logo

Genes within 1Mb (chr6:133291217:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 7.93e-01 0.0308 0.117 0.141 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 889742 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0735 0.124 0.141 B L1
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 9.46e-02 0.078 0.0465 0.141 B L1
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 3.70e-01 0.0789 0.0878 0.141 B L1
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0584 0.053 0.141 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 1.90e-01 0.147 0.111 0.141 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 2.90e-01 0.092 0.0868 0.141 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 1.03e-01 0.147 0.0899 0.141 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 2.80e-01 0.0846 0.0781 0.141 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 6.59e-01 0.0235 0.0532 0.141 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 5.63e-01 0.0623 0.108 0.141 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 9.34e-01 0.00715 0.0863 0.141 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0345 0.09 0.141 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0268 0.105 0.141 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0232 0.0359 0.141 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0657 0.109 0.141 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 1.92e-01 0.175 0.134 0.142 DC L1
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 8.45e-01 0.0164 0.0835 0.142 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 556452 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0194 0.104 0.142 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 577162 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0297 0.112 0.142 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 2.35e-01 0.142 0.119 0.142 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0607 0.0669 0.142 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 7.21e-01 -0.038 0.106 0.142 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 188089 sc-eQTL 9.13e-01 0.0106 0.0966 0.142 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00115 0.0913 0.141 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 6.86e-01 0.0247 0.061 0.141 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 556452 sc-eQTL 5.29e-01 -0.066 0.105 0.141 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 577162 sc-eQTL 8.41e-01 0.0227 0.113 0.141 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 7.25e-01 0.028 0.0796 0.141 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0541 0.0476 0.141 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00269 0.0944 0.141 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 3.03e-01 0.103 0.0996 0.142 NK L1
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0174 0.0924 0.142 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 3.31e-01 -0.112 0.115 0.142 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 7.95e-02 -0.0832 0.0472 0.142 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 1.78e-01 -0.159 0.117 0.141 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 7.89e-01 0.0249 0.0928 0.141 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 3.90e-02 0.231 0.111 0.141 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0441 0.0444 0.141 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0142 0.122 0.141 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0415 0.136 0.14 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 889742 sc-eQTL 2.81e-01 0.134 0.124 0.14 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 3.32e-01 -0.113 0.116 0.14 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 2.44e-01 0.144 0.123 0.14 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 9.26e-01 0.00619 0.0664 0.14 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 2.27e-01 0.14 0.116 0.14 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 4.25e-01 0.104 0.13 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 889742 sc-eQTL 5.37e-01 0.0707 0.114 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 3.16e-01 0.0751 0.0747 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 5.47e-01 0.068 0.113 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0498 0.069 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 5.43e-01 0.0758 0.124 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 1.54e-01 -0.178 0.125 0.142 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 889742 sc-eQTL 3.53e-01 0.107 0.115 0.142 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 9.66e-02 0.15 0.09 0.142 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 5.57e-01 0.0697 0.118 0.142 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0677 0.0569 0.142 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 2.09e-01 0.15 0.119 0.142 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 4.40e-01 -0.091 0.118 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 889742 sc-eQTL 7.70e-01 0.0379 0.13 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 2.98e-01 0.059 0.0565 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 4.56e-01 -0.082 0.11 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 8.52e-01 0.0117 0.0626 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 7.08e-01 0.0454 0.121 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 6.57e-01 0.055 0.124 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 889742 sc-eQTL 9.44e-02 -0.202 0.12 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 5.22e-01 0.0422 0.0657 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 3.70e-01 0.108 0.121 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 3.87e-01 0.0554 0.0638 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 5.02e-01 0.082 0.122 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 3.57e-02 0.267 0.126 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 3.40e-01 0.121 0.127 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 6.46e-01 0.0588 0.128 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 1.41e-01 0.087 0.0588 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 3.03e-01 0.123 0.119 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0765 0.0997 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 2.04e-01 0.124 0.0975 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 2.44e-01 0.106 0.0904 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 3.86e-01 0.0511 0.0587 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 5.17e-01 0.0734 0.113 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 2.13e-01 0.135 0.108 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 2.88e-01 0.116 0.109 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 6.73e-01 0.0453 0.107 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0297 0.0556 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 3.05e-01 0.132 0.129 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 7.90e-01 0.033 0.124 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0728 0.124 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 9.37e-01 0.00935 0.119 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 3.68e-01 0.0438 0.0486 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 9.11e-01 0.0135 0.121 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0129 0.11 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0578 0.103 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0412 0.117 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 4.14e-01 0.0512 0.0626 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 9.52e-01 0.00731 0.121 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0131 0.118 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 7.87e-01 0.0341 0.126 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00578 0.109 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0429 0.0623 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 7.52e-01 0.0396 0.125 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 9.25e-01 0.0129 0.137 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0363 0.127 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0318 0.126 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 7.64e-01 0.0185 0.0613 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 4.77e-01 0.0955 0.134 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 3.79e-01 0.106 0.12 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 9.02e-01 0.0162 0.132 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 7.19e-01 0.0472 0.131 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 2.54e-01 0.0802 0.0701 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0544 0.133 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 7.05e-01 0.0482 0.127 0.139 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 8.31e-01 0.0258 0.121 0.139 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 5.86e-02 0.231 0.122 0.139 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0334 0.0603 0.139 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0105 0.126 0.139 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0349 0.132 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 3.44e-01 0.116 0.123 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 2.97e-01 0.13 0.124 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0507 0.0694 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 3.24e-01 0.106 0.107 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0275 0.0983 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 8.03e-02 -0.215 0.122 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0415 0.0487 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 2.25e-01 -0.156 0.128 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 7.52e-01 -0.037 0.117 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 8.13e-01 0.0281 0.118 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 1.69e-01 -0.0758 0.0549 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 2.33e-01 0.131 0.11 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 7.92e-01 0.0281 0.107 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 3.29e-01 -0.117 0.12 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0835 0.0648 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 7.44e-01 0.0467 0.142 0.152 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 889742 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0915 0.121 0.152 PB L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 2.14e-01 -0.126 0.101 0.152 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000154 0.124 0.152 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 1.09e-01 -0.112 0.0696 0.152 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 4.41e-01 -0.102 0.132 0.152 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 6.62e-01 0.0538 0.123 0.141 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 4.29e-02 0.222 0.109 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 8.41e-01 0.0237 0.118 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00566 0.0446 0.141 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 2.05e-01 0.146 0.115 0.141 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 3.01e-01 0.132 0.128 0.141 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 9.25e-02 0.203 0.12 0.141 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 8.65e-01 0.0173 0.101 0.141 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 2.75e-01 -0.049 0.0448 0.141 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0218 0.127 0.141 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 1.97e-01 0.179 0.138 0.137 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0357 0.109 0.137 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 556452 sc-eQTL 2.60e-01 0.122 0.108 0.137 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 577162 sc-eQTL 9.32e-01 0.0108 0.127 0.137 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 8.81e-01 0.0186 0.124 0.137 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0546 0.0609 0.137 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 2.46e-01 0.14 0.121 0.137 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 188089 sc-eQTL 5.22e-01 -0.062 0.0966 0.137 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 8.57e-01 0.0193 0.107 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0439 0.0809 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 556452 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0456 0.114 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 577162 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0706 0.115 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 3.69e-01 0.0829 0.0922 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0483 0.0512 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00546 0.0989 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 3.31e-01 -0.117 0.12 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 8.30e-01 0.0187 0.0871 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 556452 sc-eQTL 6.86e-01 -0.044 0.109 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 577162 sc-eQTL 3.98e-01 0.0998 0.118 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0179 0.0773 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0607 0.0555 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00214 0.103 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 8.55e-02 -0.279 0.161 0.13 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 4.15e-01 0.114 0.14 0.13 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0836 0.155 0.13 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 2.74e-01 0.0644 0.0587 0.13 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 3.50e-01 -0.143 0.152 0.13 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0676 0.123 0.138 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 9.54e-01 0.00675 0.118 0.138 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 556452 sc-eQTL 5.32e-01 0.0745 0.119 0.138 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 577162 sc-eQTL 8.97e-02 0.199 0.117 0.138 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 1.39e-01 0.177 0.119 0.138 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 9.72e-01 0.0018 0.0521 0.138 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00196 0.127 0.138 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 9.59e-01 0.00645 0.126 0.14 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0125 0.0854 0.14 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 556452 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0229 0.121 0.14 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 577162 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0646 0.12 0.14 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 4.50e-01 0.087 0.115 0.14 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 1.04e-01 -0.0938 0.0573 0.14 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 2.21e-01 -0.125 0.102 0.14 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0621 0.157 0.13 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 3.30e-01 -0.102 0.104 0.13 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 556452 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0181 0.105 0.13 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 577162 sc-eQTL 1.60e-01 0.15 0.106 0.13 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 4.71e-01 0.092 0.127 0.13 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 9.92e-02 -0.144 0.087 0.13 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 3.97e-01 -0.11 0.13 0.13 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 188089 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0229 0.124 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 3.37e-01 0.121 0.126 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 889742 sc-eQTL 3.65e-01 0.111 0.123 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 1.36e-01 0.104 0.0693 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 3.90e-01 0.0948 0.11 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 4.83e-01 -0.044 0.0627 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 1.91e-01 0.151 0.115 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0702 0.118 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 889742 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0532 0.129 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 1.51e-01 0.0762 0.0528 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 9.49e-01 0.00663 0.103 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 5.73e-01 0.0352 0.0623 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 7.16e-01 0.0429 0.118 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0368 0.0957 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 6.62e-01 0.0292 0.0666 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 556452 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0624 0.108 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 577162 sc-eQTL 6.57e-01 0.0504 0.113 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 4.13e-01 0.0613 0.0747 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0686 0.0511 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 8.48e-01 0.0175 0.0913 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0523 0.123 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 9.76e-01 -0.0024 0.081 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 556452 sc-eQTL 3.28e-01 -0.117 0.119 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 577162 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0513 0.118 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 2.86e-01 0.119 0.111 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0133 0.0472 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 sc-eQTL 5.77e-01 -0.064 0.115 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -660953 sc-eQTL 1.91e-01 0.128 0.0978 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 778019 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0391 0.0923 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 527758 sc-eQTL 1.70e-01 -0.16 0.116 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 476648 sc-eQTL 7.17e-02 -0.0856 0.0473 0.14 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 778019 pQTL 0.0476 -0.0585 0.0295 0.0 0.0 0.172
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 eQTL 0.0295 -0.0632 0.029 0.0 0.0 0.168

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N 889742 2.67e-07 6.07e-07 5.35e-08 2.05e-07 8.92e-08 9.61e-08 1.53e-07 5.49e-08 1.45e-07 4.4e-08 1.62e-07 8.59e-08 1.87e-07 8e-08 6.12e-08 7.37e-08 4.24e-08 1.33e-07 5.19e-08 4.2e-08 1.04e-07 1.24e-07 1.34e-07 4.53e-08 1.63e-07 1.19e-07 1.08e-07 8.71e-08 1.08e-07 1.12e-07 1.09e-07 3.71e-08 2.74e-08 8.11e-08 6.67e-08 3.93e-08 4.51e-08 9.25e-08 7.52e-08 3.18e-08 4e-08 2.6e-07 4.19e-08 1.17e-08 9.88e-08 1.83e-08 1.24e-07 4.6e-09 4.85e-08
ENSG00000146409 SLC18B1 477878 7.3e-07 1.47e-06 1.07e-07 3.66e-07 1.05e-07 1.08e-07 4.25e-07 5.85e-08 3.03e-07 1.03e-07 9.07e-07 2.04e-07 9.44e-07 1.58e-07 1.51e-07 1.17e-07 2.98e-07 3.39e-07 7.16e-08 6.58e-08 1.18e-07 3.34e-07 2.04e-07 3.07e-08 7.72e-07 1.39e-07 1.37e-07 1.17e-07 1.6e-07 1.29e-07 3.79e-07 3.54e-08 3.56e-08 1.18e-07 1.97e-07 3.04e-08 5.3e-08 8.71e-08 6.33e-08 3.67e-08 5.13e-08 1.4e-06 3.53e-08 1.94e-08 5.87e-08 8.76e-09 1.2e-07 3.95e-09 4.79e-08