logo

Genes within 1Mb (chr6:133289460:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00756 0.114 0.184 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 887985 sc-eQTL 3.49e-01 -0.113 0.12 0.184 B L1
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 8.98e-01 0.00587 0.0455 0.184 B L1
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0852 0.0853 0.184 B L1
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 8.93e-01 0.00696 0.0517 0.184 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 7.08e-01 0.0408 0.109 0.184 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0553 0.0843 0.184 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 2.82e-01 0.0943 0.0875 0.184 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 4.37e-02 -0.153 0.0752 0.184 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0666 0.0515 0.184 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 6.41e-02 0.193 0.104 0.184 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0403 0.0826 0.184 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 3.05e-02 -0.186 0.0853 0.184 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 7.72e-01 0.0292 0.101 0.184 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0394 0.0343 0.184 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 1.31e-01 0.157 0.103 0.184 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 1.45e-01 -0.184 0.126 0.187 DC L1
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 5.87e-01 0.0428 0.0786 0.187 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 554695 sc-eQTL 3.29e-02 -0.207 0.0964 0.187 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 575405 sc-eQTL 3.04e-01 0.108 0.105 0.187 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 8.90e-01 0.0156 0.113 0.187 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 8.97e-02 -0.107 0.0627 0.187 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0487 0.0999 0.187 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 186332 sc-eQTL 4.95e-01 0.0621 0.0908 0.187 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 1.85e-01 0.117 0.0882 0.184 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 3.02e-01 0.0611 0.0591 0.184 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 554695 sc-eQTL 2.50e-01 -0.117 0.101 0.184 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 575405 sc-eQTL 2.62e-02 0.242 0.108 0.184 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 1.90e-01 -0.101 0.0769 0.184 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 7.33e-01 0.0158 0.0463 0.184 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 2.52e-01 0.105 0.0913 0.184 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 3.42e-02 0.207 0.0971 0.185 NK L1
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 1.00e-01 0.149 0.0902 0.185 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 6.07e-01 0.0582 0.113 0.185 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 9.88e-01 -0.000721 0.0467 0.185 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 2.53e-01 -0.13 0.113 0.184 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 9.19e-01 0.00907 0.0891 0.184 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 4.94e-01 0.0737 0.108 0.184 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0546 0.0426 0.184 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 5.44e-01 0.0711 0.117 0.184 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 8.54e-01 0.0242 0.131 0.184 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 887985 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0427 0.12 0.184 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 6.89e-01 -0.045 0.112 0.184 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 5.53e-01 0.0711 0.12 0.184 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0897 0.0638 0.184 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 7.65e-01 0.0336 0.112 0.184 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 2.32e-02 0.282 0.123 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 887985 sc-eQTL 9.62e-02 -0.182 0.109 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 1.08e-01 0.115 0.0714 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 6.12e-02 -0.202 0.107 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0569 0.0661 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 2.19e-01 0.147 0.119 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 6.86e-01 0.0484 0.12 0.183 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 887985 sc-eQTL 9.09e-01 0.0126 0.11 0.183 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 2.32e-01 -0.103 0.0862 0.183 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0694 0.113 0.183 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 6.03e-01 0.0284 0.0545 0.183 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 2.75e-01 0.124 0.113 0.183 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 3.41e-01 0.109 0.114 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 887985 sc-eQTL 1.79e-01 -0.169 0.125 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 6.44e-01 0.0254 0.0548 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0143 0.107 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 8.24e-01 0.0135 0.0607 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 9.08e-01 0.0135 0.117 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 6.82e-02 -0.22 0.12 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 887985 sc-eQTL 3.41e-01 0.113 0.118 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0464 0.0643 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 2.65e-01 -0.132 0.118 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00692 0.0625 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 8.76e-01 0.0186 0.119 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 4.20e-01 -0.097 0.12 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 9.77e-01 0.00351 0.119 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 1.45e-01 0.176 0.12 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 6.89e-02 -0.101 0.0552 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 5.55e-01 0.0663 0.112 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0753 0.0959 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 2.18e-01 0.116 0.0939 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 1.26e-01 -0.133 0.0868 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 1.50e-01 -0.0814 0.0563 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 1.60e-01 0.153 0.108 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 5.26e-01 0.0649 0.102 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0403 0.103 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 1.33e-01 -0.152 0.101 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 8.01e-02 -0.0919 0.0523 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 1.17e-01 0.191 0.121 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 3.84e-01 0.104 0.119 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0645 0.119 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0754 0.114 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 7.29e-02 -0.084 0.0466 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 2.19e-01 0.143 0.116 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0258 0.107 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 3.70e-03 -0.287 0.0976 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 6.48e-01 0.0518 0.113 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 1.49e-01 -0.0873 0.0602 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0339 0.117 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 5.21e-01 0.0716 0.111 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 3.39e-01 -0.114 0.119 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 2.80e-01 -0.111 0.102 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 2.68e-01 -0.065 0.0586 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 2.64e-01 0.132 0.117 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 6.68e-01 0.0546 0.127 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 1.34e-01 -0.176 0.117 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 9.42e-02 0.195 0.116 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0368 0.0568 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 3.60e-01 -0.114 0.124 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0405 0.115 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0234 0.126 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 6.02e-03 0.342 0.123 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 9.48e-01 0.00442 0.0674 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 1.21e-01 0.197 0.127 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 3.95e-01 -0.102 0.12 0.182 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 9.00e-01 0.0143 0.114 0.182 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0348 0.116 0.182 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0622 0.0568 0.182 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 9.13e-01 0.0131 0.119 0.182 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 8.56e-02 -0.221 0.128 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 9.21e-01 0.0118 0.119 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 9.59e-02 -0.201 0.12 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 8.43e-01 0.0134 0.0675 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 1.07e-01 0.17 0.105 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 3.85e-01 0.0841 0.0965 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 8.66e-01 0.0204 0.121 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0172 0.048 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 3.46e-01 0.122 0.129 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 3.18e-01 -0.118 0.117 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 2.79e-02 0.261 0.118 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 4.55e-01 0.0415 0.0554 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 2.02e-01 0.138 0.108 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 8.96e-02 0.178 0.104 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 3.80e-01 0.104 0.118 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 4.09e-01 0.0529 0.064 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 3.91e-01 -0.13 0.151 0.17 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 887985 sc-eQTL 4.91e-01 0.0893 0.129 0.17 PB L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 6.20e-02 -0.201 0.107 0.17 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 7.04e-01 0.0504 0.132 0.17 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 8.47e-01 0.0146 0.0751 0.17 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 5.14e-01 -0.092 0.14 0.17 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 1.59e-01 -0.17 0.12 0.183 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 1.20e-01 -0.167 0.107 0.183 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0216 0.116 0.183 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 3.60e-01 -0.04 0.0436 0.183 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0574 0.113 0.183 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 2.24e-01 -0.148 0.121 0.184 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 3.01e-01 0.118 0.114 0.184 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0523 0.0963 0.184 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 7.54e-01 0.0134 0.0426 0.184 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0605 0.12 0.184 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 1.87e-01 -0.169 0.128 0.183 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 5.70e-01 0.0573 0.101 0.183 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 554695 sc-eQTL 4.69e-02 -0.198 0.0991 0.183 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 575405 sc-eQTL 6.98e-01 0.0458 0.118 0.183 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 3.08e-01 0.117 0.114 0.183 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0513 0.0565 0.183 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 9.12e-02 -0.189 0.111 0.183 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 186332 sc-eQTL 3.04e-01 0.0922 0.0894 0.183 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 2.35e-02 0.224 0.0983 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 6.00e-01 0.0397 0.0755 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 554695 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0635 0.107 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 575405 sc-eQTL 2.24e-02 0.245 0.106 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0697 0.086 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 6.69e-01 0.0205 0.0478 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 5.84e-02 0.174 0.0915 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 8.11e-01 0.0273 0.114 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 9.20e-02 0.138 0.0816 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 554695 sc-eQTL 7.84e-01 0.0281 0.103 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 575405 sc-eQTL 4.14e-02 0.226 0.11 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0746 0.0728 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 2.70e-01 0.058 0.0524 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 9.10e-01 -0.011 0.0973 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 1.11e-01 0.252 0.157 0.191 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 1.44e-01 0.199 0.135 0.191 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 3.53e-01 0.14 0.15 0.191 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0743 0.057 0.191 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 3.04e-01 0.152 0.148 0.191 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 2.21e-02 0.262 0.114 0.187 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 1.73e-01 0.15 0.109 0.187 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 554695 sc-eQTL 2.41e-02 -0.249 0.11 0.187 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 575405 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000435 0.11 0.187 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 7.92e-01 0.0294 0.112 0.187 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 5.41e-01 0.0297 0.0485 0.187 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 8.14e-01 0.0279 0.118 0.187 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0348 0.124 0.181 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 8.52e-01 0.0156 0.0836 0.181 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 554695 sc-eQTL 7.95e-01 0.0307 0.118 0.181 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 575405 sc-eQTL 7.08e-04 0.392 0.114 0.181 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0227 0.113 0.181 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 2.13e-01 0.0704 0.0563 0.181 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0076 0.0998 0.181 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 3.38e-01 -0.138 0.143 0.186 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 5.22e-01 0.0613 0.0955 0.186 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 554695 sc-eQTL 2.82e-02 -0.21 0.0947 0.186 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 575405 sc-eQTL 2.27e-01 0.118 0.0975 0.186 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 7.53e-02 -0.207 0.115 0.186 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0826 0.08 0.186 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 3.54e-01 -0.11 0.119 0.186 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 186332 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00975 0.114 0.186 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 1.24e-01 0.184 0.119 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 887985 sc-eQTL 5.80e-02 -0.221 0.116 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 5.30e-01 0.0415 0.066 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0947 0.104 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0343 0.0595 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 1.91e-01 0.143 0.109 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0457 0.115 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 887985 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0671 0.126 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0235 0.0518 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0539 0.101 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0153 0.0609 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0266 0.115 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 1.62e-01 0.128 0.0909 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 2.64e-01 0.0709 0.0633 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 554695 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0908 0.103 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 575405 sc-eQTL 3.87e-02 0.222 0.107 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0961 0.0711 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 6.55e-01 0.0219 0.0489 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 2.44e-01 0.101 0.0868 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 1.39e-01 0.176 0.119 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 8.75e-01 0.0124 0.0786 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 554695 sc-eQTL 2.41e-01 -0.136 0.115 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 575405 sc-eQTL 1.73e-02 0.271 0.113 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0144 0.108 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 2.05e-01 0.0581 0.0457 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 476121 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0705 0.111 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -662710 sc-eQTL 4.85e-02 0.192 0.0967 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 776262 sc-eQTL 5.10e-02 0.178 0.0909 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 526001 sc-eQTL 3.30e-01 0.113 0.116 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 474891 sc-eQTL 9.64e-01 0.00216 0.0474 0.185 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 575405 pQTL 2.52e-09 0.258 0.0429 0.0 0.0 0.194
ENSG00000112299 VNN1 575405 eQTL 0.00558 0.0733 0.0264 0.0 0.0 0.195

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 575405 6.8e-07 3.11e-07 1.05e-07 2.57e-07 9.93e-08 1.5e-07 4.09e-07 1.03e-07 3.32e-07 2.01e-07 4.3e-07 3.11e-07 5.09e-07 9.48e-08 1.32e-07 1.96e-07 1.69e-07 3.39e-07 1.51e-07 8.39e-08 1.68e-07 2.96e-07 2.77e-07 1.03e-07 4.46e-07 2.4e-07 1.97e-07 1.77e-07 2.66e-07 2.52e-07 1.95e-07 6.04e-08 5.53e-08 1.19e-07 1.54e-07 6.85e-08 7.74e-08 5.36e-08 5.7e-08 7.67e-08 2.84e-08 2.9e-07 2.89e-08 1.08e-08 7.26e-08 8.94e-09 9.83e-08 0.0 5.61e-08