Genes within 1Mb (chr6:133288794:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 7.05e-01 0.0453 0.119 0.141 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 887319 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0472 0.126 0.141 B L1
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 8.91e-02 0.0808 0.0473 0.141 B L1
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 4.69e-01 0.0649 0.0894 0.141 B L1
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0463 0.054 0.141 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 1.56e-01 0.161 0.113 0.141 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 3.73e-01 0.0789 0.0883 0.141 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 1.39e-01 0.136 0.0915 0.141 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 2.41e-01 0.0935 0.0794 0.141 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 4.47e-01 0.0412 0.0541 0.141 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 5.29e-01 0.0691 0.109 0.141 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 7.09e-01 0.0324 0.0865 0.141 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0197 0.0904 0.141 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0261 0.105 0.141 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0155 0.036 0.141 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0597 0.109 0.141 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 2.64e-01 0.15 0.134 0.142 DC L1
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 8.06e-01 0.0205 0.0835 0.142 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 554029 sc-eQTL 9.83e-01 0.00227 0.104 0.142 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 574739 sc-eQTL 7.34e-01 -0.038 0.112 0.142 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 2.10e-01 0.15 0.119 0.142 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0627 0.0669 0.142 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0402 0.106 0.142 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 185666 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00889 0.0966 0.142 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 7.33e-01 0.0318 0.0933 0.141 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 7.03e-01 0.0238 0.0624 0.141 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 554029 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0475 0.107 0.141 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 574739 sc-eQTL 7.08e-01 0.0433 0.115 0.141 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 7.63e-01 0.0245 0.0813 0.141 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0295 0.0487 0.141 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0274 0.0964 0.141 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 3.94e-01 0.0869 0.102 0.142 NK L1
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0143 0.0942 0.142 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0774 0.117 0.142 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0619 0.0483 0.142 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 2.36e-01 -0.142 0.119 0.141 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 6.59e-01 0.0416 0.0939 0.141 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 4.05e-02 0.232 0.113 0.141 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0405 0.045 0.141 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 9.34e-01 0.0102 0.123 0.141 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0607 0.138 0.14 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 887319 sc-eQTL 2.88e-01 0.134 0.126 0.14 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 2.22e-01 -0.145 0.118 0.14 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 4.24e-01 0.101 0.126 0.14 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 7.35e-01 0.0229 0.0676 0.14 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 2.06e-01 0.15 0.118 0.14 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 3.97e-01 0.112 0.132 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 887319 sc-eQTL 4.22e-01 0.0933 0.116 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 3.28e-01 0.0745 0.0759 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 6.55e-01 0.0513 0.115 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0214 0.0702 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 5.11e-01 0.0831 0.126 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 2.88e-01 -0.135 0.126 0.142 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 887319 sc-eQTL 5.07e-01 0.0775 0.117 0.142 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 9.46e-02 0.153 0.091 0.142 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 6.23e-01 0.0589 0.12 0.142 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0496 0.0576 0.142 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 1.43e-01 0.176 0.12 0.142 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0869 0.12 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 887319 sc-eQTL 6.14e-01 0.0665 0.132 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 2.91e-01 0.0608 0.0575 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0903 0.112 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 5.80e-01 0.0352 0.0637 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 5.54e-01 0.0728 0.123 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 9.37e-01 0.00998 0.126 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 887319 sc-eQTL 1.51e-01 -0.176 0.122 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 5.06e-01 0.0444 0.0666 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 3.93e-01 0.105 0.122 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 1.97e-01 0.0837 0.0646 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 6.29e-01 0.0599 0.124 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 3.38e-02 0.269 0.126 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 3.84e-01 0.11 0.126 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 3.77e-01 0.113 0.127 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 1.69e-01 0.081 0.0586 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 3.84e-01 0.103 0.119 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0893 0.101 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 2.71e-01 0.109 0.0992 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 2.25e-01 0.112 0.0918 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 2.44e-01 0.0696 0.0596 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 4.52e-01 0.0865 0.115 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 3.04e-01 0.113 0.11 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 2.66e-01 0.123 0.11 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 7.04e-01 0.0414 0.109 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0209 0.0565 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 3.91e-01 0.112 0.131 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 9.18e-01 0.0129 0.126 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 6.68e-01 -0.054 0.126 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 8.89e-01 0.0169 0.121 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 2.74e-01 0.0541 0.0494 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 7.96e-01 0.0319 0.123 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0098 0.11 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0449 0.103 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0518 0.117 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 4.13e-01 0.0513 0.0626 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 8.73e-01 0.0194 0.121 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 8.21e-01 0.027 0.119 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 5.12e-01 0.0833 0.127 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0131 0.11 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0246 0.0627 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 9.58e-01 0.00659 0.126 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 8.09e-01 0.0334 0.138 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0634 0.128 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0219 0.127 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 3.60e-01 0.0566 0.0617 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 3.91e-01 0.116 0.135 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 2.58e-01 0.136 0.12 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 8.91e-01 0.0181 0.131 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 6.29e-01 0.0631 0.13 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 2.37e-01 0.083 0.07 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 5.17e-01 -0.086 0.133 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 7.67e-01 0.0374 0.126 0.141 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 7.86e-01 0.0326 0.12 0.141 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 7.58e-02 0.216 0.121 0.141 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0362 0.06 0.141 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00533 0.126 0.141 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0668 0.135 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 4.99e-01 0.0846 0.125 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 4.06e-01 0.106 0.127 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0327 0.0708 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 3.12e-01 0.111 0.109 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0189 0.1 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 1.57e-01 -0.177 0.125 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0247 0.0498 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 2.18e-01 -0.161 0.13 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0224 0.119 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 8.06e-01 0.0297 0.121 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0661 0.056 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 2.94e-01 0.118 0.112 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 7.75e-01 0.0311 0.109 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0718 0.122 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0528 0.0662 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 6.70e-01 0.0627 0.147 0.148 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 887319 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0677 0.125 0.148 PB L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 2.09e-01 -0.131 0.104 0.148 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 8.73e-01 0.0205 0.128 0.148 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 5.66e-02 -0.137 0.0713 0.148 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0972 0.136 0.148 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 6.74e-01 0.0527 0.125 0.141 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 5.89e-02 0.21 0.111 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 7.75e-01 0.0343 0.12 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0148 0.0453 0.141 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 1.23e-01 0.181 0.117 0.141 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 2.82e-01 0.14 0.13 0.141 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 1.13e-01 0.195 0.122 0.141 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 8.73e-01 0.0165 0.104 0.141 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0428 0.0457 0.141 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 9.60e-01 0.00655 0.129 0.141 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 3.00e-01 0.143 0.138 0.139 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0441 0.108 0.139 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 554029 sc-eQTL 1.53e-01 0.154 0.107 0.139 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 574739 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00581 0.127 0.139 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 8.37e-01 0.0254 0.123 0.139 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0486 0.0608 0.139 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 2.24e-01 0.147 0.12 0.139 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 185666 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0808 0.0962 0.139 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 5.71e-01 0.0618 0.109 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0319 0.0828 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 554029 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0295 0.117 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 574739 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0577 0.118 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 4.07e-01 0.0783 0.0943 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0177 0.0524 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0102 0.101 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 3.51e-01 -0.115 0.123 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00692 0.0888 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 554029 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0322 0.111 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 574739 sc-eQTL 2.97e-01 0.126 0.12 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 7.13e-01 -0.029 0.0788 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0469 0.0567 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0298 0.105 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 1.30e-01 -0.246 0.161 0.133 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 3.70e-01 0.125 0.139 0.133 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0839 0.154 0.133 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 2.07e-01 0.0742 0.0585 0.133 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 2.82e-01 -0.164 0.152 0.133 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 3.72e-01 -0.112 0.126 0.138 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 7.43e-01 0.0395 0.12 0.138 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 554029 sc-eQTL 5.13e-01 0.0795 0.121 0.138 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 574739 sc-eQTL 8.40e-02 0.207 0.119 0.138 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 1.24e-01 0.187 0.121 0.138 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000113 0.0531 0.138 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0713 0.129 0.138 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 8.95e-01 0.0168 0.127 0.14 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0172 0.086 0.14 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 554029 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0174 0.121 0.14 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 574739 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0679 0.12 0.14 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 5.22e-01 0.0742 0.116 0.14 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 1.58e-01 -0.082 0.0578 0.14 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 2.74e-01 -0.112 0.102 0.14 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 7.07e-01 -0.059 0.157 0.133 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0973 0.104 0.133 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 554029 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0292 0.105 0.133 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 574739 sc-eQTL 2.10e-01 0.134 0.107 0.133 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 5.97e-01 0.0674 0.127 0.133 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 5.81e-02 -0.166 0.0868 0.133 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 2.92e-01 -0.137 0.13 0.133 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 185666 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0456 0.124 0.133 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 2.30e-01 0.154 0.128 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 887319 sc-eQTL 4.55e-01 0.0933 0.125 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 1.72e-01 0.0963 0.0704 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 4.93e-01 0.0766 0.112 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0237 0.0637 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 1.67e-01 0.162 0.116 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0769 0.12 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 887319 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0253 0.131 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 1.40e-01 0.0795 0.0537 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000606 0.105 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 3.49e-01 0.0594 0.0633 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 6.32e-01 0.0573 0.12 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 9.55e-01 0.00552 0.098 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 7.22e-01 0.0243 0.0681 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 554029 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0492 0.111 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 574739 sc-eQTL 5.40e-01 0.0711 0.116 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 4.59e-01 0.0567 0.0765 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0404 0.0524 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 9.58e-01 0.00496 0.0935 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0896 0.125 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 7.48e-01 0.0264 0.0823 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 554029 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0813 0.121 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 574739 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0433 0.12 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 2.97e-01 0.118 0.113 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0222 0.048 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 sc-eQTL 3.12e-01 -0.118 0.116 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -663376 sc-eQTL 2.37e-01 0.118 0.0999 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 775596 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0342 0.0941 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 525335 sc-eQTL 3.21e-01 -0.118 0.119 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 474225 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0648 0.0484 0.14 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 eQTL 0.0111 -0.0739 0.029 0.0 0.0 0.169


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N 887319 2.76e-07 1.35e-07 5.82e-08 2.22e-07 8.83e-08 9.9e-08 1.67e-07 5.33e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.55e-07 8.68e-08 1.79e-07 7.37e-08 5.82e-08 7.3e-08 4.09e-08 1.33e-07 6.32e-08 4.8e-08 1.19e-07 1.24e-07 1.44e-07 3.03e-08 1.63e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.61e-08 1.12e-07 1.07e-07 1.06e-07 2.96e-08 3.68e-08 8.7e-08 3.81e-08 3.93e-08 5.42e-08 8.61e-08 6.35e-08 5.96e-08 5.36e-08 1.46e-07 5.21e-08 1.9e-08 3.42e-08 1.19e-08 1.19e-07 1.93e-09 5.04e-08
ENSG00000146409 SLC18B1 475455 8.7e-07 6.26e-07 1.2e-07 3.71e-07 1.07e-07 2.08e-07 5.8e-07 6.57e-08 3.94e-07 2.37e-07 5.93e-07 3.11e-07 9.57e-07 1.6e-07 3.31e-07 1.63e-07 3.35e-07 3.79e-07 2.12e-07 1.71e-07 1.8e-07 3.65e-07 3.19e-07 1.29e-07 8.99e-07 2.33e-07 2.52e-07 1.97e-07 2.84e-07 4.72e-07 3.38e-07 6.56e-08 5.31e-08 1.54e-07 3.38e-07 5.14e-08 8.6e-08 7.75e-08 7.63e-08 8.51e-09 1.14e-07 6.15e-07 2.71e-08 2.64e-08 1.27e-07 3.92e-08 8.75e-08 1.77e-08 5.61e-08