logo

Genes within 1Mb (chr6:133297752:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 8.52e-01 0.0224 0.12 0.135 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 896277 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0893 0.126 0.135 B L1
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 1.65e-01 0.0662 0.0475 0.135 B L1
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 2.84e-01 0.096 0.0895 0.135 B L1
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0589 0.0541 0.135 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 1.95e-01 0.148 0.114 0.135 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 2.64e-01 0.0991 0.0885 0.135 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 1.20e-01 0.143 0.0917 0.135 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 2.06e-01 0.101 0.0796 0.135 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 5.24e-01 0.0347 0.0543 0.135 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 6.25e-01 0.0537 0.11 0.135 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 9.61e-01 0.00433 0.0881 0.135 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 7.86e-01 -0.025 0.092 0.135 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0455 0.107 0.135 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 4.97e-01 -0.025 0.0367 0.135 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0752 0.111 0.135 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 6.40e-02 0.255 0.137 0.135 DC L1
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 7.46e-01 0.0279 0.0858 0.135 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 562987 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0404 0.106 0.135 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 583697 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0816 0.115 0.135 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 2.25e-01 0.149 0.123 0.135 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0544 0.0688 0.135 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0249 0.109 0.135 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 194624 sc-eQTL 8.65e-01 0.0169 0.0993 0.135 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -998549 sc-eQTL 3.64e-01 0.112 0.124 0.135 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 9.06e-01 -0.011 0.093 0.135 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 8.30e-01 0.0133 0.0622 0.135 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 562987 sc-eQTL 2.53e-01 -0.122 0.106 0.135 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 583697 sc-eQTL 8.21e-01 0.026 0.115 0.135 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 5.57e-01 0.0477 0.081 0.135 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0459 0.0485 0.135 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0236 0.0961 0.135 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -998549 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0279 0.0945 0.135 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 4.38e-01 0.0788 0.101 0.135 NK L1
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00603 0.094 0.135 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0954 0.117 0.135 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0663 0.0482 0.135 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 1.42e-01 -0.176 0.119 0.135 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 9.35e-01 0.00773 0.0944 0.135 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 9.88e-02 0.188 0.113 0.135 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0393 0.0452 0.135 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00821 0.124 0.135 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0364 0.137 0.135 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 896277 sc-eQTL 3.45e-01 0.118 0.125 0.135 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0994 0.117 0.135 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 1.53e-01 0.178 0.124 0.135 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00556 0.0668 0.135 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 2.46e-01 0.136 0.117 0.135 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 3.51e-01 0.124 0.133 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 896277 sc-eQTL 8.90e-01 0.0162 0.117 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 4.90e-01 0.0528 0.0764 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 4.80e-01 0.0814 0.115 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0492 0.0705 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 3.12e-01 0.128 0.127 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 1.51e-01 -0.183 0.127 0.136 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 896277 sc-eQTL 4.21e-01 0.0947 0.118 0.136 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 2.71e-01 0.102 0.0921 0.136 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 3.30e-01 0.118 0.121 0.136 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0585 0.0581 0.136 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 1.99e-01 0.156 0.121 0.136 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0523 0.12 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 896277 sc-eQTL 7.55e-01 0.0413 0.132 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 3.10e-01 0.0586 0.0576 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0823 0.112 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 8.71e-01 0.0104 0.0639 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 7.31e-01 0.0424 0.123 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 7.95e-01 0.0329 0.126 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 896277 sc-eQTL 7.19e-02 -0.221 0.122 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 7.87e-01 0.0182 0.0672 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 3.30e-01 0.12 0.123 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 4.31e-01 0.0515 0.0652 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 4.93e-01 0.0855 0.124 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 1.73e-02 0.312 0.13 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 4.97e-01 0.089 0.131 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 5.30e-01 0.0831 0.132 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 1.06e-01 0.0984 0.0606 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 2.15e-01 0.152 0.123 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0708 0.102 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 1.40e-01 0.147 0.0994 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 1.86e-01 0.122 0.0922 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 2.48e-01 0.0694 0.0599 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 7.13e-01 0.0425 0.116 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 2.99e-01 0.115 0.11 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 3.47e-01 0.104 0.111 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 6.45e-01 0.0506 0.109 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 8.68e-01 -0.00943 0.0568 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 2.03e-01 0.167 0.131 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 8.44e-01 0.0249 0.126 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0899 0.126 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 7.65e-01 0.0362 0.121 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 2.73e-01 0.0544 0.0495 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 8.29e-01 0.0267 0.123 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0168 0.113 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0466 0.105 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 8.94e-01 -0.016 0.12 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 4.05e-01 0.0534 0.064 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 8.76e-01 0.0193 0.124 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00411 0.121 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 8.40e-01 0.026 0.129 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0396 0.111 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0373 0.0636 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 7.93e-01 0.0336 0.128 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 7.42e-01 0.0462 0.14 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0272 0.13 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0743 0.128 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 7.36e-01 0.0211 0.0626 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 5.80e-01 0.0761 0.137 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 4.82e-01 0.0868 0.123 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 9.08e-01 0.0156 0.135 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 6.20e-01 0.0664 0.134 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 2.06e-01 0.0909 0.0717 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0676 0.136 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 7.42e-01 0.0427 0.129 0.132 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 7.36e-01 0.0414 0.123 0.132 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 9.51e-02 0.208 0.124 0.132 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0124 0.0615 0.132 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0101 0.129 0.132 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0946 0.135 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 4.82e-01 0.088 0.125 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 3.05e-01 0.13 0.127 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0284 0.0708 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 3.93e-01 0.0934 0.109 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 9.75e-01 -0.0032 0.1 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 1.16e-01 -0.196 0.124 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0179 0.0497 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 1.98e-01 -0.169 0.131 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0675 0.12 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 6.40e-01 0.0569 0.121 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0566 0.0564 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 3.88e-01 0.097 0.112 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 7.50e-01 0.0347 0.109 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 3.60e-01 -0.112 0.122 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0523 0.0662 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 8.28e-01 0.0321 0.148 0.144 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 896277 sc-eQTL 1.97e-01 -0.162 0.125 0.144 PB L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 1.05e-01 -0.17 0.104 0.144 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 9.32e-01 0.011 0.129 0.144 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0793 0.0726 0.144 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 1.76e-01 -0.185 0.136 0.144 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 7.57e-01 0.039 0.126 0.135 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 8.37e-02 0.194 0.112 0.135 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 8.30e-01 0.026 0.121 0.135 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 9.69e-01 0.0018 0.0456 0.135 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 1.41e-01 0.174 0.117 0.135 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 2.29e-01 0.157 0.13 0.135 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 7.22e-02 0.22 0.122 0.135 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00801 0.103 0.135 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 3.82e-01 -0.04 0.0456 0.135 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00806 0.129 0.135 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 1.56e-01 0.202 0.142 0.129 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0182 0.112 0.129 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 562987 sc-eQTL 3.15e-01 0.112 0.111 0.129 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 583697 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0134 0.131 0.129 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 8.66e-01 0.0215 0.127 0.129 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0547 0.0628 0.129 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 1.44e-01 0.182 0.124 0.129 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 194624 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0811 0.0995 0.129 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -998549 sc-eQTL 7.35e-01 0.0416 0.123 0.129 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 9.28e-01 0.00984 0.109 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0435 0.0826 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 562987 sc-eQTL 3.23e-01 -0.115 0.117 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 583697 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0807 0.118 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 2.45e-01 0.109 0.094 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0415 0.0523 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0374 0.101 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -998549 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0388 0.105 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 3.52e-01 -0.115 0.123 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 8.87e-01 0.0127 0.0889 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 562987 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0646 0.111 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 583697 sc-eQTL 3.18e-01 0.12 0.12 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 9.69e-01 0.00311 0.079 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0546 0.0568 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 9.77e-01 0.003 0.105 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -998549 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0127 0.103 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 1.14e-01 -0.265 0.167 0.121 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 6.01e-01 0.0758 0.145 0.121 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 2.76e-01 -0.174 0.159 0.121 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 4.67e-01 0.0444 0.0609 0.121 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 3.56e-01 -0.146 0.157 0.121 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0937 0.126 0.131 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 9.94e-01 0.000938 0.12 0.131 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 562987 sc-eQTL 5.76e-01 0.0679 0.121 0.131 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 583697 sc-eQTL 1.50e-01 0.173 0.119 0.131 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 9.61e-02 0.203 0.121 0.131 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 7.30e-01 0.0184 0.0531 0.131 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0353 0.129 0.131 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -998549 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0446 0.124 0.131 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00839 0.129 0.133 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0272 0.0873 0.133 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 562987 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0704 0.123 0.133 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 583697 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0592 0.122 0.133 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 3.30e-01 0.114 0.117 0.133 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0743 0.0587 0.133 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 2.77e-01 -0.113 0.104 0.133 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -998549 sc-eQTL 1.38e-01 0.163 0.11 0.133 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 7.79e-01 0.0457 0.163 0.121 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 3.13e-01 -0.109 0.108 0.121 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 562987 sc-eQTL 5.51e-01 -0.065 0.109 0.121 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 583697 sc-eQTL 3.60e-01 0.101 0.111 0.121 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 5.13e-01 0.0864 0.132 0.121 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 1.57e-01 -0.128 0.0903 0.121 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 4.31e-01 -0.106 0.134 0.121 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 194624 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00323 0.129 0.121 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -998549 sc-eQTL 7.27e-01 0.04 0.114 0.121 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 2.93e-01 0.135 0.129 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 896277 sc-eQTL 4.74e-01 0.0896 0.125 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 2.70e-01 0.0782 0.0707 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 1.94e-01 0.146 0.112 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0405 0.0639 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 8.30e-02 0.203 0.117 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0589 0.12 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 896277 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0509 0.132 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 2.50e-01 0.0623 0.054 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 8.55e-01 0.0192 0.105 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 5.84e-01 0.0348 0.0636 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 7.28e-01 0.0418 0.12 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0408 0.0974 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 7.71e-01 0.0197 0.0678 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 562987 sc-eQTL 2.75e-01 -0.12 0.11 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 583697 sc-eQTL 6.42e-01 0.0536 0.115 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 2.64e-01 0.0851 0.0759 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0619 0.0521 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00593 0.0929 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -998549 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0935 0.0972 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0814 0.125 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0122 0.0825 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 562987 sc-eQTL 1.41e-01 -0.178 0.121 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 583697 sc-eQTL 6.54e-01 -0.054 0.12 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 2.24e-01 0.138 0.113 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 9.33e-01 0.00407 0.0481 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 sc-eQTL 4.67e-01 -0.085 0.117 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -998549 sc-eQTL 4.22e-01 0.0849 0.105 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -654418 sc-eQTL 2.82e-01 0.108 0.0998 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 784554 sc-eQTL 7.82e-01 -0.026 0.094 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 534293 sc-eQTL 2.34e-01 -0.141 0.119 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 483183 sc-eQTL 1.62e-01 -0.0678 0.0483 0.134 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 784554 pQTL 0.0403 -0.0619 0.0301 0.0 0.0 0.162
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 eQTL 0.0142 -0.072 0.0293 0.0 0.0 0.16

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N 896277 2.67e-07 1.25e-07 4.08e-08 1.84e-07 8.83e-08 9.65e-08 1.44e-07 5.33e-08 1.44e-07 4.57e-08 1.62e-07 8.59e-08 1.41e-07 6.56e-08 5.99e-08 7.17e-08 3.9e-08 1.18e-07 5.39e-08 4e-08 1.05e-07 1.26e-07 1.32e-07 3.79e-08 1.37e-07 1.14e-07 1.08e-07 9.36e-08 1.05e-07 1.12e-07 9.91e-08 3.64e-08 3.35e-08 8.65e-08 8.76e-08 3.94e-08 5.11e-08 9.23e-08 6.54e-08 3.77e-08 5.13e-08 1.31e-07 5.27e-08 7.51e-09 5.19e-08 1.83e-08 1.22e-07 1.88e-09 4.9e-08
ENSG00000146409 SLC18B1 484413 5.74e-07 4.24e-07 8.67e-08 3.19e-07 1.07e-07 1.5e-07 4.09e-07 6.57e-08 2.6e-07 1.39e-07 3.21e-07 2.8e-07 4.34e-07 1.07e-07 1.27e-07 1.39e-07 8.74e-08 2.9e-07 9.97e-08 8.39e-08 1.35e-07 2.3e-07 2.11e-07 6.52e-08 4.46e-07 1.86e-07 1.74e-07 1.67e-07 1.98e-07 2.02e-07 1.78e-07 7.71e-08 5.41e-08 9.61e-08 1.76e-07 5.14e-08 7.74e-08 6e-08 5.86e-08 7.89e-08 4.32e-08 2.65e-07 1.65e-08 1.1e-08 7.26e-08 8.24e-09 9.73e-08 1.11e-08 5.61e-08