logo

Genes within 1Mb (chr6:133306261:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 6.93e-01 0.0475 0.12 0.139 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 904786 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0131 0.127 0.139 B L1
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 2.19e-01 0.0589 0.0478 0.139 B L1
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 3.83e-01 0.0787 0.09 0.139 B L1
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0209 0.0545 0.139 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 1.91e-01 0.15 0.114 0.139 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 3.79e-01 0.0779 0.0884 0.139 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 1.70e-01 0.126 0.0916 0.139 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 9.09e-02 0.134 0.0792 0.139 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 2.90e-01 0.0573 0.0541 0.139 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 6.23e-01 0.0539 0.11 0.139 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 6.54e-01 -0.039 0.0868 0.139 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0281 0.0906 0.139 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 3.37e-01 -0.102 0.106 0.139 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 8.84e-01 -0.00527 0.0362 0.139 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0319 0.109 0.139 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 4.60e-02 0.269 0.134 0.14 DC L1
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 7.72e-01 0.0244 0.0839 0.14 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 571496 sc-eQTL 6.94e-01 -0.041 0.104 0.14 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 592206 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0707 0.112 0.14 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 1.38e-01 0.178 0.12 0.14 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0277 0.0674 0.14 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 7.85e-01 0.0291 0.107 0.14 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 203133 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00588 0.0971 0.14 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -990040 sc-eQTL 3.97e-01 0.103 0.121 0.14 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 8.43e-01 0.0185 0.0934 0.139 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 8.58e-01 0.0112 0.0625 0.139 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 571496 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0893 0.107 0.139 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 592206 sc-eQTL 7.55e-01 0.036 0.115 0.139 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 5.71e-01 0.0461 0.0814 0.139 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 7.28e-01 -0.017 0.0488 0.139 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0581 0.0964 0.139 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -990040 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00184 0.0948 0.139 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 6.13e-01 0.0517 0.102 0.139 NK L1
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00691 0.0944 0.139 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0956 0.117 0.139 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0324 0.0486 0.139 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 9.43e-02 -0.199 0.119 0.139 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0737 0.0938 0.139 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 2.73e-01 0.125 0.113 0.139 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 5.20e-01 -0.029 0.045 0.139 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 9.62e-01 0.00587 0.123 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 6.85e-01 0.0554 0.137 0.138 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 904786 sc-eQTL 6.21e-01 0.0617 0.125 0.138 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 1.80e-01 -0.157 0.116 0.138 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 2.09e-01 0.156 0.124 0.138 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 8.21e-01 0.0151 0.0667 0.138 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 3.81e-01 0.102 0.117 0.138 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 9.13e-02 0.224 0.132 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 904786 sc-eQTL 2.90e-01 0.123 0.116 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 3.51e-01 0.0713 0.0763 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 3.42e-01 0.109 0.115 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 9.45e-01 0.00486 0.0705 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 3.86e-01 0.11 0.127 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 2.83e-01 -0.138 0.128 0.14 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 904786 sc-eQTL 6.52e-01 0.0533 0.118 0.14 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 2.10e-01 0.116 0.0924 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 2.06e-01 0.153 0.121 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0162 0.0584 0.14 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 3.43e-01 0.116 0.122 0.14 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000436 0.12 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 904786 sc-eQTL 5.63e-01 0.0766 0.132 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 4.38e-01 0.0448 0.0578 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 2.62e-01 -0.126 0.112 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 3.54e-01 0.0593 0.0639 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 8.54e-01 0.0228 0.123 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0408 0.127 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 904786 sc-eQTL 5.59e-02 -0.236 0.123 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 8.26e-01 0.0148 0.0675 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 3.54e-01 0.115 0.124 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 6.01e-02 0.123 0.0651 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 5.19e-01 0.0807 0.125 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 2.14e-02 0.299 0.129 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 7.91e-01 0.0344 0.13 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 6.25e-01 0.0641 0.131 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 8.51e-02 0.104 0.0601 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 1.32e-01 0.184 0.121 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0887 0.101 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 2.05e-01 0.126 0.099 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 9.49e-02 0.153 0.0914 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 1.16e-01 0.0937 0.0594 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 7.03e-01 0.0439 0.115 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 5.96e-01 0.0582 0.109 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 3.52e-01 0.103 0.11 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 6.47e-01 0.0498 0.109 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000575 0.0563 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 5.50e-01 0.078 0.13 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 7.93e-01 -0.033 0.126 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0527 0.126 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 5.91e-01 0.065 0.121 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 2.17e-01 0.0612 0.0494 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 4.10e-01 0.102 0.123 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0563 0.111 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0285 0.104 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0557 0.118 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 2.73e-01 0.0691 0.0628 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 9.03e-01 0.0148 0.122 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0146 0.12 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 9.86e-01 -0.0023 0.128 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 4.53e-01 -0.083 0.11 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0229 0.0632 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0222 0.127 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 7.77e-01 0.0393 0.138 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 8.39e-01 -0.026 0.128 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 3.35e-01 -0.122 0.127 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 3.04e-01 0.0637 0.0618 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 7.09e-01 0.0508 0.136 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 5.57e-01 0.0712 0.121 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0256 0.132 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 6.24e-01 0.0645 0.131 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 1.10e-01 0.113 0.0702 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0139 0.134 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0244 0.127 0.139 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 7.08e-01 -0.045 0.12 0.139 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 2.19e-01 0.15 0.122 0.139 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0136 0.0602 0.139 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0444 0.126 0.139 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0663 0.137 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 8.62e-01 0.0222 0.127 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 4.83e-01 0.0909 0.129 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0194 0.0721 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 4.11e-01 0.0902 0.109 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 9.96e-01 0.000479 0.1 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 1.60e-01 -0.176 0.125 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 8.75e-01 0.00786 0.0498 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 2.19e-01 -0.162 0.132 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0548 0.12 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 7.03e-01 0.0464 0.122 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0419 0.0567 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 5.86e-01 0.0616 0.113 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 3.57e-01 0.101 0.109 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 3.71e-01 -0.11 0.123 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0243 0.0668 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0295 0.15 0.144 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 904786 sc-eQTL 2.99e-01 -0.133 0.128 0.144 PB L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 3.90e-02 -0.219 0.105 0.144 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 9.11e-01 0.0146 0.131 0.144 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 1.25e-01 -0.114 0.0735 0.144 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 2.89e-01 -0.148 0.138 0.144 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 9.33e-01 0.0107 0.127 0.139 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 1.99e-01 0.145 0.113 0.139 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 8.69e-01 -0.02 0.121 0.139 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 9.66e-01 0.00194 0.0459 0.139 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 7.38e-02 0.212 0.118 0.139 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 3.57e-01 0.12 0.13 0.139 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 8.09e-02 0.214 0.122 0.139 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 9.40e-01 0.00775 0.103 0.139 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0189 0.0457 0.139 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 3.24e-01 0.127 0.129 0.139 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 1.01e-01 0.226 0.137 0.137 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0529 0.109 0.137 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 571496 sc-eQTL 4.78e-01 0.0766 0.108 0.137 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 592206 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0121 0.127 0.137 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 7.53e-01 0.039 0.124 0.137 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0419 0.0609 0.137 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 3.55e-02 0.253 0.119 0.137 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 203133 sc-eQTL 2.31e-01 -0.116 0.0962 0.137 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -990040 sc-eQTL 6.90e-01 0.0475 0.119 0.137 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 7.17e-01 0.0398 0.11 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 7.09e-01 -0.031 0.0831 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 571496 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0738 0.117 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 592206 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0847 0.118 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 3.40e-01 0.0905 0.0946 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 9.80e-01 0.00135 0.0526 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0467 0.101 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -990040 sc-eQTL 9.04e-01 0.0128 0.106 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0604 0.124 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 9.91e-01 0.00096 0.0897 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 571496 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0558 0.112 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 592206 sc-eQTL 2.40e-01 0.143 0.121 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 9.23e-01 0.00766 0.0796 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0186 0.0573 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0459 0.106 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -990040 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0345 0.104 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 2.66e-01 -0.186 0.166 0.13 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 9.10e-01 0.0163 0.144 0.13 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 3.15e-01 -0.16 0.158 0.13 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 5.54e-01 0.0358 0.0604 0.13 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 3.32e-01 -0.152 0.156 0.13 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 3.23e-01 -0.125 0.126 0.136 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 9.48e-01 0.00794 0.121 0.136 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 571496 sc-eQTL 5.64e-01 0.0703 0.122 0.136 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 592206 sc-eQTL 1.81e-01 0.161 0.12 0.136 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 8.12e-02 0.213 0.121 0.136 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 9.62e-01 0.00255 0.0532 0.136 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0874 0.129 0.136 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -990040 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0531 0.124 0.136 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 9.04e-01 0.0154 0.128 0.138 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0757 0.0862 0.138 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 571496 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0757 0.122 0.138 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 592206 sc-eQTL 5.74e-01 -0.068 0.121 0.138 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 4.44e-01 0.0892 0.116 0.138 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0411 0.0583 0.138 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0865 0.103 0.138 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -990040 sc-eQTL 1.24e-01 0.167 0.108 0.138 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 5.54e-01 0.0927 0.156 0.13 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0819 0.104 0.13 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 571496 sc-eQTL 7.76e-01 -0.03 0.105 0.13 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 592206 sc-eQTL 3.98e-01 0.0903 0.107 0.13 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 5.19e-01 0.082 0.127 0.13 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0903 0.0873 0.13 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 4.11e-01 -0.107 0.129 0.13 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 203133 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0185 0.124 0.13 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -990040 sc-eQTL 4.52e-01 0.0828 0.11 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 5.34e-02 0.247 0.127 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 904786 sc-eQTL 3.89e-01 0.107 0.124 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 2.52e-01 0.0809 0.0704 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 9.41e-02 0.187 0.111 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00611 0.0636 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 2.11e-01 0.146 0.116 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0477 0.12 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 904786 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0371 0.132 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 4.24e-01 0.0434 0.0542 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0168 0.105 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 1.59e-01 0.0897 0.0634 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 6.62e-01 0.0526 0.12 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 8.49e-01 0.0187 0.0983 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 7.74e-01 0.0197 0.0684 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 571496 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0824 0.111 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 592206 sc-eQTL 5.77e-01 0.0649 0.116 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 2.85e-01 0.0822 0.0767 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0143 0.0527 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0293 0.0938 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -990040 sc-eQTL 4.83e-01 -0.069 0.0983 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 3.84e-01 -0.109 0.125 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0238 0.0826 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 571496 sc-eQTL 2.07e-01 -0.153 0.121 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 592206 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0503 0.12 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 2.54e-01 0.13 0.113 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 9.20e-01 0.00487 0.0482 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 sc-eQTL 2.67e-01 -0.13 0.117 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -990040 sc-eQTL 3.20e-01 0.105 0.105 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -645909 sc-eQTL 3.03e-01 0.104 0.1 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 793063 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0172 0.0945 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 542802 sc-eQTL 2.52e-01 -0.137 0.119 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 491692 sc-eQTL 4.25e-01 -0.039 0.0487 0.138 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 eQTL 0.0146 -0.0719 0.0294 0.0 0.0 0.166

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 SLC18B1 492922 4.89e-07 1.83e-07 6.45e-08 3.48e-07 1.03e-07 7.75e-08 2.4e-07 5.53e-08 2.04e-07 1.37e-07 2.18e-07 1.22e-07 6e-07 8.55e-08 1.26e-07 9.6e-08 5.73e-08 1.8e-07 7.42e-08 7.49e-08 1.22e-07 1.56e-07 1.81e-07 3.42e-08 3.27e-07 1.51e-07 1.29e-07 1.47e-07 1.32e-07 1.38e-07 1.78e-07 8.37e-08 4.27e-08 1.21e-07 3.04e-07 2.68e-08 1.14e-07 7.25e-08 5.98e-08 5.61e-08 8.81e-08 2.5e-07 3.19e-08 1.07e-08 3.32e-08 8.07e-09 1.2e-07 2.71e-09 4.72e-08