logo

Genes within 1Mb (chr6:133268509:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 7.63e-01 0.0331 0.11 0.16 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 867034 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0621 0.116 0.16 B L1
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 1.63e-01 0.061 0.0436 0.16 B L1
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 6.29e-01 0.0398 0.0823 0.16 B L1
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0377 0.0497 0.16 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 6.22e-01 0.0517 0.105 0.16 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 9.54e-02 0.136 0.0811 0.16 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 1.52e-01 0.121 0.0845 0.16 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 3.29e-01 0.0718 0.0733 0.16 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 4.43e-01 0.0384 0.0499 0.16 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00787 0.101 0.16 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 4.88e-01 0.0553 0.0796 0.16 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0413 0.0831 0.16 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 2.79e-01 -0.105 0.0969 0.16 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00379 0.0332 0.16 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0998 0.1 0.16 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 6.57e-01 0.0554 0.125 0.162 DC L1
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 8.60e-01 0.0137 0.0775 0.162 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 533744 sc-eQTL 7.02e-01 0.0369 0.0961 0.162 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 554454 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0883 0.104 0.162 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 5.67e-01 0.0636 0.111 0.162 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 2.41e-01 -0.073 0.062 0.162 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 2.42e-01 -0.115 0.0982 0.162 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 165381 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0582 0.0896 0.162 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 7.27e-01 0.0304 0.0869 0.16 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 7.60e-01 0.0178 0.0582 0.16 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 533744 sc-eQTL 2.56e-01 -0.113 0.0996 0.16 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 554454 sc-eQTL 7.41e-01 0.0355 0.107 0.16 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 5.36e-01 -0.047 0.0758 0.16 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0525 0.0453 0.16 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0968 0.0897 0.16 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 5.49e-02 0.18 0.0932 0.161 NK L1
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0446 0.0869 0.161 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 2.91e-01 -0.114 0.108 0.161 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 1.15e-01 -0.0704 0.0445 0.161 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 1.92e-01 -0.143 0.11 0.16 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 9.21e-01 0.00862 0.0865 0.16 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 1.29e-01 0.159 0.104 0.16 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0364 0.0414 0.16 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0255 0.114 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 2.52e-01 -0.144 0.126 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 867034 sc-eQTL 6.29e-01 0.0557 0.115 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 1.85e-01 -0.143 0.107 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 1.77e-01 0.155 0.114 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 4.28e-01 0.0489 0.0615 0.161 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 2.39e-01 0.127 0.107 0.161 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00728 0.123 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 867034 sc-eQTL 1.23e-01 0.166 0.107 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 3.52e-01 0.0656 0.0704 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 3.36e-01 0.102 0.106 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 7.36e-01 -0.022 0.065 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0263 0.117 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0998 0.118 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 867034 sc-eQTL 3.36e-01 0.105 0.109 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 1.83e-01 0.114 0.0851 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 9.80e-01 0.00284 0.112 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0531 0.0537 0.162 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 4.66e-01 0.082 0.112 0.162 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 3.14e-01 -0.111 0.11 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 867034 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0193 0.121 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 3.08e-01 0.0541 0.053 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 2.28e-01 -0.124 0.103 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000612 0.0587 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0458 0.113 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 6.09e-01 0.0595 0.116 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 867034 sc-eQTL 1.54e-01 -0.161 0.113 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00307 0.0617 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 2.21e-01 0.138 0.113 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 4.41e-01 0.0462 0.0599 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 6.15e-01 0.0576 0.114 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 5.82e-02 0.219 0.115 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 8.11e-02 0.2 0.114 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 4.01e-01 0.0975 0.116 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 1.23e-01 0.0827 0.0533 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 3.77e-01 0.0955 0.108 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 6.80e-01 0.0386 0.0935 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 3.36e-01 0.0882 0.0915 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 2.63e-01 0.095 0.0847 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 1.04e-01 0.0895 0.0548 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 9.41e-01 0.00792 0.106 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 4.70e-01 0.0731 0.101 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 2.07e-01 0.128 0.101 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0907 0.1 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 8.60e-01 -0.00917 0.052 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 9.51e-01 0.00748 0.12 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0259 0.116 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0957 0.116 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 8.27e-01 0.0243 0.111 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 3.37e-01 0.0437 0.0455 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 7.84e-01 -0.031 0.113 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 5.19e-01 0.0657 0.102 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0513 0.0951 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 2.22e-01 -0.132 0.108 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 7.77e-01 0.0164 0.0578 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00148 0.112 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 9.37e-01 0.00864 0.109 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 7.84e-01 0.0319 0.116 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0529 0.1 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000356 0.0574 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 9.80e-01 0.00284 0.115 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 9.06e-01 -0.015 0.126 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0551 0.117 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 2.48e-01 -0.134 0.116 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 3.15e-01 0.0569 0.0565 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 7.53e-01 0.0391 0.124 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 2.01e-01 0.142 0.11 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 7.79e-01 0.034 0.121 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 8.88e-01 0.0169 0.12 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 4.66e-01 0.0472 0.0646 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 2.52e-01 -0.14 0.122 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0122 0.116 0.16 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 8.62e-01 0.0192 0.11 0.16 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 9.10e-02 0.189 0.111 0.16 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0234 0.0552 0.16 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 9.96e-01 0.000605 0.116 0.16 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0889 0.123 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 6.08e-01 0.0589 0.115 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 1.14e-01 0.184 0.116 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0508 0.0647 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 4.72e-02 0.199 0.0999 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0392 0.0923 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 9.86e-02 -0.19 0.115 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0318 0.0458 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 7.09e-01 -0.045 0.12 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0284 0.11 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000263 0.111 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 1.22e-01 -0.0799 0.0514 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 8.86e-02 0.176 0.103 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0106 0.1 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 2.22e-01 -0.138 0.112 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0749 0.0609 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 1.48e-01 0.207 0.142 0.159 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 867034 sc-eQTL 7.27e-01 -0.043 0.123 0.159 PB L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 9.90e-01 0.00132 0.102 0.159 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 5.92e-01 0.0671 0.125 0.159 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0864 0.0706 0.159 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0897 0.133 0.159 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 8.97e-01 0.0149 0.116 0.161 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 2.50e-01 0.119 0.103 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 6.51e-01 0.0501 0.111 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0116 0.0419 0.161 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 3.11e-01 0.11 0.108 0.161 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 1.52e-01 0.171 0.119 0.16 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 3.28e-01 0.11 0.112 0.16 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 7.08e-01 0.0355 0.0946 0.16 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0354 0.0418 0.16 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 9.60e-01 0.00594 0.118 0.16 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 6.56e-01 0.0571 0.128 0.159 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0523 0.1 0.159 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 533744 sc-eQTL 6.52e-02 0.184 0.0989 0.159 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 554454 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0638 0.117 0.159 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0484 0.114 0.159 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0759 0.0562 0.159 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 3.05e-01 0.115 0.112 0.159 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 165381 sc-eQTL 1.21e-01 -0.139 0.0888 0.159 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 6.80e-01 0.0417 0.101 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0277 0.0764 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 533744 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0933 0.108 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 554454 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0493 0.109 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 9.80e-01 0.0022 0.0872 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0382 0.0483 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0695 0.0932 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 2.00e-01 -0.145 0.113 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0431 0.0818 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 533744 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0896 0.102 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 554454 sc-eQTL 2.35e-01 0.132 0.111 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0667 0.0726 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 1.25e-01 -0.0801 0.0521 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0698 0.0968 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 6.33e-02 -0.269 0.144 0.161 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 4.86e-01 0.0874 0.125 0.161 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 3.11e-01 -0.14 0.138 0.161 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 1.62e-01 0.0737 0.0525 0.161 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 5.06e-01 -0.091 0.136 0.161 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0438 0.117 0.158 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 3.24e-01 0.11 0.111 0.158 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 533744 sc-eQTL 7.06e-01 0.0426 0.113 0.158 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 554454 sc-eQTL 8.21e-02 0.193 0.111 0.158 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 2.40e-01 0.133 0.113 0.158 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00295 0.0493 0.158 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 3.49e-01 -0.112 0.12 0.158 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 6.21e-01 0.0579 0.117 0.161 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00961 0.0791 0.161 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 533744 sc-eQTL 9.13e-01 0.0123 0.112 0.161 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 554454 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0822 0.111 0.161 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0307 0.107 0.161 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0634 0.0532 0.161 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0562 0.0943 0.161 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 3.24e-01 -0.138 0.14 0.158 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0268 0.0932 0.158 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 533744 sc-eQTL 9.88e-01 0.00138 0.0939 0.158 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 554454 sc-eQTL 4.24e-01 0.0764 0.0954 0.158 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 4.56e-01 0.0848 0.114 0.158 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 1.86e-01 -0.103 0.0779 0.158 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 7.35e-03 -0.308 0.113 0.158 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 165381 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0808 0.111 0.158 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 7.60e-01 0.0365 0.119 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 867034 sc-eQTL 1.96e-01 0.15 0.115 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 3.11e-01 0.0665 0.0655 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 4.59e-01 0.0768 0.104 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0194 0.0591 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 6.97e-01 0.0424 0.109 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0376 0.111 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 867034 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0832 0.121 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 3.27e-01 0.0489 0.0498 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 9.91e-01 0.00105 0.0969 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 7.76e-01 0.0167 0.0586 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00123 0.111 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0133 0.0907 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 9.52e-01 0.00378 0.0631 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 533744 sc-eQTL 2.84e-01 -0.11 0.103 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 554454 sc-eQTL 5.04e-01 0.0717 0.107 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000656 0.0709 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0674 0.0484 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0498 0.0864 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0415 0.116 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 7.86e-01 0.0208 0.0765 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 533744 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0472 0.113 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 554454 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0523 0.112 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 8.92e-01 0.0143 0.105 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0317 0.0446 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 sc-eQTL 1.55e-01 -0.154 0.108 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -683661 sc-eQTL 2.49e-02 0.206 0.0914 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 755311 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0628 0.0868 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 505050 sc-eQTL 1.25e-01 -0.169 0.109 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 453940 sc-eQTL 1.05e-01 -0.0726 0.0446 0.159 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 554454 pQTL 0.0319 0.0944 0.0439 0.0 0.0 0.191
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 eQTL 0.00262 -0.0823 0.0273 0.0 0.0 0.192

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N 867034 2.67e-07 1.3e-07 3.71e-08 1.84e-07 8.83e-08 9.65e-08 1.53e-07 5.19e-08 1.44e-07 4.57e-08 1.6e-07 8.36e-08 1.41e-07 6.56e-08 6e-08 7.17e-08 3.93e-08 1.21e-07 5.36e-08 4.21e-08 1.04e-07 1.27e-07 1.39e-07 4.05e-08 1.4e-07 1.14e-07 1.08e-07 9.32e-08 1.08e-07 1.07e-07 9.64e-08 4.09e-08 3.28e-08 8.55e-08 8.96e-08 3.99e-08 5.11e-08 9.25e-08 6.54e-08 3.55e-08 3.89e-08 1.35e-07 4.52e-08 7.35e-09 5.75e-08 1.68e-08 1.19e-07 3.95e-09 4.81e-08
ENSG00000146409 SLC18B1 455170 5.59e-07 4.78e-07 7.92e-08 3.19e-07 1.02e-07 1.32e-07 4.68e-07 7.65e-08 2.76e-07 1.5e-07 3.92e-07 2.11e-07 5.62e-07 1.01e-07 1.01e-07 1.26e-07 2.11e-07 2.96e-07 9.19e-08 8.31e-08 1.52e-07 2.51e-07 2.81e-07 5.6e-08 5.53e-07 2.29e-07 1.72e-07 1.52e-07 2.31e-07 3.39e-07 1.95e-07 6.04e-08 4.98e-08 1.21e-07 1.33e-07 3.43e-08 8.07e-08 6.2e-08 5.54e-08 8.34e-08 3.68e-08 3.73e-07 2.89e-08 5.64e-09 6.59e-08 9.65e-09 9.38e-08 0.0 4.61e-08