logo

Genes within 1Mb (chr6:133298557:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 1.37e-01 -0.159 0.106 0.212 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 897082 sc-eQTL 7.34e-01 0.0384 0.113 0.212 B L1
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 2.69e-01 -0.047 0.0424 0.212 B L1
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 7.32e-01 0.0274 0.08 0.212 B L1
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 4.06e-01 0.0402 0.0483 0.212 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 2.34e-01 -0.121 0.101 0.212 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0589 0.0782 0.212 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0108 0.0814 0.212 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0586 0.0704 0.212 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 2.86e-01 0.0511 0.0478 0.212 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0963 0.0967 0.212 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 8.32e-01 0.0165 0.0777 0.212 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0393 0.0811 0.212 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 1.12e-01 -0.15 0.0941 0.212 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 9.76e-01 0.000976 0.0324 0.212 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0835 0.0977 0.212 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0166 0.122 0.209 DC L1
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0494 0.0755 0.209 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 563792 sc-eQTL 7.59e-01 0.0288 0.0937 0.209 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 584502 sc-eQTL 8.10e-01 0.0244 0.101 0.209 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0833 0.108 0.209 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 5.44e-01 0.0368 0.0606 0.209 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 5.55e-02 0.183 0.0951 0.209 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 195429 sc-eQTL 1.31e-01 -0.132 0.0869 0.209 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -997744 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0406 0.109 0.209 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 8.00e-02 0.144 0.0817 0.212 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0247 0.055 0.212 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 563792 sc-eQTL 7.85e-01 0.0258 0.0945 0.212 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 584502 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0719 0.102 0.212 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 1.32e-01 -0.108 0.0714 0.212 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 1.74e-01 0.0584 0.0428 0.212 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 5.57e-01 -0.05 0.085 0.212 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -997744 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0535 0.0835 0.212 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0614 0.09 0.21 NK L1
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 6.98e-02 -0.151 0.0827 0.21 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0065 0.104 0.21 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 1.04e-01 0.0697 0.0427 0.21 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 2.46e-01 0.121 0.104 0.212 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0988 0.0821 0.212 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 1.42e-01 -0.146 0.0991 0.212 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 9.57e-02 0.0657 0.0392 0.212 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0346 0.108 0.212 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0208 0.125 0.224 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 897082 sc-eQTL 8.34e-01 0.024 0.114 0.224 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 2.61e-01 0.12 0.107 0.224 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 3.09e-01 -0.116 0.114 0.224 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00701 0.061 0.224 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 2.53e-01 -0.122 0.107 0.224 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 1.42e-01 -0.173 0.117 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 897082 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0425 0.103 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 6.76e-03 -0.182 0.0665 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 8.76e-01 0.0159 0.102 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 8.67e-02 0.107 0.062 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0526 0.112 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0891 0.111 0.209 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 897082 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0854 0.102 0.209 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0284 0.0802 0.209 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 3.22e-01 -0.104 0.105 0.209 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 9.99e-01 8.82e-05 0.0506 0.209 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 2.38e-01 -0.124 0.105 0.209 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0591 0.105 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 897082 sc-eQTL 8.09e-01 0.028 0.116 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0281 0.0506 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 1.62e-01 0.137 0.0978 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 1.52e-01 0.08 0.0557 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0906 0.108 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 2.51e-01 -0.128 0.111 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 897082 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0545 0.108 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0441 0.059 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0161 0.109 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 5.46e-01 0.0347 0.0574 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 1.29e-01 -0.166 0.109 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 9.80e-01 0.00287 0.112 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 9.89e-01 0.00153 0.111 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 6.24e-03 -0.305 0.11 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 4.26e-01 0.0413 0.0518 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 2.25e-01 -0.127 0.104 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 2.94e-01 -0.094 0.0893 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 5.83e-01 0.0482 0.0877 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 9.85e-01 0.00152 0.0813 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 1.97e-01 0.068 0.0526 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0887 0.101 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 2.73e-01 -0.105 0.0959 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0917 0.0967 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 2.55e-01 -0.109 0.0952 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 6.08e-01 0.0254 0.0495 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 1.13e-01 -0.181 0.114 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 8.72e-01 -0.018 0.111 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0856 0.111 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 5.55e-01 0.063 0.107 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 1.18e-01 0.0684 0.0436 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 3.27e-01 -0.107 0.109 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0341 0.0991 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 7.24e-01 0.0328 0.0926 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 2.79e-01 -0.114 0.105 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 5.32e-01 0.0352 0.0563 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0977 0.109 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 2.67e-01 0.116 0.104 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 1.63e-01 -0.155 0.111 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00511 0.096 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 2.07e-01 0.0692 0.0547 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 2.20e-01 -0.135 0.11 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 3.83e-01 0.105 0.121 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 6.70e-01 0.0476 0.112 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 3.38e-01 -0.106 0.111 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 2.45e-01 0.0629 0.0539 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0365 0.118 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 3.59e-01 0.0973 0.106 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 9.18e-01 0.012 0.116 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 1.81e-01 -0.154 0.115 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0182 0.0619 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00468 0.117 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 4.82e-01 0.0771 0.11 0.212 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0153 0.104 0.212 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 1.29e-01 -0.16 0.105 0.212 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 9.97e-02 0.0856 0.0518 0.212 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 5.45e-01 0.0662 0.109 0.212 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 3.15e-01 0.118 0.117 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 6.17e-01 0.0544 0.109 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 4.89e-01 0.0765 0.11 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0597 0.0614 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 1.00e+00 8.46e-06 0.0969 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 1.68e-01 -0.122 0.0884 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 5.01e-01 0.0748 0.111 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 3.12e-01 0.0446 0.0439 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00969 0.123 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0609 0.112 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0883 0.113 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 6.49e-01 0.024 0.0527 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0534 0.0996 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0729 0.0964 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 8.29e-01 0.0234 0.109 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 9.92e-01 0.00061 0.0589 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 6.71e-01 0.0579 0.136 0.219 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 897082 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0983 0.116 0.219 PB L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00483 0.0968 0.219 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0755 0.118 0.219 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 3.12e-01 0.0679 0.0668 0.219 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 7.66e-01 0.0375 0.126 0.219 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 3.05e-01 0.115 0.112 0.213 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 1.63e-01 -0.14 0.1 0.213 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0929 0.108 0.213 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 3.98e-01 0.0345 0.0407 0.213 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 9.67e-01 0.00432 0.105 0.213 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 6.63e-01 0.0495 0.113 0.212 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 6.56e-01 0.0477 0.107 0.212 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0987 0.0897 0.212 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 7.40e-01 0.0132 0.0398 0.212 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 7.10e-02 0.202 0.112 0.212 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0199 0.12 0.215 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0163 0.0941 0.215 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 563792 sc-eQTL 2.59e-01 -0.105 0.0931 0.215 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 584502 sc-eQTL 5.45e-01 0.0666 0.11 0.215 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0561 0.107 0.215 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0069 0.0528 0.215 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 8.86e-01 0.015 0.105 0.215 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 195429 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0951 0.0834 0.215 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -997744 sc-eQTL 8.36e-01 0.0213 0.103 0.215 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00884 0.0936 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0232 0.071 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 563792 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0165 0.1 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 584502 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0682 0.101 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 1.65e-01 -0.112 0.0806 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 3.77e-01 0.0397 0.0449 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00991 0.0867 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -997744 sc-eQTL 8.03e-01 0.0226 0.0903 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 3.13e-02 0.229 0.106 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0307 0.0771 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 563792 sc-eQTL 6.61e-01 0.0423 0.0963 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 584502 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0813 0.104 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 3.58e-01 -0.063 0.0684 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 1.87e-01 0.065 0.0492 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0934 0.0911 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -997744 sc-eQTL 2.59e-02 -0.198 0.0883 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 6.36e-01 0.0653 0.138 0.224 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 1.22e-01 -0.183 0.118 0.224 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 4.66e-01 0.0956 0.131 0.224 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 8.62e-01 0.00868 0.0499 0.224 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 2.49e-01 -0.149 0.129 0.224 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 7.62e-01 -0.033 0.109 0.207 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00593 0.104 0.207 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 563792 sc-eQTL 5.94e-02 -0.197 0.104 0.207 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 584502 sc-eQTL 9.13e-01 0.0114 0.104 0.207 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0854 0.105 0.207 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0426 0.0458 0.207 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 7.48e-01 0.0359 0.112 0.207 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -997744 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0273 0.107 0.207 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 4.67e-01 0.0823 0.113 0.213 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 2.18e-01 -0.094 0.0761 0.213 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 563792 sc-eQTL 1.46e-01 -0.156 0.107 0.213 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 584502 sc-eQTL 1.15e-01 -0.168 0.106 0.213 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0573 0.103 0.213 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 8.86e-01 0.00738 0.0516 0.213 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0614 0.091 0.213 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -997744 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0463 0.0963 0.213 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 9.26e-02 0.221 0.131 0.22 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 1.36e-01 -0.13 0.0871 0.22 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 563792 sc-eQTL 7.45e-02 0.157 0.0874 0.22 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 584502 sc-eQTL 8.94e-02 -0.152 0.089 0.22 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 8.52e-01 -0.02 0.107 0.22 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 4.88e-01 0.0511 0.0736 0.22 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 3.00e-02 0.235 0.107 0.22 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 195429 sc-eQTL 2.63e-01 -0.117 0.104 0.22 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -997744 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0904 0.0923 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 6.93e-02 -0.205 0.112 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 897082 sc-eQTL 9.10e-01 0.0124 0.11 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 5.94e-02 -0.117 0.0616 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0978 0.0981 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 1.70e-01 0.0768 0.0558 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 1.91e-01 -0.134 0.102 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0797 0.106 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 897082 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0283 0.116 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0166 0.0478 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 6.11e-01 0.0473 0.0928 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 2.69e-01 0.062 0.056 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 3.27e-01 -0.104 0.106 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 8.90e-02 0.146 0.0852 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0286 0.0596 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 563792 sc-eQTL 6.93e-01 0.0385 0.0972 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 584502 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0697 0.101 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0892 0.0667 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 2.36e-01 0.0545 0.0458 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0587 0.0817 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -997744 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0466 0.0857 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 6.58e-01 0.0485 0.11 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0237 0.0723 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 563792 sc-eQTL 1.74e-02 -0.252 0.105 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 584502 sc-eQTL 1.05e-01 -0.171 0.105 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 2.47e-01 -0.115 0.0991 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 7.74e-01 0.0121 0.0422 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 485218 sc-eQTL 4.79e-01 0.0725 0.102 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -997744 sc-eQTL 9.07e-01 0.0108 0.0926 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -653613 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0294 0.0892 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 785359 sc-eQTL 5.59e-02 -0.16 0.083 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 535098 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0183 0.106 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 483988 sc-eQTL 1.38e-01 0.0641 0.0431 0.211 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 584502 pQTL 0.0206 -0.0938 0.0405 0.0 0.0 0.229

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina