logo

Genes within 1Mb (chr6:133299079:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 8.52e-01 0.0224 0.12 0.135 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 897604 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0893 0.126 0.135 B L1
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 1.65e-01 0.0662 0.0475 0.135 B L1
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 2.84e-01 0.096 0.0895 0.135 B L1
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0589 0.0541 0.135 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 1.95e-01 0.148 0.114 0.135 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 2.64e-01 0.0991 0.0885 0.135 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 1.20e-01 0.143 0.0917 0.135 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 2.06e-01 0.101 0.0796 0.135 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 5.24e-01 0.0347 0.0543 0.135 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 6.25e-01 0.0537 0.11 0.135 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 9.61e-01 0.00433 0.0881 0.135 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 7.86e-01 -0.025 0.092 0.135 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0455 0.107 0.135 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 4.97e-01 -0.025 0.0367 0.135 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0752 0.111 0.135 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 6.40e-02 0.255 0.137 0.135 DC L1
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 7.46e-01 0.0279 0.0858 0.135 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 564314 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0404 0.106 0.135 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 585024 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0816 0.115 0.135 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 2.25e-01 0.149 0.123 0.135 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0544 0.0688 0.135 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0249 0.109 0.135 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 195951 sc-eQTL 8.65e-01 0.0169 0.0993 0.135 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -997222 sc-eQTL 3.64e-01 0.112 0.124 0.135 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 9.06e-01 -0.011 0.093 0.135 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 8.30e-01 0.0133 0.0622 0.135 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 564314 sc-eQTL 2.53e-01 -0.122 0.106 0.135 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 585024 sc-eQTL 8.21e-01 0.026 0.115 0.135 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 5.57e-01 0.0477 0.081 0.135 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0459 0.0485 0.135 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0236 0.0961 0.135 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -997222 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0279 0.0945 0.135 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 4.38e-01 0.0788 0.101 0.135 NK L1
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00603 0.094 0.135 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0954 0.117 0.135 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0663 0.0482 0.135 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 1.42e-01 -0.176 0.119 0.135 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 9.35e-01 0.00773 0.0944 0.135 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 9.88e-02 0.188 0.113 0.135 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0393 0.0452 0.135 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00821 0.124 0.135 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0364 0.137 0.135 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 897604 sc-eQTL 3.45e-01 0.118 0.125 0.135 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0994 0.117 0.135 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 1.53e-01 0.178 0.124 0.135 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00556 0.0668 0.135 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 2.46e-01 0.136 0.117 0.135 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 3.51e-01 0.124 0.133 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 897604 sc-eQTL 8.90e-01 0.0162 0.117 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 4.90e-01 0.0528 0.0764 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 4.80e-01 0.0814 0.115 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0492 0.0705 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 3.12e-01 0.128 0.127 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 1.51e-01 -0.183 0.127 0.136 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 897604 sc-eQTL 4.21e-01 0.0947 0.118 0.136 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 2.71e-01 0.102 0.0921 0.136 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 3.30e-01 0.118 0.121 0.136 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0585 0.0581 0.136 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 1.99e-01 0.156 0.121 0.136 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0523 0.12 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 897604 sc-eQTL 7.55e-01 0.0413 0.132 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 3.10e-01 0.0586 0.0576 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0823 0.112 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 8.71e-01 0.0104 0.0639 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 7.31e-01 0.0424 0.123 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 7.95e-01 0.0329 0.126 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 897604 sc-eQTL 7.19e-02 -0.221 0.122 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 7.87e-01 0.0182 0.0672 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 3.30e-01 0.12 0.123 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 4.31e-01 0.0515 0.0652 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 4.93e-01 0.0855 0.124 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 1.73e-02 0.312 0.13 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 4.97e-01 0.089 0.131 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 5.30e-01 0.0831 0.132 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 1.06e-01 0.0984 0.0606 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 2.15e-01 0.152 0.123 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0708 0.102 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 1.40e-01 0.147 0.0994 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 1.86e-01 0.122 0.0922 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 2.48e-01 0.0694 0.0599 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 7.13e-01 0.0425 0.116 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 2.99e-01 0.115 0.11 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 3.47e-01 0.104 0.111 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 6.45e-01 0.0506 0.109 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 8.68e-01 -0.00943 0.0568 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 2.03e-01 0.167 0.131 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 8.44e-01 0.0249 0.126 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0899 0.126 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 7.65e-01 0.0362 0.121 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 2.73e-01 0.0544 0.0495 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 8.29e-01 0.0267 0.123 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0168 0.113 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0466 0.105 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 8.94e-01 -0.016 0.12 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 4.05e-01 0.0534 0.064 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 8.76e-01 0.0193 0.124 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00411 0.121 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 8.40e-01 0.026 0.129 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0396 0.111 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0373 0.0636 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 7.93e-01 0.0336 0.128 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 7.42e-01 0.0462 0.14 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0272 0.13 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0743 0.128 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 7.36e-01 0.0211 0.0626 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 5.80e-01 0.0761 0.137 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 4.82e-01 0.0868 0.123 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 9.08e-01 0.0156 0.135 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 6.20e-01 0.0664 0.134 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 2.06e-01 0.0909 0.0717 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0676 0.136 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 7.42e-01 0.0427 0.129 0.132 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 7.36e-01 0.0414 0.123 0.132 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 9.51e-02 0.208 0.124 0.132 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0124 0.0615 0.132 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0101 0.129 0.132 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0946 0.135 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 4.82e-01 0.088 0.125 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 3.05e-01 0.13 0.127 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0284 0.0708 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 3.93e-01 0.0934 0.109 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 9.75e-01 -0.0032 0.1 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 1.16e-01 -0.196 0.124 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0179 0.0497 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 1.98e-01 -0.169 0.131 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0675 0.12 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 6.40e-01 0.0569 0.121 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0566 0.0564 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 3.88e-01 0.097 0.112 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 7.50e-01 0.0347 0.109 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 3.60e-01 -0.112 0.122 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0523 0.0662 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 8.28e-01 0.0321 0.148 0.144 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 897604 sc-eQTL 1.97e-01 -0.162 0.125 0.144 PB L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 1.05e-01 -0.17 0.104 0.144 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 9.32e-01 0.011 0.129 0.144 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0793 0.0726 0.144 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 1.76e-01 -0.185 0.136 0.144 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 7.57e-01 0.039 0.126 0.135 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 8.37e-02 0.194 0.112 0.135 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 8.30e-01 0.026 0.121 0.135 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 9.69e-01 0.0018 0.0456 0.135 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 1.41e-01 0.174 0.117 0.135 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 2.29e-01 0.157 0.13 0.135 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 7.22e-02 0.22 0.122 0.135 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00801 0.103 0.135 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 3.82e-01 -0.04 0.0456 0.135 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00806 0.129 0.135 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 1.56e-01 0.202 0.142 0.129 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0182 0.112 0.129 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 564314 sc-eQTL 3.15e-01 0.112 0.111 0.129 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 585024 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0134 0.131 0.129 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 8.66e-01 0.0215 0.127 0.129 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0547 0.0628 0.129 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 1.44e-01 0.182 0.124 0.129 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 195951 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0811 0.0995 0.129 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -997222 sc-eQTL 7.35e-01 0.0416 0.123 0.129 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 9.28e-01 0.00984 0.109 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0435 0.0826 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 564314 sc-eQTL 3.23e-01 -0.115 0.117 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 585024 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0807 0.118 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 2.45e-01 0.109 0.094 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0415 0.0523 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0374 0.101 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -997222 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0388 0.105 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 3.52e-01 -0.115 0.123 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 8.87e-01 0.0127 0.0889 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 564314 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0646 0.111 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 585024 sc-eQTL 3.18e-01 0.12 0.12 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 9.69e-01 0.00311 0.079 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0546 0.0568 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 9.77e-01 0.003 0.105 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -997222 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0127 0.103 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 1.14e-01 -0.265 0.167 0.121 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 6.01e-01 0.0758 0.145 0.121 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 2.76e-01 -0.174 0.159 0.121 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 4.67e-01 0.0444 0.0609 0.121 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 3.56e-01 -0.146 0.157 0.121 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0937 0.126 0.131 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 9.94e-01 0.000938 0.12 0.131 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 564314 sc-eQTL 5.76e-01 0.0679 0.121 0.131 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 585024 sc-eQTL 1.50e-01 0.173 0.119 0.131 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 9.61e-02 0.203 0.121 0.131 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 7.30e-01 0.0184 0.0531 0.131 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0353 0.129 0.131 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -997222 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0446 0.124 0.131 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00839 0.129 0.133 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0272 0.0873 0.133 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 564314 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0704 0.123 0.133 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 585024 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0592 0.122 0.133 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 3.30e-01 0.114 0.117 0.133 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0743 0.0587 0.133 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 2.77e-01 -0.113 0.104 0.133 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -997222 sc-eQTL 1.38e-01 0.163 0.11 0.133 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 7.79e-01 0.0457 0.163 0.121 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 3.13e-01 -0.109 0.108 0.121 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 564314 sc-eQTL 5.51e-01 -0.065 0.109 0.121 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 585024 sc-eQTL 3.60e-01 0.101 0.111 0.121 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 5.13e-01 0.0864 0.132 0.121 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 1.57e-01 -0.128 0.0903 0.121 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 4.31e-01 -0.106 0.134 0.121 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 195951 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00323 0.129 0.121 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -997222 sc-eQTL 7.27e-01 0.04 0.114 0.121 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 2.93e-01 0.135 0.129 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 897604 sc-eQTL 4.74e-01 0.0896 0.125 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 2.70e-01 0.0782 0.0707 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 1.94e-01 0.146 0.112 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0405 0.0639 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 8.30e-02 0.203 0.117 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0589 0.12 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 897604 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0509 0.132 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 2.50e-01 0.0623 0.054 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 8.55e-01 0.0192 0.105 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 5.84e-01 0.0348 0.0636 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 7.28e-01 0.0418 0.12 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0408 0.0974 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 7.71e-01 0.0197 0.0678 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 564314 sc-eQTL 2.75e-01 -0.12 0.11 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 585024 sc-eQTL 6.42e-01 0.0536 0.115 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 2.64e-01 0.0851 0.0759 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0619 0.0521 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00593 0.0929 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -997222 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0935 0.0972 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0814 0.125 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0122 0.0825 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 564314 sc-eQTL 1.41e-01 -0.178 0.121 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 585024 sc-eQTL 6.54e-01 -0.054 0.12 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 2.24e-01 0.138 0.113 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 9.33e-01 0.00407 0.0481 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 sc-eQTL 4.67e-01 -0.085 0.117 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -997222 sc-eQTL 4.22e-01 0.0849 0.105 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -653091 sc-eQTL 2.82e-01 0.108 0.0998 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 785881 sc-eQTL 7.82e-01 -0.026 0.094 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 535620 sc-eQTL 2.34e-01 -0.141 0.119 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 484510 sc-eQTL 1.62e-01 -0.0678 0.0483 0.134 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 785881 pQTL 0.0366 -0.0631 0.0301 0.0 0.0 0.162
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 eQTL 0.0133 -0.0727 0.0293 0.0 0.0 0.16

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N 897604 2.91e-07 1.5e-07 6.04e-08 2.2e-07 9.24e-08 9.48e-08 1.67e-07 5.4e-08 1.47e-07 6.08e-08 1.57e-07 1.08e-07 1.87e-07 7.95e-08 5.98e-08 7.74e-08 4.31e-08 1.44e-07 6.32e-08 4.92e-08 1.27e-07 1.25e-07 1.58e-07 3.17e-08 1.85e-07 1.25e-07 1.18e-07 1.01e-07 1.22e-07 9.49e-08 1.08e-07 3.84e-08 3.73e-08 8.89e-08 3.71e-08 2.74e-08 4.49e-08 8.63e-08 6.76e-08 5.96e-08 6.07e-08 1.6e-07 5.27e-08 1.09e-08 4.25e-08 1.65e-08 1.15e-07 1.9e-09 5.02e-08
ENSG00000146409 SLC18B1 485740 1.17e-06 8.23e-07 1.63e-07 3.71e-07 9.72e-08 2.46e-07 6.02e-07 1.11e-07 6.27e-07 2.81e-07 9e-07 5.01e-07 1.05e-06 1.97e-07 2.86e-07 3.41e-07 5.63e-07 4.33e-07 2.56e-07 1.9e-07 2.57e-07 5.2e-07 4.4e-07 2.24e-07 1.36e-06 2.6e-07 4.16e-07 3.18e-07 4.39e-07 7.06e-07 3.68e-07 3.99e-08 5.39e-08 1.69e-07 3.26e-07 2.59e-07 1.94e-07 1.06e-07 7.99e-08 1.79e-08 1.21e-07 1.08e-06 6.37e-08 5.68e-09 9.95e-08 2.64e-08 1.08e-07 2.35e-08 4.71e-08