Genes within 1Mb (chr6:133302193:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 8.90e-01 0.0168 0.121 0.137 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 900718 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0343 0.128 0.137 B L1
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 1.28e-01 0.0733 0.048 0.137 B L1
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 2.91e-01 0.0958 0.0904 0.137 B L1
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 3.16e-01 -0.055 0.0547 0.137 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 1.79e-01 0.155 0.115 0.137 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 2.93e-01 0.0944 0.0896 0.137 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 1.50e-01 0.134 0.0929 0.137 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 1.71e-01 0.111 0.0805 0.137 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 4.16e-01 0.0448 0.0549 0.137 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 6.72e-01 0.0472 0.111 0.137 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00641 0.0879 0.137 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0132 0.0918 0.137 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0504 0.107 0.137 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0203 0.0366 0.137 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 6.45e-01 -0.051 0.111 0.137 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 6.12e-02 0.256 0.136 0.137 DC L1
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 7.25e-01 0.03 0.0852 0.137 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 567428 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0841 0.105 0.137 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 588138 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0729 0.114 0.137 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 1.45e-01 0.177 0.121 0.137 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0458 0.0683 0.137 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 9.41e-01 0.00808 0.108 0.137 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 199065 sc-eQTL 8.74e-01 0.0157 0.0985 0.137 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -994108 sc-eQTL 4.01e-01 0.103 0.123 0.137 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 7.24e-01 0.0332 0.0939 0.137 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 8.14e-01 0.0148 0.0629 0.137 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 567428 sc-eQTL 3.54e-01 -0.1 0.108 0.137 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 588138 sc-eQTL 9.46e-01 0.00794 0.116 0.137 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 4.63e-01 0.0601 0.0818 0.137 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0355 0.049 0.137 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0387 0.0971 0.137 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -994108 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00519 0.0955 0.137 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 5.66e-01 0.0591 0.103 0.137 NK L1
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00999 0.0953 0.137 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0825 0.118 0.137 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0486 0.049 0.137 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 1.16e-01 -0.189 0.12 0.137 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0119 0.095 0.137 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 7.96e-02 0.201 0.114 0.137 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0295 0.0455 0.137 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 9.97e-01 0.000445 0.125 0.137 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 9.86e-01 0.0024 0.139 0.135 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 900718 sc-eQTL 4.82e-01 0.0891 0.126 0.135 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 2.48e-01 -0.137 0.118 0.135 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 2.08e-01 0.159 0.126 0.135 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00647 0.0677 0.135 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 3.20e-01 0.118 0.118 0.135 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 1.69e-01 0.185 0.134 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 900718 sc-eQTL 5.17e-01 0.0766 0.118 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 2.55e-01 0.0879 0.077 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 3.35e-01 0.112 0.116 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0392 0.0712 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 3.03e-01 0.132 0.128 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 2.37e-01 -0.153 0.129 0.138 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 900718 sc-eQTL 6.56e-01 0.0533 0.119 0.138 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 1.76e-01 0.127 0.0932 0.138 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 4.14e-01 0.1 0.122 0.138 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 4.46e-01 -0.045 0.0589 0.138 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 3.00e-01 0.127 0.123 0.138 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0615 0.121 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 900718 sc-eQTL 6.53e-01 0.06 0.133 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 3.11e-01 0.0591 0.0582 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 4.38e-01 -0.088 0.113 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 7.72e-01 0.0187 0.0645 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 7.50e-01 0.0398 0.125 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0475 0.128 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 900718 sc-eQTL 5.22e-02 -0.241 0.124 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 6.62e-01 0.0297 0.0679 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 2.42e-01 0.146 0.124 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 2.69e-01 0.0729 0.0658 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 7.11e-01 0.0467 0.126 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 1.82e-02 0.306 0.128 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 6.79e-01 0.0536 0.129 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 4.63e-01 0.0959 0.13 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 8.77e-02 0.103 0.0599 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 2.01e-01 0.156 0.121 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0713 0.103 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 1.57e-01 0.143 0.101 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 1.60e-01 0.132 0.0932 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 1.97e-01 0.0784 0.0605 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 6.85e-01 0.0475 0.117 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 4.85e-01 0.0779 0.111 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 4.23e-01 0.0901 0.112 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 6.07e-01 0.057 0.111 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0126 0.0574 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 3.99e-01 0.112 0.133 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 8.91e-01 0.0176 0.128 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0736 0.128 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 8.41e-01 0.0246 0.123 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 2.47e-01 0.0581 0.0501 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 5.22e-01 0.0801 0.125 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0196 0.112 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0389 0.105 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0333 0.119 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 4.22e-01 0.0511 0.0636 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 9.28e-01 0.0111 0.123 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 8.25e-01 0.0268 0.121 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 5.96e-01 0.0685 0.129 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0414 0.112 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0286 0.0638 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 8.84e-01 0.0186 0.128 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 9.42e-01 0.0101 0.14 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0358 0.129 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 3.97e-01 -0.109 0.128 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 2.47e-01 0.0724 0.0623 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 7.33e-01 0.0468 0.137 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 6.54e-01 0.0549 0.122 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 8.90e-01 0.0185 0.134 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 5.18e-01 0.0861 0.133 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 1.76e-01 0.0966 0.0712 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0719 0.135 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 9.01e-01 -0.016 0.128 0.136 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 9.73e-01 0.00421 0.122 0.136 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 1.05e-01 0.2 0.123 0.136 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0134 0.061 0.136 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0367 0.128 0.136 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 4.25e-01 -0.11 0.138 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 8.20e-01 0.0291 0.128 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 4.65e-01 0.0951 0.13 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0251 0.0724 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 3.31e-01 0.108 0.111 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000755 0.102 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 1.83e-01 -0.169 0.126 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 8.59e-01 -0.00899 0.0504 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 1.94e-01 -0.173 0.133 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0601 0.121 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 6.87e-01 0.0496 0.123 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0545 0.0571 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 6.19e-01 0.0567 0.114 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 7.16e-01 0.0402 0.11 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 3.72e-01 -0.111 0.124 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0413 0.0672 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 8.68e-01 0.0252 0.152 0.144 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 900718 sc-eQTL 3.54e-01 -0.12 0.129 0.144 PB L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 1.06e-01 -0.174 0.107 0.144 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 7.38e-01 0.0442 0.132 0.144 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 1.67e-01 -0.104 0.0744 0.144 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 2.55e-01 -0.16 0.14 0.144 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 9.16e-01 0.0135 0.128 0.137 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 1.15e-01 0.179 0.113 0.137 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 9.36e-01 0.00983 0.122 0.137 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00348 0.0462 0.137 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 1.29e-01 0.181 0.119 0.137 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 3.89e-01 0.114 0.132 0.137 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 5.55e-02 0.237 0.123 0.137 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00336 0.104 0.137 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0331 0.0462 0.137 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 5.11e-01 0.086 0.13 0.137 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 1.22e-01 0.217 0.14 0.134 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0441 0.111 0.134 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 567428 sc-eQTL 5.28e-01 0.0695 0.11 0.134 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 588138 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0282 0.129 0.134 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 7.99e-01 0.0321 0.126 0.134 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0635 0.062 0.134 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 1.03e-01 0.2 0.122 0.134 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 199065 sc-eQTL 3.02e-01 -0.102 0.0982 0.134 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -994108 sc-eQTL 7.35e-01 0.041 0.121 0.134 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 6.45e-01 0.0507 0.11 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0299 0.0835 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 567428 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0916 0.118 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 588138 sc-eQTL 3.22e-01 -0.118 0.119 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 2.53e-01 0.109 0.095 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0257 0.0529 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0446 0.102 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -994108 sc-eQTL 8.80e-01 -0.016 0.106 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0866 0.124 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00534 0.09 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 567428 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0577 0.112 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 588138 sc-eQTL 3.36e-01 0.117 0.122 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 8.23e-01 0.0179 0.0799 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0535 0.0575 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0221 0.107 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -994108 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0178 0.104 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 1.79e-01 -0.225 0.166 0.127 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 7.99e-01 0.0368 0.144 0.127 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 3.77e-01 -0.141 0.159 0.127 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 4.79e-01 0.043 0.0606 0.127 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 4.86e-01 -0.109 0.157 0.127 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 4.11e-01 -0.105 0.127 0.133 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 7.40e-01 0.0404 0.122 0.133 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 567428 sc-eQTL 5.47e-01 0.074 0.123 0.133 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 588138 sc-eQTL 1.69e-01 0.167 0.121 0.133 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 1.27e-01 0.188 0.123 0.133 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 9.19e-01 0.00547 0.0537 0.133 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 6.52e-01 -0.059 0.131 0.133 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -994108 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0312 0.125 0.133 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000658 0.129 0.136 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0597 0.0869 0.136 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 567428 sc-eQTL 3.49e-01 -0.115 0.123 0.136 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 588138 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0899 0.122 0.136 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 3.81e-01 0.103 0.117 0.136 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0618 0.0586 0.136 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0874 0.104 0.136 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -994108 sc-eQTL 1.36e-01 0.164 0.109 0.136 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 8.22e-01 0.0361 0.16 0.127 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0909 0.106 0.127 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 567428 sc-eQTL 3.06e-01 -0.11 0.107 0.127 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 588138 sc-eQTL 3.06e-01 0.112 0.109 0.127 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 3.54e-01 0.121 0.13 0.127 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 1.90e-01 -0.117 0.0892 0.127 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0901 0.133 0.127 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 199065 sc-eQTL 9.41e-01 0.00947 0.127 0.127 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -994108 sc-eQTL 6.08e-01 0.0579 0.113 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 9.97e-02 0.213 0.129 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 900718 sc-eQTL 5.30e-01 0.0794 0.126 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 1.60e-01 0.1 0.0712 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 1.68e-01 0.156 0.113 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0361 0.0644 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 1.34e-01 0.177 0.118 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 4.02e-01 -0.102 0.121 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 900718 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0441 0.133 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 2.62e-01 0.0614 0.0546 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 8.36e-01 0.0221 0.106 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 4.90e-01 0.0444 0.0642 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 7.56e-01 0.0377 0.121 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 9.08e-01 0.0114 0.0987 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 7.95e-01 0.0178 0.0686 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 567428 sc-eQTL 3.61e-01 -0.102 0.112 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 588138 sc-eQTL 7.71e-01 0.0341 0.117 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 2.08e-01 0.097 0.0768 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0472 0.0528 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0198 0.0941 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -994108 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0839 0.0985 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0946 0.126 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 9.62e-01 0.00402 0.0832 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 567428 sc-eQTL 1.54e-01 -0.174 0.122 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 588138 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0767 0.121 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 2.38e-01 0.135 0.114 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0129 0.0485 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 sc-eQTL 3.92e-01 -0.101 0.118 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -994108 sc-eQTL 2.89e-01 0.113 0.106 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -649977 sc-eQTL 3.54e-01 0.094 0.101 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 788995 sc-eQTL 7.85e-01 -0.026 0.0953 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 538734 sc-eQTL 3.10e-01 -0.122 0.12 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 487624 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0517 0.0491 0.136 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 eQTL 0.0103 -0.076 0.0296 0.0 0.0 0.158


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N 900718 2.64e-07 1.16e-07 3.59e-08 1.82e-07 8.92e-08 9.71e-08 1.38e-07 5.49e-08 1.4e-07 4.57e-08 1.56e-07 8.36e-08 1.33e-07 6.38e-08 5.84e-08 7.26e-08 4.48e-08 1.14e-07 5.36e-08 4.03e-08 1.04e-07 1.26e-07 1.26e-07 3.79e-08 1.32e-07 1.19e-07 1.12e-07 9.36e-08 1.03e-07 1.12e-07 9.73e-08 3.68e-08 3.28e-08 8.65e-08 8.96e-08 3.95e-08 5.05e-08 9.22e-08 7.23e-08 3.8e-08 5.45e-08 1.35e-07 4.14e-08 1.3e-08 6.38e-08 1.83e-08 1.21e-07 3.78e-09 4.81e-08
ENSG00000146409 SLC18B1 488854 3.92e-07 2.67e-07 6.55e-08 2.66e-07 1.01e-07 1.19e-07 3.25e-07 5.78e-08 2.12e-07 1.28e-07 2.68e-07 2.22e-07 3.77e-07 8.85e-08 6.93e-08 1.1e-07 6.63e-08 2.33e-07 8.93e-08 6.02e-08 1.52e-07 2.15e-07 2e-07 5.01e-08 4.11e-07 1.43e-07 1.25e-07 1.69e-07 1.44e-07 2e-07 1.52e-07 8.02e-08 4.86e-08 9.9e-08 1.31e-07 5.05e-08 6.39e-08 5.92e-08 5.27e-08 5.96e-08 4.49e-08 3.06e-07 3.26e-08 1.55e-08 3.87e-08 8.24e-09 1.03e-07 2.94e-09 4.61e-08