -0.183 0.0771 0.225 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00918 0.0972 0.225 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 1.36e-01 0.0598 0.04 0.225 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 3.65e-01 0.0882 0.097 0.226 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0854 0.0763 0.226 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 2.64e-01 -0.103 0.0923 0.226 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 1.87e-01 0.0484 0.0365 0.226 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0437 0.1 0.226 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0696 0.116 0.232 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 912417 sc-eQTL 5.52e-01 0.0631 0.106 0.232 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 4.03e-01 0.0832 0.0992 0.232 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0283 0.106 0.232 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 8.77e-01 -0.00876 0.0567 0.232 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0598 0.0992 0.232 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0836 0.109 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 912417 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0895 0.096 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 2.85e-03 -0.186 0.0616 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0463 0.0948 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 2.41e-01 0.068 0.0579 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0525 0.105 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0416 0.104 0.224 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 912417 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0256 0.0956 0.224 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0682 0.0749 0.224 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0861 0.098 0.224 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 8.36e-01 -0.00979 0.0473 0.224 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 3.06e-01 -0.101 0.0984 0.224 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0681 0.0996 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 912417 sc-eQTL 7.99e-01 0.028 0.11 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0557 0.0478 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 1.21e-01 0.144 0.0925 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 3.57e-01 0.0488 0.0529 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 3.17e-01 -0.102 0.102 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0826 0.104 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 912417 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0932 0.101 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0444 0.0551 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0866 0.101 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 9.00e-01 0.00673 0.0537 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 2.99e-01 -0.106 0.102 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0342 0.104 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 2.39e-01 0.121 0.103 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 1.65e-02 -0.248 0.103 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 1.84e-01 0.0638 0.0479 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0677 0.0968 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 8.89e-01 0.0118 0.0845 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 5.30e-01 0.052 0.0827 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 7.04e-01 0.0292 0.0767 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 1.04e-01 0.0807 0.0495 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0725 0.0957 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 3.20e-01 -0.09 0.0903 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0867 0.091 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0245 0.0899 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 4.29e-01 0.0369 0.0465 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 2.16e-01 -0.133 0.108 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0205 0.104 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0835 0.104 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 7.22e-01 0.0357 0.1 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 8.67e-02 0.0702 0.0408 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0992 0.102 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0318 0.0932 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 9.28e-01 0.00792 0.0871 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 1.56e-01 -0.14 0.0985 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 7.18e-01 0.0191 0.053 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0839 0.102 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 4.17e-01 0.0793 0.0975 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 2.13e-01 -0.129 0.104 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0271 0.0897 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 9.23e-02 0.0863 0.051 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 2.81e-01 -0.111 0.103 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 7.43e-01 0.0363 0.111 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 5.79e-01 0.0569 0.102 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0278 0.102 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 7.38e-02 0.0884 0.0492 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0491 0.109 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 2.77e-01 0.107 0.098 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 5.35e-01 0.0666 0.107 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 9.64e-02 -0.177 0.106 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0205 0.0574 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 4.61e-01 -0.08 0.108 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 4.65e-01 0.0749 0.102 0.227 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0303 0.0972 0.227 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 2.17e-01 -0.122 0.0986 0.227 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 6.40e-02 0.0899 0.0483 0.227 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 7.26e-01 0.0358 0.102 0.227 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 3.32e-01 0.107 0.11 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0124 0.102 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 4.71e-01 0.0747 0.103 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0422 0.0576 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 8.95e-01 -0.012 0.0907 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 1.05e-01 -0.134 0.0825 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 6.08e-01 0.0533 0.104 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 3.82e-01 0.036 0.0411 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 8.76e-01 0.0179 0.114 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0778 0.104 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0763 0.105 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 7.15e-01 0.018 0.0491 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0307 0.0931 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 1.07e-01 -0.145 0.0897 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 7.57e-01 0.0314 0.101 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 8.07e-01 0.0135 0.055 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 4.99e-01 0.0868 0.128 0.233 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 912417 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0787 0.109 0.233 PB L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 6.00e-01 0.048 0.0913 0.233 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 2.36e-01 -0.132 0.111 0.233 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 1.28e-01 0.0961 0.0627 0.233 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 9.60e-01 0.00604 0.119 0.233 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 2.75e-01 0.113 0.104 0.228 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 1.43e-01 -0.136 0.0923 0.228 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00912 0.0995 0.228 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 3.33e-01 0.0364 0.0376 0.228 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0656 0.0973 0.228 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 9.99e-01 8.88e-05 0.106 0.226 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 9.97e-01 0.00036 0.0998 0.226 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0934 0.0837 0.226 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 9.00e-01 0.00465 0.0371 0.226 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 4.79e-02 0.207 0.104 0.226 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0517 0.111 0.229 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 6.96e-01 -0.034 0.087 0.229 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 579127 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0931 0.0862 0.229 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 599837 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0513 0.102 0.229 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 1.40e-01 -0.146 0.0985 0.229 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 9.64e-01 0.00223 0.0489 0.229 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0307 0.0968 0.229 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 210764 sc-eQTL 3.92e-02 -0.159 0.0765 0.229 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -982409 sc-eQTL 6.52e-01 0.043 0.0952 0.229 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0456 0.0873 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 9.48e-01 0.00429 0.0663 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 579127 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0441 0.0937 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 599837 sc-eQTL 2.52e-01 -0.108 0.0943 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0898 0.0754 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 5.53e-01 0.0249 0.042 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 8.54e-01 0.015 0.081 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -982409 sc-eQTL 4.86e-01 0.0588 0.0842 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 2.84e-01 0.107 0.0999 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0229 0.0724 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 579127 sc-eQTL 7.25e-01 0.0318 0.0904 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 599837 sc-eQTL 2.11e-01 -0.123 0.0978 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0643 0.0641 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 2.57e-01 0.0524 0.0461 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0414 0.0856 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -982409 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0638 0.0837 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0281 0.127 0.242 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 7.10e-02 -0.196 0.108 0.242 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 5.16e-01 0.0784 0.12 0.242 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 9.33e-01 0.00388 0.0459 0.242 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0937 0.118 0.242 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0407 0.102 0.222 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00882 0.0972 0.222 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 579127 sc-eQTL 1.36e-01 -0.146 0.0976 0.222 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 599837 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0443 0.097 0.222 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0687 0.0985 0.222 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 9.60e-01 0.00218 0.0429 0.222 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 8.18e-01 0.0241 0.104 0.222 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -982409 sc-eQTL 6.30e-01 0.0483 0.0999 0.222 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 4.83e-01 0.074 0.105 0.231 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0302 0.0713 0.231 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 579127 sc-eQTL 2.34e-01 -0.12 0.1 0.231 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 599837 sc-eQTL 1.13e-01 -0.158 0.0993 0.231 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0729 0.0959 0.231 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 8.82e-01 -0.00715 0.0482 0.231 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000117 0.0851 0.231 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -982409 sc-eQTL 6.23e-01 0.0443 0.0899 0.231 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 1.78e-01 0.165 0.122 0.234 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 2.16e-02 -0.186 0.0801 0.234 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 579127 sc-eQTL 1.91e-01 0.107 0.0816 0.234 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 599837 sc-eQTL 1.20e-01 -0.13 0.0829 0.234 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 9.60e-01 0.00493 0.0994 0.234 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 5.20e-01 0.044 0.0684 0.234 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 7.88e-02 0.178 0.1 0.234 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 210764 sc-eQTL 2.99e-01 -0.101 0.0966 0.234 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -982409 sc-eQTL 1.47e-01 -0.125 0.0854 0.234 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 2.64e-01 -0.117 0.105 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 912417 sc-eQTL 9.33e-01 0.0086 0.102 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 3.10e-02 -0.124 0.0571 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 2.47e-01 -0.106 0.0911 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 3.71e-01 0.0466 0.052 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 1.79e-01 -0.128 0.0951 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0611 0.0997 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 912417 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0404 0.11 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0368 0.0449 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 8.41e-01 0.0175 0.0873 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 5.63e-01 0.0306 0.0528 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0855 0.0995 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 5.09e-01 0.0529 0.08 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0131 0.0557 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 579127 sc-eQTL 9.21e-01 0.00904 0.0908 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 599837 sc-eQTL 1.98e-01 -0.122 0.0944 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0637 0.0625 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 4.04e-01 0.0359 0.0429 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00985 0.0764 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -982409 sc-eQTL 7.91e-01 0.0212 0.0801 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 8.97e-01 0.0132 0.102 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 9.77e-01 0.00194 0.0675 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 579127 sc-eQTL 9.27e-02 -0.167 0.0986 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 599837 sc-eQTL 1.01e-01 -0.161 0.0978 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 2.69e-01 -0.102 0.0925 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00356 0.0394 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 500553 sc-eQTL 2.21e-01 0.117 0.0952 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -982409 sc-eQTL 2.92e-01 0.0911 0.0862 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -638278 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0237 0.0834 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 800694 sc-eQTL 1.43e-02 -0.191 0.0773 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 550433 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0296 0.0992 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 499323 sc-eQTL 1.73e-01 0.0551 0.0403 0.224 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 599837 pQTL 0.00155 -0.128 0.0403 0.0 0.0 0.22

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000028839 \N -638278 1.27e-06 9.04e-06 1.85e-07 1.35e-06 3.09e-07 5.96e-07 1.48e-06 1.09e-07 1.74e-06 2.85e-07 2.88e-06 1.45e-06 3.33e-06 1.37e-06 1.2e-06 9.19e-07 9.22e-07 1.29e-06 3.95e-07 2.37e-07 2.86e-07 2.35e-06 8.66e-07 1.19e-07 2.41e-06 2.38e-07 7.31e-07 5.29e-07 1.48e-06 1.08e-06 1.21e-06 4.22e-08 3.74e-08 5.45e-07 5.3e-07 5.05e-08 4.49e-08 7.51e-08 1.12e-07 1.17e-07 5.03e-08 2.26e-05 6.68e-08 1.17e-08 5.84e-08 2.64e-08 9.12e-08 4.14e-09 5.09e-08