logo

Genes within 1Mb (chr6:133293568:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 9.10e-01 0.0124 0.109 0.203 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 892093 sc-eQTL 3.73e-01 -0.103 0.115 0.203 B L1
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 7.85e-01 0.0119 0.0435 0.203 B L1
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0645 0.0817 0.203 B L1
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 6.72e-01 0.021 0.0495 0.203 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0459 0.104 0.203 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 8.73e-01 0.0129 0.0806 0.203 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 5.48e-01 0.0504 0.0837 0.203 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 9.06e-02 -0.123 0.0721 0.203 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0431 0.0492 0.203 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 3.42e-01 0.0948 0.0996 0.203 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0186 0.0787 0.203 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 3.64e-02 -0.171 0.0813 0.203 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0153 0.0959 0.203 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0278 0.0327 0.203 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 6.64e-01 0.0431 0.0991 0.203 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 3.94e-02 -0.252 0.121 0.205 DC L1
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 4.21e-01 0.0614 0.0761 0.205 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 558803 sc-eQTL 6.31e-02 -0.175 0.0937 0.205 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 579513 sc-eQTL 4.38e-01 0.0792 0.102 0.205 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0552 0.109 0.205 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 7.00e-02 -0.111 0.0607 0.205 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0523 0.0968 0.205 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 190440 sc-eQTL 7.93e-01 0.0232 0.0881 0.205 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 2.52e-01 0.0973 0.0846 0.203 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 3.82e-01 0.0497 0.0567 0.203 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 558803 sc-eQTL 2.71e-01 -0.107 0.0972 0.203 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 579513 sc-eQTL 3.26e-02 0.223 0.104 0.203 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 5.95e-02 -0.139 0.0734 0.203 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 8.76e-01 0.00693 0.0444 0.203 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 9.74e-01 -0.0029 0.0878 0.203 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 1.11e-02 0.235 0.0915 0.204 NK L1
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 2.47e-01 0.0993 0.0857 0.204 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 9.23e-01 0.0104 0.107 0.204 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00236 0.0443 0.204 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 2.82e-01 -0.117 0.108 0.203 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 9.85e-01 0.00157 0.0853 0.203 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 7.29e-01 0.0358 0.103 0.203 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0444 0.0408 0.203 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 6.90e-01 0.0447 0.112 0.203 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0106 0.126 0.204 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 892093 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0879 0.115 0.204 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 3.75e-01 -0.096 0.108 0.204 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 6.09e-01 0.0589 0.115 0.204 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0579 0.0615 0.204 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 6.53e-01 0.0486 0.108 0.204 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 8.66e-02 0.204 0.118 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 892093 sc-eQTL 2.26e-01 -0.127 0.104 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 1.36e-01 0.102 0.0682 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 1.03e-01 -0.168 0.103 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 6.47e-01 -0.029 0.0632 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 5.98e-01 0.06 0.114 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 2.34e-01 0.135 0.113 0.203 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 892093 sc-eQTL 8.97e-01 0.0135 0.105 0.203 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0941 0.082 0.203 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0953 0.107 0.203 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 6.98e-01 0.0202 0.0518 0.203 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 4.21e-01 0.087 0.108 0.203 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 5.07e-01 0.0725 0.109 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 892093 sc-eQTL 6.99e-02 -0.217 0.119 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 4.14e-01 0.0428 0.0523 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0089 0.102 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 7.27e-01 0.0202 0.058 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0908 0.112 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 9.24e-02 -0.194 0.115 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 892093 sc-eQTL 4.49e-01 0.0856 0.113 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0701 0.0613 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0472 0.113 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 9.97e-01 0.000259 0.0598 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0329 0.114 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0855 0.114 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 6.67e-01 0.049 0.114 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 2.49e-01 0.132 0.114 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 1.03e-01 -0.0863 0.0527 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 4.45e-01 0.0818 0.107 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 9.32e-01 0.00784 0.0917 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 4.51e-01 0.0677 0.0898 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0986 0.083 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0473 0.0539 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 4.16e-01 0.0846 0.104 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 5.77e-01 0.0545 0.0975 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 6.70e-01 -0.042 0.0982 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 2.63e-02 -0.214 0.0957 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 1.60e-01 -0.0705 0.05 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 5.09e-01 0.0768 0.116 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 5.78e-01 0.0633 0.114 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0745 0.114 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0691 0.109 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 8.15e-02 -0.0779 0.0445 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 5.86e-01 0.0606 0.111 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 6.94e-01 0.0399 0.101 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 1.51e-02 -0.229 0.0935 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 8.93e-01 0.0144 0.108 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 4.31e-02 -0.116 0.0571 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0834 0.112 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 4.49e-01 0.0809 0.107 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 3.73e-01 -0.101 0.114 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 2.05e-01 -0.124 0.0978 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0474 0.0561 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 8.05e-01 0.0278 0.113 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0215 0.121 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 1.28e-01 -0.171 0.112 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 2.69e-01 0.123 0.111 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00346 0.0543 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 1.94e-01 -0.154 0.118 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0371 0.111 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 9.65e-01 0.00528 0.121 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 2.40e-02 0.271 0.119 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0328 0.0649 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 2.33e-01 0.146 0.122 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 3.66e-01 -0.103 0.114 0.203 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 8.49e-01 0.0207 0.108 0.203 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0338 0.11 0.203 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0572 0.0541 0.203 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 9.23e-01 0.0109 0.114 0.203 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 3.66e-02 -0.254 0.121 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 7.71e-01 -0.033 0.113 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 4.02e-02 -0.235 0.114 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00369 0.0641 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 2.81e-02 0.219 0.099 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 5.93e-01 0.0491 0.0917 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 9.80e-01 0.00294 0.115 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0216 0.0455 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 1.73e-01 0.167 0.123 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0969 0.112 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 2.08e-02 0.261 0.112 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 9.47e-01 0.00352 0.0528 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 1.06e-01 0.166 0.103 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 1.45e-01 0.145 0.0994 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 6.50e-01 0.051 0.112 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 5.90e-01 0.0329 0.0609 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0464 0.15 0.181 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 892093 sc-eQTL 2.96e-01 0.134 0.127 0.181 PB L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0929 0.107 0.181 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 4.77e-01 0.093 0.13 0.181 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 6.53e-01 0.0333 0.0741 0.181 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0448 0.139 0.181 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 1.24e-01 -0.178 0.115 0.202 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 7.16e-02 -0.186 0.103 0.202 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0272 0.111 0.202 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0436 0.0419 0.202 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0795 0.109 0.202 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0998 0.116 0.203 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 5.02e-01 0.0735 0.109 0.203 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00324 0.0921 0.203 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 4.82e-01 0.0287 0.0407 0.203 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0925 0.115 0.203 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 5.78e-02 -0.235 0.123 0.205 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 4.92e-01 0.067 0.0973 0.205 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 558803 sc-eQTL 7.22e-02 -0.173 0.0959 0.205 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 579513 sc-eQTL 9.23e-01 0.0111 0.114 0.205 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 6.97e-01 0.0432 0.111 0.205 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0759 0.0545 0.205 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 1.76e-01 -0.147 0.108 0.205 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 190440 sc-eQTL 6.11e-01 0.0442 0.0866 0.205 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 6.80e-02 0.177 0.0964 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 5.30e-01 0.0464 0.0737 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 558803 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0529 0.104 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 579513 sc-eQTL 1.83e-02 0.247 0.104 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 9.73e-02 -0.139 0.0835 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 5.96e-01 0.0248 0.0467 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 2.64e-01 0.101 0.0898 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 8.50e-01 0.0209 0.11 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 2.31e-01 0.0954 0.0794 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 558803 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0091 0.0995 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 579513 sc-eQTL 4.93e-02 0.212 0.107 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 7.75e-02 -0.125 0.0702 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 4.69e-01 0.0369 0.0509 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 2.63e-01 -0.105 0.094 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 3.63e-01 0.139 0.153 0.221 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 2.63e-01 0.147 0.131 0.221 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 4.21e-01 0.117 0.146 0.221 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0736 0.0552 0.221 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 2.73e-01 0.157 0.143 0.221 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 2.34e-02 0.252 0.11 0.204 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 9.02e-02 0.18 0.106 0.204 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 558803 sc-eQTL 5.81e-02 -0.203 0.107 0.204 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 579513 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00185 0.106 0.204 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00733 0.108 0.204 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 7.33e-01 0.016 0.047 0.204 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0506 0.114 0.204 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0135 0.118 0.201 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 6.41e-01 0.0372 0.0797 0.201 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 558803 sc-eQTL 9.53e-01 0.00668 0.112 0.201 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 579513 sc-eQTL 2.34e-03 0.336 0.109 0.201 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0515 0.107 0.201 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 1.48e-01 0.0779 0.0536 0.201 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 5.77e-01 0.0531 0.095 0.201 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 1.37e-01 -0.207 0.138 0.212 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 2.59e-01 0.105 0.0924 0.212 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 558803 sc-eQTL 4.79e-02 -0.184 0.0922 0.212 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 579513 sc-eQTL 2.25e-01 0.115 0.0946 0.212 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 3.58e-02 -0.236 0.112 0.212 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0822 0.0776 0.212 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 5.38e-02 -0.222 0.114 0.212 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 190440 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0367 0.11 0.212 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 1.28e-01 0.174 0.114 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 892093 sc-eQTL 7.64e-02 -0.197 0.111 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 7.19e-01 0.0228 0.0631 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0869 0.0997 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0203 0.0569 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 5.19e-01 0.0675 0.104 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0404 0.11 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 892093 sc-eQTL 3.61e-01 -0.11 0.12 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0214 0.0494 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00996 0.096 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0119 0.0581 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0981 0.109 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 2.55e-01 0.1 0.0879 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 3.77e-01 0.0541 0.0612 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 558803 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0831 0.0997 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 579513 sc-eQTL 5.08e-02 0.203 0.103 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 5.31e-02 -0.133 0.0683 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 7.20e-01 0.017 0.0472 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 8.64e-01 0.0145 0.084 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 1.74e-01 0.156 0.114 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 5.15e-01 0.0494 0.0758 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 558803 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0901 0.111 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 579513 sc-eQTL 2.25e-02 0.251 0.109 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0348 0.104 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 6.54e-01 0.0199 0.0442 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 480229 sc-eQTL 2.50e-01 -0.124 0.107 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -658602 sc-eQTL 1.22e-02 0.23 0.0911 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 780370 sc-eQTL 1.35e-01 0.129 0.0864 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 530109 sc-eQTL 5.08e-01 0.0728 0.11 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 478999 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00166 0.0449 0.205 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 579513 pQTL 2.55e-12 0.3 0.0424 0.0 0.0 0.203
ENSG00000112299 VNN1 579513 eQTL 0.000737 0.0881 0.026 0.0 0.0 0.206

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 579513 3.21e-07 3.11e-07 6.41e-08 2.92e-07 1.07e-07 1.5e-07 2.74e-07 5.89e-08 1.86e-07 1.03e-07 2.18e-07 1.62e-07 4.11e-07 1.01e-07 6.12e-08 1.13e-07 8.74e-08 2.66e-07 7.76e-08 8.69e-08 1.33e-07 1.89e-07 1.81e-07 4.37e-08 4.11e-07 1.76e-07 1.48e-07 1.47e-07 1.4e-07 1.69e-07 1.43e-07 6.68e-08 4.86e-08 1.24e-07 1.29e-07 3.5e-08 8.87e-08 6.78e-08 5.95e-08 8.34e-08 5.65e-08 2.19e-07 1.67e-08 1.73e-08 3.71e-08 1.78e-08 9.19e-08 2.85e-09 4.98e-08